; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh00G000340 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh00G000340
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionSplicing factor YJU2
Genome locationCmo_Chr00:6279027..6281075
RNA-Seq ExpressionCmoCh00G000340
SyntenyCmoCh00G000340
Gene Ontology termsGO:0000349 - generation of catalytic spliceosome for first transesterification step (biological process)
GO:0071006 - U2-type catalytic step 1 spliceosome (cellular component)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6583657.1 Splicing factor YJU2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.1e-3184.95Show/hide
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KAG7011084.1 Coiled-coil domain-containing protein 94-like protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.1e-3184.95Show/hide
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XP_022932207.1 coiled-coil domain-containing protein 94 homolog isoform X1 [Cucurbita moschata]2.4e-42100Show/hide
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XP_022970327.1 coiled-coil domain-containing protein 94 homolog [Cucurbita maxima]1.5e-3994.62Show/hide
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XP_023519851.1 coiled-coil domain-containing protein 94 homolog [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.8e-3893.55Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1E3A4 Splicing factor YJU24.5e-1862.37Show/hide
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A0A6J1E6Q8 Splicing factor YJU23.8e-2568.82Show/hide
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A0A6J1EW00 Splicing factor YJU21.2e-42100Show/hide
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A0A6J1HNB0 Splicing factor YJU27.6e-2669.89Show/hide
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A0A6J1HYT1 Splicing factor YJU27.1e-4094.62Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGCCTTCTCCTATTGTTGAACGTTTTGGTCTTGGTGCCAACAAAAAGCAAAAGCTCTCTGAAGAATCTCCACATGATGATCCTACCACTACGACAAAAGATGCTAT
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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TTCTTCG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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