; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh01G000930 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh01G000930
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionOxidative stress 3, putative isoform 2
Genome locationCmo_Chr01:423584..424723
RNA-Seq ExpressionCmoCh01G000930
SyntenyCmoCh01G000930
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6606744.1 hypothetical protein SDJN03_00086, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.5e-7797.53Show/hide
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KAG7036459.1 hypothetical protein SDJN02_00076 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.2e-7796.93Show/hide
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XP_022949011.1 uncharacterized protein LOC111452482 [Cucurbita moschata]2.3e-81100Show/hide
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XP_022997869.1 uncharacterized protein LOC111492699 [Cucurbita maxima]3.3e-7292.68Show/hide
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XP_023524906.1 uncharacterized protein LOC111788696 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.0e-7393.45Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BH50 uncharacterized protein LOC1034899763.6e-4871.17Show/hide
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        +LHQPCS  L + FH   ED W   KGG+  YN+ASSTSSFEDS+ SS         DDACSSTSNSSS SNG LEDFT+LFAQLPIKRGLSMFY+GKS+
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A0A5D3CBD2 Oxidative stress 3, putative isoform 23.6e-4871.17Show/hide
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A0A6J1DLD1 uncharacterized protein LOC1110211141.7e-4568.48Show/hide
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A0A6J1GAT2 uncharacterized protein LOC1114524821.1e-81100Show/hide
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A0A6J1KCR8 uncharacterized protein LOC1114926991.6e-7292.68Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G43850.1 unknown protein1.7e-0539.34Show/hide
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        L+SSTSS     NS DD        SS  NG L+    L   LPIKR +S FY+GKS+SF SLS   S  ++DL K  + YS R     S+     GG+ 
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          K  +    A + ++  SSSS
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AT4G26288.1 FUNCTIONS IN: molecular_function unknown3.5e-1142.98Show/hide
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        ++SS+S    SS+ ++DA SS+S+SSS SNG  +D ++L +QLPI    K GLS +Y+GKSQSFTSL++V S++DL K+     SR   C          
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Query:  KSAYTLPKAPTFKKASSSSSK
        +  +  PKA    KA+ +SSK
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AT5G56550.1 oxidative stress 32.2e-1344.53Show/hide
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        E D + + S SS   S  + DD     S+SS  SNG LED ++L + LPIKRGLS FYEGKSQSFTSL +V+S+EDL K   K   Y ++    +S  G 
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        LD        PKA   KK + + S  +S
Subjt:  LDTHKSAYTLPKAPTFKKASSSSSKKIS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTGGATTGCTTCATCAACCTTGTTCTGTTGCTCTGTGCAAAGGGTTCCATGAAGATGATTGGGGCAAGGGCGGTGAGTATGACTACAACCTTGCCTCTTCCACATC
TTCCTTCGAAGATTCAAGCAATTCGTCGGATGATGCGTGTTCATCCACTTCAAATTCTTCATCTCCATCCAATGGAGCGTTGGAGGATTTTACAGAGCTTTTTGCCCAAC
TCCCAATCAAGAGAGGACTGTCCATGTTCTATGAAGGGAAATCCCAGTCGTTTACATCGCTATCAAGTGTAAGAAGCATAGAAGACCTTCCGAAGAAGAGAAGCCCTTAC
AGCAGTAGATTAAGCGGATGTAAGAGCTATGCAGGAGGGTTGGACACCCACAAATCTGCTTATACTCTTCCCAAGGCTCCCACTTTTAAGAAGGCATCATCATCATCATC
CAAAAAGATCTCTGTCTCTTGTCCCGGTTACGAGAGGCAGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTGGGTGTTTGGTGGTTTGGGAATTCTATGCCTTTTCATGTGAGGCCATCAATCCCCCCGTCTTTTATTTATTTATTAATTTAAAATAAAAAATAAGCAAGAACTTGGAA
TTTTCTCTTGCTGCCTATAAATGTTCCACAAGAAATGTCATAGACTCGAAGGCTGTTTGTGTTGAAAGGGTTATCTTATATATAATATAAATACATCAAAAGCTTATCCC
ATCAAAGCATCCTTTATCAATTTCTGGATTTTTCTCTGTTTCTCTCTGTTTGTGTTGCTGCTGTTCTTCATCTTCTTCTTGAATATGGGTGGATTGCTTCATCAACCTTG
TTCTGTTGCTCTGTGCAAAGGGTTCCATGAAGATGATTGGGGCAAGGGCGGTGAGTATGACTACAACCTTGCCTCTTCCACATCTTCCTTCGAAGATTCAAGCAATTCGT
CGGATGATGCGTGTTCATCCACTTCAAATTCTTCATCTCCATCCAATGGAGCGTTGGAGGATTTTACAGAGCTTTTTGCCCAACTCCCAATCAAGAGAGGACTGTCCATG
TTCTATGAAGGGAAATCCCAGTCGTTTACATCGCTATCAAGTGTAAGAAGCATAGAAGACCTTCCGAAGAAGAGAAGCCCTTACAGCAGTAGATTAAGCGGATGTAAGAG
CTATGCAGGAGGGTTGGACACCCACAAATCTGCTTATACTCTTCCCAAGGCTCCCACTTTTAAGAAGGCATCATCATCATCATCCAAAAAGATCTCTGTCTCTTGTCCCG
GTTACGAGAGGCAGTGATTTGGTTGGTTGGTTGGTTGGTTGTGATAGCCTTCCATTTCTGTGTGTACATGATGTCTGAGTAGTAGGTTTACAACGTTAAATTGGCCCATC
TATGTTGGGAGTTTTGGTTGTACAATAGGGGAATCATTGATATTGATCTAAACTATTATTGAGTTCAGATGTTTGGTGTGAAAGGAGGTATGAATGTTAATAACAACACT
GAACTCAAGTGTTCAACAGAAACTGGATCCATCTTAACCAATCACTTCTAATACAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGGLLHQPCSVALCKGFHEDDWGKGGEYDYNLASSTSSFEDSSNSSDDACSSTSNSSSPSNGALEDFTELFAQLPIKRGLSMFYEGKSQSFTSLSSVRSIEDLPKKRSPY
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