; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh01G001810 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh01G001810
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionDefective in cullin neddylation protein
Genome locationCmo_Chr01:790026..794017
RNA-Seq ExpressionCmoCh01G001810
SyntenyCmoCh01G001810
Gene Ontology termsGO:0045116 - protein neddylation (biological process)
GO:0051443 - positive regulation of ubiquitin-protein transferase activity (biological process)
GO:0000151 - ubiquitin ligase complex (cellular component)
GO:0031624 - ubiquitin conjugating enzyme binding (molecular function)
GO:0032182 - ubiquitin-like protein binding (molecular function)
GO:0097602 - cullin family protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR005176 - Potentiating neddylation domain
IPR011992 - EF-hand domain pair
IPR014764 - Defective-in-cullin neddylation protein
IPR042460 - DCN1-like, PONY binding domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6606827.1 DCN1-like protein 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.1e-120100Show/hide
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KAG7036533.1 DCN1-like protein 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.7e-125100Show/hide
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XP_022948455.1 DCN1-like protein 4 [Cucurbita moschata]1.7e-125100Show/hide
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XP_022997694.1 DCN1-like protein 4 [Cucurbita maxima]3.1e-12499.13Show/hide
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XP_023523784.1 DCN1-like protein 4 [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.2e-12599.13Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KYL5 Defective in cullin neddylation protein2.9e-11590.79Show/hide
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A0A1S4DZM9 Defective in cullin neddylation protein2.0e-11691.67Show/hide
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A0A6J1DKL7 Defective in cullin neddylation protein8.9e-11792.11Show/hide
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A0A6J1G9W7 Defective in cullin neddylation protein8.0e-126100Show/hide
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A0A6J1KCA5 Defective in cullin neddylation protein1.5e-12499.13Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q1RMX9 DCN1-like protein 55.9e-3338.5Show/hide
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         Q+S+DI++   +L L+LG  +    + F +YL+ QS Y+V+N DQW     F   ++  DLSNYD + AWP++LD FVEW + +Q+
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Q5PPL2 DCN1-like protein 55.9e-3338.5Show/hide
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        FY YA     ++ PEG+E  C D+ V+  ++ +L+LAWK++AE  G+F  EEW +G+ SL+ D   KL+     L  ++   S+F + Y YAF +   ++
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         Q+S+DI++   +L L+LG  +    + F +YL+ QS Y+V+N DQW     F   ++  DLSNYD + AWP++LD FVEW + +Q+
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Q92564 DCN1-like protein 41.5e-3338.79Show/hide
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        R  R+    +  S   S  D ++R   S     E E  +S      FY YA  +  ++ PEG+E  C D+ V+  +V +L+LAWK+ A+  GYF L+EW 
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        +G+ SL+ DT  KL+  L  L   +   +NF   Y YAF +   E+ Q+S+DI +   +L L+LG +       F ++L+ QS YKVIN DQW     F 
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          IN  DLSNYD + AWP++LD FVEW + KQ
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Q9BTE7 DCN1-like protein 54.5e-3338.5Show/hide
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        FY YA     ++ PEG+E  C D+ V+  ++ +L+LAWK++AE  G+F  EEW +G+ SL+ D   KL+     L  ++   S+F + Y YAF +   ++
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         Q+S+DI++   +L L+LG  +    + F +YL+ QS Y+V+N DQW     F   ++  DLSNYD + AWP++LD FVEW + +Q+
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Q9CXV9 DCN1-like protein 55.9e-3338.5Show/hide
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        FY YA     ++ PEG+E  C D+ V+  ++ +L+LAWK++AE  G+F  EEW +G+ SL+ D   KL+     L  ++   S+F + Y YAF +   ++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G15860.1 Domain of unknown function (DUF298)1.3e-9673.8Show/hide
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AT1G15860.2 Domain of unknown function (DUF298)1.3e-9673.8Show/hide
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AT1G15860.3 Domain of unknown function (DUF298)2.8e-9471.01Show/hide
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Query:  SLKADTVSKLKKALPDLEKEVRRPSNFVDFYSYAFRYCLTEEKQKSIDIESICELLNLVLGSQFHAQVNSFVEYLK---------IQSDYKVINMDQWMG
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Query:  FFRFCNEINFPDLSNYDSELAWPLILDNFVEWLQAKQS
         +RFCNEI+FPD+ +Y+ ELAWPLILDNFVEW+Q KQ+
Subjt:  FFRFCNEINFPDLSNYDSELAWPLILDNFVEWLQAKQS

AT3G12760.1 CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Defective-in-cullin neddylation protein (InterPro:IPR014764), Protein of unknown function DUF298 (InterPro:IPR005176), UBA-like (InterPro:IPR009060)6.5e-2731.9Show/hide
Query:  SAVDLFRS-ASSKASTKELERINSLFYSYANASSGLIDPEGIETLCSDMEVDHTDVRILMLAWKMKAEKQGYFNLEEWRRGLKSLKADTVSKLKKALPDL
        +A D+F S    +++  E+ R+  L+  Y +  S +I  EGI  LC+D+EV+  D+  L+L+W M A     F+ +E+  GL++L  D++ KL++ LP +
Subjt:  SAVDLFRS-ASSKASTKELERINSLFYSYANASSGLIDPEGIETLCSDMEVDHTDVRILMLAWKMKAEKQGYFNLEEWRRGLKSLKADTVSKLKKALPDL

Query:  EKEVRRPSNFVDFYSYAFRYCLTEEKQKSIDIESICELLNLVLGSQFHAQVNSFVEYLKIQSDYKVINMDQWMGFFRFCNEINFPDLSNYDSELAWPLIL
          E++    F + Y++AF +   E+ QKS+ +++   +  L+   +    V  + ++L+ + + K I+ D W     F   ++ P LSNYD+E AWP ++
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Query:  DNFVEWLQAK
        D FVE+L  K
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AT3G28970.1 Domain of unknown function (DUF298)1.3e-0631.63Show/hide
Query:  SNFVDFYSYAFRYCLTEEKQKSIDIESICELLNLVLGSQFHAQVNSFVEYLKIQSDYKVINMDQWMGFFRFCNEINFPDLSNYDSELAWPLILDNFVE
        + F  FY + F  C  E  QK+I I        LVL  +F   +N + ++++    +  I+ D W     F   ++  +L  YDSE AWP+++D+FVE
Subjt:  SNFVDFYSYAFRYCLTEEKQKSIDIESICELLNLVLGSQFHAQVNSFVEYLKIQSDYKVINMDQWMGFFRFCNEINFPDLSNYDSELAWPLILDNFVE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCGGCGTACTACAAGGAAAACCGGTCAACCAAATTCAACTTCCGTTAATTCTTCCGCCGTGGATCTCTTTCGTTCCGCCTCAAGTAAAGCAAGCACAAAAGAGTTGGA
ACGGATCAATAGCCTATTTTACTCATATGCCAATGCCTCTTCTGGTTTGATCGATCCAGAAGGAATTGAAACTCTTTGTTCAGACATGGAAGTGGATCACACTGATGTAA
GGATCTTGATGCTTGCTTGGAAAATGAAAGCTGAAAAACAGGGATACTTTAACCTGGAGGAATGGCGTAGAGGCCTCAAATCCCTGAAGGCTGACACTGTTAGTAAACTA
AAGAAGGCACTACCAGATCTCGAGAAAGAGGTAAGGAGGCCATCAAATTTTGTGGACTTCTATTCATATGCATTTCGGTATTGTTTAACAGAGGAGAAGCAAAAGAGTAT
TGACATAGAGAGTATATGCGAGCTGCTGAATCTTGTTTTAGGGTCTCAGTTTCATGCTCAAGTCAATTCATTTGTTGAATACTTGAAGATACAAAGTGACTATAAGGTTA
TTAATATGGATCAATGGATGGGATTCTTTCGGTTCTGCAATGAGATAAATTTTCCGGACCTGAGCAATTACGATTCGGAACTTGCTTGGCCGTTGATCCTCGACAATTTT
GTTGAATGGTTACAAGCAAAACAAAGTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAGGAAAGCCGAAGTTTTGTTCTTGCTCTTATATTTCCTCTATTCTCCGATTTGGTGCGATAAAAATCAATCTTCTTCTTTGCTTTCTCATAGTATCTCCTCCATTGCAA
TCGAATTGCGGAAGAAGAAGATGCGGCGTACTACAAGGAAAACCGGTCAACCAAATTCAACTTCCGTTAATTCTTCCGCCGTGGATCTCTTTCGTTCCGCCTCAAGTAAA
GCAAGCACAAAAGAGTTGGAACGGATCAATAGCCTATTTTACTCATATGCCAATGCCTCTTCTGGTTTGATCGATCCAGAAGGAATTGAAACTCTTTGTTCAGACATGGA
AGTGGATCACACTGATGTAAGGATCTTGATGCTTGCTTGGAAAATGAAAGCTGAAAAACAGGGATACTTTAACCTGGAGGAATGGCGTAGAGGCCTCAAATCCCTGAAGG
CTGACACTGTTAGTAAACTAAAGAAGGCACTACCAGATCTCGAGAAAGAGGTAAGGAGGCCATCAAATTTTGTGGACTTCTATTCATATGCATTTCGGTATTGTTTAACA
GAGGAGAAGCAAAAGAGTATTGACATAGAGAGTATATGCGAGCTGCTGAATCTTGTTTTAGGGTCTCAGTTTCATGCTCAAGTCAATTCATTTGTTGAATACTTGAAGAT
ACAAAGTGACTATAAGGTTATTAATATGGATCAATGGATGGGATTCTTTCGGTTCTGCAATGAGATAAATTTTCCGGACCTGAGCAATTACGATTCGGAACTTGCTTGGC
CGTTGATCCTCGACAATTTTGTTGAATGGTTACAAGCAAAACAAAGTTAAAAAACCGAATGTCTTCATCATACATTGTATACTCCCACAGTCGTTGAAGGCTCGCTTGGT
TGGATTACACATTGCATAGCAGCAGAATTTTCACTTATTATTCTTTCTTTCACTGTTCTAACTTCTTTGAAATCGAGGATGATTCCCATTCTTATGCTAAAGTTATAATT
TCAAACATTCATGGATGATTCTGCTAAAGTTTCCTCCCAAGTCCCCCACCCTGTTTTTTTTTTGGTATCCATTCTTCATCTTAGCCCTCCAATTGACTTGACTATTTTAC
TTTTACTTGTAAGAACAGCTCAAGCTGAAAATTTTCTAACAGGATAAGTGTTGGAATATTTTTATTGCCTTTTTGAACACTTATTTGG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRRTTRKTGQPNSTSVNSSAVDLFRSASSKASTKELERINSLFYSYANASSGLIDPEGIETLCSDMEVDHTDVRILMLAWKMKAEKQGYFNLEEWRRGLKSLKADTVSKL
KKALPDLEKEVRRPSNFVDFYSYAFRYCLTEEKQKSIDIESICELLNLVLGSQFHAQVNSFVEYLKIQSDYKVINMDQWMGFFRFCNEINFPDLSNYDSELAWPLILDNF
VEWLQAKQS