; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh01G004740 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh01G004740
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Description50S ribosomal protein L7/L12
Genome locationCmo_Chr01:2264307..2264888
RNA-Seq ExpressionCmoCh01G004740
SyntenyCmoCh01G004740
Gene Ontology termsGO:0006412 - translation (biological process)
GO:0005840 - ribosome (cellular component)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
InterPro domainsIPR000206 - Ribosomal protein L7/L12
IPR013823 - Ribosomal protein L7/L12, C-terminal
IPR014719 - Ribosomal protein L7/L12, C-terminal/adaptor protein ClpS-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6607092.1 50S ribosomal protein L7/L12, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.0e-9798.45Show/hide
Query:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGLLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
        MKMIAVAQSLQARSTLPKIIG LQVRFFQPDFTPRDPNAKPK+YKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
Subjt:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGLLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD

Query:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME
        GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVM+
Subjt:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME

KAG7036781.1 50S ribosomal protein L7/L12, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]8.0e-9798.45Show/hide
Query:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGLLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
        MKMIAVAQSLQARSTLPKIIG LQVRFFQPDFTPRDPNAKPK+YKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
Subjt:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGLLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD

Query:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME
        GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVM+
Subjt:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME

XP_022949504.1 uncharacterized protein LOC111452831 [Cucurbita moschata]3.2e-98100Show/hide
Query:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGLLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
        MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGLLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
Subjt:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGLLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD

Query:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME
        GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME
Subjt:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME

XP_022998047.1 uncharacterized protein LOC111492812 [Cucurbita maxima]6.8e-9697.93Show/hide
Query:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGLLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
        MKMI VAQSLQARS LPKIIGLLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
Subjt:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGLLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD

Query:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME
        GMD+GS GGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME
Subjt:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME

XP_023525921.1 uncharacterized protein LOC111789392 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.0e-9698.45Show/hide
Query:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGLLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
        MKMIAVAQSLQARSTLPKIIG LQVRFFQPDFTPRDPNAKPK+YKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGP LTERLKHPKLEQISVD
Subjt:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGLLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD

Query:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME
        GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME
Subjt:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BPI3 50S ribosomal protein L7/L126.4e-8486.53Show/hide
Query:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGLLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
        MK+  VA+SLQARSTL KIIGL QVRFFQPDFTPRDP AKPK+YKYPPFYDPYGPRPPPS+KII LAERIAALP  ER QIGP L E+L+HPKL++ISVD
Subjt:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGLLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD

Query:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME
        G+DMGS GGAA GSS VEEKKEKTAFDVKLEKF+AA+KIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEAN IIEKIKAAGGVAVME
Subjt:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME

A0A5A7U2A3 50S ribosomal protein L7/L126.4e-8486.53Show/hide
Query:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGLLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
        MK+  VA+SLQARSTL KIIGL QVRFFQPDFTPRDP AKPK+YKYPPFYDPYGPRPPPS+KII LAERIAALP  ER QIGP L E+L+HPKL++ISVD
Subjt:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGLLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD

Query:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME
        G+DMGS GGAA GSS VEEKKEKTAFDVKLEKF+AA+KIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEAN IIEKIKAAGGVAVME
Subjt:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME

A0A6J1DM08 uncharacterized protein LOC1110222078.1e-8787.56Show/hide
Query:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGLLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
        MK++AVA+SLQ  STLPK+IG  QVRFFQPDF PRD  AKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPS+KIIQLAE+I ALPVDERCQIGPALTERL+HPKL+ ISVD
Subjt:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGLLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD

Query:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME
        G+DMGS GGA  GSSKVEEKKEKTAFDVKLEKF+AAAKIKVIKEVR+FTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEAN IIEKIKAAGGVAVME
Subjt:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME

A0A6J1GD07 uncharacterized protein LOC1114528311.6e-98100Show/hide
Query:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGLLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
        MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGLLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
Subjt:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGLLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD

Query:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME
        GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME
Subjt:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME

A0A6J1K6S5 uncharacterized protein LOC1114928123.3e-9697.93Show/hide
Query:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGLLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
        MKMI VAQSLQARS LPKIIGLLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
Subjt:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGLLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD

Query:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME
        GMD+GS GGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME
Subjt:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2C031 50S ribosomal protein L7/L124.4e-1349.41Show/hide
Query:  GAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME
        GAA G    +  +EKT F+V LE F+A++KIKV+KEVR  T LGL EAK LVE  P  +K+G TKE+A ++ + I+A GG   ++
Subjt:  GAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME

A9BDG4 50S ribosomal protein L7/L123.9e-1438.81Show/hide
Query:  SNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVDGMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDL
        S K  ++ + + +L + E  ++   + E           V     G+GGGA   S+  E  +EKT FDV LE F+AAAKIKV+KEVR  T LGL EAK +
Subjt:  SNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVDGMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDL

Query:  VEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME
        VE  P  +K+G +KE+A ++ + I+A GG   ++
Subjt:  VEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME

P41189 50S ribosomal protein L7/L121.1e-1337.12Show/hide
Query:  NKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVDGMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLV
        + I  + E++++L + +  ++   L E         ++V     G    A           EKT F+V LE F+A  KI VIKEVRA T LGLKEAKD V
Subjt:  NKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVDGMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLV

Query:  EKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVM
        E  P  LK GV+K+EA  + +K++AAG   ++
Subjt:  EKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVM

Q2JM48 50S ribosomal protein L7/L123.3e-1338.76Show/hide
Query:  PSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVDGMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKD
        PS ++ ++ E + AL + E  ++  A+ E              M       AA  ++  E  +E+TAFDV LE   A  KI ++K VR  T LGLK+AKD
Subjt:  PSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVDGMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKD

Query:  LVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAG
        LVE  P  +K+GV KEEAN I +K++ AG
Subjt:  LVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAG

Q46HH2 50S ribosomal protein L7/L122.0e-1350.59Show/hide
Query:  GAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME
        GAA G    +  +EKT F+V LE FEA++KIKV+KEVR  T LGL EAK LVE  P  +K+G TKE+A ++ + I+A GG   ++
Subjt:  GAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G70190.1 Ribosomal protein L7/L12, oligomerisation;Ribosomal protein L7/L12, C-terminal/adaptor protein ClpS-like6.4e-2845.45Show/hide
Query:  PPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISV------DGMDMGSGGGAATGSSKVEEKK-EKTAFDVKLEKFEAAAKI
        P  +DP   R PP++++ +L + I++L + E  ++G  + ++    +L  ++V       G+ +G GGG  + S   EE K EKT F++KLE FEA+AKI
Subjt:  PPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISV------DGMDMGSGGGAATGSSKVEEKK-EKTAFDVKLEKFEAAAKI

Query:  KVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME
        K+IKE+R+FT+LGLKEAK LVEK PAILK G++KEE   I+EK+KA G   V+E
Subjt:  KVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME

AT1G70190.2 Ribosomal protein L7/L12, oligomerisation;Ribosomal protein L7/L12, C-terminal/adaptor protein ClpS-like6.4e-2845.45Show/hide
Query:  PPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISV------DGMDMGSGGGAATGSSKVEEKK-EKTAFDVKLEKFEAAAKI
        P  +DP   R PP++++ +L + I++L + E  ++G  + ++    +L  ++V       G+ +G GGG  + S   EE K EKT F++KLE FEA+AKI
Subjt:  PPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISV------DGMDMGSGGGAATGSSKVEEKK-EKTAFDVKLEKFEAAAKI

Query:  KVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME
        K+IKE+R+FT+LGLKEAK LVEK PAILK G++KEE   I+EK+KA G   V+E
Subjt:  KVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME

AT3G06040.1 Ribosomal protein L12/ ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS family protein1.4e-5965.28Show/hide
Query:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGLLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
        MK+I++ +++++R   P++I  +QVRF Q D   +   AKPK+YKYP  YDPYGPRP PS+KI++LAERIAAL  +ER QIGPAL E L+ PK + IS D
Subjt:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGLLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD

Query:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME
        G+    G    TG+  VEEKKEKTAFDVKLEKF A+ KIKVIKEVR FT+LGLKEAK+LVEKVPAILKQGVTKEEAN II KIKA GG+AVME
Subjt:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME

AT3G06040.2 Ribosomal protein L12/ ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS family protein1.4e-5965.28Show/hide
Query:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGLLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
        MK+I++ +++++R   P++I  +QVRF Q D   +   AKPK+YKYP  YDPYGPRP PS+KI++LAERIAAL  +ER QIGPAL E L+ PK + IS D
Subjt:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGLLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD

Query:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME
        G+    G    TG+  VEEKKEKTAFDVKLEKF A+ KIKVIKEVR FT+LGLKEAK+LVEKVPAILKQGVTKEEAN II KIKA GG+AVME
Subjt:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME

AT3G06040.3 Ribosomal protein L12/ ATP-dependent Clp protease adaptor protein ClpS family protein1.4e-5965.28Show/hide
Query:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGLLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD
        MK+I++ +++++R   P++I  +QVRF Q D   +   AKPK+YKYP  YDPYGPRP PS+KI++LAERIAAL  +ER QIGPAL E L+ PK + IS D
Subjt:  MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGLLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVD

Query:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME
        G+    G    TG+  VEEKKEKTAFDVKLEKF A+ KIKVIKEVR FT+LGLKEAK+LVEKVPAILKQGVTKEEAN II KIKA GG+AVME
Subjt:  GMDMGSGGGAATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAGATGATTGCAGTTGCACAATCCCTTCAAGCCCGTTCCACACTTCCTAAAATCATTGGGTTGTTGCAGGTCCGCTTCTTCCAGCCTGATTTTACTCCCAGAGACCC
GAATGCCAAGCCAAAAAGATACAAGTATCCACCTTTTTATGATCCATATGGCCCTAGGCCCCCACCCTCTAATAAAATCATTCAGCTAGCTGAAAGAATTGCAGCACTGC
CTGTCGATGAGCGTTGCCAGATTGGTCCCGCACTCACTGAAAGGCTTAAACATCCTAAGCTGGAGCAAATTTCAGTTGATGGTATGGACATGGGTTCCGGAGGAGGAGCA
GCCACAGGATCTTCCAAAGTAGAGGAGAAAAAGGAGAAAACCGCTTTCGACGTGAAGTTAGAGAAGTTCGAGGCAGCTGCCAAAATTAAGGTGATTAAAGAAGTGAGGGC
TTTCACTAATTTGGGTCTGAAAGAGGCAAAAGACTTAGTAGAGAAAGTACCTGCAATTCTTAAGCAAGGAGTGACCAAGGAGGAAGCGAACAGCATTATCGAAAAAATCA
AAGCTGCTGGAGGGGTTGCAGTCATGGAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAAGATGATTGCAGTTGCACAATCCCTTCAAGCCCGTTCCACACTTCCTAAAATCATTGGGTTGTTGCAGGTCCGCTTCTTCCAGCCTGATTTTACTCCCAGAGACCC
GAATGCCAAGCCAAAAAGATACAAGTATCCACCTTTTTATGATCCATATGGCCCTAGGCCCCCACCCTCTAATAAAATCATTCAGCTAGCTGAAAGAATTGCAGCACTGC
CTGTCGATGAGCGTTGCCAGATTGGTCCCGCACTCACTGAAAGGCTTAAACATCCTAAGCTGGAGCAAATTTCAGTTGATGGTATGGACATGGGTTCCGGAGGAGGAGCA
GCCACAGGATCTTCCAAAGTAGAGGAGAAAAAGGAGAAAACCGCTTTCGACGTGAAGTTAGAGAAGTTCGAGGCAGCTGCCAAAATTAAGGTGATTAAAGAAGTGAGGGC
TTTCACTAATTTGGGTCTGAAAGAGGCAAAAGACTTAGTAGAGAAAGTACCTGCAATTCTTAAGCAAGGAGTGACCAAGGAGGAAGCGAACAGCATTATCGAAAAAATCA
AAGCTGCTGGAGGGGTTGCAGTCATGGAGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKMIAVAQSLQARSTLPKIIGLLQVRFFQPDFTPRDPNAKPKRYKYPPFYDPYGPRPPPSNKIIQLAERIAALPVDERCQIGPALTERLKHPKLEQISVDGMDMGSGGGA
ATGSSKVEEKKEKTAFDVKLEKFEAAAKIKVIKEVRAFTNLGLKEAKDLVEKVPAILKQGVTKEEANSIIEKIKAAGGVAVME