; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh01G005510 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh01G005510
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionzf-RVT domain-containing protein
Genome locationCmo_Chr01:2746793..2749614
RNA-Seq ExpressionCmoCh01G005510
SyntenyCmoCh01G005510
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022948420.1 uncharacterized protein LOC111452109 [Cucurbita moschata]5.4e-7690.8Show/hide
Query:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEVGFRSKTPFICHYH
        MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKE+  R      C   
Subjt:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEVGFRSKTPFICHYH

Query:  IESNCGGSGLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
           +CGGSGLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
Subjt:  IESNCGGSGLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS

XP_022998903.1 uncharacterized protein LOC111493423 [Cucurbita maxima]7.3e-7387.93Show/hide
Query:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEVGFRSKTPFICHYH
        MELTLPTPLFASSSKIIRDPK INHGLRL D+NPISADLKLQGGRRTL IASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEA+E+  R      C   
Subjt:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEVGFRSKTPFICHYH

Query:  IESNCGGSGLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
           +CGGSGLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
Subjt:  IESNCGGSGLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS

XP_023522036.1 uncharacterized protein LOC111785907, partial [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.5e-6587.97Show/hide
Query:  IRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEVGFRSKTPFICHYHIESNCGGSGLCSECKG
        IRDPK INHGLRL D+NPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKE+  R      C      +CGGSGLCSECKG
Subjt:  IRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEVGFRSKTPFICHYHIESNCGGSGLCSECKG

Query:  EGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
        EGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
Subjt:  EGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS

XP_023522425.1 uncharacterized protein LOC111786358, partial [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.6e-6686.88Show/hide
Query:  KIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEVGFRSKTPFICHYHIESNCGGSGLCSEC
        ++IRDPK INHGLRL D+NPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKE+  R      C      +CGGSGLCSEC
Subjt:  KIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEVGFRSKTPFICHYHIESNCGGSGLCSEC

Query:  KGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
        KGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
Subjt:  KGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS

XP_023525360.1 uncharacterized protein LOC111788983 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.9e-7489.08Show/hide
Query:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEVGFRSKTPFICHYH
        MELTLPTPLFASSSKIIRDPK INHGLRL D+NPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKE+  R      C   
Subjt:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEVGFRSKTPFICHYH

Query:  IESNCGGSGLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
           +CGGSGLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
Subjt:  IESNCGGSGLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LVE3 Uncharacterized protein6.0e-6581.03Show/hide
Query:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEVGFRSKTPFICHYH
        MELTLPTPLF S  KI+R+ K  N+GL LLD+NP+SAD+KLQGGRRTL IASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNK+SEA EV      P I    
Subjt:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEVGFRSKTPFICHYH

Query:  IESNCGGSGLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
           +CGGSGLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGG+GT NS
Subjt:  IESNCGGSGLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS

A0A1S3CIP4 uncharacterized protein LOC103501412 isoform X23.9e-6480.46Show/hide
Query:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEVGFRSKTPFICHYH
        MELTLPTPLF S  KI+R  K  NHGL LL++ P+SAD+KLQGGRRTL IASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEA EV      P I    
Subjt:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEVGFRSKTPFICHYH

Query:  IESNCGGSGLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
           +CGGSGLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGG+GT +S
Subjt:  IESNCGGSGLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS

A0A1S3CJ25 uncharacterized protein LOC103501412 isoform X12.8e-6277.22Show/hide
Query:  MELTLPTPLF------ASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEVGFRSKTP
        MELTLPTPLF       SS +++R  K  NHGL LL++ P+SAD+KLQGGRRTL IASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEA EV      P
Subjt:  MELTLPTPLF------ASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEVGFRSKTP

Query:  FICHYHIESNCGGSGLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
         I       +CGGSGLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGG+GT +S
Subjt:  FICHYHIESNCGGSGLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS

A0A6J1G9T1 uncharacterized protein LOC1114521092.6e-7690.8Show/hide
Query:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEVGFRSKTPFICHYH
        MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKE+  R      C   
Subjt:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEVGFRSKTPFICHYH

Query:  IESNCGGSGLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
           +CGGSGLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
Subjt:  IESNCGGSGLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS

A0A6J1KI37 uncharacterized protein LOC1114934233.5e-7387.93Show/hide
Query:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEVGFRSKTPFICHYH
        MELTLPTPLFASSSKIIRDPK INHGLRL D+NPISADLKLQGGRRTL IASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEA+E+  R      C   
Subjt:  MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEVGFRSKTPFICHYH

Query:  IESNCGGSGLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
           +CGGSGLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS
Subjt:  IESNCGGSGLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G45050.1 unknown protein1.6e-2249.64Show/hide
Query:  FASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRR-NKDSEAKEVGFRSKTPFICHYHIESNCGGS
        F SS   ++D + +N  L+             Q  +R+  +  +L ETA S+AIAATVVG AAT L RR NK SE  E   +      C       C GS
Subjt:  FASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRR-NKDSEAKEVGFRSKTPFICHYHIESNCGGS

Query:  GLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTA
        G+C ECKGEGFVLKKLSD NAE+ARLAAKNMATR+TA
Subjt:  GLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTA

AT3G45050.2 unknown protein4.9e-3553.7Show/hide
Query:  FASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRR-NKDSEAKEVGFRSKTPFICHYHIESNCGGS
        F SS   ++D + +N  L+             Q  +R+  +  +L ETA S+AIAATVVG AAT L RR NK SE  E   +      C       C GS
Subjt:  FASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRR-NKDSEAKEVGFRSKTPFICHYHIESNCGGS

Query:  GLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTG
        G+C ECKGEGFVLKKLSD NAE+ARLAAKNMATR+TA LPKKWSYC+KCSS RSC  CGG+G
Subjt:  GLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTG

AT3G45050.3 unknown protein4.9e-3553.7Show/hide
Query:  FASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRR-NKDSEAKEVGFRSKTPFICHYHIESNCGGS
        F SS   ++D + +N  L+             Q  +R+  +  +L ETA S+AIAATVVG AAT L RR NK SE  E   +      C       C GS
Subjt:  FASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRR-NKDSEAKEVGFRSKTPFICHYHIESNCGGS

Query:  GLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTG
        G+C ECKGEGFVLKKLSD NAE+ARLAAKNMATR+TA LPKKWSYC+KCSS RSC  CGG+G
Subjt:  GLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTG

AT3G45050.4 unknown protein4.9e-3553.7Show/hide
Query:  FASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRR-NKDSEAKEVGFRSKTPFICHYHIESNCGGS
        F SS   ++D + +N  L+             Q  +R+  +  +L ETA S+AIAATVVG AAT L RR NK SE  E   +      C       C GS
Subjt:  FASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRR-NKDSEAKEVGFRSKTPFICHYHIESNCGGS

Query:  GLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTG
        G+C ECKGEGFVLKKLSD NAE+ARLAAKNMATR+TA LPKKWSYC+KCSS RSC  CGG+G
Subjt:  GLCSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTG


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGCTGACTCTGCCTACACCCTTGTTTGCCTCCTCCTCCAAGATAATTAGGGATCCTAAGCTAATCAACCATGGACTTCGGTTGTTGGACACCAATCCTATTTCAGC
CGATTTGAAGCTACAAGGAGGGAGAAGAACACTGCCTATAGCTTCTTCCCTACCTGAAACAGCTGCTTCTGTGGCCATTGCTGCTACAGTTGTAGGTGCAGCAGCCACCT
TCCTTTCCAGAAGAAACAAAGATTCTGAGGCGAAGGAGGTTGGCTTCAGATCTAAAACACCATTTATATGCCATTATCATATAGAATCAAACTGTGGAGGTTCAGGCCTG
TGTTCTGAATGCAAAGGTGAAGGGTTTGTGCTGAAGAAACTGTCGGATGAAAATGCAGAGCGGGCACGGTTGGCTGCGAAGAACATGGCCACTCGGTTCACCGCAGCGCT
TCCTAAAAAATGGAGCTACTGTTCCAAGTGTTCTTCTGCTCGTTCTTGTAGTACTTGTGGTGGCACGGGGACGTTCAACTCTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TGTTCCCAATATCTCTGATGAAGATAAGGGACCCAAGAATAGCGGAACAAGAAGCAGGTAGAGAATTTTCTTTGTTCTGCGCGAAAGAACTCACAATTCCTTCTCAATGG
AGCTGACTCTGCCTACACCCTTGTTTGCCTCCTCCTCCAAGATAATTAGGGATCCTAAGCTAATCAACCATGGACTTCGGTTGTTGGACACCAATCCTATTTCAGCCGAT
TTGAAGCTACAAGGAGGGAGAAGAACACTGCCTATAGCTTCTTCCCTACCTGAAACAGCTGCTTCTGTGGCCATTGCTGCTACAGTTGTAGGTGCAGCAGCCACCTTCCT
TTCCAGAAGAAACAAAGATTCTGAGGCGAAGGAGGTTGGCTTCAGATCTAAAACACCATTTATATGCCATTATCATATAGAATCAAACTGTGGAGGTTCAGGCCTGTGTT
CTGAATGCAAAGGTGAAGGGTTTGTGCTGAAGAAACTGTCGGATGAAAATGCAGAGCGGGCACGGTTGGCTGCGAAGAACATGGCCACTCGGTTCACCGCAGCGCTTCCT
AAAAAATGGAGCTACTGTTCCAAGTGTTCTTCTGCTCGTTCTTGTAGTACTTGTGGTGGCACGGGGACGTTCAACTCTTAGTCTTACAACCCGACAAACTCCTTATATCT
CCGCATATTTTTCTGTCTCGTAAATTTCTCTCATTAGGAGTGTTCATAAGAATTCGATGACTCACAAAATTTAATCAACCCAATCTAATTCCTATGACTTGAATGGGGTT
GAGTTCAAATAAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MELTLPTPLFASSSKIIRDPKLINHGLRLLDTNPISADLKLQGGRRTLPIASSLPETAASVAIAATVVGAAATFLSRRNKDSEAKEVGFRSKTPFICHYHIESNCGGSGL
CSECKGEGFVLKKLSDENAERARLAAKNMATRFTAALPKKWSYCSKCSSARSCSTCGGTGTFNS