| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG7036964.1 DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma] | 6.5e-53 | 100 | Show/hide |
Query: MEHGSFTDESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHKLTKPVGD
MEHGSFTDESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHKLTKPVGD
Subjt: MEHGSFTDESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHKLTKPVGD
Query: INIK
INIK
Subjt: INIK
|
|
| XP_022150895.1 DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2 [Momordica charantia] | 2.8e-48 | 91.35 | Show/hide |
Query: MEHGSFTDESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHKLTKPVGD
MEHGSF+DESKSTFSMADEDHTLAN++RYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGD AREVLKD+CQNLM VCQHVRNT DK+VLD KLTKPVGD
Subjt: MEHGSFTDESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHKLTKPVGD
Query: INIK
INIK
Subjt: INIK
|
|
| XP_022948356.1 DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2 [Cucurbita moschata] | 6.5e-53 | 100 | Show/hide |
Query: MEHGSFTDESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHKLTKPVGD
MEHGSFTDESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHKLTKPVGD
Subjt: MEHGSFTDESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHKLTKPVGD
Query: INIK
INIK
Subjt: INIK
|
|
| XP_023522054.1 DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2-like [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 1.4e-52 | 99.04 | Show/hide |
Query: MEHGSFTDESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHKLTKPVGD
MEHGSFTDE+KSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHKLTKPVGD
Subjt: MEHGSFTDESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHKLTKPVGD
Query: INIK
INIK
Subjt: INIK
|
|
| XP_038893936.1 DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2 [Benincasa hispida] | 8.8e-50 | 94.23 | Show/hide |
Query: MEHGSFTDESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHKLTKPVGD
MEHGSFTDE+KSTFSMADEDHTLAN++RYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLM VCQHVRNT DKAVLD KLTKPVGD
Subjt: MEHGSFTDESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHKLTKPVGD
Query: INIK
INIK
Subjt: INIK
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0LUT5 RNA_pol_L_2 domain-containing protein | 4.0e-48 | 91.35 | Show/hide |
Query: MEHGSFTDESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHKLTKPVGD
MEHGSFTDE+KSTFS+ADEDHTLAN++RYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLM VCQHVRNT DKAVLD KLT PV D
Subjt: MEHGSFTDESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHKLTKPVGD
Query: INIK
INIK
Subjt: INIK
|
|
| A0A0A0LV21 RNA_pol_L_2 domain-containing protein | 5.8e-47 | 88.89 | Show/hide |
Query: MEHGSFTDESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHKLT----K
MEHGSFTDE+KSTFSMADEDHTLAN++R TLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLM VCQHVRNT DKAVLD LT K
Subjt: MEHGSFTDESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHKLT----K
Query: PVGDINIK
PVGDINIK
Subjt: PVGDINIK
|
|
| A0A6J1D9Q8 DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2 | 1.4e-48 | 91.35 | Show/hide |
Query: MEHGSFTDESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHKLTKPVGD
MEHGSF+DESKSTFSMADEDHTLAN++RYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGD AREVLKD+CQNLM VCQHVRNT DK+VLD KLTKPVGD
Subjt: MEHGSFTDESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHKLTKPVGD
Query: INIK
INIK
Subjt: INIK
|
|
| A0A6J1G901 DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2 | 3.2e-53 | 100 | Show/hide |
Query: MEHGSFTDESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHKLTKPVGD
MEHGSFTDESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHKLTKPVGD
Subjt: MEHGSFTDESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHKLTKPVGD
Query: INIK
INIK
Subjt: INIK
|
|
| A0A6J1KDK3 DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2 | 3.2e-53 | 100 | Show/hide |
Query: MEHGSFTDESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHKLTKPVGD
MEHGSFTDESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHKLTKPVGD
Subjt: MEHGSFTDESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHKLTKPVGD
Query: INIK
INIK
Subjt: INIK
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| P0DPB6 DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2 | 2.3e-16 | 42.55 | Show/hide |
Query: MEHGSFTDESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGD-PAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHK
M + TD TF + +EDHTL NS+RY + ++P V FCGY+ HPS++++N+R+QT G PA E + LM VCQHV + + ++ D+K
Subjt: MEHGSFTDESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGD-PAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHK
|
|
| P97304 DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2 | 1.9e-15 | 40.21 | Show/hide |
Query: MEHGSFTDESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGD-PAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHKLTK
M + TD TF + +EDHTL N +RY + ++P V FCGY+ HPS++++N+R+QT G PA E + L+ VCQHV + ++ D+K K
Subjt: MEHGSFTDESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGD-PAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHKLTK
|
|
| Q1RMG8 DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2 | 8.6e-16 | 41.49 | Show/hide |
Query: MEHGSFTDESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGD-PAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHK
M + TD TF + +EDHTL NS+RY + ++P V FCGY+ HPS++++N+R+QT G PA E + +LM VCQHV + + ++ ++K
Subjt: MEHGSFTDESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGD-PAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHK
|
|
| Q5XK67 DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2 | 2.7e-17 | 46.67 | Show/hide |
Query: DESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQT-TGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHKLTK
+ES TF + +EDHTL NS+RY + ++P V FCGYSI HPS+ ++N R+QT G PA E + L+ VCQHV NT + ++ ++K K
Subjt: DESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQT-TGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHKLTK
|
|
| Q6DRI4 DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2 | 1.5e-15 | 45.98 | Show/hide |
Query: DESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQT-TGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHK
DE TF + +EDHTL NS+RY + + V FCGYSI HPS++++N R+QT G PA E L++ NL VC+HV T + + + K
Subjt: DESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQT-TGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHK
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT2G29540.1 RNApolymerase 14 kDa subunit | 5.2e-32 | 65.59 | Show/hide |
Query: MEHGSFTDESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHK
MEHGSFT+ S ++F++++EDHTLAN++R+ LNQDPRVT Y+IPHPS +VNIRVQTTGDPAREV KDACQ LM + +HVR+ DKAV ++K
Subjt: MEHGSFTDESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHK
|
|
| AT2G29540.2 RNApolymerase 14 kDa subunit | 5.2e-32 | 65.59 | Show/hide |
Query: MEHGSFTDESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHK
MEHGSFT+ S ++F++++EDHTLAN++R+ LNQDPRVT Y+IPHPS +VNIRVQTTGDPAREV KDACQ LM + +HVR+ DKAV ++K
Subjt: MEHGSFTDESKSTFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHK
|
|
| AT2G29540.3 RNApolymerase 14 kDa subunit | 9.5e-18 | 67.8 | Show/hide |
Query: PRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHK
PRVT Y+IPHPS +VNIRVQTTGDPAREV KDACQ LM + +HVR+ DKAV ++K
Subjt: PRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAVLDHK
|
|
| AT3G52090.1 DNA-directed RNA polymerase, RBP11-like | 4.4e-07 | 29.11 | Show/hide |
Query: STFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPA-REVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAV
++F++ EDHT+ N +R L++D V F GY +PHP ++ +R+ TT + + A +L +++N + V
Subjt: STFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPA-REVLKDACQNLMAVCQHVRNTLDKAV
|
|
| AT3G52090.2 DNA-directed RNA polymerase, RBP11-like | 3.2e-05 | 36.36 | Show/hide |
Query: STFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLMAV
++F++ EDHT+ N +R L++D V F GY +PHP ++ +R DP KD +NL V
Subjt: STFSMADEDHTLANSIRYTLNQDPRVTFCGYSIPHPSDNRVNIRVQTTGDPAREVLKDACQNLMAV
|
|
