CuGenDBv2

Gene ID	CmoCh01G007010
Organism	Cucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Description	VARLMGL domain-containing protein
Genome location	Cmo_Chr01:3576225..3577460
RNA-Seq Expression	CmoCh01G007010
Synteny	CmoCh01G007010
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	IPR032795 - DUF3741-associated sequence motif

Homology

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GenBank top hits

e value

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Alignment

KAG6607312.1 hypothetical protein SDJN03_00654, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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KAG7036990.1 hypothetical protein SDJN02_00610, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

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A0A1S3C6M1 uncharacterized protein LOC103497072

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A0A5A7SKY9 Transcriptional regulator ATRX-like protein isoform X2

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A0A5D3BBU9 Transcriptional regulator ATRX-like protein isoform X2

6.7e-139

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A0A6J1G9P3 uncharacterized protein LOC111452211

5.9e-204

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A0A6J1K8I1 uncharacterized protein LOC111492651

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

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AT5G58630.1 unknown protein

5.6e-13

28.67

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Query:  PSPSCSSTSSFSTSNFDPHVCNPRAAAATPSCLSGILRRILCSGSLPTHPSDQTTEETSSLKSEDNVKNVGVMKDTNGGIEAKPTAGIVARLMGLDTMPD
        PSP+ S +    T +F               C+S IL+R LCSG+  T+PSD  TE   S KS D +     ++    G       G VARLMGLD++P 
Subjt:  PSPSCSSTSSFSTSNFDPHVCNPRAAAATPSCLSGILRRILCSGSLPTHPSDQTTEETSSLKSEDNVKNVGVMKDTNGGIEAKPTAGIVARLMGLDTMPD

Query:  MKQNCNSIARTQSMNSVEHFYKHLEGRHKGARSTQSFREIPTFLELENEDYFILSFEGDSKNEELKAKARRHGEEKCKNR-----GSNKTE---HSYVRK
        + +    ++R+ S+N ++     ++G+H+  +ST        ++ELE++D+FILSFE D  ++EL       G   CK R       +KTE   H   ++
Subjt:  MKQNCNSIARTQSMNSVEHFYKHLEGRHKGARSTQSFREIPTFLELENEDYFILSFEGDSKNEELKAKARRHGEEKCKNR-----GSNKTE---HSYVRK

Query:  TKKKIFNPEEANEFVLIDLKQKKKSRKRVSRNKPTSRISTKDRHGRRSTRKVES----ERSDELSPVSVLDSSEFLRDSEEAAPLSGFISLSSTNPNSDS
              N     E + I    +++  KR SR K   R  TK R        V+S     + ++L    V  + E     EE           S + +S  
Subjt:  TKKKIFNPEEANEFVLIDLKQKKKSRKRVSRNKPTSRISTKDRHGRRSTRKVES----ERSDELSPVSVLDSSEFLRDSEEAAPLSGFISLSSTNPNSDS

Query:  SICVQNSLNRTLSGDAASKSPVN-SRRKLSPELEISQRSSRNDDDLII----KEGNPAKTKAIEE---EICKITEMELGKSNWNYRKFCEEHEELGVESI
        S+   +      +G   + SP N SRR+LS ELE S+ +   + D I      +    +    +E    ICK+T  +L  S+W   K  +  +  G+  I
Subjt:  SICVQNSLNRTLSGDAASKSPVN-SRRKLSPELEISQRSSRNDDDLII----KEGNPAKTKAIEE---EICKITEMELGKSNWNYRKFCEEHEELGVESI

Query:  IEGFDSFILEGLIEE
         E   S IL+ L+EE
Subjt:  IEGFDSFILEGLIEE

Sequences

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ATGAAGTTGTTGTTGCCTTCTCCTTCTTGCTCTTCCACTTCTTCCTTCTCCACTTCCAACTTTGATCCTCATGTCTGCAACCCCAGAGCTGCAGCAGCTACCCCCAGCTG
CCTTTCGGGAATTCTCCGCCGAATTCTCTGCTCCGGTAGCCTCCCGACGCACCCGTCCGATCAGACTACAGAAGAAACCAGCTCATTAAAGTCTGAGGACAATGTTAAGA
ACGTGGGTGTCATGAAAGACACAAATGGTGGGATTGAGGCCAAGCCCACCGCTGGAATTGTGGCCAGGCTGATGGGTTTGGATACCATGCCAGATATGAAGCAGAATTGT
AATTCAATAGCAAGAACTCAATCCATGAACTCTGTGGAGCATTTCTACAAACACCTTGAAGGCAGACATAAAGGGGCTAGATCAACACAGTCGTTTCGAGAGATACCCAC
CTTTCTCGAGCTTGAAAATGAAGATTACTTCATCCTAAGCTTCGAAGGAGACAGCAAAAATGAAGAACTCAAAGCGAAAGCAAGAAGGCATGGAGAAGAAAAATGCAAAA
ACAGGGGAAGCAACAAAACAGAGCATTCTTACGTGAGAAAGACGAAGAAGAAGATATTCAATCCAGAAGAAGCCAATGAGTTCGTCCTAATCGATTTGAAACAAAAGAAG
AAATCAAGAAAAAGAGTCTCAAGAAATAAACCAACCTCCAGAATTTCAACCAAGGATCGCCATGGCAGAAGATCAACGAGGAAGGTAGAATCAGAGCGCTCCGACGAATT
AAGCCCAGTATCAGTTCTTGATAGCAGTGAATTCCTCCGAGATTCTGAAGAAGCAGCCCCATTATCAGGTTTTATTTCGCTTTCTTCAACAAACCCTAATTCGGATTCTT
CAATTTGTGTCCAAAATTCCTTAAATCGCACTCTTTCAGGAGACGCCGCTTCGAAATCCCCCGTAAACAGTCGAAGGAAATTATCACCGGAGCTCGAAATCTCTCAGCGA
TCGTCTCGCAACGACGATGATTTGATAATCAAAGAAGGAAACCCCGCGAAGACGAAGGCGATTGAAGAAGAGATTTGTAAAATAACAGAGATGGAATTGGGGAAATCGAA
TTGGAATTACAGGAAATTTTGTGAAGAACATGAAGAACTTGGAGTTGAGAGTATAATTGAAGGTTTTGATTCGTTCATTCTTGAAGGATTGATAGAGGAATTTGCAGAAC
AAATGTATGATTCGATCTTCATCTGA

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NSIARTQSMNSVEHFYKHLEGRHKGARSTQSFREIPTFLELENEDYFILSFEGDSKNEELKAKARRHGEEKCKNRGSNKTEHSYVRKTKKKIFNPEEANEFVLIDLKQKK
KSRKRVSRNKPTSRISTKDRHGRRSTRKVESERSDELSPVSVLDSSEFLRDSEEAAPLSGFISLSSTNPNSDSSICVQNSLNRTLSGDAASKSPVNSRRKLSPELEISQR
SSRNDDDLIIKEGNPAKTKAIEEEICKITEMELGKSNWNYRKFCEEHEELGVESIIEGFDSFILEGLIEEFAEQMYDSIFI

CmoCh01G007010 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome