; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh01G007140 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh01G007140
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionRING-H2 finger protein ATL63-like
Genome locationCmo_Chr01:3659869..3660612
RNA-Seq ExpressionCmoCh01G007140
SyntenyCmoCh01G007140
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7037003.1 E3 ubiquitin-protein ligase ATL41, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.4e-13099.19Show/hide
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XP_022998608.1 RING-H2 finger protein ATL63-like [Cucurbita maxima]4.5e-12997.98Show/hide
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        E QNGQFHS S             SSSSSSTD PLMSLGASLKRMLSRNRS+GRIFPSS+GDEL+V
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XP_023521602.1 RING-H2 finger protein ATL63-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.2e-13099.19Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3C6K6 RING-H2 finger protein ATL63 isoform X15.9e-9075.81Show/hide
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        YESEEKKCA  MECVICLSEFEERE+GRRLP C HGFHLECIDMWLNSHANCPVCR PV+ EAV+      SGE EIG E V           NE Q+GQ
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        F+S SSSSSS   PPLM S+GASL R+LSRNRS+GRIFPSSNG+EL+V
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A0A6J1GBH1 RING-H2 finger protein ATL63-like1.4e-131100Show/hide
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A0A6J1HPE0 RING-H2 finger protein ATL63-like4.0e-10779.7Show/hide
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        E QNGQFHSSS                  SSSSSSTD PLMSLGASLKRMLSRNRS+GRIFPSS+GDEL+V
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A0A6J1HZJ3 RING-H2 finger protein ATL63-like9.0e-10781.3Show/hide
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        E QNGQF+S S         SSSSSSTD PLMSLGASLKRMLSRNRS+GRIFPSS+GDEL+V
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A0A6J1KH83 RING-H2 finger protein ATL63-like2.2e-12997.98Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22255 RING-H2 finger protein ATL641.9e-2136.09Show/hide
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        EEK+     EC +CLSEFEE + GR LP C H FH++CID W  S + CP+CRAPV    + +E+G  S
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Q8L9T5 RING-H2 finger protein ATL21.6e-2333.99Show/hide
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        ++ +  ++L+A++ L  VV+ ++ LH YA  +  R R RH +R S     T+ +    P  +    +        S+GLD +VI ++P+F +  E  K  
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          +EC +CLSEFEE E GR LP C H FH++CIDMW +SH+ CP+CR+ V + A +ES   + ERE+   + ++     E   +     + H S SS   
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Query:  STD
          D
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Q9LUZ9 RING-H2 finger protein ATL632.0e-3438.38Show/hide
Query:  TSLSDFTQSIFSYNSNVILAALISLLLVVLFVLLLHAYANCFFP------------RPRHRHAQRSSVTVSYVLGPPRLSRFE---SIPFDLGFAQSKGL
        +SLS F + + SYNSNV+LAAL+ LLLVVLFVLLLH YA  F+             R R R  +R +VT + ++    L  F+   S P        KGL
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Query:  DSSVISAIPLFVYESEEKKCATVMECVICLSEFEEREIGRRLPICNHGFHLECIDMWLNSHANCPVCRAPVVA------------EAVE-----------
        DSSVIS+IPLFVYE  E++     ECVICL  +E  + GR+L  C HGFH+ECIDMWL+SH+ CP+CR+PV+A             AVE           
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Query:  ----SGRLSGEREIG-------EEIVT-----EERTNCEIQRNEEQ--NGQFHSSSSSSSSSTDPPLMSLGASLKRMLSRNRS---NGRIFPSSNGD
               +SG+R +        +++ T     EE    E+  ++E+  +G   S    S S T     S  +SL RMLS + S     ++FP++  D
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Q9LZJ6 RING-H2 finger protein ATL54.7e-2037.16Show/hide
Query:  SIFSYNSNVILAALISLLLVVLFVLLLHAYANCFFPRPRHRHAQRSSVTVSYVLGPPRLSRFESIPFDLGFAQSKGLDSSVISAIPLFVYESEEKKCATV
        S +S N  ++LA++I L + V+ +L  H+YA   F R   R  +R S  +  +      ++  S            LD +V+  IP+FVY  +  + + +
Subjt:  SIFSYNSNVILAALISLLLVVLFVLLLHAYANCFFPRPRHRHAQRSSVTVSYVLGPPRLSRFESIPFDLGFAQSKGLDSSVISAIPLFVYESEEKKCATV

Query:  MECVICLSEFEEREIGRRLPICNHGFHLECIDMWLNSHANCPVCRAPV
         EC +CLSEFEE + GR LP C H FH++CID W  S ++CP+CRAPV
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Q9XF63 RING-H2 finger protein ATL35.2e-1934.57Show/hide
Query:  SNVILAALISLLLVVLFVLLLHAYANCFFPR-------PRHRHAQRSSVTVSYVLGPPRLSRFESIPFDLGFAQ----SKGLDSSVISAIPLFVYESEEK
        S +IL A+I L + VLFVL+LH YA  ++ R        + +  ++        + PP ++R +   F     Q    + GL S  +S++P+  +  +  
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Query:  KCATVMECVICLSEFEEREIGRRLPICNHGFHLECIDMWLNSHANCPVCRAPVVAEAVESGR
         C   +EC ICLSE  + +  R LP CNH FH+ECIDMW  SH+ CP+CR  V+     S +
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G72310.1 RING/U-box superfamily protein3.7e-2034.57Show/hide
Query:  SNVILAALISLLLVVLFVLLLHAYANCFFPR-------PRHRHAQRSSVTVSYVLGPPRLSRFESIPFDLGFAQ----SKGLDSSVISAIPLFVYESEEK
        S +IL A+I L + VLFVL+LH YA  ++ R        + +  ++        + PP ++R +   F     Q    + GL S  +S++P+  +  +  
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         C   +EC ICLSE  + +  R LP CNH FH+ECIDMW  SH+ CP+CR  V+     S +
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AT2G47560.1 RING/U-box superfamily protein1.4e-2236.09Show/hide
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        T S ++ N  ++L+++I L + V+ +L  H+YA   F R   R  +R    +  +   PR                + LD +V+  IP+FVY S      
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Query:  EEKKCATVMECVICLSEFEEREIGRRLPICNHGFHLECIDMWLNSHANCPVCRAPVVA--EAVESGRLS
        EEK+     EC +CLSEFEE + GR LP C H FH++CID W  S + CP+CRAPV    + +E+G  S
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AT3G16720.1 TOXICOS EN LEVADURA 21.1e-2433.99Show/hide
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        ++ +  ++L+A++ L  VV+ ++ LH YA  +  R R RH +R S     T+ +    P  +    +        S+GLD +VI ++P+F +  E  K  
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Query:  TVMECVICLSEFEEREIGRRLPICNHGFHLECIDMWLNSHANCPVCRAPVVAEA-VESGRLSGEREIGEEIVTEERTNCEIQRNEEQNGQFHSSSSSSSS
          +EC +CLSEFEE E GR LP C H FH++CIDMW +SH+ CP+CR+ V + A +ES   + ERE+   + ++     E   +     + H S SS   
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Query:  STD
          D
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AT3G62690.1 AtL53.4e-2137.16Show/hide
Query:  SIFSYNSNVILAALISLLLVVLFVLLLHAYANCFFPRPRHRHAQRSSVTVSYVLGPPRLSRFESIPFDLGFAQSKGLDSSVISAIPLFVYESEEKKCATV
        S +S N  ++LA++I L + V+ +L  H+YA   F R   R  +R S  +  +      ++  S            LD +V+  IP+FVY  +  + + +
Subjt:  SIFSYNSNVILAALISLLLVVLFVLLLHAYANCFFPRPRHRHAQRSSVTVSYVLGPPRLSRFESIPFDLGFAQSKGLDSSVISAIPLFVYESEEKKCATV

Query:  MECVICLSEFEEREIGRRLPICNHGFHLECIDMWLNSHANCPVCRAPV
         EC +CLSEFEE + GR LP C H FH++CID W  S ++CP+CRAPV
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AT5G58580.1 TOXICOS EN LEVADURA 631.4e-3538.38Show/hide
Query:  TSLSDFTQSIFSYNSNVILAALISLLLVVLFVLLLHAYANCFFP------------RPRHRHAQRSSVTVSYVLGPPRLSRFE---SIPFDLGFAQSKGL
        +SLS F + + SYNSNV+LAAL+ LLLVVLFVLLLH YA  F+             R R R  +R +VT + ++    L  F+   S P        KGL
Subjt:  TSLSDFTQSIFSYNSNVILAALISLLLVVLFVLLLHAYANCFFP------------RPRHRHAQRSSVTVSYVLGPPRLSRFE---SIPFDLGFAQSKGL

Query:  DSSVISAIPLFVYESEEKKCATVMECVICLSEFEEREIGRRLPICNHGFHLECIDMWLNSHANCPVCRAPVVA------------EAVE-----------
        DSSVIS+IPLFVYE  E++     ECVICL  +E  + GR+L  C HGFH+ECIDMWL+SH+ CP+CR+PV+A             AVE           
Subjt:  DSSVISAIPLFVYESEEKKCATVMECVICLSEFEEREIGRRLPICNHGFHLECIDMWLNSHANCPVCRAPVVA------------EAVE-----------

Query:  ----SGRLSGEREIG-------EEIVT-----EERTNCEIQRNEEQ--NGQFHSSSSSSSSSTDPPLMSLGASLKRMLSRNRS---NGRIFPSSNGD
               +SG+R +        +++ T     EE    E+  ++E+  +G   S    S S T     S  +SL RMLS + S     ++FP++  D
Subjt:  ----SGRLSGEREIG-------EEIVT-----EERTNCEIQRNEEQ--NGQFHSSSSSSSSSTDPPLMSLGASLKRMLSRNRS---NGRIFPSSNGD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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