; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh01G007500 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh01G007500
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionhistone-lysine N-methyltransferase SETD1B-like
Genome locationCmo_Chr01:3884030..3884676
RNA-Seq ExpressionCmoCh01G007500
SyntenyCmoCh01G007500
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR007789 - Protein of unknown function DUF688


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6607361.1 hypothetical protein SDJN03_00703, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.3e-10299.48Show/hide
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KAG7037033.1 hypothetical protein SDJN02_00654, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.3e-9998.43Show/hide
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XP_022949317.1 uncharacterized protein LOC111452704 [Cucurbita moschata]1.7e-102100Show/hide
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XP_022997732.1 uncharacterized protein LOC111492604 [Cucurbita maxima]3.2e-10198.95Show/hide
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XP_038894794.1 uncharacterized protein LOC120083212 [Benincasa hispida]4.9e-4660.51Show/hide
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        +  NS D GGK  KMRLK L+TRDD+  V +EDYHTGVSA+VPF WESEPGTPKANF ++G++LSPLTPPPSYFS+    +++P  H +++ P  S++NF
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        L SVF+KLSV K  L P SP  S SS+SS+T +SSE  R  SPRRLSFDSRVD    +D+ +++ N +SPVSTLFFG G   SDKG  CYPKLVK
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LYC9 Uncharacterized protein5.2e-4157.36Show/hide
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        NSG+ G GK GKMRLK L+ R+D+ T+   +EDYHTG+SA+VPF WESEPGTPKAN  D    SLLSPLTPPPSYFS+    + +P  H  ++ P  ++ 
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        +FL +VF+KLSV  + L P SP SSSSS+S     + E  R  SPRRLSFDSRVD++  +D+E E+ N +SPVSTLFFGR    SDKG  CYPKLVK
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A0A1S3C5A7 uncharacterized protein At4g009505.7e-4057.87Show/hide
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        NSG+  GGK GKMRLK L+TRDD   I+  +EDYHTG+SA+VPF WESEPGTPKAN  D  +GSLLSPLTPPPSYFS+    + +P  H  ++ P  ++ 
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        + L +VF+ LSV K  L P SP SSSSS+      + E  R  SPRRLSFDSRVD+++ ED+E E+ N +SPVSTLFFGRG   S+KG  CYP LVK
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A0A5D3BF70 NADPH oxidase activator5.7e-4057.87Show/hide
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        + L +VF+ LSV K  L P SP SSSSS+      + E  R  SPRRLSFDSRVD+++ ED+E E+ N +SPVSTLFFGRG   S+KG  CYP LVK
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A0A6J1GBP3 uncharacterized protein LOC1114527048.1e-103100Show/hide
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A0A6J1K5W9 uncharacterized protein LOC1114926041.5e-10198.95Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06930.1 unknown protein2.1e-1035.36Show/hide
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        + V+ DY+ G SA VPF WES+PGTP+   +   S            + +PLTPPPSYF +SPS T  KH    +P  +   F + + K  SV      P
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Query:  LSPGSSSSSTSSTTLTSSEGERGRSPRRLSFDSRVDENEHEDEEEEEENFDSPVSTLFFGRGGGSSDKGCYCYPKLVKRLM
         SP SSSSS+SS+  +S       S RR S                   F+S  S  +    G +S K   CY  LVK L+
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AT2G40475.1 unknown protein3.9e-0936.67Show/hide
Query:  YHTGVSATVPFIWESEPGTPKANFRDHGSLLSPLTPPPSYFSSPSHTPSKHKYNTNPHPSRANFLTSV-FKKLSVNKAPLHPLSPGSSSSSTSSTTLTSS
        Y+ G  A+VPF+WE+ PGTPK         L PLTPPPSY+SS S + +K         S+A  +    F K  +++    P    SS+SS+SS++ +SS
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Query:  E--GERGRSPRRLSFDSRVDENEHEDEEEEEENFDSPVSTLFFGRGGGSS
            +    PR+    SR   +  ++++EEE    SP STL + RG  SS
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AT3G56260.2 unknown protein1.7e-0736.71Show/hide
Query:  DDILTVDED---YHTGVSATVPFIWESEPGTPKANFRDHGSLLSPLTPPPSYFSSPSHTPSKHKYNTNPHPSRANFLT-SVFKKL-SVNKAPLHPLSPGS
        +D   +DE+   Y+ G  A++PFIWES PGTPK +     SL  PLTPPPSY+S  S   S  +  +      + FL+ S+F  L   N       S   
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Query:  SSSSTSSTTLTSSEGERGRSPRRLSFDSRVDENEHEDEEEEEENFDSPVSTLFFGRGG
        S SSTSS++  SS        +R+S D +        EE+E  +  SP STL    GG
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCAACAAATTCAGGGGATTTTGGAGGCAAATTTGGGAAAATGAGGCTTAAAAGCCTCAAAACAAGGGATGATATATTGACAGTGGATGAAGATTACCACACAGGAGT
ATCAGCCACAGTGCCATTCATATGGGAGTCCGAGCCAGGCACTCCCAAGGCCAATTTCAGGGACCATGGCTCACTCCTTTCCCCTCTCACGCCCCCACCATCCTATTTCT
CCTCACCCTCACACACACCCTCCAAGCATAAATATAACACCAACCCACATCCCTCTCGAGCCAATTTCCTCACCTCGGTTTTCAAGAAGCTTTCTGTGAATAAGGCTCCT
CTCCATCCGCTCTCTCCCGGCTCGTCGTCGTCGTCGACTTCGTCTACGACACTGACAAGCTCTGAGGGAGAGAGAGGAAGAAGCCCAAGGAGATTGTCGTTTGATTCAAG
AGTGGACGAGAATGAGCACGAGGACGAAGAAGAGGAAGAGGAGAATTTCGACTCGCCCGTTTCGACTTTGTTCTTTGGACGTGGCGGAGGATCGAGTGATAAAGGATGCT
ATTGCTATCCAAAGTTGGTGAAGAGATTAATGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCAACAAATTCAGGGGATTTTGGAGGCAAATTTGGGAAAATGAGGCTTAAAAGCCTCAAAACAAGGGATGATATATTGACAGTGGATGAAGATTACCACACAGGAGT
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ATTGCTATCCAAAGTTGGTGAAGAGATTAATGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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