; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh01G007590 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh01G007590
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionSuperoxide dismutase
Genome locationCmo_Chr01:3911981..3915140
RNA-Seq ExpressionCmoCh01G007590
SyntenyCmoCh01G007590
Gene Ontology termsGO:0009793 - embryo development ending in seed dormancy (biological process)
GO:0010043 - response to zinc ion (biological process)
GO:0019430 - removal of superoxide radicals (biological process)
GO:0005739 - mitochondrion (cellular component)
GO:0004784 - superoxide dismutase activity (molecular function)
GO:0030145 - manganese ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001189 - Manganese/iron superoxide dismutase
IPR019831 - Manganese/iron superoxide dismutase, N-terminal
IPR019832 - Manganese/iron superoxide dismutase, C-terminal
IPR019833 - Manganese/iron superoxide dismutase, binding site
IPR036314 - Manganese/iron superoxide dismutase, C-terminal domain superfamily
IPR036324 - Manganese/iron superoxide dismutase, N-terminal domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6607370.1 Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.8e-12382.37Show/hide
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KAG7037039.1 Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]9.1e-12282.18Show/hide
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XP_022949364.1 superoxide dismutase [Mn], mitochondrial-like [Cucurbita moschata]3.6e-12684.17Show/hide
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XP_023523564.1 superoxide dismutase [Mn], mitochondrial-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.7e-12382.37Show/hide
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A0A1L5JHV8 Superoxide dismutase4.1e-12080.22Show/hide
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A0A345BTG9 Superoxide dismutase8.0e-12482.37Show/hide
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A0A6J1DNG7 Superoxide dismutase9.5e-11777.7Show/hide
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A0A6J1GCM2 Superoxide dismutase1.7e-12684.17Show/hide
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A0A6J1KCD3 Superoxide dismutase3.6e-12482.73Show/hide
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O49066 Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial1.2e-9263.87Show/hide
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O81235 Superoxide dismutase [Mn] 1, mitochondrial2.2e-9463.74Show/hide
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P11796 Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial3.6e-9764.36Show/hide
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P35017 Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial2.4e-10168.36Show/hide
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Q9SM64 Superoxide dismutase [Mn], mitochondrial1.1e-9866.18Show/hide
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        MALR ++SR+ L    +G       RG QTFSLPDLPY+YGALEP I  +IMQLHHQ HHQ Y+TNYNKALEQLH+AI+KGD   V KL SAIKFNGGGH
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        +NHSIFWKNLA + EGGGEPPKGSLGWAIDT FGSLEAL+Q++NAEGAALQGSGWVWLALDKELKKL VETTANQ                         
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                           DPLVTKG  LVPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKNIWKVINWKYA E++ KE+P
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G10920.1 manganese superoxide dismutase 11.6e-9563.74Show/hide
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        MA+R + SRK L      + R    RG QTF+LPDLPYDYGALEP I  EIMQ+HHQKHHQAY+TNYN ALEQL +A+NKGD S VVKLQSAIKFNGGGH
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        VNHSIFWKNLA   EGGGEPPKGSLG AID  FGSLE L+++++AEGAA+QGSGWVWL LDKELKKL V+TTANQ                         
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Query:  AQLFCVKYFMESGFLFLSLDPLVTKGSALVPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKNIWKVINWKYADEIFAKE
                           DPLVTKG +LVPL+GIDVWEHAYYLQYKNVRP+YLKN+WKVINWKYA E++ KE
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AT3G10920.2 manganese superoxide dismutase 11.1e-9363.37Show/hide
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        MA+R + SRK L      + R    RG QTF+LPDLPYDYGALEP I  EIMQ+HHQKHHQAY+TNYN ALEQL +A+NKGD S VVKLQSAIKFNGGGH
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Query:  VNHSIFWKNLASIHEGGGEPPKGSLGWAIDTQFGSLEALIQRVNAEGAALQGSGWVWLALDKELKKLSVETTANQLQTCCRCSLVLFLFSLMPSVISYLF
        VNHSIFWKNLA   EGGGEPPKGSLG AID  FGSLE L+++++AEGAA+QGSGW WL LDKELKKL V+TTANQ                         
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Query:  AQLFCVKYFMESGFLFLSLDPLVTKGSALVPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKNIWKVINWKYADEIFAKE
                           DPLVTKG +LVPL+GIDVWEHAYYLQYKNVRP+YLKN+WKVINWKYA E++ KE
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AT3G56350.1 Iron/manganese superoxide dismutase family protein1.8e-8058.82Show/hide
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        GA         +T SLPDLPY Y ALEP I  EIM+LHHQKHHQ Y+T YNKAL  L  A+  GD S+VVKLQS IKFNGGGHVNH+IFWKNLA +HEGG
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Query:  GEPPKGSLGWAIDTQFGSLEALIQRVNAEGAALQGSGWVWLALDKELKKLSVETTANQLQTCCRCSLVLFLFSLMPSVISYLFAQLFCVKYFMESGFLFL
        G+PP   L  AID  FGSLE LIQ++NAEGAA+QGSGWVW  LD+ELK+L VETTANQ                                          
Subjt:  GEPPKGSLGWAIDTQFGSLEALIQRVNAEGAALQGSGWVWLALDKELKKLSVETTANQLQTCCRCSLVLFLFSLMPSVISYLFAQLFCVKYFMESGFLFL

Query:  SLDPLVTKGSALVPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKNIWKVINWKYADEIFAK
          DPLVTKGS LVPL+GIDVWEHAYY QYKN R +YLKNIW VINWKYA ++F K
Subjt:  SLDPLVTKGSALVPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKNIWKVINWKYADEIFAK

AT5G23310.1 Fe superoxide dismutase 32.8e-2027.31Show/hide
Query:  FSLPDLPYDYGALEPVIHAEIMQLHHQKHHQAYITNYNKALEQLHEAINKGDTSAVVKLQSAIK-----------FNGGGHV-NHSIFWKNLASIHEGGG
        + L   PY   ALEP +    +++H  KHH+ Y+ N NK L        K D      ++  IK           FN    V NH  FW+   S+  GGG
Subjt:  FSLPDLPYDYGALEPVIHAEIMQLHHQKHHQAYITNYNKALEQLHEAINKGDTSAVVKLQSAIK-----------FNGGGHV-NHSIFWKNLASIHEGGG

Query:  EPPKGSLGWAIDTQFGSLEALIQRVNAEGAALQGSGWVWLALDKELKKLSVETTANQLQTCCRCSLVLFLFSLMPSVISYLFAQLFCVKYFMESGFLFLS
        + P+  +   ID  FGS     ++         GSGWVWL L +E ++L V  T+N                                           +
Subjt:  EPPKGSLGWAIDTQFGSLEALIQRVNAEGAALQGSGWVWLALDKELKKLSVETTANQLQTCCRCSLVLFLFSLMPSVISYLFAQLFCVKYFMESGFLFLS

Query:  LDPLVTKGSALVPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKNIWK-VINWKYADEIFAKEAPLV
        ++PLV      +P++ +DVWEH+YYL YKN R  Y+      +++W  A    A+    V
Subjt:  LDPLVTKGSALVPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKNIWK-VINWKYADEIFAKEAPLV

AT5G51100.1 Fe superoxide dismutase 21.6e-2030.92Show/hide
Query:  ISGAIRSGHFRGFQTFSLPDLPYDYGALEPVIHAEIMQLHHQKHHQAYITNYNKAL-----------EQLHEAINKGDTSAVVKLQSAIKFNGGGHV-NH
        +SG I +G       F L   PY   ALEP +  E +  H  KHH+ Y+ N NK +           E +  + NKG+            FN      NH
Subjt:  ISGAIRSGHFRGFQTFSLPDLPYDYGALEPVIHAEIMQLHHQKHHQAYITNYNKAL-----------EQLHEAINKGDTSAVVKLQSAIKFNGGGHV-NH

Query:  SIFWKNLASIHEGGGEPPKGSLGWAIDTQFGSLEALIQRVNAEGAALQGSGWVWLALDKELKKLSVETTANQLQTCCRCSLVLFLFSLMPSVISYLFAQL
          FW+   SI  GGG  P G L   I+  FGS E  ++R  +  A+  GSGW WLA   +  +L V    N L       LV+      P+ +       
Subjt:  SIFWKNLASIHEGGGEPPKGSLGWAIDTQFGSLEALIQRVNAEGAALQGSGWVWLALDKELKKLSVETTANQLQTCCRCSLVLFLFSLMPSVISYLFAQL

Query:  FCVKYFMESGFLFLSLDPLVTKGSALVPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKNIW-KVINWK
                        +PLV   S   PLL ID WEHAYYL ++N R +Y+     K+++W+
Subjt:  FCVKYFMESGFLFLSLDPLVTKGSALVPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKNIW-KVINWK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTCTTCGAATTCTTAGCAGGAAAAACCTAACGCCGACAATTTCTGGAGCGATACGGTCTGGACATTTTCGCGGCTTCCAGACCTTCTCCTTGCCCGACCTCCCTTA
CGACTATGGCGCTCTTGAGCCCGTCATCCATGCCGAAATCATGCAGCTTCATCACCAGAAGCACCATCAAGCCTACATCACCAACTATAACAAGGCTCTTGAGCAGCTTC
ACGAGGCCATCAACAAAGGCGACACTTCCGCTGTTGTCAAGTTGCAAAGTGCCATCAAATTCAATGGCGGAGGTCACGTCAATCATTCGATTTTCTGGAAAAATCTCGCT
TCTATTCATGAAGGGGGTGGTGAGCCTCCAAAGGGATCTCTAGGATGGGCGATCGACACTCAGTTCGGTTCTCTTGAAGCCTTGATTCAGAGGGTCAACGCAGAAGGTGC
TGCTTTACAGGGCTCTGGATGGGTGTGGCTTGCTCTGGATAAAGAACTGAAGAAGCTGTCGGTTGAAACCACGGCCAATCAGCTACAAACATGTTGCAGATGCAGTCTTG
TTCTATTTCTGTTTTCGTTGATGCCTTCTGTGATCTCTTATTTATTTGCCCAATTATTTTGCGTTAAGTATTTTATGGAGTCAGGGTTTTTATTTTTATCACTTGATCCT
CTTGTGACTAAAGGATCTGCCTTAGTTCCTCTGCTTGGGATCGATGTTTGGGAGCATGCGTATTACTTGCAGTACAAAAATGTCAGACCAGACTACCTGAAGAACATATG
GAAAGTCATAAACTGGAAGTATGCTGATGAGATTTTCGCGAAAGAAGCTCCCCTAGTTGAGAGTCACTGCGTGCGGCAAATGCGGAAGAAAAGCCAAAACTATAATGGGT
CAATCGCCGCATCAGATTGGAAGACGACGACATGGGGGGAAAGGATGGATAACCGAGGGCGGTTTATGGCAAACCAATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTTTGGTGTAGCGAGCACTAGACCACTTGAAGCCGCCTGTGTCGAGCAGCTGAGGTCGATATTGTGGTGTGTGAGAAAGGAAGTGAGAGAGAGAGAGTATCGACAATGGC
TCTTCGAATTCTTAGCAGGAAAAACCTAACGCCGACAATTTCTGGAGCGATACGGTCTGGACATTTTCGCGGCTTCCAGACCTTCTCCTTGCCCGACCTCCCTTACGACT
ATGGCGCTCTTGAGCCCGTCATCCATGCCGAAATCATGCAGCTTCATCACCAGAAGCACCATCAAGCCTACATCACCAACTATAACAAGGCTCTTGAGCAGCTTCACGAG
GCCATCAACAAAGGCGACACTTCCGCTGTTGTCAAGTTGCAAAGTGCCATCAAATTCAATGGCGGAGGTCACGTCAATCATTCGATTTTCTGGAAAAATCTCGCTTCTAT
TCATGAAGGGGGTGGTGAGCCTCCAAAGGGATCTCTAGGATGGGCGATCGACACTCAGTTCGGTTCTCTTGAAGCCTTGATTCAGAGGGTCAACGCAGAAGGTGCTGCTT
TACAGGGCTCTGGATGGGTGTGGCTTGCTCTGGATAAAGAACTGAAGAAGCTGTCGGTTGAAACCACGGCCAATCAGCTACAAACATGTTGCAGATGCAGTCTTGTTCTA
TTTCTGTTTTCGTTGATGCCTTCTGTGATCTCTTATTTATTTGCCCAATTATTTTGCGTTAAGTATTTTATGGAGTCAGGGTTTTTATTTTTATCACTTGATCCTCTTGT
GACTAAAGGATCTGCCTTAGTTCCTCTGCTTGGGATCGATGTTTGGGAGCATGCGTATTACTTGCAGTACAAAAATGTCAGACCAGACTACCTGAAGAACATATGGAAAG
TCATAAACTGGAAGTATGCTGATGAGATTTTCGCGAAAGAAGCTCCCCTAGTTGAGAGTCACTGCGTGCGGCAAATGCGGAAGAAAAGCCAAAACTATAATGGGTCAATC
GCCGCATCAGATTGGAAGACGACGACATGGGGGGAAAGGATGGATAACCGAGGGCGGTTTATGGCAAACCAATAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MALRILSRKNLTPTISGAIRSGHFRGFQTFSLPDLPYDYGALEPVIHAEIMQLHHQKHHQAYITNYNKALEQLHEAINKGDTSAVVKLQSAIKFNGGGHVNHSIFWKNLA
SIHEGGGEPPKGSLGWAIDTQFGSLEALIQRVNAEGAALQGSGWVWLALDKELKKLSVETTANQLQTCCRCSLVLFLFSLMPSVISYLFAQLFCVKYFMESGFLFLSLDP
LVTKGSALVPLLGIDVWEHAYYLQYKNVRPDYLKNIWKVINWKYADEIFAKEAPLVESHCVRQMRKKSQNYNGSIAASDWKTTTWGERMDNRGRFMANQ