; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh01G008420 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh01G008420
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationCmo_Chr01:4486479..4488337
RNA-Seq ExpressionCmoCh01G008420
SyntenyCmoCh01G008420
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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KAG7037120.1 hypothetical protein SDJN02_00741 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.7e-11296.44Show/hide
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XP_022948859.1 uncharacterized protein LOC111452392 [Cucurbita moschata]3.7e-117100Show/hide
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XP_022997987.1 uncharacterized protein LOC111492777 [Cucurbita maxima]2.7e-11296.09Show/hide
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XP_023524923.1 uncharacterized protein LOC111788705 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.4e-11598.24Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LVK1 Uncharacterized protein7.3e-7170.48Show/hide
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         SDDE SHP SP PSD QI+K M AS+W+  GVQILR RI AM S+IW NA    A WLFSPAGRIGLLVTL WLYKR R+RRLR S+EQLKMMIKEKD+
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        KIS L+QQVAQLNRS++LAQQKVLPSN
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A0A1S3BA65 uncharacterized protein LOC1034878351.3e-7272.25Show/hide
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        MA  E+RSVFDW N    NSYQSS             SMV IRDS PKDDFSVFPPS HENL  PSI  +ERGSPVSFQSNSPSSSFRSSQSSSSFSSFS
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         SDDE SHP SP PS  QI+K M  S+W+ +GVQILR RI AM S+IW NA    A WLFSPAGRIGLLVTL WLYKR R+RRLR ST QLKMM+KEKD+
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A0A6J1C560 uncharacterized protein LOC1110085811.8e-8578.41Show/hide
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         SDDETSH  SP PSDCQIRKSMAAS+WM +GVQILR+RI AM S+IW N ARRTA W+FSPAGRI L+VTLWWLYKR RQRRLR S+EQL+M+IKEKDK
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A0A6J1GB64 uncharacterized protein LOC1114523921.8e-117100Show/hide
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A0A6J1K6L4 uncharacterized protein LOC1114927771.3e-11296.09Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G61360.1 unknown protein4.3e-0730.89Show/hide
Query:  EWSMVGIRDS--LPKDDFSVFPPSNHENLWLPSIEGNERGSPVSFQSNSPS-SSFRSSQSSSSFSSFSLSDDETSHPQSPSPSDCQIRKSMAASKWMAFG
        ++ MV +R+S    KDD ++FPP NHENL++  +E     S  S  S+  S SSF  S S   F     S  + S     SP    I   +    W    
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         +IL +R+ +   ++      R ++  FS   R    ++V   W +KR R RR     E     L+  IKE+D++I+QLL Q+ Q+N  ++
Subjt:  VQILRSRIAAMTSSIWPNAARRTAVWLFSPAGR--IGLLVTLWWLYKRLRQRRLRHSTE----QLKMMIKEKDKKISQLLQQVAQLNRSML


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAGGTCATGAAGCCAGATCGGTTTTCGACTGGGAAAACTTCCATTCGTTGAATTCATATCAGTCGTCTTCTTCATCTCAGCAGCCGAAAATCCAACTGAAAGAATG
GTCAATGGTGGGGATTAGGGATTCTCTTCCCAAAGACGATTTCTCCGTCTTCCCACCTTCAAATCACGAGAATCTATGGCTACCATCGATTGAAGGAAACGAACGAGGAA
GCCCAGTTTCATTTCAGTCCAATTCGCCATCCTCATCGTTTAGGTCGTCCCAATCATCTTCCTCGTTCTCATCTTTCTCACTTTCTGATGATGAGACTTCACATCCACAG
TCACCGAGCCCATCTGATTGTCAAATTCGGAAGTCCATGGCGGCTTCTAAATGGATGGCTTTCGGGGTTCAGATTCTTCGCTCCCGGATTGCTGCAATGACTTCCTCAAT
TTGGCCCAATGCTGCGCGTAGAACGGCTGTTTGGTTGTTTTCCCCTGCTGGAAGGATTGGGTTATTGGTAACCCTCTGGTGGCTTTACAAGAGACTTCGTCAGCGCCGTT
TGCGTCATAGTACAGAACAATTAAAGATGATGATCAAGGAGAAAGACAAGAAAATCAGCCAACTACTGCAACAAGTTGCACAATTGAATAGATCAATGTTATTAGCCCAA
CAGAAAGTACTGCCATCAAATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGACATCGACATTTAGGGCACCAAAAAGCCTAATTTTTCTAATGGGAATTTCGAATTCGTAATTTTGTTCTATCGGATAGAATCGATCAATAATCTTCAAGGGCAATTAC
AAGTTCAAACATCCAAGGAAACACGACTCGGTTCCTTCCTGTTGCATGAACGCATCCCAAGGCGTTTTCTTTGGATCTCTCAAGCTCAAATTACTCTCCATTTTTTGTTC
GTTGCAATTCTTTATGTTGAAAAGGGAATTGGGTCGGCAGGTAAATGGCAGGTCATGAAGCCAGATCGGTTTTCGACTGGGAAAACTTCCATTCGTTGAATTCATATCAG
TCGTCTTCTTCATCTCAGCAGCCGAAAATCCAACTGAAAGAATGGTCAATGGTGGGGATTAGGGATTCTCTTCCCAAAGACGATTTCTCCGTCTTCCCACCTTCAAATCA
CGAGAATCTATGGCTACCATCGATTGAAGGAAACGAACGAGGAAGCCCAGTTTCATTTCAGTCCAATTCGCCATCCTCATCGTTTAGGTCGTCCCAATCATCTTCCTCGT
TCTCATCTTTCTCACTTTCTGATGATGAGACTTCACATCCACAGTCACCGAGCCCATCTGATTGTCAAATTCGGAAGTCCATGGCGGCTTCTAAATGGATGGCTTTCGGG
GTTCAGATTCTTCGCTCCCGGATTGCTGCAATGACTTCCTCAATTTGGCCCAATGCTGCGCGTAGAACGGCTGTTTGGTTGTTTTCCCCTGCTGGAAGGATTGGGTTATT
GGTAACCCTCTGGTGGCTTTACAAGAGACTTCGTCAGCGCCGTTTGCGTCATAGTACAGAACAATTAAAGATGATGATCAAGGAGAAAGACAAGAAAATCAGCCAACTAC
TGCAACAAGTTGCACAATTGAATAGATCAATGTTATTAGCCCAACAGAAAGTACTGCCATCAAATTAGAAAATGTGTCAAGGTAGCCATGTTTAGCGTCTATACCAGAGA
TGAGGCGGCAATAAGTATTGCAGCTATTCTGAATATCTTGCTCGTTGAAGAAGTTTAGGCTTGAATTCTTGTTCAGATTCATAGAAGGAATCCAGTAGCAGTAGAATCGA
ACTGACACAGAAGCTCATGCCTTTGCCAGGGGAAGAGTATAAGGCAGGCACCATGTATGTCTCAAAACGACATGAATCTGTTTGTGGCTGCACAAAAACAGATGATCAGC
TCAGAGATGCAATGTATACACAGATGATTTGTATTGATTTTTTCAGTATTTGTTCCAAGAAATATATATATTAGATTAGGATTTTCTTGTAATGTCTTTGCCAACTTCGT
TTATTGACTGGGAAGCTTATGCTTATGCACAGTGTATTGGGGTTTGTAAATCGATATGATTTGCTTGCAATGTTAAACCATAAAACTATGCACTTCCTGCAGAGCATGCT
TTCCAATAGAAACTGACAAGCACAGAATCATATTCCTACTTCCTTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAGHEARSVFDWENFHSLNSYQSSSSSQQPKIQLKEWSMVGIRDSLPKDDFSVFPPSNHENLWLPSIEGNERGSPVSFQSNSPSSSFRSSQSSSSFSSFSLSDDETSHPQ
SPSPSDCQIRKSMAASKWMAFGVQILRSRIAAMTSSIWPNAARRTAVWLFSPAGRIGLLVTLWWLYKRLRQRRLRHSTEQLKMMIKEKDKKISQLLQQVAQLNRSMLLAQ
QKVLPSN