; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh01G008440 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh01G008440
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationCmo_Chr01:4493135..4493683
RNA-Seq ExpressionCmoCh01G008440
SyntenyCmoCh01G008440
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6607466.1 hypothetical protein SDJN03_00808, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.5e-6587.72Show/hide
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KAG7037123.1 hypothetical protein SDJN02_00744, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.8e-6487.13Show/hide
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XP_022137383.1 uncharacterized protein LOC111008849 [Momordica charantia]1.8e-5381.76Show/hide
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XP_022997920.1 uncharacterized protein LOC111492724 [Cucurbita maxima]1.3e-6486.55Show/hide
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XP_023524540.1 uncharacterized protein LOC111788436 [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.3e-6888.89Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LTF3 Uncharacterized protein3.7e-4171.53Show/hide
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A0A1S3BBR5 uncharacterized protein LOC1034881796.3e-4172.22Show/hide
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A0A6J1CA73 uncharacterized protein LOC1110088498.5e-5481.76Show/hide
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A0A6J1E8C5 uncharacterized protein LOC1114315561.5e-4573.1Show/hide
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A0A6J1KB84 uncharacterized protein LOC1114927246.3e-6586.55Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G61340.1 unknown protein7.4e-1845.93Show/hide
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        S I+R SI +FLQNY   T+ +A +A PFS  LLLSQ F    F+S   +++ R N+LF  AGF  S +  +I + KLSQT+ SS+FTLPF+LTFLL++K
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        A V++       S++ S  S    Y  LL T++CN
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGAAGACAAGCAGCAGCAGCAGCATCATCAGAACATCAATCTTCAGTTTCCTGCAGAATTATCAGTATTTTACCTCTTTTTCAGCATTCCTTGCATTTCCCTTCTC
AGTTTCTCTTCTTCTCTCACAAACTTTTGTTTTTACTTCCTTCACTTCTCTTCTTCCAAGCATATACCATCGCTTCAACATCCTTTTTGATGCTGCAGGATTCCCTCCTT
CCTTGGAATCCTTATCCATTTTCACTCACAAGCTTTCCCAAACGATATTTTCTTCCATCTTCACTCTTCCTTTCACTCTTACCTTTCTGCTCATTGCAAAAGCCTCTGTT
CTTCAAGCTTTCAAGGACACCAAACCAAGCTCTCACCCCTCCTTTTCCTCTATCAGATCCCTTTACACTCCTCTTCTTTTCACCCATATTTGCAACTCAATCCCTTTACA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGGAAGACAAGCAGCAGCAGCAGCATCATCAGAACATCAATCTTCAGTTTCCTGCAGAATTATCAGTATTTTACCTCTTTTTCAGCATTCCTTGCATTTCCCTTCTC
AGTTTCTCTTCTTCTCTCACAAACTTTTGTTTTTACTTCCTTCACTTCTCTTCTTCCAAGCATATACCATCGCTTCAACATCCTTTTTGATGCTGCAGGATTCCCTCCTT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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