| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6607892.1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 2.1e-86 | 99.46 | Show/hide |
Query: MAAASFSCFALPSKFGNLSLNASPSCLPVSSSSLALKSLSFSSNISVSAFSNGCLSMSGAQRPLRYSVVCEAAPQKKADSAAKRARQAEKRRTYNKARKS
MAAASFSCFALPSKFGNLSLNAS SCLPVSSSSLALKSLSFSSNISVSAFSNGCLSMSGAQRPLRYSVVCEAAPQKKADSAAKRARQAEKRRTYNKARKS
Subjt: MAAASFSCFALPSKFGNLSLNASPSCLPVSSSSLALKSLSFSSNISVSAFSNGCLSMSGAQRPLRYSVVCEAAPQKKADSAAKRARQAEKRRTYNKARKS
Query: EIRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
EIRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
Subjt: EIRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
| XP_022941386.1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic [Cucurbita moschata] | 2.5e-87 | 100 | Show/hide |
Query: MAAASFSCFALPSKFGNLSLNASPSCLPVSSSSLALKSLSFSSNISVSAFSNGCLSMSGAQRPLRYSVVCEAAPQKKADSAAKRARQAEKRRTYNKARKS
MAAASFSCFALPSKFGNLSLNASPSCLPVSSSSLALKSLSFSSNISVSAFSNGCLSMSGAQRPLRYSVVCEAAPQKKADSAAKRARQAEKRRTYNKARKS
Subjt: MAAASFSCFALPSKFGNLSLNASPSCLPVSSSSLALKSLSFSSNISVSAFSNGCLSMSGAQRPLRYSVVCEAAPQKKADSAAKRARQAEKRRTYNKARKS
Query: EIRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
EIRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
Subjt: EIRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
| XP_022976587.1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic-like [Cucurbita maxima] | 1.3e-72 | 87.98 | Show/hide |
Query: AAASFSCFALPSKFGNLSLNASPSCLPVSSSSLALKSLSFSSNISVSAFSNGCLSMSGAQRPLRYSVVCEAAPQKKADSAAKRARQAEKRRTYNKARKSE
A A SCFALPSKF NLSLNAS S +P+S SS L+SLSFSSN+SVSAFSNGCLS+S AQRP RYSVVCEAAP KKADSAAKRARQAEKRR YNKARKSE
Subjt: AAASFSCFALPSKFGNLSLNASPSCLPVSSSSLALKSLSFSSNISVSAFSNGCLSMSGAQRPLRYSVVCEAAPQKKADSAAKRARQAEKRRTYNKARKSE
Query: IRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
I+TRMKK MEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEA+SVIDKAVKVGTLHRNTAA RKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
Subjt: IRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
| XP_022981947.1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic-like [Cucurbita maxima] | 3.0e-85 | 97.28 | Show/hide |
Query: MAAASFSCFALPSKFGNLSLNASPSCLPVSSSSLALKSLSFSSNISVSAFSNGCLSMSGAQRPLRYSVVCEAAPQKKADSAAKRARQAEKRRTYNKARKS
MAAASFSCFALPSKFGNLSLNAS SCLPVSSSSLAL+SLSFSSN+SVSAFS+GCLSMSGAQRPLRYSVVCEAAPQKKADSAAKRARQAEKRRTYNKARKS
Subjt: MAAASFSCFALPSKFGNLSLNASPSCLPVSSSSLALKSLSFSSNISVSAFSNGCLSMSGAQRPLRYSVVCEAAPQKKADSAAKRARQAEKRRTYNKARKS
Query: EIRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
EIRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLP+EKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
Subjt: EIRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
| XP_023525527.1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 8.7e-85 | 97.83 | Show/hide |
Query: MAAASFSCFALPSKFGNLSLNASPSCLPVSSSSLALKSLSFSSNISVSAFSNGCLSMSGAQRPLRYSVVCEAAPQKKADSAAKRARQAEKRRTYNKARKS
MAAASFSCFALPSKFGNLSLNAS SCLPVSSSSLALK LSFSSNISVSAFS+GCLSMSGAQRPLRYSVVCEAAPQKKADSAAKRARQAEKRRTYNKARKS
Subjt: MAAASFSCFALPSKFGNLSLNASPSCLPVSSSSLALKSLSFSSNISVSAFSNGCLSMSGAQRPLRYSVVCEAAPQKKADSAAKRARQAEKRRTYNKARKS
Query: EIRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
EIRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKAVEIHHGWYTP SPAAA
Subjt: EIRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A6J1CG14 30S ribosomal protein S20, chloroplastic | 9.1e-72 | 85.33 | Show/hide |
Query: MAAASFSCFALPSKFGNLSLNASPSCLPVSSSSLALKSLSFSSNISVSAFSNGCLSMSGAQRPLRYSVVCEAAPQKKADSAAKRARQAEKRRTYNKARKS
MAAA+ +CF++ SKF NLSLNAS S P SSSS LKSL+FSSN+S AFSNGCLSMS AQRPLRYSVVCEAAP+KK DSAAKRARQAEKRR YNKARKS
Subjt: MAAASFSCFALPSKFGNLSLNASPSCLPVSSSSLALKSLSFSSNISVSAFSNGCLSMSGAQRPLRYSVVCEAAPQKKADSAAKRARQAEKRRTYNKARKS
Query: EIRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
EI+TRMKK +EALDDLKKKPEAQSEEVL IEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAA RKSRLARRKKAVEIHHGWY PASPAAA
Subjt: EIRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
| A0A6J1F6F1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic-like | 9.1e-72 | 87.43 | Show/hide |
Query: AAASFSCFALPSKFGNLSLNASPSCLPVSSSSLALKSLSFSSNISVSAFSNGCLSMSGAQRPLRYSVVCEAAPQKKADSAAKRARQAEKRRTYNKARKSE
A A SCFALPSKF NLSLNAS S + +S SS L+SLSFSSN+SVSAFSNGCLS+S AQRP RYSVVCEAAP KKADSAAKRARQAEKRR YNKARKSE
Subjt: AAASFSCFALPSKFGNLSLNASPSCLPVSSSSLALKSLSFSSNISVSAFSNGCLSMSGAQRPLRYSVVCEAAPQKKADSAAKRARQAEKRRTYNKARKSE
Query: IRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
I+TRMKK MEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEA+SVIDKAVKVGTLHRNTAA RKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
Subjt: IRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
| A0A6J1FKZ1 30S ribosomal protein S20, chloroplastic | 1.2e-87 | 100 | Show/hide |
Query: MAAASFSCFALPSKFGNLSLNASPSCLPVSSSSLALKSLSFSSNISVSAFSNGCLSMSGAQRPLRYSVVCEAAPQKKADSAAKRARQAEKRRTYNKARKS
MAAASFSCFALPSKFGNLSLNASPSCLPVSSSSLALKSLSFSSNISVSAFSNGCLSMSGAQRPLRYSVVCEAAPQKKADSAAKRARQAEKRRTYNKARKS
Subjt: MAAASFSCFALPSKFGNLSLNASPSCLPVSSSSLALKSLSFSSNISVSAFSNGCLSMSGAQRPLRYSVVCEAAPQKKADSAAKRARQAEKRRTYNKARKS
Query: EIRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
EIRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
Subjt: EIRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
| A0A6J1IG57 30S ribosomal protein S20, chloroplastic-like | 6.3e-73 | 87.98 | Show/hide |
Query: AAASFSCFALPSKFGNLSLNASPSCLPVSSSSLALKSLSFSSNISVSAFSNGCLSMSGAQRPLRYSVVCEAAPQKKADSAAKRARQAEKRRTYNKARKSE
A A SCFALPSKF NLSLNAS S +P+S SS L+SLSFSSN+SVSAFSNGCLS+S AQRP RYSVVCEAAP KKADSAAKRARQAEKRR YNKARKSE
Subjt: AAASFSCFALPSKFGNLSLNASPSCLPVSSSSLALKSLSFSSNISVSAFSNGCLSMSGAQRPLRYSVVCEAAPQKKADSAAKRARQAEKRRTYNKARKSE
Query: IRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
I+TRMKK MEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEA+SVIDKAVKVGTLHRNTAA RKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
Subjt: IRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
| A0A6J1IVC5 30S ribosomal protein S20, chloroplastic-like | 1.5e-85 | 97.28 | Show/hide |
Query: MAAASFSCFALPSKFGNLSLNASPSCLPVSSSSLALKSLSFSSNISVSAFSNGCLSMSGAQRPLRYSVVCEAAPQKKADSAAKRARQAEKRRTYNKARKS
MAAASFSCFALPSKFGNLSLNAS SCLPVSSSSLAL+SLSFSSN+SVSAFS+GCLSMSGAQRPLRYSVVCEAAPQKKADSAAKRARQAEKRRTYNKARKS
Subjt: MAAASFSCFALPSKFGNLSLNASPSCLPVSSSSLALKSLSFSSNISVSAFSNGCLSMSGAQRPLRYSVVCEAAPQKKADSAAKRARQAEKRRTYNKARKS
Query: EIRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
EIRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLP+EKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
Subjt: EIRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| B0C2C8 30S ribosomal protein S20 | 4.0e-08 | 47.19 | Show/hide |
Query: SAAKRARQAEKRRTYNKARKSEIRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKA
SA KR AE+ R NKA KS I+T K+ A+DD K P +++ I+ ++ YS IDKAVKVG HRNT A +K+ LAR KA
Subjt: SAAKRARQAEKRRTYNKARKSEIRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKA
|
|
| B1WZT9 30S ribosomal protein S20 | 5.3e-08 | 42.22 | Show/hide |
Query: SAAKRARQAEKRRTYNKARKSEIRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKAV
SA KR R +E+ R NK+ KS +RT MKK ++A+++ P +++ V +++ ++ AYS IDKAVK LHRN A +K+RLA+ + V
Subjt: SAAKRARQAEKRRTYNKARKSEIRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKAV
|
|
| B7JWV1 30S ribosomal protein S20 | 6.9e-08 | 46.67 | Show/hide |
Query: SAAKRARQAEKRRTYNKARKSEIRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKAV
SA KR AE+ R +NKA KS +RT MKK EA+ P + V +E+ ++ AYS IDKAVK LHRN A +K+RLA+ K V
Subjt: SAAKRARQAEKRRTYNKARKSEIRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKAV
|
|
| P82130 30S ribosomal protein S20, chloroplastic | 6.0e-44 | 62.01 | Show/hide |
Query: MAAASFSCFALPSKFGNLSLNASPSCLPVSSSSLALKSLSFSSNISVSAFSNGCLSMSGAQRPLRYSVVCEAAPQKKADSAAKRARQAEKRRTYNKARKS
MA S C ++ SK NLS +++ P SS LK L+FS+N+S FS GC S+ QR +SVVCE A KKADSAAKR RQAE RR NKARKS
Subjt: MAAASFSCFALPSKFGNLSLNASPSCLPVSSSSLALKSLSFSSNISVSAFSNGCLSMSGAQRPLRYSVVCEAAPQKKADSAAKRARQAEKRRTYNKARKS
Query: EIRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPA
E++TRM+K EALD LKKK A +EE++PI+ LIAEAYS IDKAV GTLHRNTAA RKSRLAR KK VEIHHGWYTP+
Subjt: EIRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPA
|
|
| Q9ASV6 30S ribosomal protein S20, chloroplastic | 3.9e-43 | 60.96 | Show/hide |
Query: SCFALPSKFGNLSLNASPSCLPVSS-------SSLALKSLSFSSNIS-VSAFSNGCLSMSGAQRPLRYSVVCE-AAPQKKADSAAKRARQAEKRRTYNKA
SC L S+F LSL P SS S+ SLSFS ++S AFS G L Q+P+R +VCE AAP KKADSAAKRARQAEKRR YNK+
Subjt: SCFALPSKFGNLSLNASPSCLPVSS-------SSLALKSLSFSSNIS-VSAFSNGCLSMSGAQRPLRYSVVCE-AAPQKKADSAAKRARQAEKRRTYNKA
Query: RKSEIRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
+KSE RTRMKK +EAL+ LKKK +AQ++E++ +EKLI EAYS IDKAVKV LH+NT A RKSRLARRKKAVEIHHGWY P + AAA
Subjt: RKSEIRTRMKKAMEALDDLKKKPEAQSEEVLPIEKLIAEAYSVIDKAVKVGTLHRNTAAHRKSRLARRKKAVEIHHGWYTPASPAAA
|
|
