; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh01G012950 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh01G012950
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionUBP1-associated protein 2C-like
Genome locationCmo_Chr01:10293792..10299517
RNA-Seq ExpressionCmoCh01G012950
SyntenyCmoCh01G012950
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003723 - RNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000504 - RNA recognition motif domain
IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily
IPR035979 - RNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6607907.1 UBP1-associated protein 2C, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.6e-24199.77Show/hide
Query:  MDVVKKRKMDENGVPLTDSDDSLLKLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEE
        MDVVKKRKMDENGVPLTDSDDSLLKLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEE
Subjt:  MDVVKKRKMDENGVPLTDSDDSLLKLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEE

Query:  AVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQ
        AVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQ
Subjt:  AVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQ

Query:  TGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGGFSG
        TGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPG SGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGGFSG
Subjt:  TGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGGFSG

Query:  GLHGPPQLGHNTLNSSLGPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGSTGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGSGLYRLPPNSGGVPSNGYPDSL
        GLHGPPQLGHNTLNSSLGPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGSTGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGSGLYRLPPNSGGVPSNGYPDSL
Subjt:  GLHGPPQLGHNTLNSSLGPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGSTGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGSGLYRLPPNSGGVPSNGYPDSL

Query:  PYSLSSSSGYLNQHPHTTGTSPAPRVPPGGMYPNVPPFY
        PYSLSSSSGYLNQHPHTTGTSPAPRVPPGGMYPNVPPFY
Subjt:  PYSLSSSSGYLNQHPHTTGTSPAPRVPPGGMYPNVPPFY

XP_022940378.1 UBP1-associated protein 2C-like [Cucurbita moschata]4.1e-242100Show/hide
Query:  MDVVKKRKMDENGVPLTDSDDSLLKLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEE
        MDVVKKRKMDENGVPLTDSDDSLLKLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEE
Subjt:  MDVVKKRKMDENGVPLTDSDDSLLKLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEE

Query:  AVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQ
        AVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQ
Subjt:  AVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQ

Query:  TGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGGFSG
        TGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGGFSG
Subjt:  TGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGGFSG

Query:  GLHGPPQLGHNTLNSSLGPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGSTGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGSGLYRLPPNSGGVPSNGYPDSL
        GLHGPPQLGHNTLNSSLGPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGSTGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGSGLYRLPPNSGGVPSNGYPDSL
Subjt:  GLHGPPQLGHNTLNSSLGPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGSTGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGSGLYRLPPNSGGVPSNGYPDSL

Query:  PYSLSSSSGYLNQHPHTTGTSPAPRVPPGGMYPNVPPFY
        PYSLSSSSGYLNQHPHTTGTSPAPRVPPGGMYPNVPPFY
Subjt:  PYSLSSSSGYLNQHPHTTGTSPAPRVPPGGMYPNVPPFY

XP_022981162.1 UBP1-associated protein 2C-like [Cucurbita maxima]3.8e-23598.18Show/hide
Query:  MDVVKKRKMDENGVPLTDSDDSLLKLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEE
        MDVVKKRKMDENGVPLTDSDDS LKLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEE
Subjt:  MDVVKKRKMDENGVPLTDSDDSLLKLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEE

Query:  AVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQ
        AVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQ
Subjt:  AVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQ

Query:  TGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGGFSG
        TGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGGFSG
Subjt:  TGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGGFSG

Query:  GLHGPPQLGHNTLNSSLGPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGSTGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGSGLYRLPPNSGGVPSNGYPDSL
        GLHGPPQLGHNTLNSSLGPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGP    YGGPGSTGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGS LYRLPPNSGGVPSNGYPDSL
Subjt:  GLHGPPQLGHNTLNSSLGPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGSTGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGSGLYRLPPNSGGVPSNGYPDSL

Query:  PYSLSSSSGYLNQHPHTTGTSPAPRVPPGGMYPNVPPFY
        PYSLSSSSGYLN HPHTTGTSPAPRV PGGMYPNVPPFY
Subjt:  PYSLSSSSGYLNQHPHTTGTSPAPRVPPGGMYPNVPPFY

XP_023524648.1 UBP1-associated protein 2C-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.6e-24199.77Show/hide
Query:  MDVVKKRKMDENGVPLTDSDDSLLKLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEE
        MDVVKKRKMDENGVPLTDSDDSLLKLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEE
Subjt:  MDVVKKRKMDENGVPLTDSDDSLLKLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEE

Query:  AVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQ
        AVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQ
Subjt:  AVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQ

Query:  TGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGGFSG
        TGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGGFSG
Subjt:  TGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGGFSG

Query:  GLHGPPQLGHNTLNSSLGPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGSTGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGSGLYRLPPNSGGVPSNGYPDSL
        GLHGPPQLGHNTLNSSLGPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPG TGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGSGLYRLPPNSGGVPSNGYPDSL
Subjt:  GLHGPPQLGHNTLNSSLGPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGSTGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGSGLYRLPPNSGGVPSNGYPDSL

Query:  PYSLSSSSGYLNQHPHTTGTSPAPRVPPGGMYPNVPPFY
        PYSLSSSSGYLNQHPHTTGTSPAPRVPPGGMYPNVPPFY
Subjt:  PYSLSSSSGYLNQHPHTTGTSPAPRVPPGGMYPNVPPFY

XP_038899568.1 UBP1-associated protein 2C-like [Benincasa hispida]4.0e-21389.39Show/hide
Query:  MDVVKKRKMDENGVPLTDSDDSLLKLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEE
        MDVVKKRKMDENGV L DSD S+LKLS EDARKIIERFT DQLIDILQDAVS HSDVLDAVRSVAD DVAQRKLF+RGLGWDT+T+GLRKLFS+YGELEE
Subjt:  MDVVKKRKMDENGVPLTDSDDSLLKLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEE

Query:  AVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQ
        AVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNAPDVS+RKIYVANVPIDMAADKLL+HF LYGEIEEGPLGFDKQ
Subjt:  AVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQ

Query:  TGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGGFSG
        TGKCRGYALFVYKK EGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGG+GPDGVQGSVGNQG+VHGDGM MPSQAP+PGSMGG YGGP G+GSYGGFSG
Subjt:  TGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGGFSG

Query:  GLHG-PPQLGHNTLNSSL---GPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGSTGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGSGLYRLPPNSGGVPSNGY
        GLH  PPQLGHN +NSSL   GPGLSSMGSQT NSLNGTGGYGGGLGG PYGGGYGGPGS+GFSG+  G AGG GS+ AGTGSGLYRLPPNSGG+PSNGY
Subjt:  GLHG-PPQLGHNTLNSSL---GPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGSTGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGSGLYRLPPNSGGVPSNGY

Query:  PDSLPYSLSSSSGYLNQHPHTTGTSPAPRVPPGGMYPNVPPFY
        P+SLPYSLSS +GY NQH  TTGTSPAPRVPPGGMYPNVPPFY
Subjt:  PDSLPYSLSSSSGYLNQHPHTTGTSPAPRVPPGGMYPNVPPFY

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KYY6 Uncharacterized protein7.3e-16875.34Show/hide
Query:  MDVVKKRKMDENGVPLTDSDDSLLKLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEE
        MDV KKR+MDENGV    S+ S  +++PEDARKII+RFTPDQLIDILQDAVS H DVLDAVRS+AD+DV+QRKLFIRGL  DT+T+GLR LFS YGELEE
Subjt:  MDVVKKRKMDENGVPLTDSDDSLLKLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEE

Query:  AVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQ
        AVVI+DKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAA G +G NSNA D+S+RKIYVANVP+DM ADKLLAHF LYGEIEEGPLGFDKQ
Subjt:  AVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQ

Query:  TGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGGFSG
        TGKCRGYALFVYKK EGAQAALVDPIKTI+GRQ+SCK+ANDGKKGKPGG GPDG Q     QGNVHGDGM M   + MPGS GGQYGGPGG+GSYGGFS 
Subjt:  TGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGGFSG

Query:  GLHGPPQLGHNTLNSSLGPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGST-GFSGLSAGPAGGQGS--SGAGTGSGLYRLPPNSGGVPSNGYP
        GL G   L H+ LNSS+GPGLSS+G Q  +SL  +GGY    GGGPYGGGYGGPGS  G  G   G  GG G    GAG  S LYRLP +S G+PS GYP
Subjt:  GLHGPPQLGHNTLNSSLGPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGST-GFSGLSAGPAGGQGS--SGAGTGSGLYRLPPNSGGVPSNGYP

Query:  DSLPYSLSSSSGYLNQHPHTTGTSPAPRVPPGGMYPNVPPFY
        DS  YS+SS+SG+ NQH    GTSPAPRVPPGGMYPNVPP+Y
Subjt:  DSLPYSLSSSSGYLNQHPHTTGTSPAPRVPPGGMYPNVPPFY

A0A6J1CQ00 UBP1-associated protein 2C-like2.3e-20688.41Show/hide
Query:  MDVVKKRKMDENGVPLTDSDDSLLKLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEE
        MDVVKKRK+DENGV L DSD S LKLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVS HSDVLDAVRSVAD DV+QRKLFIRGLGWDT+T+GLR LFS YGELEE
Subjt:  MDVVKKRKMDENGVPLTDSDDSLLKLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEE

Query:  AVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQ
        AVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNA DVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHF LYGEIEEGPLGFDKQ
Subjt:  AVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQ

Query:  TGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGGFSG
        TGKCRGYALFVYKK EGAQAALVDPIKTIEGRQVSCK+ANDGKKGKPGG+GPDG Q SVG+QG+ HGDG+GMPSQAPMPGSMGG YGGPGG+GSYGGF+G
Subjt:  TGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGGFSG

Query:  GLHGPPQLGHNTLNSSL-GPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGSTGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGSGLYRLPPNSGGVPSNGYPDS
        GLHGPPQLGHN LNSSL GPGL SM +Q QNSLNGTGGYGGGL GGPY GGYGGPG + FSGL AG AGG G + AGTGSGLYRLPPNS G+PSNGY DS
Subjt:  GLHGPPQLGHNTLNSSL-GPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGSTGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGSGLYRLPPNSGGVPSNGYPDS

Query:  LPYSLSSSSGYLNQHPHTTGTSPAPRVPPGGMYPNVPPFY
        LPYSL SSSGY NQH   TGTSPAPRVPPGGMYPNVPPFY
Subjt:  LPYSLSSSSGYLNQHPHTTGTSPAPRVPPGGMYPNVPPFY

A0A6J1FJY4 UBP1-associated protein 2C-like2.0e-242100Show/hide
Query:  MDVVKKRKMDENGVPLTDSDDSLLKLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEE
        MDVVKKRKMDENGVPLTDSDDSLLKLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEE
Subjt:  MDVVKKRKMDENGVPLTDSDDSLLKLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEE

Query:  AVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQ
        AVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQ
Subjt:  AVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQ

Query:  TGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGGFSG
        TGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGGFSG
Subjt:  TGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGGFSG

Query:  GLHGPPQLGHNTLNSSLGPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGSTGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGSGLYRLPPNSGGVPSNGYPDSL
        GLHGPPQLGHNTLNSSLGPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGSTGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGSGLYRLPPNSGGVPSNGYPDSL
Subjt:  GLHGPPQLGHNTLNSSLGPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGSTGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGSGLYRLPPNSGGVPSNGYPDSL

Query:  PYSLSSSSGYLNQHPHTTGTSPAPRVPPGGMYPNVPPFY
        PYSLSSSSGYLNQHPHTTGTSPAPRVPPGGMYPNVPPFY
Subjt:  PYSLSSSSGYLNQHPHTTGTSPAPRVPPGGMYPNVPPFY

A0A6J1IT82 UBP1-associated protein 2C-like1.8e-23598.18Show/hide
Query:  MDVVKKRKMDENGVPLTDSDDSLLKLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEE
        MDVVKKRKMDENGVPLTDSDDS LKLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEE
Subjt:  MDVVKKRKMDENGVPLTDSDDSLLKLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEE

Query:  AVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQ
        AVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQ
Subjt:  AVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQ

Query:  TGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGGFSG
        TGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGGFSG
Subjt:  TGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGGFSG

Query:  GLHGPPQLGHNTLNSSLGPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGSTGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGSGLYRLPPNSGGVPSNGYPDSL
        GLHGPPQLGHNTLNSSLGPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGP    YGGPGSTGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGS LYRLPPNSGGVPSNGYPDSL
Subjt:  GLHGPPQLGHNTLNSSLGPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGSTGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGSGLYRLPPNSGGVPSNGYPDSL

Query:  PYSLSSSSGYLNQHPHTTGTSPAPRVPPGGMYPNVPPFY
        PYSLSSSSGYLN HPHTTGTSPAPRV PGGMYPNVPPFY
Subjt:  PYSLSSSSGYLNQHPHTTGTSPAPRVPPGGMYPNVPPFY

A0A6P4AU64 UBP1-associated protein 2C9.5e-16873.03Show/hide
Query:  MDVVKKRKMDENGVPLTDSDDSLLKLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEE
        MD+ KKRKM+ENG    D+D S+LKL+PEDARKIIERFTPDQLI+ILQ+AV+ H+DVL+AVRSVAD D +QRKLFIRGLGWDTTT+GLR LFS YGELEE
Subjt:  MDVVKKRKMDENGVPLTDSDDSLLKLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEE

Query:  AVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSN---APDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGF
        AVVILDK TGKSKGYGFVTF+HVDGALLALKEPSK IDGR+TVTQLAAAGN+G+N+N   A DVS+RKIYVANVP DM ADKLLAHF LYGEIEEGPLGF
Subjt:  AVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSN---APDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGF

Query:  DKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGG
        DKQTGKCRGYALFVYK  EGAQAALVDP+KTIEGRQ++CK A DGKKGK  GSG DG+Q  VG  GN HGDGMG+   + MPGS+GGQYGGP G+GSYGG
Subjt:  DKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGG

Query:  FSGGLHGPPQLGHNTLNSSL-GPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGSTGFSGLSAGPAGG-------------QGSSGAGTGSGLYR
        FSGGL GPP +GH+ LNSS+ GPGLSS+G+Q  +SL G GGYG GL GGPY GGYGGPGS GF GL +G AGG              G +G G GS LYR
Subjt:  FSGGLHGPPQLGHNTLNSSL-GPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGSTGFSGLSAGPAGG-------------QGSSGAGTGSGLYR

Query:  LPPNSGGVPSNGYPDSLPYSLSSSSGYLNQHPHTTGTSPAPRVPPGGMYPNVPPFY
        LPP+SGG+PS+GYPD+  Y++SSSS Y  QH    GTSP PRVPPGGMYP  PP+Y
Subjt:  LPPNSGGVPSNGYPDSLPYSLSSSSGYLNQHPHTTGTSPAPRVPPGGMYPNVPPFY

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80678 UBP1-associated protein 2B1.6e-4239.2Show/hide
Query:  EDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEEAVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALL
        E    ++E F+ DQL+ +L++A   H DV + +R VAD+D+  RK+F+ GLGWDT  D L   F  YGE+E+   ++DK +G+SKGYGF+ FK   GA  
Subjt:  EDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEEAVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALL

Query:  ALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNA-------PDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQAA
        ALK+P K I  R+T  QLA+ G    N          P+   RKIYV+NV  D+   KLL  F  +GEIEEGPLG DK TG+ +G+ALFVY+  E A+ A
Subjt:  ALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNA-------PDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQAA

Query:  LVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGGFSGGLHGPPQLGHNTLNSSLGPGL
        L +P KT EG  + C  AND         GP  V+    N  N H       S+     + G  YG PGG   +G F  G +   Q  +  +  +L   L
Subjt:  LVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGGFSGGLHGPPQLGHNTLNSSLGPGL

Query:  SSMGS------QTQNSLNGTGGYG--GGLGGGPYGGGYG-----GPGSTGFSGLSAGPAGG-----QGSSGAGTG
        +S G+          +L GT G    G +GG P   GYG      PG     G  AG  GG      G  GAG G
Subjt:  SSMGS------QTQNSLNGTGGYG--GGLGGGPYGGGYG-----GPGSTGFSGLSAGPAGG-----QGSSGAGTG

Q9CX86 Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein A01.4e-2233.11Show/hide
Query:  KLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEEAVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNAPDVSMRKIYVANVP
        KLFI GL   T+  GLR  F  +G L + VV+++  T +S+ +GFVT+ +V+ A  A+      +DG  TV    A     S        ++K++V  + 
Subjt:  KLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEEAVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNAPDVSMRKIYVANVP

Query:  IDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGP----DGVQGSVGNQGNVHGD
         D+A   L+ HF  +G +E+  +  DKQ+GK RG+    ++  + A  A V     I+G +V  K A   +    GG G      G  G  G  G   G 
Subjt:  IDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGP----DGVQGSVGNQGNVHGD

Query:  GMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGGFSGGLHGPPQLGHNTLNSSLGPGLSSMGSQTQNSLN-------GTGGYGGGLGG----GPYGGGYGG
        G      A   G  GG Y   GG G YG + GG  G    G     S  G G    GS +Q+  +       G GG GG  GG    GPY GGYGG
Subjt:  GMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGGFSGGLHGPPQLGHNTLNSSLGPGLSSMGSQTQNSLN-------GTGGYGGGLGG----GPYGGGYGG

Q9LES2 UBP1-associated protein 2A4.3e-4035.61Show/hide
Query:  EDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEEAVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALL
        E  + ++E F+ +Q++ +L++A   H DV + +R VAD+D   RK+F+ GLGWDT T+ L + F  YGE+E+   + DK +GKSKGYGF+ +K   GA  
Subjt:  EDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEEAVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALL

Query:  ALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAG-------------NTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKA
        ALK+P K I  R+T  QLA+ G             +  +  +  + + +KIYV+NV  ++   KLL  F  +GEIEEGPLG DK TG+ +G+ LFVYK +
Subjt:  ALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAG-------------NTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKA

Query:  EGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGS-YGGFSGGLHGP------PQL
        E A+ AL +P KT EG  + C+ A DG K               G Q   H +     +         G YG PGG G    G   G+ GP      P +
Subjt:  EGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGS-YGGFSGGLHGP------PQL

Query:  GH--NTLNSSLGPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGSTGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGSGLYRLPPNSGGVPSNGYPDSLPY
        G     L +S G GL+   +  Q  L   G  G   G  P G G G P   G   ++ G   G G+     G   Y+ P    G  S G     PY
Subjt:  GH--NTLNSSLGPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGSTGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGSGLYRLPPNSGGVPSNGYPDSLPY

Q9LJ04 RNA-binding protein P2.5e-4838.27Show/hide
Query:  DENGVPLTDSDDSLLKLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEEAVVILDKAT
        DE+G    + ++   +   +  + ++  F  DQL+++L  A   H DVL AV   AD D A RK+F+ GLGWD T + L + FS YGE+E+  V+ D+AT
Subjt:  DENGVPLTDSDDSLLKLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEEAVVILDKAT

Query:  GKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNT---GSNSN-APDV---------------SMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEI
        GK KGYGF+ F    GA  AL+EP K I  R T  QLA+ G     G  +N AP V               + RKI+V+NV  D+   KLL  F  YGEI
Subjt:  GKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNT---GSNSN-APDV---------------SMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEI

Query:  EEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPG
        EEGPLG DK TGK +G+ALFVYK  + A+ AL +P K  EG  + C+ A DG K   GG G  G+ G+  + G     G G  S + +PG+  G +  P 
Subjt:  EEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPG

Query:  GLGSYGGFSGGLHGPPQLGHNTLNSSLGPGLSSM-----GSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGSTGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGSGLYRLP
         + S     G   GP       +N +LG  L+++     G    N++ G G  G GL   P  G   G GS+G  G+   P  G    G G G G    P
Subjt:  GLGSYGGFSGGLHGPPQLGHNTLNSSLGPGLSSM-----GSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGSTGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGSGLYRLP

Query:  PNSGG
        P   G
Subjt:  PNSGG

Q9LKA4 UBP1-associated protein 2C1.1e-12360.45Show/hide
Query:  MDVVKKRKMDENGVPLTDSDDSLL---KLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGE
        MD++KKRK+DENG  L  +    +   +LSP+DARKIIERFT DQL+D+LQ+A+  H DVL++VR  AD D++QRKLFIRGL  DTTT+GLR LFS YG+
Subjt:  MDVVKKRKMDENGVPLTDSDDSLL---KLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGE

Query:  LEEAVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGF
        LEEA+VILDK TGKSKGYGFVTF HVDGALLALKEPSK IDGRVTVTQLAA+GN G+ S   D+SMRKIYVANVP DM AD+LL HF+ YG++EEGPLGF
Subjt:  LEEAVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGF

Query:  DKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKK-GKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYG
        DK TGK RG+ALFVYK AEGAQAAL DP+K I+G+ ++CK A DGKK GKPG   P    G  G+ G+VHG+GMGM   A       G YG  GG+ +YG
Subjt:  DKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKK-GKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYG

Query:  GFSGGLHGPPQLGHNTLNSSLGPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGSTGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGSGLYRLPPNS--GGVPSN
        G+SG   GPP    N+ +SS+G               G+ GYGG      + GGYGGPG TG  G   G  GG G  G GTGSG YR+PP+S  GG    
Subjt:  GFSGGLHGPPQLGHNTLNSSLGPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGSTGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGSGLYRLPPNS--GGVPSN

Query:  GYPDSLPYSLSSSSGYLNQHPHTTGTSPAPRVPPGGMYPNVPPFY
        GYP+S  Y LSSS+GY  QH    GTSP PRVP GGMYPN PP Y
Subjt:  GYPDSLPYSLSSSSGYLNQHPHTTGTSPAPRVPPGGMYPNVPPFY

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G41060.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein1.1e-4339.2Show/hide
Query:  EDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEEAVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALL
        E    ++E F+ DQL+ +L++A   H DV + +R VAD+D+  RK+F+ GLGWDT  D L   F  YGE+E+   ++DK +G+SKGYGF+ FK   GA  
Subjt:  EDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEEAVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALL

Query:  ALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNA-------PDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQAA
        ALK+P K I  R+T  QLA+ G    N          P+   RKIYV+NV  D+   KLL  F  +GEIEEGPLG DK TG+ +G+ALFVY+  E A+ A
Subjt:  ALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNA-------PDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQAA

Query:  LVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGGFSGGLHGPPQLGHNTLNSSLGPGL
        L +P KT EG  + C  AND         GP  V+    N  N H       S+     + G  YG PGG   +G F  G +   Q  +  +  +L   L
Subjt:  LVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGGFSGGLHGPPQLGHNTLNSSLGPGL

Query:  SSMGS------QTQNSLNGTGGYG--GGLGGGPYGGGYG-----GPGSTGFSGLSAGPAGG-----QGSSGAGTG
        +S G+          +L GT G    G +GG P   GYG      PG     G  AG  GG      G  GAG G
Subjt:  SSMGS------QTQNSLNGTGGYG--GGLGGGPYGGGYG-----GPGSTGFSGLSAGPAGG-----QGSSGAGTG

AT2G41060.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein1.1e-4339.2Show/hide
Query:  EDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEEAVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALL
        E    ++E F+ DQL+ +L++A   H DV + +R VAD+D+  RK+F+ GLGWDT  D L   F  YGE+E+   ++DK +G+SKGYGF+ FK   GA  
Subjt:  EDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEEAVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALL

Query:  ALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNA-------PDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQAA
        ALK+P K I  R+T  QLA+ G    N          P+   RKIYV+NV  D+   KLL  F  +GEIEEGPLG DK TG+ +G+ALFVY+  E A+ A
Subjt:  ALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNA-------PDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQAA

Query:  LVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGGFSGGLHGPPQLGHNTLNSSLGPGL
        L +P KT EG  + C  AND         GP  V+    N  N H       S+     + G  YG PGG   +G F  G +   Q  +  +  +L   L
Subjt:  LVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGGFSGGLHGPPQLGHNTLNSSLGPGL

Query:  SSMGS------QTQNSLNGTGGYG--GGLGGGPYGGGYG-----GPGSTGFSGLSAGPAGG-----QGSSGAGTG
        +S G+          +L GT G    G +GG P   GYG      PG     G  AG  GG      G  GAG G
Subjt:  SSMGS------QTQNSLNGTGGYG--GGLGGGPYGGGYG-----GPGSTGFSGLSAGPAGG-----QGSSGAGTG

AT3G15010.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein7.5e-12560.45Show/hide
Query:  MDVVKKRKMDENGVPLTDSDDSLL---KLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGE
        MD++KKRK+DENG  L  +    +   +LSP+DARKIIERFT DQL+D+LQ+A+  H DVL++VR  AD D++QRKLFIRGL  DTTT+GLR LFS YG+
Subjt:  MDVVKKRKMDENGVPLTDSDDSLL---KLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGE

Query:  LEEAVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGF
        LEEA+VILDK TGKSKGYGFVTF HVDGALLALKEPSK IDGRVTVTQLAA+GN G+ S   D+SMRKIYVANVP DM AD+LL HF+ YG++EEGPLGF
Subjt:  LEEAVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGF

Query:  DKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKK-GKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYG
        DK TGK RG+ALFVYK AEGAQAAL DP+K I+G+ ++CK A DGKK GKPG   P    G  G+ G+VHG+GMGM   A       G YG  GG+ +YG
Subjt:  DKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKK-GKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYG

Query:  GFSGGLHGPPQLGHNTLNSSLGPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGSTGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGSGLYRLPPNS--GGVPSN
        G+SG   GPP    N+ +SS+G               G+ GYGG      + GGYGGPG TG  G   G  GG G  G GTGSG YR+PP+S  GG    
Subjt:  GFSGGLHGPPQLGHNTLNSSLGPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGSTGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGSGLYRLPPNS--GGVPSN

Query:  GYPDSLPYSLSSSSGYLNQHPHTTGTSPAPRVPPGGMYPNVPPFY
        GYP+S  Y LSSS+GY  QH    GTSP PRVP GGMYPN PP Y
Subjt:  GYPDSLPYSLSSSSGYLNQHPHTTGTSPAPRVPPGGMYPNVPPFY

AT3G15010.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein7.5e-12560.45Show/hide
Query:  MDVVKKRKMDENGVPLTDSDDSLL---KLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGE
        MD++KKRK+DENG  L  +    +   +LSP+DARKIIERFT DQL+D+LQ+A+  H DVL++VR  AD D++QRKLFIRGL  DTTT+GLR LFS YG+
Subjt:  MDVVKKRKMDENGVPLTDSDDSLL---KLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGE

Query:  LEEAVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGF
        LEEA+VILDK TGKSKGYGFVTF HVDGALLALKEPSK IDGRVTVTQLAA+GN G+ S   D+SMRKIYVANVP DM AD+LL HF+ YG++EEGPLGF
Subjt:  LEEAVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGF

Query:  DKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKK-GKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYG
        DK TGK RG+ALFVYK AEGAQAAL DP+K I+G+ ++CK A DGKK GKPG   P    G  G+ G+VHG+GMGM   A       G YG  GG+ +YG
Subjt:  DKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKK-GKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYG

Query:  GFSGGLHGPPQLGHNTLNSSLGPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGSTGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGSGLYRLPPNS--GGVPSN
        G+SG   GPP    N+ +SS+G               G+ GYGG      + GGYGGPG TG  G   G  GG G  G GTGSG YR+PP+S  GG    
Subjt:  GFSGGLHGPPQLGHNTLNSSLGPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGSTGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGSGLYRLPPNS--GGVPSN

Query:  GYPDSLPYSLSSSSGYLNQHPHTTGTSPAPRVPPGGMYPNVPPFY
        GYP+S  Y LSSS+GY  QH    GTSP PRVP GGMYPN PP Y
Subjt:  GYPDSLPYSLSSSSGYLNQHPHTTGTSPAPRVPPGGMYPNVPPFY

AT3G56860.3 UBP1-associated protein 2A3.0e-4135.61Show/hide
Query:  EDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEEAVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALL
        E  + ++E F+ +Q++ +L++A   H DV + +R VAD+D   RK+F+ GLGWDT T+ L + F  YGE+E+   + DK +GKSKGYGF+ +K   GA  
Subjt:  EDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEEAVVILDKATGKSKGYGFVTFKHVDGALL

Query:  ALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAG-------------NTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKA
        ALK+P K I  R+T  QLA+ G             +  +  +  + + +KIYV+NV  ++   KLL  F  +GEIEEGPLG DK TG+ +G+ LFVYK +
Subjt:  ALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAG-------------NTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKA

Query:  EGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGS-YGGFSGGLHGP------PQL
        E A+ AL +P KT EG  + C+ A DG K               G Q   H +     +         G YG PGG G    G   G+ GP      P +
Subjt:  EGAQAALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGS-YGGFSGGLHGP------PQL

Query:  GH--NTLNSSLGPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGSTGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGSGLYRLPPNSGGVPSNGYPDSLPY
        G     L +S G GL+   +  Q  L   G  G   G  P G G G P   G   ++ G   G G+     G   Y+ P    G  S G     PY
Subjt:  GH--NTLNSSLGPGLSSMGSQTQNSLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGSTGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGSGLYRLPPNSGGVPSNGYPDSLPY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACGTCGTTAAGAAGCGAAAGATGGACGAAAACGGCGTCCCTCTTACCGACTCCGACGATTCTTTGTTAAAACTTTCACCGGAAGATGCTCGCAAGATCATCGAACG
GTTCACTCCGGATCAACTCATCGACATTCTTCAAGACGCGGTTTCCTGTCATTCGGATGTGCTTGACGCAGTACGTTCTGTTGCTGATCAAGATGTTGCTCAGCGTAAGC
TCTTTATTCGTGGGCTTGGTTGGGACACTACGACCGATGGTCTCCGGAAGCTTTTTTCTATATATGGCGAATTGGAAGAGGCCGTCGTTATTCTAGATAAGGCCACGGGG
AAGTCGAAAGGGTATGGGTTTGTTACGTTTAAGCATGTTGATGGTGCTCTACTGGCTTTGAAAGAGCCGAGTAAAACGATTGATGGGCGTGTCACTGTGACTCAATTGGC
AGCTGCAGGAAATACTGGGTCTAACTCCAACGCCCCCGATGTGTCGATGAGGAAAATTTACGTGGCTAATGTGCCGATTGACATGGCTGCTGATAAATTGCTTGCGCATT
TTGTTCTGTACGGGGAGATTGAGGAAGGGCCTTTGGGGTTCGATAAGCAGACGGGGAAGTGTAGGGGTTATGCATTGTTTGTCTACAAGAAGGCGGAGGGTGCACAAGCG
GCGTTGGTGGATCCGATTAAGACTATTGAAGGGCGACAAGTAAGCTGTAAATATGCCAATGATGGAAAGAAGGGAAAGCCTGGAGGTTCTGGGCCTGATGGCGTTCAGGG
CTCTGTTGGTAATCAAGGTAATGTTCATGGAGATGGGATGGGTATGCCTTCGCAGGCTCCGATGCCTGGTTCAATGGGTGGACAGTATGGGGGACCTGGCGGTCTTGGAT
CATACGGTGGGTTTTCAGGAGGTCTCCATGGTCCACCACAGCTTGGGCATAATACGCTGAACTCGTCGTTGGGACCAGGCTTGTCTTCTATGGGTAGTCAAACACAAAAT
TCTCTGAATGGTACTGGTGGGTATGGTGGTGGGCTTGGCGGCGGCCCTTACGGTGGTGGATACGGTGGTCCTGGGTCAACTGGCTTTTCTGGTCTGAGTGCTGGTCCAGC
CGGCGGCCAGGGAAGTTCCGGTGCTGGAACGGGATCTGGTTTGTACAGGTTGCCCCCGAATTCTGGGGGAGTTCCTTCTAATGGTTATCCAGATAGTTTGCCATATAGTT
TATCGTCTTCGTCTGGTTATCTAAATCAGCACCCACACACCACGGGTACATCACCGGCGCCCCGAGTGCCGCCTGGGGGCATGTACCCTAATGTGCCGCCATTTTATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AGGAATTTGTAGGATTTTCTTTAGGGTTTACGCTCTCTTCCCTGTGTTCCCTCCCTTCACGTCGTTCTTGACTCGACCATGGACGTCGTTAAGAAGCGAAAGATGGACGA
AAACGGCGTCCCTCTTACCGACTCCGACGATTCTTTGTTAAAACTTTCACCGGAAGATGCTCGCAAGATCATCGAACGGTTCACTCCGGATCAACTCATCGACATTCTTC
AAGACGCGGTTTCCTGTCATTCGGATGTGCTTGACGCAGTACGTTCTGTTGCTGATCAAGATGTTGCTCAGCGTAAGCTCTTTATTCGTGGGCTTGGTTGGGACACTACG
ACCGATGGTCTCCGGAAGCTTTTTTCTATATATGGCGAATTGGAAGAGGCCGTCGTTATTCTAGATAAGGCCACGGGGAAGTCGAAAGGGTATGGGTTTGTTACGTTTAA
GCATGTTGATGGTGCTCTACTGGCTTTGAAAGAGCCGAGTAAAACGATTGATGGGCGTGTCACTGTGACTCAATTGGCAGCTGCAGGAAATACTGGGTCTAACTCCAACG
CCCCCGATGTGTCGATGAGGAAAATTTACGTGGCTAATGTGCCGATTGACATGGCTGCTGATAAATTGCTTGCGCATTTTGTTCTGTACGGGGAGATTGAGGAAGGGCCT
TTGGGGTTCGATAAGCAGACGGGGAAGTGTAGGGGTTATGCATTGTTTGTCTACAAGAAGGCGGAGGGTGCACAAGCGGCGTTGGTGGATCCGATTAAGACTATTGAAGG
GCGACAAGTAAGCTGTAAATATGCCAATGATGGAAAGAAGGGAAAGCCTGGAGGTTCTGGGCCTGATGGCGTTCAGGGCTCTGTTGGTAATCAAGGTAATGTTCATGGAG
ATGGGATGGGTATGCCTTCGCAGGCTCCGATGCCTGGTTCAATGGGTGGACAGTATGGGGGACCTGGCGGTCTTGGATCATACGGTGGGTTTTCAGGAGGTCTCCATGGT
CCACCACAGCTTGGGCATAATACGCTGAACTCGTCGTTGGGACCAGGCTTGTCTTCTATGGGTAGTCAAACACAAAATTCTCTGAATGGTACTGGTGGGTATGGTGGTGG
GCTTGGCGGCGGCCCTTACGGTGGTGGATACGGTGGTCCTGGGTCAACTGGCTTTTCTGGTCTGAGTGCTGGTCCAGCCGGCGGCCAGGGAAGTTCCGGTGCTGGAACGG
GATCTGGTTTGTACAGGTTGCCCCCGAATTCTGGGGGAGTTCCTTCTAATGGTTATCCAGATAGTTTGCCATATAGTTTATCGTCTTCGTCTGGTTATCTAAATCAGCAC
CCACACACCACGGGTACATCACCGGCGCCCCGAGTGCCGCCTGGGGGCATGTACCCTAATGTGCCGCCATTTTATTGAATGCTTTATGTGCTTCACCTGATTGCGTAGAA
TGCCGACTATCGATCTGATTTGGTGAATGTATTGGCTTTTGCTTTTTCTAGATGTTTTTGAGTGCTTGTAGAAAGAAATCATTCAATGGTGTTTTTGTACTTGTCTACAA
TTAATATGCTTTTGGTTTCATCCCCTCCAAAATAGTCTAACAAGTGATCGCTTATTTCTGTGCCCCCCCCCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDVVKKRKMDENGVPLTDSDDSLLKLSPEDARKIIERFTPDQLIDILQDAVSCHSDVLDAVRSVADQDVAQRKLFIRGLGWDTTTDGLRKLFSIYGELEEAVVILDKATG
KSKGYGFVTFKHVDGALLALKEPSKTIDGRVTVTQLAAAGNTGSNSNAPDVSMRKIYVANVPIDMAADKLLAHFVLYGEIEEGPLGFDKQTGKCRGYALFVYKKAEGAQA
ALVDPIKTIEGRQVSCKYANDGKKGKPGGSGPDGVQGSVGNQGNVHGDGMGMPSQAPMPGSMGGQYGGPGGLGSYGGFSGGLHGPPQLGHNTLNSSLGPGLSSMGSQTQN
SLNGTGGYGGGLGGGPYGGGYGGPGSTGFSGLSAGPAGGQGSSGAGTGSGLYRLPPNSGGVPSNGYPDSLPYSLSSSSGYLNQHPHTTGTSPAPRVPPGGMYPNVPPFY