; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh01G013510 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh01G013510
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionSerine/arginine repetitive matrix-like protein
Genome locationCmo_Chr01:10695397..10696626
RNA-Seq ExpressionCmoCh01G013510
SyntenyCmoCh01G013510
Gene Ontology termsGO:0016310 - phosphorylation (biological process)
GO:0016301 - kinase activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6591844.1 hypothetical protein SDJN03_14190, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.1e-17181.71Show/hide
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XP_022981104.1 uncharacterized protein LOC111480353 [Cucurbita maxima]1.2e-21998.78Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1FD24 probable membrane-associated kinase regulator 35.6e-17080.73Show/hide
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A0A6J1FNE5 uncharacterized protein LOC1114458384.3e-223100Show/hide
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A0A6J1IF15 uncharacterized protein LOC1114759925.0e-17181.71Show/hide
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A0A6J1J120 uncharacterized protein LOC1114803535.9e-22098.78Show/hide
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A0A6P3Z940 Uncharacterized protein3.0e-11558.88Show/hide
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         DGKL+PL +SSVK S+ + ++T         E  +RSP+T+  RR TEI G D Y FSP+APRCSSRWRELLGLKK      +++KNE+ KT   SSS 
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          +          R+GRSP+RR  GES  V SR VS+DSPRMNSSGKIVFQSLERSSSSPSSFNGGPR KH G+ERSYSANVR+ PVLNVPV SLRGSSK
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Query:  SSGSMFGFSQLFSSPQKRTEVTCGG----GKGQTRQHCRNRITRT
        +  S+FGF QLFSSPQKR     GG    G GQ + + RNR  RT
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G56020.1 unknown protein2.2e-6544.39Show/hide
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        MASACV + G+ PE F        +SYGW SPR S +R   DD+  + S  K     +   P+   P +          DFEF LEDPVT++ ADELF D
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Query:  GKLMPLQISSVKSSVKKLSSTEIGLR-----SPDTMTPRRVTEIDGADPYSFSPRAPRCSSRWRELLGLKKATQMTNTSAKNENPKTELSSSSNRMK--S
        GKL+PL+ S  K++    S+T          SP+ +   R  E++ +D   FSP+APRC++RWRELLGLK+   + N   + E+ K   SSSS   K  S
Subjt:  GKLMPLQISSVKSSVKKLSSTEIGLR-----SPDTMTPRRVTEIDGADPYSFSPRAPRCSSRWRELLGLKKATQMTNTSAKNENPKTELSSSSNRMK--S

Query:  LKQFLHRNSKLVSSESTDALYHPLLKDLDY-ESVFLSSARLSL-SSSSSGHSHEDLPRLSLDFDKPSKF----NQEHKNRINLVKTRVSQSEAKRIGRSP
         KQFLHR SK     S+ A   PL K+ D  ES+ ++S+RLSL SSSSS H  +DLPRLSLD DKPS      ++ H   +N  + R+++        +P
Subjt:  LKQFLHRNSKLVSSESTDALYHPLLKDLDY-ESVFLSSARLSL-SSSSSGHSHEDLPRLSLDFDKPSKF----NQEHKNRINLVKTRVSQSEAKRIGRSP

Query:  -VRRTPGESGRVKSR--EVSMDSPRMNSSGKIVFQSLERSSSSPSSFNGGPRLK-HNGIERSYSANVRVPPVLNVPVSSLRGSSKSSGSMFGFSQLFSSP
         V  +   S  ++SR   V+ DSPR+N+SGKIVF  LERSSSSP SF GGPR+K H+G+ RSYSANVR+ PVLNVPV SL+     SG  FG  QLFSS 
Subjt:  -VRRTPGESGRVKSR--EVSMDSPRMNSSGKIVFQSLERSSSSPSSFNGGPRLK-HNGIERSYSANVRVPPVLNVPVSSLRGSSKSSGSMFGFSQLFSSP

Query:  QKRTEVT-CGGGKGQTRQH-CRNRITRT
           +  +   G K Q + +  +NRI RT
Subjt:  QKRTEVT-CGGGKGQTRQH-CRNRITRT

AT1G79060.1 unknown protein2.8e-7345.79Show/hide
Query:  MASACVNNVGIQPENFLDGSRTAYTSYGWLSPRASFSREYPDDSSANLSGFKLSPSAIADTPQTSKPAILGTDLEGSSSDFEFRL-EDPVTLIPADELFF
        MAS CVNNV +  +         + +YG  +PRASFSR+          G + S S  ++ P+              + DFEFRL EDPV ++PADELF 
Subjt:  MASACVNNVGIQPENFLDGSRTAYTSYGWLSPRASFSREYPDDSSANLSGFKLSPSAIADTPQTSKPAILGTDLEGSSSDFEFRL-EDPVTLIPADELFF

Query:  DGKLMPLQISSVKSSVKKLSSTEIGLRSPDTMTPRRVTEID---GADPYSFSPRAPRCSSRWRELLGLKKATQMTNTSAKNENPKTELSSSSNRMKSLKQ
        DGKL+  Q        ++  +TEIG           V EI+   G D  SFSP+APRCSSRWR+LLGLK+ +Q ++ SA      T    SS    SLKQ
Subjt:  DGKLMPLQISSVKSSVKKLSSTEIGLRSPDTMTPRRVTEID---GADPYSFSPRAPRCSSRWRELLGLKKATQMTNTSAKNENPKTELSSSSNRMKSLKQ

Query:  FLHRNSKLVSSESTDALYH--PLLKDLDYESVFLSSARLSLSSSSSGHSHEDLPRLSLDFDKPSK---FNQEHK----------------NRINLVKTRV
        FLHR+S+  SS S  +L    PLLKD D ESV +SS+R+SLSSSSSGH HEDLPRLSLD ++P++    N  H                  R+ LV    
Subjt:  FLHRNSKLVSSESTDALYH--PLLKDLDYESVFLSSARLSLSSSSSGHSHEDLPRLSLDFDKPSK---FNQEHK----------------NRINLVKTRV

Query:  SQSEAKRIGRSPVRRTPGESGRVKSREVSMDSPRMNSSGKIVFQSLERSSSSPSSFNGGPR-LKHNGIERSYSANVRVPPVLNVPVSSLRGSSKSSGSMF
        S +   R+GRSP+RR+ GE+  + +R VS+DSPR+NSSGKIVFQ+LERSSSSPSSFNGG    +H G+ERSYS+NVRV PVLNVPV S+RG S   G  F
Subjt:  SQSEAKRIGRSPVRRTPGESGRVKSREVSMDSPRMNSSGKIVFQSLERSSSSPSSFNGGPR-LKHNGIERSYSANVRVPPVLNVPVSSLRGSSKSSGSMF

Query:  GFSQLFSSPQKRTEVTCGGGKGQTRQHC
          S   SS Q        G     R  C
Subjt:  GFSQLFSSPQKRTEVTCGGGKGQTRQHC

AT3G05980.1 unknown protein4.3e-0527.66Show/hide
Query:  LSPRASFSREYPDDSSANLSGFKLSPSAIADTPQTSKPAILGTDLEGSSSDFEFRLED---PVTLIPADELFFDGKLMPL----------QISSVKSSVK
        L PR SFS +  D               I  TP   K  ++   ++   SDFEF   +   P  ++ ADELF +GKL+P            I+   +  +
Subjt:  LSPRASFSREYPDDSSANLSGFKLSPSAIADTPQTSKPAILGTDLEGSSSDFEFRLED---PVTLIPADELFFDGKLMPL----------QISSVKSSVK

Query:  KLSSTEIGLRSPD---TMTPRRVTEIDGADPYSFSPRAPRCSSRWRELLGLKK-----ATQMTNTSAKNENPKTELSSSSNRMKSLKQ
        +    ++ ++  D        RVT     DP   SPR P+C+  W+ELL LKK     ++ +T  +  + +P +  SSSS+   + K+
Subjt:  KLSSTEIGLRSPD---TMTPRRVTEIDGADPYSFSPRAPRCSSRWRELLGLKK-----ATQMTNTSAKNENPKTELSSSSNRMKSLKQ

AT3G12970.1 unknown protein1.3e-5740.76Show/hide
Query:  MASACVNNVGIQPENFLDGSRTAYTSYGWLSPRASFSREYPDDSSANLSGFKLSPSAIADTPQTSKPAILGTDLEGSSSDFEFRLEDPVTLIPADELFFD
        MAS CV NVG  P            S+ W S + S +RE                         S+P     + E    DFEF LEDPVT++ ADELF D
Subjt:  MASACVNNVGIQPENFLDGSRTAYTSYGWLSPRASFSREYPDDSSANLSGFKLSPSAIADTPQTSKPAILGTDLEGSSSDFEFRLEDPVTLIPADELFFD

Query:  GKLMPLQISSVKSSVKKLSSTEIGLRSPDTMTPRRVTEIDG-ADPYSFSPRAPRCSSRWRELLGLKKATQMTNTSAKNENPKTELSSSSNRMKSLKQFLH
        GKL+PL+ S V    +K  ++ +   +      R   EI G  DPY FSPRAPRC+ RWRELLGLK+  +    ++ + + +   SS + +  S + FL+
Subjt:  GKLMPLQISSVKSSVKKLSSTEIGLRSPDTMTPRRVTEIDG-ADPYSFSPRAPRCSSRWRELLGLKKATQMTNTSAKNENPKTELSSSSNRMKSLKQFLH

Query:  RNSKLVSSESTDALYHPLLKD---LDYESVFLSSARLSL-SSSSSGHSHEDLPRLSLDFD-KPSKFNQEHKNRINLVKTRVSQSEAKRIGRSPVRRTPGE
        R+SK  + + +   + P  KD   L+  S  +SS+RLSL SSSSSGH  +DLPRLSLD D KP   N   ++R +      +Q++     R P R T  +
Subjt:  RNSKLVSSESTDALYHPLLKD---LDYESVFLSSARLSL-SSSSSGHSHEDLPRLSLDFD-KPSKFNQEHKNRINLVKTRVSQSEAKRIGRSPVRRTPGE

Query:  SGRVKSRE-----VSMDSPRMNSSGKIVFQSLERSSSSPSSFNGGPRLK-HNGIERSYSANVRVPPVLNVPVSSLRGSSKSSGSMFGFSQLFSSPQKRTE
             S E     V+ DSPR+N+SGKIVF  LERSSSSP +F GGPR+K H+G+ RS+SANVR+ PVLNVPVSSLR   K SG  FG  QLF+S    + 
Subjt:  SGRVKSRE-----VSMDSPRMNSSGKIVFQSLERSSSSPSSFNGGPRLK-HNGIERSYSANVRVPPVLNVPVSSLRGSSKSSGSMFGFSQLFSSPQKRTE

Query:  VTCGGGKGQTR-QHCRNRITRT
         +  G + Q +  + +NR  R+
Subjt:  VTCGGGKGQTR-QHCRNRITRT

AT5G66800.1 unknown protein7.0e-0833.33Show/hide
Query:  LSPRASFSREYPDDSSANLSGFKLSPSAIADTPQTSKPAILGTDLEGSSSDFEFRLEDPV---TLIPADELFFDGKLMPLQISSVKSSVKKLSSTEIGLR
        +SPR SFS ++           ++ P    +T +T++ + L    EGSSS F    E  V   T++PADELF  GKL+P + +   + V++    E+ + 
Subjt:  LSPRASFSREYPDDSSANLSGFKLSPSAIADTPQTSKPAILGTDLEGSSSDFEFRLEDPV---TLIPADELFFDGKLMPLQISSVKSSVKKLSSTEIGLR

Query:  SPDTMTPRRVTEIDGADPYSFSPRAPRCSS---RWRELLGLKKA
          +   PR  T I    P  FS  +   SS   RW+ LLGLK+A
Subjt:  SPDTMTPRRVTEIDGADPYSFSPRAPRCSS---RWRELLGLKKA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTTCTGCGTGCGTCAACAACGTTGGAATACAGCCGGAGAATTTCCTCGACGGCTCACGTACCGCCTACACTTCTTATGGTTGGTTGAGCCCTCGCGCATCCTTCAG
CCGCGAGTATCCAGACGACTCGTCTGCTAACCTCTCAGGCTTTAAGCTCAGTCCATCTGCCATTGCTGATACTCCTCAGACGAGTAAGCCGGCGATTTTAGGTACAGATC
TAGAAGGTTCATCCAGTGATTTTGAGTTTAGGCTTGAAGATCCGGTTACTCTGATTCCTGCTGATGAGCTTTTCTTCGACGGAAAGCTTATGCCGCTGCAGATTTCATCG
GTGAAATCGTCGGTTAAGAAACTCTCCTCGACGGAGATCGGTTTGCGGTCGCCTGATACAATGACGCCGCGTAGAGTAACGGAAATCGATGGTGCGGATCCGTACTCTTT
CTCTCCTCGCGCTCCTAGATGCTCGAGTCGGTGGAGAGAGCTTCTAGGGCTAAAAAAGGCTACTCAGATGACTAACACATCCGCGAAGAACGAAAATCCGAAGACGGAGT
TGTCTTCATCGAGCAATAGAATGAAATCTCTGAAGCAATTTCTTCACAGGAATTCGAAACTCGTGTCCTCCGAGTCCACAGATGCCCTATATCATCCGTTACTGAAGGAT
TTGGATTACGAATCAGTTTTCTTATCCTCTGCTCGCCTCTCTCTTTCTTCTTCATCATCTGGCCATTCGCACGAGGATCTCCCTAGACTCTCACTCGATTTCGATAAGCC
ATCAAAATTCAATCAAGAACACAAGAATCGGATAAATCTGGTGAAGACGAGAGTATCGCAATCAGAAGCGAAGAGAATAGGGCGGAGCCCGGTCCGTCGGACTCCAGGGG
AATCAGGTAGAGTGAAGAGCAGAGAAGTATCCATGGATAGTCCTAGAATGAACTCCTCAGGGAAAATAGTGTTTCAGAGTCTAGAAAGGAGTTCGAGTAGTCCGAGTAGC
TTCAATGGCGGACCGAGATTGAAGCACAACGGCATCGAGAGGTCATACTCCGCGAATGTGAGAGTTCCGCCGGTGTTAAACGTCCCGGTGAGCTCGCTGAGAGGTTCATC
GAAATCATCGGGGTCGATGTTCGGGTTCAGCCAGCTGTTTTCCTCGCCACAGAAGAGGACCGAAGTGACTTGCGGCGGCGGTAAAGGCCAGACGAGGCAGCACTGCAGAA
ACCGGATCACTCGAACCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTTCTGCGTGCGTCAACAACGTTGGAATACAGCCGGAGAATTTCCTCGACGGCTCACGTACCGCCTACACTTCTTATGGTTGGTTGAGCCCTCGCGCATCCTTCAG
CCGCGAGTATCCAGACGACTCGTCTGCTAACCTCTCAGGCTTTAAGCTCAGTCCATCTGCCATTGCTGATACTCCTCAGACGAGTAAGCCGGCGATTTTAGGTACAGATC
TAGAAGGTTCATCCAGTGATTTTGAGTTTAGGCTTGAAGATCCGGTTACTCTGATTCCTGCTGATGAGCTTTTCTTCGACGGAAAGCTTATGCCGCTGCAGATTTCATCG
GTGAAATCGTCGGTTAAGAAACTCTCCTCGACGGAGATCGGTTTGCGGTCGCCTGATACAATGACGCCGCGTAGAGTAACGGAAATCGATGGTGCGGATCCGTACTCTTT
CTCTCCTCGCGCTCCTAGATGCTCGAGTCGGTGGAGAGAGCTTCTAGGGCTAAAAAAGGCTACTCAGATGACTAACACATCCGCGAAGAACGAAAATCCGAAGACGGAGT
TGTCTTCATCGAGCAATAGAATGAAATCTCTGAAGCAATTTCTTCACAGGAATTCGAAACTCGTGTCCTCCGAGTCCACAGATGCCCTATATCATCCGTTACTGAAGGAT
TTGGATTACGAATCAGTTTTCTTATCCTCTGCTCGCCTCTCTCTTTCTTCTTCATCATCTGGCCATTCGCACGAGGATCTCCCTAGACTCTCACTCGATTTCGATAAGCC
ATCAAAATTCAATCAAGAACACAAGAATCGGATAAATCTGGTGAAGACGAGAGTATCGCAATCAGAAGCGAAGAGAATAGGGCGGAGCCCGGTCCGTCGGACTCCAGGGG
AATCAGGTAGAGTGAAGAGCAGAGAAGTATCCATGGATAGTCCTAGAATGAACTCCTCAGGGAAAATAGTGTTTCAGAGTCTAGAAAGGAGTTCGAGTAGTCCGAGTAGC
TTCAATGGCGGACCGAGATTGAAGCACAACGGCATCGAGAGGTCATACTCCGCGAATGTGAGAGTTCCGCCGGTGTTAAACGTCCCGGTGAGCTCGCTGAGAGGTTCATC
GAAATCATCGGGGTCGATGTTCGGGTTCAGCCAGCTGTTTTCCTCGCCACAGAAGAGGACCGAAGTGACTTGCGGCGGCGGTAAAGGCCAGACGAGGCAGCACTGCAGAA
ACCGGATCACTCGAACCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MASACVNNVGIQPENFLDGSRTAYTSYGWLSPRASFSREYPDDSSANLSGFKLSPSAIADTPQTSKPAILGTDLEGSSSDFEFRLEDPVTLIPADELFFDGKLMPLQISS
VKSSVKKLSSTEIGLRSPDTMTPRRVTEIDGADPYSFSPRAPRCSSRWRELLGLKKATQMTNTSAKNENPKTELSSSSNRMKSLKQFLHRNSKLVSSESTDALYHPLLKD
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FNGGPRLKHNGIERSYSANVRVPPVLNVPVSSLRGSSKSSGSMFGFSQLFSSPQKRTEVTCGGGKGQTRQHCRNRITRT