; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh01G013840 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh01G013840
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionRING/U-box superfamily protein isoform 2
Genome locationCmo_Chr01:10893944..10898415
RNA-Seq ExpressionCmoCh01G013840
SyntenyCmoCh01G013840
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR011016 - Zinc finger, RING-CH-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022940078.1 uncharacterized protein LOC111445808 isoform X1 [Cucurbita moschata]4.2e-12299.12Show/hide
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XP_023525147.1 uncharacterized protein LOC111788839 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.8e-11896.48Show/hide
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XP_023525151.1 uncharacterized protein LOC111788839 isoform X3 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.8e-11896.48Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1FIM5 uncharacterized protein LOC111445808 isoform X32.0e-12299.12Show/hide
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A0A6J1FNA3 uncharacterized protein LOC111445808 isoform X12.0e-12299.12Show/hide
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A0A6J1FPJ1 uncharacterized protein LOC111445808 isoform X23.1e-11897.36Show/hide
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A0A6J1IVY7 uncharacterized protein LOC111480425 isoform X21.3e-11393.83Show/hide
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A0A6J1IYW4 uncharacterized protein LOC111480425 isoform X18.9e-11895.59Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G09760.1 RING/U-box superfamily protein2.2e-2840.51Show/hide
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AT5G60580.1 RING/U-box superfamily protein1.8e-4148.77Show/hide
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AT5G60580.2 RING/U-box superfamily protein1.8e-4148.77Show/hide
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AT5G60580.3 RING/U-box superfamily protein1.8e-4148.77Show/hide
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AT5G60580.4 RING/U-box superfamily protein1.8e-4148.77Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTTGTTCCTATTTTACCAGAGATGCAACCATCAAATAGATGTTCAGACAATGCAGCTACCTCACGATCTTTTTCTCTTAACAAGCTTCTCTTTGCCTCATCTACAAA
AGCTGCACATTCTTCACCAGTCACACCAATTTCAAGTTCCAATACCAATGCACTTGAAGCAACAAACATGGAGTGTCATCCTGGTTTCCTTAAAACTAAAGTCAAGCAGC
ATATTGCTCGTTCATTATCAGCTCCTCTGAATGCCAAGCCTAAAGTCTTAAGGCGACTAGATTCAGTAGGTTTAATTCGAGTAGTGTCTGCAGGTCCACAATATGCAGGG
ACTGGAGACTCCTCAGTTTCTCAAACAAAGGAAAGTGGTAATGATATAGAAAGGGAACCTGCTGGTGATGATATACCTGAAGATGAAGCAGTTTGCAGGATCTGTTATAT
AGAATTGGTGGAAGGCGGGGATGCACTTAAACTGGAATGCAGTTGCAAAGGAGACCTAGCTCTCGCTCACAAAGAGTGTGCAATTAAGTGGTTCAGCATTAAAGGTAACA
AGATCTGTGATATTTGCAACCAGGATGTCAAAAACTTGCCAGTGACTTTATTGAAATTACACAACACACTCCCTATTACTAGACGACCCCCAGTAACATTGCAGCAGAGG
GAGGTTCATCGCAATTGTGTGTGTAGAGTATCATTCATTTGGTTTTTATTTTTGTTGGAGTCTCAAATTACTTCACTTTTCATTTTCTTTTTCAAAAGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGACGACGCTGTAGTTCGACTTCAAGGCACCGAAGATTCGACCTCAGTTTATCCGGATCATCCCGAGGTTGTTTTGTTCAATCCTTCAACGATATACTTCAGCTATTC
TTGTTGTTATCCTCTCCCTATTGCCAATCAAACATGGTGTGGCTCTTTTACCTGAATCCAGAAAGACAATGTTGAAGCTTCATGTTTCCTAGGCCTTTACTCTAAACATG
ATCAAGAAGAAAATGTTATCGAAACATCCTTATTGAAACAGTCTAGACGGCCCAATTTGCCATTTCTGCAAATTCCAGTAAGGAATGTAGAGAGTTCGTCCTTTTTGAGG
TTGGATGGTTCATCAACTTCAAGTTCTAGCTCTATTAGGGGAGGATTGCCTCCAAAACCAAATTCAGTAAAAGTCAAATCATCTGCGAGAGGCCTCTTTCCTCAAAAAAG
CTTCGGGGCAAAACATTCATTCCCAGATGGTGATATGGTTGTTCCTATTTTACCAGAGATGCAACCATCAAATAGATGTTCAGACAATGCAGCTACCTCACGATCTTTTT
CTCTTAACAAGCTTCTCTTTGCCTCATCTACAAAAGCTGCACATTCTTCACCAGTCACACCAATTTCAAGTTCCAATACCAATGCACTTGAAGCAACAAACATGGAGTGT
CATCCTGGTTTCCTTAAAACTAAAGTCAAGCAGCATATTGCTCGTTCATTATCAGCTCCTCTGAATGCCAAGCCTAAAGTCTTAAGGCGACTAGATTCAGTAGGTTTAAT
TCGAGTAGTGTCTGCAGGTCCACAATATGCAGGGACTGGAGACTCCTCAGTTTCTCAAACAAAGGAAAGTGGTAATGATATAGAAAGGGAACCTGCTGGTGATGATATAC
CTGAAGATGAAGCAGTTTGCAGGATCTGTTATATAGAATTGGTGGAAGGCGGGGATGCACTTAAACTGGAATGCAGTTGCAAAGGAGACCTAGCTCTCGCTCACAAAGAG
TGTGCAATTAAGTGGTTCAGCATTAAAGGTAACAAGATCTGTGATATTTGCAACCAGGATGTCAAAAACTTGCCAGTGACTTTATTGAAATTACACAACACACTCCCTAT
TACTAGACGACCCCCAGTAACATTGCAGCAGAGGGAGGTTCATCGCAATTGTGTGTGTAGAGTATCATTCATTTGGTTTTTATTTTTGTTGGAGTCTCAAATTACTTCAC
TTTTCATTTTCTTTTTCAAAAGATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVVPILPEMQPSNRCSDNAATSRSFSLNKLLFASSTKAAHSSPVTPISSSNTNALEATNMECHPGFLKTKVKQHIARSLSAPLNAKPKVLRRLDSVGLIRVVSAGPQYAG
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EVHRNCVCRVSFIWFLFLLESQITSLFIFFFKR