; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh01G015220 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh01G015220
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionMads-box transcription factor 57
Genome locationCmo_Chr01:11736935..11740895
RNA-Seq ExpressionCmoCh01G015220
SyntenyCmoCh01G015220
Gene Ontology termsGO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002100 - Transcription factor, MADS-box
IPR033896 - MADS MEF2-like
IPR036879 - Transcription factor, MADS-box superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6608122.1 MADS-box transcription factor 27, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.3e-23100Show/hide
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TYK31253.1 mads-box transcription factor 57 [Cucumis melo var. makuwa]3.3e-23100Show/hide
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XP_011652594.1 MADS-box transcription factor 23 isoform X4 [Cucumis sativus]1.2e-22100Show/hide
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XP_016903556.1 PREDICTED: MADS-box transcription factor 23-like isoform X5 [Cucumis melo]1.2e-22100Show/hide
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XP_023525011.1 MADS-box transcription factor 23-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.2e-22100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S4E6G1 MADS-box transcription factor 23-like isoform X16.0e-23100Show/hide
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A0A5D3E554 Mads-box transcription factor 571.6e-23100Show/hide
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A0A6J1ISW7 MADS-box transcription factor 23-like isoform X36.0e-23100Show/hide
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A0A6J1IVD9 MADS-box transcription factor 23-like isoform X26.0e-23100Show/hide
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A0A6J1J0X9 MADS-box transcription factor 23-like isoform X46.0e-23100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2RVQ5 Agamous-like MADS-box protein AGL163.2e-2183.33Show/hide
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        MGRGKI I+RI+NSTSRQVTFSKRR+GLLKKAKELAILCDA+VGVIIFSST +LY++SS+
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Q6EP49 MADS-box transcription factor 271.7e-2286.67Show/hide
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Q6Z6W2 MADS-box transcription factor 571.7e-2285Show/hide
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Q9SI38 MADS-box transcription factor ANR15.8e-2391.53Show/hide
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Q9SZJ6 Agamous-like MADS-box protein AGL217.1e-2181.67Show/hide
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        MGRGKIVI+RID+STSRQVTFSKRR GL+KKAKELAILCDA+VG+IIFSST KLY+++S+
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G14210.1 AGAMOUS-like 444.1e-2491.53Show/hide
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AT2G22630.1 AGAMOUS-like 172.7e-2076.67Show/hide
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AT3G57230.1 AGAMOUS-like 162.2e-2283.33Show/hide
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AT3G57230.2 AGAMOUS-like 162.2e-2283.33Show/hide
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AT4G37940.1 AGAMOUS-like 215.0e-2281.67Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGAGAGGCAAGATTGTAATTAGGAGGATCGATAATTCGACGAGCAGACAGGTGACTTTCTCGAAGCGAAGGAGTGGACTGCTGAAGAAGGCGAAAGAACTG
GCGATCCTTTGTGACGCCGATGTTGGAGTCATCATCTTCTCCAGCACCAGCAAGCTTTATGAATACTCCAGCACCAGAAAAGATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTGAATTATGTGAACCCGCTTCAGTACAACGCTCCGTAAAAAAGCGTTGATTCTGTTGGATTTGATCTCTTTGCCTCGCCTCCAAACAGCACCGCACTCAACTGC
GCAAGAAAGAATCGAGTTTCGGATCTAAGAATGGGGAGAGGCAAGATTGTAATTAGGAGGATCGATAATTCGACGAGCAGACAGGTGACTTTCTCGAAGCGAAGG
AGTGGACTGCTGAAGAAGGCGAAAGAACTGGCGATCCTTTGTGACGCCGATGTTGGAGTCATCATCTTCTCCAGCACCAGCAAGCTTTATGAATACTCCAGCACC
AGAAAAGATTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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