; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh01G015490 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh01G015490
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionU-box domain-containing protein 1-like
Genome locationCmo_Chr01:11926056..11927999
RNA-Seq ExpressionCmoCh01G015490
SyntenyCmoCh01G015490
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
InterPro domainsIPR011989 - Armadillo-like helical
IPR016024 - Armadillo-type fold


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6608146.1 U-box domain-containing protein 13, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.9e-16299.37Show/hide
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KAG7031783.1 U-box domain-containing protein 13, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.6e-16199.06Show/hide
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XP_022940416.1 U-box domain-containing protein 1-like [Cucurbita moschata]6.2e-163100Show/hide
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XP_023524300.1 U-box domain-containing protein 1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.4e-16098.43Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LGP7 Uncharacterized protein5.9e-14387.7Show/hide
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        IMN+D + YSN+DSVYS
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A0A1S3CR56 U-box domain-containing protein 8-like4.8e-13787.25Show/hide
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        VLGLLARFEEGLRALIK DRIV SMVNVLKGRCMLSKEGATEILL+LFDESE CL DAL+ PEF GVVADLSVRGS KARERA+LLMNKIMN+D + YSN
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        ADSVYS
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A0A6J1CG09 U-box domain-containing protein 1-like2.8e-13785.8Show/hide
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          EDLAGTAL VLGLLARFEEGLRAL+K D IV SMVNVLKGRCMLSKEGATEILL+LFDES+ CLRDAL  PEFLGVVADLSVRGS KARERA LLMNK
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        +MN+D++ YSNA SVYS
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A0A6J1FIE4 U-box domain-containing protein 1-like3.0e-163100Show/hide
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A0A6J1J4T3 U-box domain-containing protein 1-like1.8e-16098.11Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22193 U-box domain-containing protein 41.9e-1327.57Show/hide
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        + S  S+ + R +S       + + V + +S + D Q +A  +L ++ + +   R ++    G+I +L+ L  S+ S  Q  +++ L NLS+N++ KK +
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        A    I  L  ++  GS E  + +++ + SL+++++NK K G +G I  LV  L   +         +L  L     N  + V+SGA+  L+D+++  +G
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          +   A+ VL  LA   EG  A+ +   I   +V V++      KE A   LLQL   S       L+      +VA LS  G+ +ARE+A  L++   
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        N
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Q681N2 U-box domain-containing protein 151.1e-1325.47Show/hide
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        Q +++K + ++ + +P  R L+A   G+IP+L+ L     S +Q  +++ L NLS++   KKL+++   I ++  ++  G+ E  + +++ + SL+MLD+
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Query:  NKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLVDVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVYSMVN
        NK   G++  I  LV  L   ++      L +L  L     N   A+ +G +  L+++++      +   AL +L LLA   EG +A+ ++   + ++V 
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Query:  VLKGRCMLSKEGATEILLQLFDESEGCLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERATLLMNKIMNND
         ++     +KE AT +LL+L   +   +  AL+F  +  +V +++  G+ +A+ +A  L+  I  ++
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Q8GUG9 U-box domain-containing protein 119.4e-1325.66Show/hide
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        +  A+ ++  +++ S   R L+A+  G+IP+L+ L  S     Q  +++ + NLS+  + K+L+     +  +  ++  G+ E  + A++ + SL++ D+
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        NK   G +G I  LV  L   +         +L  L  +HGN   AVR+G ++ LV ++  ++   +   AL +L +LA  ++   A++K + +  +++ 
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Query:  VLKGRCMLSKEGATEILLQLFDESEGCLRDALRFPEF--LGVVA---DLSVRGSTKARERATLLM
        +L+     ++E A  ILL L      C RD  +      LG V    DLS  G+ + + +A  L+
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Q9C9A6 U-box domain-containing protein 101.0e-1126.98Show/hide
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        S  SF+  S   S   A   K  +Q + D R+        A+ ++  +++ S   R L+A+  G+IP+L+ L  S   T  Q  +++ + NLS+    K+
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        L+     +  +  ++  GS E  + A++ + SL++ D+NK   G +G I  LV  L   SV        +L  L  + GN   AVR+G +  LV ++  +
Subjt:  LLASMETIYHLNTLISLGSPETVKLASSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLVDVVEST

Query:  SGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLQLFDESEGCLRDALRFPEF--LGVVA---DLSVRGSTKARERAT
        S E +A  AL +L +LA  +    A+++ + I   +++ L+     ++E A  ILL L      C RD  +      LG V    +LS  G+ +A+ +A 
Subjt:  SGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLQLFDESEGCLRDALRFPEF--LGVVA---DLSVRGSTKARERAT

Query:  LLMNKIMNNDLEMYS
         L+  +  +  ++ S
Subjt:  LLMNKIMNNDLEMYS

Q9SNC6 U-box domain-containing protein 137.2e-1327Show/hide
Query:  GSIPILIALSKSSSSTVQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSPETVKLASSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAA
        G+IP+L+ L  +  S +Q  S++ L NLS+  + K  + S   I  +  ++  GS E  + A++ + SL+++D+NK   G  G I  LV  L   +    
Subjt:  GSIPILIALSKSSSSTVQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSPETVKLASSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAA

Query:  HHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLVDVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLQLFDESEG
             +L  L  + GN   A+R+G I  L  ++ +  G  +   AL +L +L+   EG +A+I     V S+V  ++     ++E A  +L+ L      
Subjt:  HHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLVDVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLQLFDESEG

Query:  CLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERATLLMNKI
         L +A +    +G + DL+  G+ + + +A  L+ +I
Subjt:  CLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERATLLMNKI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G23030.1 ARM repeat superfamily protein6.7e-1425.66Show/hide
Query:  QEKALKDLVVITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSSTVQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSPETVKLASSLICSLAMLDK
        +  A+ ++  +++ S   R L+A+  G+IP+L+ L  S     Q  +++ + NLS+  + K+L+     +  +  ++  G+ E  + A++ + SL++ D+
Subjt:  QEKALKDLVVITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSSTVQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSPETVKLASSLICSLAMLDK

Query:  NKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLVDVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVYSMVN
        NK   G +G I  LV  L   +         +L  L  +HGN   AVR+G ++ LV ++  ++   +   AL +L +LA  ++   A++K + +  +++ 
Subjt:  NKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLVDVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVYSMVN

Query:  VLKGRCMLSKEGATEILLQLFDESEGCLRDALRFPEF--LGVVA---DLSVRGSTKARERATLLM
        +L+     ++E A  ILL L      C RD  +      LG V    DLS  G+ + + +A  L+
Subjt:  VLKGRCMLSKEGATEILLQLFDESEGCLRDALRFPEF--LGVVA---DLSVRGSTKARERATLLM

AT2G23140.1 RING/U-box superfamily protein with ARM repeat domain1.3e-1427.57Show/hide
Query:  VASFQSSSSMRSMSVATAHKNITQCVADARSDAHDVQEKALKDLVVITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSSTVQSLSLSILFNLSLNNDMKKLL
        + S  S+ + R +S       + + V + +S + D Q +A  +L ++ + +   R ++    G+I +L+ L  S+ S  Q  +++ L NLS+N++ KK +
Subjt:  VASFQSSSSMRSMSVATAHKNITQCVADARSDAHDVQEKALKDLVVITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSSTVQSLSLSILFNLSLNNDMKKLL

Query:  ASMETIYHLNTLISLGSPETVKLASSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLVDVVESTSG
        A    I  L  ++  GS E  + +++ + SL+++++NK K G +G I  LV  L   +         +L  L     N  + V+SGA+  L+D+++  +G
Subjt:  ASMETIYHLNTLISLGSPETVKLASSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLVDVVESTSG

Query:  EDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLQLFDESEGCLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERATLLMNKIM
          +   A+ VL  LA   EG  A+ +   I   +V V++      KE A   LLQL   S       L+      +VA LS  G+ +ARE+A  L++   
Subjt:  EDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLQLFDESEGCLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERATLLMNKIM

Query:  N
        N
Subjt:  N

AT2G23140.2 RING/U-box superfamily protein with ARM repeat domain1.3e-1427.57Show/hide
Query:  VASFQSSSSMRSMSVATAHKNITQCVADARSDAHDVQEKALKDLVVITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSSTVQSLSLSILFNLSLNNDMKKLL
        + S  S+ + R +S       + + V + +S + D Q +A  +L ++ + +   R ++    G+I +L+ L  S+ S  Q  +++ L NLS+N++ KK +
Subjt:  VASFQSSSSMRSMSVATAHKNITQCVADARSDAHDVQEKALKDLVVITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSSTVQSLSLSILFNLSLNNDMKKLL

Query:  ASMETIYHLNTLISLGSPETVKLASSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLVDVVESTSG
        A    I  L  ++  GS E  + +++ + SL+++++NK K G +G I  LV  L   +         +L  L     N  + V+SGA+  L+D+++  +G
Subjt:  ASMETIYHLNTLISLGSPETVKLASSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLVDVVESTSG

Query:  EDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLQLFDESEGCLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERATLLMNKIM
          +   A+ VL  LA   EG  A+ +   I   +V V++      KE A   LLQL   S       L+      +VA LS  G+ +ARE+A  L++   
Subjt:  EDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLQLFDESEGCLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERATLLMNKIM

Query:  N
        N
Subjt:  N

AT3G46510.1 plant U-box 135.1e-1427Show/hide
Query:  GSIPILIALSKSSSSTVQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSPETVKLASSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAA
        G+IP+L+ L  +  S +Q  S++ L NLS+  + K  + S   I  +  ++  GS E  + A++ + SL+++D+NK   G  G I  LV  L   +    
Subjt:  GSIPILIALSKSSSSTVQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSPETVKLASSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAA

Query:  HHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLVDVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLQLFDESEG
             +L  L  + GN   A+R+G I  L  ++ +  G  +   AL +L +L+   EG +A+I     V S+V  ++     ++E A  +L+ L      
Subjt:  HHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLVDVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLQLFDESEG

Query:  CLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERATLLMNKI
         L +A +    +G + DL+  G+ + + +A  L+ +I
Subjt:  CLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERATLLMNKI

AT5G42340.1 Plant U-Box 157.9e-1525.47Show/hide
Query:  QEKALKDLVVITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSSTVQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSPETVKLASSLICSLAMLDK
        Q +++K + ++ + +P  R L+A   G+IP+L+ L     S +Q  +++ L NLS++   KKL+++   I ++  ++  G+ E  + +++ + SL+MLD+
Subjt:  QEKALKDLVVITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSSTVQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYHLNTLISLGSPETVKLASSLICSLAMLDK

Query:  NKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLVDVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVYSMVN
        NK   G++  I  LV  L   ++      L +L  L     N   A+ +G +  L+++++      +   AL +L LLA   EG +A+ ++   + ++V 
Subjt:  NKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLVDVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFEEGLRALIKIDRIVYSMVN

Query:  VLKGRCMLSKEGATEILLQLFDESEGCLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERATLLMNKIMNND
         ++     +KE AT +LL+L   +   +  AL+F  +  +V +++  G+ +A+ +A  L+  I  ++
Subjt:  VLKGRCMLSKEGATEILLQLFDESEGCLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERATLLMNKIMNND


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCAGTTGCATCTTTCCAATCATCATCGTCCATGAGGTCGATGAGTGTTGCAACTGCACATAAGAATATAACCCAGTGTGTAGCCGATGCTCGGTCGGACGCTCATGA
CGTTCAGGAAAAGGCTCTTAAAGACTTGGTTGTCATTACCCAGGTTAGTCCCCTCTACAGGAACTTGCTTGCACAAGTAGATGGATCAATTCCAATTCTTATAGCTCTCT
CCAAATCCTCTTCCTCCACCGTCCAATCCCTTTCACTGTCTATTCTCTTCAATCTTTCTCTGAATAATGACATGAAAAAGCTTCTTGCATCAATGGAAACCATTTACCAT
CTCAATACGCTCATATCCTTGGGCTCGCCCGAGACCGTCAAGTTAGCGTCCTCATTGATTTGTAGTCTTGCAATGCTAGACAAGAACAAGGCTAAGTTTGGGGTAGCTGG
TACCATACAGTTGTTGGTTAGAGCACTTACTGTCCCTAGTGTTCCTGCTGCTCATCACCTTCTCTGTTCTCTAGCTGAACTAGGCCAGTTTCATGGAAACTGCACGGTGG
CTGTTCGATCAGGAGCCATCTCGGTTCTTGTCGACGTAGTGGAGAGTACCAGTGGAGAGGATCTCGCTGGCACTGCTCTTGTTGTTCTCGGTCTCTTGGCTAGATTCGAG
GAGGGGTTGAGGGCTTTGATAAAAATCGATCGGATCGTTTATTCAATGGTCAATGTGTTGAAAGGGAGGTGTATGTTGAGTAAAGAAGGTGCAACCGAGATCCTTTTGCA
ATTGTTCGACGAGAGTGAAGGTTGTTTGAGAGACGCATTGAGGTTCCCGGAGTTTTTAGGCGTCGTTGCAGATCTATCTGTGAGAGGATCCACAAAAGCCAGAGAAAGAG
CTACACTACTTATGAATAAGATCATGAATAATGACTTGGAGATGTATTCAAATGCCGACTCAGTGTATTCGCCATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCAGTTGCATCTTTCCAATCATCATCGTCCATGAGGTCGATGAGTGTTGCAACTGCACATAAGAATATAACCCAGTGTGTAGCCGATGCTCGGTCGGACGCTCATGA
CGTTCAGGAAAAGGCTCTTAAAGACTTGGTTGTCATTACCCAGGTTAGTCCCCTCTACAGGAACTTGCTTGCACAAGTAGATGGATCAATTCCAATTCTTATAGCTCTCT
CCAAATCCTCTTCCTCCACCGTCCAATCCCTTTCACTGTCTATTCTCTTCAATCTTTCTCTGAATAATGACATGAAAAAGCTTCTTGCATCAATGGAAACCATTTACCAT
CTCAATACGCTCATATCCTTGGGCTCGCCCGAGACCGTCAAGTTAGCGTCCTCATTGATTTGTAGTCTTGCAATGCTAGACAAGAACAAGGCTAAGTTTGGGGTAGCTGG
TACCATACAGTTGTTGGTTAGAGCACTTACTGTCCCTAGTGTTCCTGCTGCTCATCACCTTCTCTGTTCTCTAGCTGAACTAGGCCAGTTTCATGGAAACTGCACGGTGG
CTGTTCGATCAGGAGCCATCTCGGTTCTTGTCGACGTAGTGGAGAGTACCAGTGGAGAGGATCTCGCTGGCACTGCTCTTGTTGTTCTCGGTCTCTTGGCTAGATTCGAG
GAGGGGTTGAGGGCTTTGATAAAAATCGATCGGATCGTTTATTCAATGGTCAATGTGTTGAAAGGGAGGTGTATGTTGAGTAAAGAAGGTGCAACCGAGATCCTTTTGCA
ATTGTTCGACGAGAGTGAAGGTTGTTTGAGAGACGCATTGAGGTTCCCGGAGTTTTTAGGCGTCGTTGCAGATCTATCTGTGAGAGGATCCACAAAAGCCAGAGAAAGAG
CTACACTACTTATGAATAAGATCATGAATAATGACTTGGAGATGTATTCAAATGCCGACTCAGTGTATTCGCCATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSVASFQSSSSMRSMSVATAHKNITQCVADARSDAHDVQEKALKDLVVITQVSPLYRNLLAQVDGSIPILIALSKSSSSTVQSLSLSILFNLSLNNDMKKLLASMETIYH
LNTLISLGSPETVKLASSLICSLAMLDKNKAKFGVAGTIQLLVRALTVPSVPAAHHLLCSLAELGQFHGNCTVAVRSGAISVLVDVVESTSGEDLAGTALVVLGLLARFE
EGLRALIKIDRIVYSMVNVLKGRCMLSKEGATEILLQLFDESEGCLRDALRFPEFLGVVADLSVRGSTKARERATLLMNKIMNNDLEMYSNADSVYSP