; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh01G018670 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh01G018670
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionSASA domain-containing protein
Genome locationCmo_Chr01:13543762..13545073
RNA-Seq ExpressionCmoCh01G018670
SyntenyCmoCh01G018670
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR005181 - Sialate O-acetylesterase domain
IPR036514 - SGNH hydrolase superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6608446.1 putative carbohydrate esterase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.7e-16596.74Show/hide
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KAG7037782.1 putative carbohydrate esterase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.3e-16296.96Show/hide
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XP_022941448.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucurbita moschata]6.4e-173100Show/hide
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XP_022982273.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucurbita maxima]8.3e-16595.75Show/hide
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XP_023525343.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.3e-16295.77Show/hide
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        L QILLS
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L4Z7 SASA domain-containing protein4.2e-13079.46Show/hide
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A0A1S3BVE3 probable carbohydrate esterase At4g342152.6e-12778.33Show/hide
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A0A5A7VA07 Putative carbohydrate esterase2.6e-12778.33Show/hide
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A0A6J1FS50 probable carbohydrate esterase At4g342153.1e-173100Show/hide
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A0A6J1J4F1 probable carbohydrate esterase At4g342154.0e-16595.75Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9J9 Probable carbohydrate esterase At4g342159.5e-7153.91Show/hide
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        Q P PP  IF+L+GQSNMAGRGGV      +R  WD ++PP+C+PN SILRL++DL W EA EPLH DID  K  G+GPGM FAN +         VIGL
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Query:  VPCAMGGTSIQQWQKGSNLYTHLLTRAEASILSGGTIKALLWYQGESDTVNAEDSELYGGRLNKFFTDIRSDLNIPFLPIIQVGIASGEGPYKEGVRRGQ
        VPCA GGT+I++W++GS+LY  ++ R E S   GG IKA+LWYQGESD ++  D+E YG  +++   ++R DLN+P LPIIQV IASG G Y + VR  Q
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Query:  LGIEVMNVMTVDAYALGLSFEPDGLHLNTPSQVKLGGVLADAY
        LG+++ NV+ VD  A GL  + D LHL T +QV+LG  LA AY
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G53010.1 Domain of unknown function (DUF303)1.2e-7650.85Show/hide
Query:  YFSLLFLLMAAHLPLTSQQPPPPTAIFLLAGQSNMAGRGGVTNSTLTHRPTWDGVVPPQCSPNPSILRLASDLTWVEAREPLHADIDFLKTNGIGPGMPF
        +F ++FL    H  L SQ      +IF+LAGQSNMAGRGGV N T T+   WDGV+PP+C  NPSILRL S L W EA+EPLH DID  KTNG+GPGMPF
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Query:  ANTILMDKPAGRTVIGLVPCAMGGTSIQQWQKGSNLYTHLLTRAEASILS--GGTIKALLWYQGESDTVNAEDSELYGGRLNKFFTDIRSDLNIPFLPII
        AN ++     G+  +GLVPC++GGT + QWQKG  LY   + RA+A++ S  GG+ +A+LWYQGESDTV+  D+ +Y  RL KFF+D+R+DL  P LPII
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Query:  QVGIASGEGPYKEGVRRGQLGIEVMNVMTVDAYALGLSFEPDGLHLNTPSQVKLGGVLADAYRRFPPHPLAASPLRSAASTASVHSFFISMFRTL
        QV +A+G GPY + VR+ QL  ++ NV  VD  A GL  EPDGLHL T SQV+LG ++A+++   P            ++  S++  F S+F +L
Subjt:  QVGIASGEGPYKEGVRRGQLGIEVMNVMTVDAYALGLSFEPDGLHLNTPSQVKLGGVLADAYRRFPPHPLAASPLRSAASTASVHSFFISMFRTL

AT4G34215.1 Domain of unknown function (DUF303)6.7e-7253.91Show/hide
Query:  QQPPPPTAIFLLAGQSNMAGRGGVTNSTLTHRPTWDGVVPPQCSPNPSILRLASDLTWVEAREPLHADIDFLKTNGIGPGMPFANTILMDKPAGRTVIGL
        Q P PP  IF+L+GQSNMAGRGGV      +R  WD ++PP+C+PN SILRL++DL W EA EPLH DID  K  G+GPGM FAN +         VIGL
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Query:  VPCAMGGTSIQQWQKGSNLYTHLLTRAEASILSGGTIKALLWYQGESDTVNAEDSELYGGRLNKFFTDIRSDLNIPFLPIIQVGIASGEGPYKEGVRRGQ
        VPCA GGT+I++W++GS+LY  ++ R E S   GG IKA+LWYQGESD ++  D+E YG  +++   ++R DLN+P LPIIQV IASG G Y + VR  Q
Subjt:  VPCAMGGTSIQQWQKGSNLYTHLLTRAEASILSGGTIKALLWYQGESDTVNAEDSELYGGRLNKFFTDIRSDLNIPFLPIIQVGIASGEGPYKEGVRRGQ

Query:  LGIEVMNVMTVDAYALGLSFEPDGLHLNTPSQVKLGGVLADAY
        LG+++ NV+ VD  A GL  + D LHL T +QV+LG  LA AY
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AT4G34215.2 Domain of unknown function (DUF303)6.7e-7253.91Show/hide
Query:  QQPPPPTAIFLLAGQSNMAGRGGVTNSTLTHRPTWDGVVPPQCSPNPSILRLASDLTWVEAREPLHADIDFLKTNGIGPGMPFANTILMDKPAGRTVIGL
        Q P PP  IF+L+GQSNMAGRGGV      +R  WD ++PP+C+PN SILRL++DL W EA EPLH DID  K  G+GPGM FAN +         VIGL
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Query:  VPCAMGGTSIQQWQKGSNLYTHLLTRAEASILSGGTIKALLWYQGESDTVNAEDSELYGGRLNKFFTDIRSDLNIPFLPIIQVGIASGEGPYKEGVRRGQ
        VPCA GGT+I++W++GS+LY  ++ R E S   GG IKA+LWYQGESD ++  D+E YG  +++   ++R DLN+P LPIIQV IASG G Y + VR  Q
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Query:  LGIEVMNVMTVDAYALGLSFEPDGLHLNTPSQVKLGGVLADAY
        LG+++ NV+ VD  A GL  + D LHL T +QV+LG  LA AY
Subjt:  LGIEVMNVMTVDAYALGLSFEPDGLHLNTPSQVKLGGVLADAY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCTCTACTTCTCCCTCCTATTTCTTCTAATGGCCGCTCACCTTCCCCTCACTTCTCAACAACCACCTCCACCGACAGCCATTTTCCTCCTCGCTGGACAAAGCAACAT
GGCGGGGCGCGGCGGCGTCACCAACAGCACCCTAACGCACCGTCCCACGTGGGACGGCGTTGTTCCTCCCCAGTGCTCCCCCAATCCTTCCATCCTCCGCCTCGCCTCCG
ATCTCACCTGGGTTGAAGCTCGCGAGCCACTCCACGCCGACATTGATTTCCTCAAGACCAACGGGATTGGGCCTGGAATGCCATTCGCCAACACCATTCTCATGGATAAA
CCCGCCGGTCGGACGGTCATCGGTCTTGTCCCGTGCGCGATGGGCGGGACTTCGATTCAACAGTGGCAAAAGGGGTCCAATCTGTACACCCATTTATTGACCCGAGCCGA
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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