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| A6MM28 DNA-directed RNA polymerase subunit beta | 1.2e-225 | 93.66 | Show/hide |
Query: MQEQTIFIGNIPLMNSLETSIVNGLYRIVISQILQRPDIYYQSELDHNGISVYTGTIISDWGGRLELEIDRKARIWARVSRKQKISILVLSSAMGSNLRE
MQEQTIFIGNIPLMNSL TSIVNG+YRIVI+QILQ P IYY+SELDHNG SVYTGTIISDWGGR ELEIDRKARIWARVSRKQKISILVLSSAMGSNLRE
Subjt: MQEQTIFIGNIPLMNSLETSIVNGLYRIVISQILQRPDIYYQSELDHNGISVYTGTIISDWGGRLELEIDRKARIWARVSRKQKISILVLSSAMGSNLRE
Query: ILENVCYPEIFLSFLNDKEKKKIGSKENAILEFYQQFSCVGGDPVFSESLCKELQKKFFQQRCELGRIGRRNLNQRLNLDIPENNTFLLPRDILAAADHL
IL+NVCYPEIFLSF NDKEKKKIGSKENAILEFYQQF+CVGGDPVFSESLCKELQKKFFQQRCELGRIGRRN+N+RLNLDIP+NNTFLLPRDILAAAD L
Subjt: ILENVCYPEIFLSFLNDKEKKKIGSKENAILEFYQQFSCVGGDPVFSESLCKELQKKFFQQRCELGRIGRRNLNQRLNLDIPENNTFLLPRDILAAADHL
Query: IGLKFGMGTLDDMNHLKNKRIRSVADLLQDQFGLALVRLENMVRGTICGAIRHKLIPTPQNLVTSTPLTTTFESFFGLHPLSQVLDRTNPLTQIVHGRKL
IG+KFGMGTLDDMNHLKNKRIRSVADLLQDQFGLALVRLEN VRGTICGAIRHKLIPTPQNLVTSTPLTTT+ESFFGLHPLSQVLDRTNPLTQIVHGRK
Subjt: IGLKFGMGTLDDMNHLKNKRIRSVADLLQDQFGLALVRLENMVRGTICGAIRHKLIPTPQNLVTSTPLTTTFESFFGLHPLSQVLDRTNPLTQIVHGRKL
Query: SYLGPGGLTGRTASFRIRDIHPSHYGRICPIDTSEGINVGLIGSLAIHARIGHWGSLETPFYEISERSKKVRMLYLSPSRDEYYMVATGNSLALNPGIQE
SYLGPGGLTGRTASFRIRDIHPSHYGRICPIDTSEGINVGLIGSLAIHARIGHWGSLE+PFYEISERSKKVRMLYLSPS+DEYYMVA GNSL+LN GIQE
Subjt: SYLGPGGLTGRTASFRIRDIHPSHYGRICPIDTSEGINVGLIGSLAIHARIGHWGSLETPFYEISERSKKVRMLYLSPSRDEYYMVATGNSLALNPGIQE
Query: EQIVPARYHQ
EQ+VPARY Q
Subjt: EQIVPARYHQ
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| Q0ZJ28 DNA-directed RNA polymerase subunit beta | 7.6e-228 | 94.15 | Show/hide |
Query: MQEQTIFIGNIPLMNSLETSIVNGLYRIVISQILQRPDIYYQSELDHNGISVYTGTIISDWGGRLELEIDRKARIWARVSRKQKISILVLSSAMGSNLRE
MQEQTIFIGNIPLMNSL TSIVNGLYRIVI+QILQ P IYY+SELDHNGISVYTGTI+SDWGGRLELEIDRKARIWARVSRKQKISILVLSSAMGSNLRE
Subjt: MQEQTIFIGNIPLMNSLETSIVNGLYRIVISQILQRPDIYYQSELDHNGISVYTGTIISDWGGRLELEIDRKARIWARVSRKQKISILVLSSAMGSNLRE
Query: ILENVCYPEIFLSFLNDKEKKKIGSKENAILEFYQQFSCVGGDPVFSESLCKELQKKFFQQRCELGRIGRRNLNQRLNLDIPENNTFLLPRDILAAADHL
ILENVCYPEIFLSFLNDKEKKKIGSKE+AILEFYQQF+CVGGDPVFSESLCKELQKKFFQQRCELGRIGRRN+N+RLNLDIP+NNTFLLP+DILAAADHL
Subjt: ILENVCYPEIFLSFLNDKEKKKIGSKENAILEFYQQFSCVGGDPVFSESLCKELQKKFFQQRCELGRIGRRNLNQRLNLDIPENNTFLLPRDILAAADHL
Query: IGLKFGMGTLDDMNHLKNKRIRSVADLLQDQFGLALVRLENMVRGTICGAIRHKLIPTPQNLVTSTPLTTTFESFFGLHPLSQVLDRTNPLTQIVHGRKL
IG+KFGMG LDDMNHLKNKRIRSVADLLQDQFGLAL+RLEN+VRGTICGAIRHKLIPTPQNLVTSTP+TTT+ESFFGLHPLSQVLDRTNPLTQIVHGRK
Subjt: IGLKFGMGTLDDMNHLKNKRIRSVADLLQDQFGLALVRLENMVRGTICGAIRHKLIPTPQNLVTSTPLTTTFESFFGLHPLSQVLDRTNPLTQIVHGRKL
Query: SYLGPGGLTGRTASFRIRDIHPSHYGRICPIDTSEGINVGLIGSLAIHARIGHWGSLETPFYEISERSKKVRMLYLSPSRDEYYMVATGNSLALNPGIQE
SYLGPGGLTGRTASFRIRDIHPSHYGRICPIDTSEGINVGLIGSLAIHARIGHWGSLE+PFYEISERSKKVRMLYLSPSRDEYYMVA GNSLALN GIQE
Subjt: SYLGPGGLTGRTASFRIRDIHPSHYGRICPIDTSEGINVGLIGSLAIHARIGHWGSLETPFYEISERSKKVRMLYLSPSRDEYYMVATGNSLALNPGIQE
Query: EQIVPARYHQ
EQ+VPARY Q
Subjt: EQIVPARYHQ
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| Q2L8Z9 DNA-directed RNA polymerase subunit beta | 4.2e-226 | 93.9 | Show/hide |
Query: MQEQTIFIGNIPLMNSLETSIVNGLYRIVISQILQRPDIYYQSELDHNGISVYTGTIISDWGGRLELEIDRKARIWARVSRKQKISILVLSSAMGSNLRE
MQEQTIFIGNIPLMNSL TSIVNG+YRIVI+QILQ P IYY+SELDHNGISVYTGTIISDWGGRLELEIDRKARIWARVSRKQKISILVLSSAMGSNLRE
Subjt: MQEQTIFIGNIPLMNSLETSIVNGLYRIVISQILQRPDIYYQSELDHNGISVYTGTIISDWGGRLELEIDRKARIWARVSRKQKISILVLSSAMGSNLRE
Query: ILENVCYPEIFLSFLNDKEKKKIGSKENAILEFYQQFSCVGGDPVFSESLCKELQKKFFQQRCELGRIGRRNLNQRLNLDIPENNTFLLPRDILAAADHL
ILENVCYPEIFLSFL DKEKKKIGSKENAILEFYQQFSCVGGDPVFSESLCKELQKKFFQQRCELGRIGRRN+NQRLNL+IP+NNTFLLPRDILAAAD L
Subjt: ILENVCYPEIFLSFLNDKEKKKIGSKENAILEFYQQFSCVGGDPVFSESLCKELQKKFFQQRCELGRIGRRNLNQRLNLDIPENNTFLLPRDILAAADHL
Query: IGLKFGMGTLDDMNHLKNKRIRSVADLLQDQFGLALVRLENMVRGTICGAIRHKLIPTPQNLVTSTPLTTTFESFFGLHPLSQVLDRTNPLTQIVHGRKL
IG+KFGMG LDDMNHLKNKRIRSVADLLQDQFGLALVRLEN+VRGTICGAIRHKLIPTPQNLVTSTPLTTT+ESFFGLHPLSQVLDRTNPLTQIVHGRKL
Subjt: IGLKFGMGTLDDMNHLKNKRIRSVADLLQDQFGLALVRLENMVRGTICGAIRHKLIPTPQNLVTSTPLTTTFESFFGLHPLSQVLDRTNPLTQIVHGRKL
Query: SYLGPGGLTGRTASFRIRDIHPSHYGRICPIDTSEGINVGLIGSLAIHARIGHWGSLETPFYEISERSKKVRMLYLSPSRDEYYMVATGNSLALNPGIQE
SYLGPGGLTGRTA+FRIRDIHPSHYGRICPIDTSEGINVGLIGSLAIHARIGHWGSLE+PFY+I ERSKK +MLYLSPSRDEYYMVA GNSLALN GIQE
Subjt: SYLGPGGLTGRTASFRIRDIHPSHYGRICPIDTSEGINVGLIGSLAIHARIGHWGSLETPFYEISERSKKVRMLYLSPSRDEYYMVATGNSLALNPGIQE
Query: EQIVPARYHQ
EQ+VPARY Q
Subjt: EQIVPARYHQ
|
|
| Q4VZP1 DNA-directed RNA polymerase subunit beta | 8.4e-235 | 98.54 | Show/hide |
Query: MQEQTIFIGNIPLMNSLETSIVNGLYRIVISQILQRPDIYYQSELDHNGISVYTGTIISDWGGRLELEIDRKARIWARVSRKQKISILVLSSAMGSNLRE
MQEQTIFIGNIPLMNSL TSIVNGLYRIVISQILQ P IYY+SELDHNGISVYTGTIISDWGGRLELEIDRKARIWARVSRKQKISILVLSSAMGSNLRE
Subjt: MQEQTIFIGNIPLMNSLETSIVNGLYRIVISQILQRPDIYYQSELDHNGISVYTGTIISDWGGRLELEIDRKARIWARVSRKQKISILVLSSAMGSNLRE
Query: ILENVCYPEIFLSFLNDKEKKKIGSKENAILEFYQQFSCVGGDPVFSESLCKELQKKFFQQRCELGRIGRRNLNQRLNLDIPENNTFLLPRDILAAADHL
ILENVCYPEIFLSFLNDKEKKKIGSKENAILEFYQQFSCVGGDPVFSESLCKELQKKFFQQRCELGRIGRRNLNQRLNLDIPENNTFLL RDILAAADHL
Subjt: ILENVCYPEIFLSFLNDKEKKKIGSKENAILEFYQQFSCVGGDPVFSESLCKELQKKFFQQRCELGRIGRRNLNQRLNLDIPENNTFLLPRDILAAADHL
Query: IGLKFGMGTLDDMNHLKNKRIRSVADLLQDQFGLALVRLENMVRGTICGAIRHKLIPTPQNLVTSTPLTTTFESFFGLHPLSQVLDRTNPLTQIVHGRKL
IGLKFGMGTLDDMNHLKNKRIRSVADLLQDQFGLALVRLENMVRGTICGAIRHKLIPTPQNLVTSTPLTTTFESFFGLHPLSQVLDRTNPLTQIVHGRKL
Subjt: IGLKFGMGTLDDMNHLKNKRIRSVADLLQDQFGLALVRLENMVRGTICGAIRHKLIPTPQNLVTSTPLTTTFESFFGLHPLSQVLDRTNPLTQIVHGRKL
Query: SYLGPGGLTGRTASFRIRDIHPSHYGRICPIDTSEGINVGLIGSLAIHARIGHWGSLETPFYEISERSKKVRMLYLSPSRDEYYMVATGNSLALNPGIQE
SYLGPGGLTGRTASFRIRDIHPSHYGRICPIDTSEGINVGLIGSLAIHARIGHWGSLETPFYEISERSKKVRMLYLSPSRDEYYMVATGNSLALNPGIQE
Subjt: SYLGPGGLTGRTASFRIRDIHPSHYGRICPIDTSEGINVGLIGSLAIHARIGHWGSLETPFYEISERSKKVRMLYLSPSRDEYYMVATGNSLALNPGIQE
Query: EQIVPARYHQ
EQIVPARY Q
Subjt: EQIVPARYHQ
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT3G18090.1 nuclear RNA polymerase D2B | 2.2e-04 | 23.53 | Show/hide |
Query: LIGLKFGMGTLDDMNHLKNKRIRSVADLLQDQFGLALV----RLENMVRGTICG-----AIRHKLIPTPQNLVTSTPLTTTFESFFGLHPLSQV------
L+ G ++ + +NKRI +LL+ + + L ++ ++ + G I H L + V + L F + HP ++
Subjt: LIGLKFGMGTLDDMNHLKNKRIRSVADLLQDQFGLALV----RLENMVRGTICG-----AIRHKLIPTPQNLVTSTPLTTTFESFFGLHPLSQV------
Query: ---LDRTNPLTQIVHGRK----LSYLGPGGLTGRTASFRIRDIHPSHYGRICPIDTSEGINVGLIGSLAI
L R NPL ++ R+ + Y G G R HPSH+GR+C + T +G N GL+ ++++
Subjt: ---LDRTNPLTQIVHGRK----LSYLGPGGLTGRTASFRIRDIHPSHYGRICPIDTSEGINVGLIGSLAI
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| AT3G23780.1 nuclear RNA polymerase D2A | 4.9e-04 | 23.78 | Show/hide |
Query: GMGTLDDMNHLKNKRIRSVADLLQDQFGLALV----RLENMVRGTICG-----AIRHKLIPTPQNLVTSTPLTTTFESFFGLHPLSQV---------LDR
G ++ + +NKRI +LL+ + + L ++ ++ + G I H L + V + L+ F + HP ++ L R
Subjt: GMGTLDDMNHLKNKRIRSVADLLQDQFGLALV----RLENMVRGTICG-----AIRHKLIPTPQNLVTSTPLTTTFESFFGLHPLSQV---------LDR
Query: TNPLTQIVHGRK----LSYLGPGGLTGRTASFRIRDIHPSHYGRICPIDTSEGINVGLIGSLAI
NPL ++ R+ + Y G G R HPSH+GR+C + T +G N GL+ ++++
Subjt: TNPLTQIVHGRK----LSYLGPGGLTGRTASFRIRDIHPSHYGRICPIDTSEGINVGLIGSLAI
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| AT3G23780.2 nuclear RNA polymerase D2A | 4.9e-04 | 23.78 | Show/hide |
Query: GMGTLDDMNHLKNKRIRSVADLLQDQFGLALV----RLENMVRGTICG-----AIRHKLIPTPQNLVTSTPLTTTFESFFGLHPLSQV---------LDR
G ++ + +NKRI +LL+ + + L ++ ++ + G I H L + V + L+ F + HP ++ L R
Subjt: GMGTLDDMNHLKNKRIRSVADLLQDQFGLALV----RLENMVRGTICG-----AIRHKLIPTPQNLVTSTPLTTTFESFFGLHPLSQV---------LDR
Query: TNPLTQIVHGRK----LSYLGPGGLTGRTASFRIRDIHPSHYGRICPIDTSEGINVGLIGSLAI
NPL ++ R+ + Y G G R HPSH+GR+C + T +G N GL+ ++++
Subjt: TNPLTQIVHGRK----LSYLGPGGLTGRTASFRIRDIHPSHYGRICPIDTSEGINVGLIGSLAI
|
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| AT4G21710.1 DNA-directed RNA polymerase family protein | 8.1e-07 | 28.18 | Show/hide |
Query: DDMNHLKNKRIRSVADLLQDQFGLALVRLENMVRG------------TICGAIRHKLIPTPQNLVTSTPLTTTFESFFGLHPLSQVLDRTNPLTQIVHGR
DD +H NKR+ LL F + +L VR + AI+ K I + +T + +SQVL+R + + H R
Subjt: DDMNHLKNKRIRSVADLLQDQFGLALVRLENMVRG------------TICGAIRHKLIPTPQNLVTSTPLTTTFESFFGLHPLSQVLDRTNPLTQIVHGR
Query: KLSYLGPGGLTGRTASFRIRDIHPSHYGRICPIDTSEGINVGLIGSLAIHARIGHWGSLETPFYEISERSKKVRMLYLSPS
+L+ P G G+ A + R +H S +G +CP +T EG GL+ +LA+ I GS P E E +SPS
Subjt: KLSYLGPGGLTGRTASFRIRDIHPSHYGRICPIDTSEGINVGLIGSLAIHARIGHWGSLETPFYEISERSKKVRMLYLSPS
|
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| ATCG00190.1 RNA polymerase subunit beta | 8.7e-219 | 90.05 | Show/hide |
Query: MQEQTIFIGNIPLMNSLETSIVNGLYRIVISQILQRPDIYYQSELDHNGISVYTGTIISDWGGRLELEIDRKARIWARVSRKQKISILVLSSAMGSNLRE
MQEQ IFIGNIPLMNSL TSIVNG+YRIVI+QILQ P IYYQSELDHNGISVYTGTIISDWGGRLELEID+KARIWARVSRKQKISILVLSSAMG NLRE
Subjt: MQEQTIFIGNIPLMNSLETSIVNGLYRIVISQILQRPDIYYQSELDHNGISVYTGTIISDWGGRLELEIDRKARIWARVSRKQKISILVLSSAMGSNLRE
Query: ILENVCYPEIFLSFLNDKEKKKIGSKENAILEFYQQFSCVGGDPVFSESLCKELQKKFFQQRCELGRIGRRNLNQRLNLDIPENNTFLLPRDILAAADHL
ILENVCYPEIFLSFL DKEKKKIGSKENAILEFYQQFSCVGGDP+FSESLCKELQKKFF QRCELGRIGRRN+N RLNL+IP+NN FLLPRD+LAAADHL
Subjt: ILENVCYPEIFLSFLNDKEKKKIGSKENAILEFYQQFSCVGGDPVFSESLCKELQKKFFQQRCELGRIGRRNLNQRLNLDIPENNTFLLPRDILAAADHL
Query: IGLKFGMGTLDDMNHLKNKRIRSVADLLQDQFGLALVRLENMVRGTICGAIRHKLIPTPQNLVTSTPLTTTFESFFGLHPLSQVLDRTNPLTQIVHGRKL
IG+KFGMGTLDDMNHLKNKRIRSVADLLQDQ GLAL RLEN+V+GTI GAIRHKLIPTPQNLVTSTPLTTT+ESFFGLHPLSQVLDRTNPLTQIVHGRKL
Subjt: IGLKFGMGTLDDMNHLKNKRIRSVADLLQDQFGLALVRLENMVRGTICGAIRHKLIPTPQNLVTSTPLTTTFESFFGLHPLSQVLDRTNPLTQIVHGRKL
Query: SYLGPGGLTGRTASFRIRDIHPSHYGRICPIDTSEGINVGLIGSLAIHARIGHWGSLETPFYEISERSKK--VRMLYLSPSRDEYYMVATGNSLALNPGI
SYLGPGGLTGRTA+FRIRDIHPSHYGRICPIDTSEGINVGLIGSL+IHARIG WGSLE+PFYE+ E+SKK +RML+LSPS+DEYYM+A GNSLALN GI
Subjt: SYLGPGGLTGRTASFRIRDIHPSHYGRICPIDTSEGINVGLIGSLAIHARIGHWGSLETPFYEISERSKK--VRMLYLSPSRDEYYMVATGNSLALNPGI
Query: QEEQIVPARYHQ
QEEQ VPARY Q
Subjt: QEEQIVPARYHQ
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