; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh02G006090 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh02G006090
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionTransmembrane protein
Genome locationCmo_Chr02:3769688..3777335
RNA-Seq ExpressionCmoCh02G006090
SyntenyCmoCh02G006090
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6605297.1 hypothetical protein SDJN03_02614, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.1e-8497.7Show/hide
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XP_023007256.1 uncharacterized protein LOC111499795 isoform X2 [Cucurbita maxima]1.2e-7289.14Show/hide
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XP_023534758.1 uncharacterized protein LOC111796230 [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.2e-8195.4Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LM30 Uncharacterized protein3.4e-5269.32Show/hide
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A0A1S3C6P8 uncharacterized protein LOC1034974679.6e-5572.16Show/hide
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A0A5A7TVH8 Uncharacterized protein9.6e-5572.16Show/hide
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A0A6J1G8H3 uncharacterized protein LOC111451714 isoform X11.2e-86100Show/hide
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A0A6J1L017 uncharacterized protein LOC111499795 isoform X26.0e-7389.14Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G64880.1 unknown protein1.2e-1237.58Show/hide
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           +T+ GEGS+   E      L  HPC+ FRLA SAFL+C G+D STE +  E+  R ES K +
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CGCCATTGATTTCTCCAAAATCGATACCGTCGGCAACTCCACTGCCGCCATTGCTTCTTCTTCTTCTACTTCTAATAGTCGCTTCGTTTCTGAAATTGCTCACAACCACA
AGAATGTTTCTATGCACAATATCAGGATTGATTCTGATCCATCGCGGAATGCGCAGGCCAATATAGAGCAAAGCACGCGGGGGGAGATAGTGTGGAGTACGAGTAGGAGA
ATCACGCAAACGGGAGAAGGCAGTGTGGTAGGAGGGGAAGGCTGTGAAGAAACCAAGTTAGAACTTCACCCTTGCAGTTATTTCAGGCTTGCTAAATCAGCTTTCCTTAG
GTGTCTGGGGTTGGACTCTTCAACTGAGAACTCGGTCCCGGAGGAAAGACAGAGACCGGAGTCGACAAAGTCGAAACGAAGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGATAAGGTAATTTTTGTGAACTTTTCTTAGACCTTCCCCTGTTTAGGTATTGAAATCGGAAGCTGAATCCAAATCATTCTCTCTATGAAATTCTCGTTTGCCCTAATAT
GTTCAATTTTGAAGATGAGCTCATACTTCAACCCCGAGTTTCGTGGTTAATCTGGATTCAGCTTCTTCTTCTTATCCTCCTCTTCGCGCTTTATTGTCTCACCATCTTCG
CCATTGATTTCTCCAAAATCGATACCGTCGGCAACTCCACTGCCGCCATTGCTTCTTCTTCTTCTACTTCTAATAGTCGCTTCGTTTCTGAAATTGCTCACAACCACAAG
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CACGCAAACGGGAGAAGGCAGTGTGGTAGGAGGGGAAGGCTGTGAAGAAACCAAGTTAGAACTTCACCCTTGCAGTTATTTCAGGCTTGCTAAATCAGCTTTCCTTAGGT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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