; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh02G006490 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh02G006490
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionMembrane lipoprotein, putative
Genome locationCmo_Chr02:4042622..4043062
RNA-Seq ExpressionCmoCh02G006490
SyntenyCmoCh02G006490
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6605337.1 hypothetical protein SDJN03_02654, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.7e-6897.26Show/hide
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KAG7035293.1 hypothetical protein SDJN02_02088, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.6e-6897.26Show/hide
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XP_022947828.1 uncharacterized protein LOC111451588 [Cucurbita moschata]9.7e-71100Show/hide
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XP_023533092.1 uncharacterized protein LOC111795084 [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.7e-6895.89Show/hide
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XP_038900833.1 uncharacterized protein LOC120087896 [Benincasa hispida]2.9e-4368.87Show/hide
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        MSLV+PS GR  IWIVT  LF S++SGGGCLLMY+ LPETE TAWLPVAGLSLVCLPWFFW LTF YR+ISRACGFRVS+G+ V+   D A  NN N +N
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        N   ESP+ D G + ++ED   G+QR+SNSSSN+S ASRESE PLAITMGS
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LJX6 Uncharacterized protein5.6e-4064.71Show/hide
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        MSLV+PS GR  IWIVT  LF S+LSGGGCLLMY+ LPETE TAWLP+ GLSLVCLPWFFW LTF YR++SRACGFRVSLG+  +    ++NN NA+NN 
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        +N     ES Q D G + N+++ N  QR SNSSSN+S  SRESE PLAITM S
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A0A1S3CDW9 Uncharacterized protein6.2e-3963.4Show/hide
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        MSLV+PS GR  IWIVT  LF S++SGGGCLLMY+ LPE+E+T WLP+ GLSLVCLPWFFW LTF YR+ISRACG+RVSLG    ED    N N+N +NN
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         +N    ESP+ D G + N+++ N  QR+SNSSSN+S  SRESE PLAITM S
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A0A5A7TCV0 Uncharacterized protein1.4e-3862.34Show/hide
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        MSLV+PS GR  IWIVT  LF S++SGGGCLLMY+ LPE+E+T WLP+ GLSLVCLPWFFW LTF YR+ISRACG+RVSLG   +     TNN N +NN 
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        +N      ESP+ D G + N+++ N  QR+SNSSSN+S  SRESE PLAITM S
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A0A6J1EV39 uncharacterized protein LOC1114383191.6e-3965.1Show/hide
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        MSLVDPS GR  +W V F LFL +LSGG CLL+YI LPETE+TAWLPVAGLSLVCLPWFFW LTF YR+ISRACGFRVSL +  + +    ++ N +NN+
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          ESP+ DA  QA +EDGN   QR+SN SSN+S  SRESE P AI+MGS
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A0A6J1G7P7 uncharacterized protein LOC1114515884.7e-71100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G30770.1 Putative membrane lipoprotein1.6e-1841.46Show/hide
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        M + DP  G+  I ++T  LFLS+  GGGCL+ Y  LP      WL   G+  VCLPWFFW LTF YRI+SR  GFR+ +G          NN N +  T
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         +        ESP  D         G      +GNQ  ++ ++SSNS+ AS ESE PLAI+M S
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTTTGGTCGATCCATCAATTGGACGTGTATTAATATGGATCGTTACTTTCATTCTCTTCCTCTCTGTTCTCAGCGGCGGCGGATGCCTTTTGATGTATATTACCCT
ACCTGAGACCGAAAACACCGCATGGCTACCGGTCGCAGGCTTGTCGTTGGTCTGCCTCCCTTGGTTCTTTTGGTTCTTAACTTTCTTGTATAGAATCATCTCACGTGCAT
GTGGTTTTAGAGTCTCTCTTGGCTTAGTTGTGAACGAAGATGCAGCGGCAACAAATAACGAAAATGCCGATAATAATACTCATAATGAATCCCCTCAAAGTGATGCAGGG
TGTCAGGCTAATAAGGAGGACGGCAATCAAAGGCAAAGCAATTCATCATCAAACAGCTCGGGAGCGTCTCGTGAAAGTGAAAAGCCATTAGCCATAACAATGGGGTCGTA
A
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCTTTGGTCGATCCATCAATTGGACGTGTATTAATATGGATCGTTACTTTCATTCTCTTCCTCTCTGTTCTCAGCGGCGGCGGATGCCTTTTGATGTATATTACCCT
ACCTGAGACCGAAAACACCGCATGGCTACCGGTCGCAGGCTTGTCGTTGGTCTGCCTCCCTTGGTTCTTTTGGTTCTTAACTTTCTTGTATAGAATCATCTCACGTGCAT
GTGGTTTTAGAGTCTCTCTTGGCTTAGTTGTGAACGAAGATGCAGCGGCAACAAATAACGAAAATGCCGATAATAATACTCATAATGAATCCCCTCAAAGTGATGCAGGG
TGTCAGGCTAATAAGGAGGACGGCAATCAAAGGCAAAGCAATTCATCATCAAACAGCTCGGGAGCGTCTCGTGAAAGTGAAAAGCCATTAGCCATAACAATGGGGTCGTA
A
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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CQANKEDGNQRQSNSSSNSSGASRESEKPLAITMGS