; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh02G007150 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh02G007150
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionGDSL esterase/lipase
Genome locationCmo_Chr02:4479884..4480138
RNA-Seq ExpressionCmoCh02G007150
SyntenyCmoCh02G007150
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0016788 - hydrolase activity, acting on ester bonds (molecular function)
InterPro domainsIPR036514 - SGNH hydrolase superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004151059.1 GDSL esterase/lipase At2g30310 [Cucumis sativus]3.0e-3286.59Show/hide
Query:  KIFPGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI
        K FPGH ATGRFS+GKLIPDMVASRLGIKE VPPFLDPKLSNDD++TGVSFASAG GFDDLTA +SK IPVMKQID FKNYI
Subjt:  KIFPGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI

XP_016902930.1 PREDICTED: GDSL esterase/lipase At2g30310-like [Cucumis melo]3.0e-3286.59Show/hide
Query:  KIFPGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI
        K FPGH ATGRFS+GKLIPDMVASRLGIKE VPPFLDPKLSNDD++TGVSFASAG GFDDLTA +SK IPVMKQID FKNYI
Subjt:  KIFPGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI

XP_022947820.1 GDSL esterase/lipase At2g30310-like [Cucurbita moschata]1.3e-3287.65Show/hide
Query:  KIFPGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNY
        K FPGH ATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKE VPPFLDPKLS DD++TGVSFASAG GFDDLTA +SK IPVMKQIDLFKNY
Subjt:  KIFPGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNY

XP_023006812.1 GDSL esterase/lipase At2g30310-like [Cucurbita maxima]1.2e-3389.02Show/hide
Query:  KIFPGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI
        K FPGH ATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKL NDD++TGVSFASAG GFDDLTA +SK IPVMKQIDLFKNYI
Subjt:  KIFPGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI

XP_023533087.1 GDSL esterase/lipase At2g30310-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.7e-3388.89Show/hide
Query:  KIFPGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNY
        K FPGH ATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKE VPPFLDPKLSNDD++TGVSFASAG GFDDLTA +SK IPVMKQIDLFKNY
Subjt:  KIFPGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNY

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LNE2 Uncharacterized protein1.5e-3286.59Show/hide
Query:  KIFPGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI
        K FPGH ATGRFS+GKLIPDMVASRLGIKE VPPFLDPKLSNDD++TGVSFASAG GFDDLTA +SK IPVMKQID FKNYI
Subjt:  KIFPGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI

A0A1S4E4N0 GDSL esterase/lipase At2g30310-like1.5e-3286.59Show/hide
Query:  KIFPGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI
        K FPGH ATGRFS+GKLIPDMVASRLGIKE VPPFLDPKLSNDD++TGVSFASAG GFDDLTA +SK IPVMKQID FKNYI
Subjt:  KIFPGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI

A0A5A7VF47 GDSL esterase/lipase1.5e-3286.59Show/hide
Query:  KIFPGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI
        K FPGH ATGRFS+GKLIPDMVASRLGIKE VPPFLDPKLSNDD++TGVSFASAG GFDDLTA +SK IPVMKQID FKNYI
Subjt:  KIFPGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI

A0A6J1G7Z0 GDSL esterase/lipase At2g30310-like6.5e-3387.65Show/hide
Query:  KIFPGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNY
        K FPGH ATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKE VPPFLDPKLS DD++TGVSFASAG GFDDLTA +SK IPVMKQIDLFKNY
Subjt:  KIFPGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNY

A0A6J1KWV5 GDSL esterase/lipase At2g30310-like5.9e-3489.02Show/hide
Query:  KIFPGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI
        K FPGH ATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKL NDD++TGVSFASAG GFDDLTA +SK IPVMKQIDLFKNYI
Subjt:  KIFPGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22918 GDSL esterase/lipase At2g302202.4e-2464.56Show/hide
Query:  PGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI
        PGH A GRFSNGKLI D+++++L IKEFVPPFL P +S+ D+ TGV FASAG G+DD T++ SKAIPV +Q  +FKNYI
Subjt:  PGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI

O22927 GDSL esterase/lipase At2g303107.0e-2463.29Show/hide
Query:  PGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI
        PGH A GR+SNGK+I D++AS+L IKE VPPFL P +S+ D+ TGVSFASAG G+DD +++ SKAIPV +Q  +FKNYI
Subjt:  PGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI

Q9LMJ3 GDSL esterase/lipase At1g069902.6e-2361.25Show/hide
Query:  FPGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI
        FPGH ATGRFSNGKLIPD +AS +GIK+ VPPFLDP LS+ D+ TGV FASAG G+D+LT   +  + V KQ D+ ++Y+
Subjt:  FPGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI

Q9SIQ2 GDSL esterase/lipase At2g315501.9e-2159.49Show/hide
Query:  PGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI
        P   A GRFSNGKLI D++A++L IKEF+PPFL P LS+ D+ TGV FASAG G+DDLT++ ++AI V +Q ++FK+YI
Subjt:  PGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI

Q9SIQ3 GDSL esterase/lipase At2g315401.9e-2159.49Show/hide
Query:  PGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI
        P   A GRFSNGKLI D++A++L IKEF+PPFL P LS+ D+ TGV FASAG G+DDLT++ ++AI V +Q ++FK+YI
Subjt:  PGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G06990.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein1.9e-2461.25Show/hide
Query:  FPGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI
        FPGH ATGRFSNGKLIPD +AS +GIK+ VPPFLDP LS+ D+ TGV FASAG G+D+LT   +  + V KQ D+ ++Y+
Subjt:  FPGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI

AT2G24560.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase family protein8.7e-2255.7Show/hide
Query:  PGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI
        P H A+GRF+NGK+  D++A++L IK+FVPPFL P LS+ ++ TGV FASAG G+DD T++ ++AI V+ Q  +FKNYI
Subjt:  PGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI

AT2G30220.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase family protein1.7e-2564.56Show/hide
Query:  PGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI
        PGH A GRFSNGKLI D+++++L IKEFVPPFL P +S+ D+ TGV FASAG G+DD T++ SKAIPV +Q  +FKNYI
Subjt:  PGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI

AT2G30310.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase family protein4.9e-2563.29Show/hide
Query:  PGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI
        PGH A GR+SNGK+I D++AS+L IKE VPPFL P +S+ D+ TGVSFASAG G+DD +++ SKAIPV +Q  +FKNYI
Subjt:  PGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI

AT2G31540.1 GDSL-like Lipase/Acylhydrolase superfamily protein1.3e-2259.49Show/hide
Query:  PGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI
        P   A GRFSNGKLI D++A++L IKEF+PPFL P LS+ D+ TGV FASAG G+DDLT++ ++AI V +Q ++FK+YI
Subjt:  PGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTAAAGATTTTCCCTGGTCATACTGCTACTGGAAGGTTTAGTAATGGAAAACTCATTCCTGACATGGTGGCTTCTAGATTGGGGATAAAGGAGTTTGTTCCTCCATT
TTTGGATCCAAAATTGTCGAATGATGACATGAGAACAGGAGTCAGTTTTGCATCAGCTGGCATAGGGTTTGATGATCTAACTGCTATGGTATCCAAAGCTATTCCTGTGA
TGAAGCAAATTGATCTTTTCAAGAACTATATTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGTAAAGATTTTCCCTGGTCATACTGCTACTGGAAGGTTTAGTAATGGAAAACTCATTCCTGACATGGTGGCTTCTAGATTGGGGATAAAGGAGTTTGTTCCTCCATT
TTTGGATCCAAAATTGTCGAATGATGACATGAGAACAGGAGTCAGTTTTGCATCAGCTGGCATAGGGTTTGATGATCTAACTGCTATGGTATCCAAAGCTATTCCTGTGA
TGAAGCAAATTGATCTTTTCAAGAACTATATTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVKIFPGHTATGRFSNGKLIPDMVASRLGIKEFVPPFLDPKLSNDDMRTGVSFASAGIGFDDLTAMVSKAIPVMKQIDLFKNYI