; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh02G007680 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh02G007680
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionacyl-coenzyme A thioesterase 13-like
Genome locationCmo_Chr02:4786774..4787876
RNA-Seq ExpressionCmoCh02G007680
SyntenyCmoCh02G007680
Gene Ontology termsGO:0047617 - acyl-CoA hydrolase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR006683 - Thioesterase domain
IPR029069 - HotDog domain superfamily
IPR039298 - Acyl-coenzyme A thioesterase 13


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6570673.1 Acyl-coenzyme A thioesterase 13, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.8e-5979.08Show/hide
Query:  MEKAKQLLELTPEESDAVEKLDGRPNIAGDSCFYTFFSFRGIRVNRVEPGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGSAVIYDEPPPTLVSVDIS
        MEK KQLLEL+ EE++AVEKLD RP  AG+SCFYTFF+ RGIRV+R EPGL+VCTLKVPPRLTDRSGKL+SGAIANLVDE+G AVIYDE  P  VSVD+S
Subjt:  MEKAKQLLELTPEESDAVEKLDGRPNIAGDSCFYTFFSFRGIRVNRVEPGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGSAVIYDEPPPTLVSVDIS

Query:  IAYFSTADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRHSFFRIR
        I+Y STADVDDELEI SRLLGQK RY+G SV+IKNK TGEIVAEGRHS F IR
Subjt:  IAYFSTADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRHSFFRIR

KAG6605429.1 Acyl-coenzyme A thioesterase 13, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.5e-7798.08Show/hide
Query:  MEKAKQLLELTPEESDAVEKLDGRPNIAGDSCFYTFFSFRGIRVNRVEPGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGSAVIYDEPPPTLVSVDIS
        MEKAKQLLELTPEESDAVEKLDGR NIAGDSCFYTFFSFRGI VNRVEPGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGSAVIYDEPPPTLVSVDIS
Subjt:  MEKAKQLLELTPEESDAVEKLDGRPNIAGDSCFYTFFSFRGIRVNRVEPGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGSAVIYDEPPPTLVSVDIS

Query:  IAYFSTADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRHSFFRIRSKM
        IAY STADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRHSFFRIRSKM
Subjt:  IAYFSTADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRHSFFRIRSKM

XP_022943771.1 uncharacterized protein LOC111448424 [Cucurbita moschata]1.8e-5979.08Show/hide
Query:  MEKAKQLLELTPEESDAVEKLDGRPNIAGDSCFYTFFSFRGIRVNRVEPGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGSAVIYDEPPPTLVSVDIS
        MEK KQLLEL+ EE++AVEKLD RP  AG+SCFYTFF+ RGIRV+R EPGL+VCTLKVPPRLTDRSGKL+SGAIANLVDE+G AVIYDE  P  VSVD+S
Subjt:  MEKAKQLLELTPEESDAVEKLDGRPNIAGDSCFYTFFSFRGIRVNRVEPGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGSAVIYDEPPPTLVSVDIS

Query:  IAYFSTADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRHSFFRIR
        I+Y STADVDDELEI SRLLGQK RY+G SV+IKNK TGEIVAEGRHS F IR
Subjt:  IAYFSTADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRHSFFRIR

XP_022948156.1 acyl-coenzyme A thioesterase 13-like [Cucurbita moschata]4.2e-80100Show/hide
Query:  MEKAKQLLELTPEESDAVEKLDGRPNIAGDSCFYTFFSFRGIRVNRVEPGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGSAVIYDEPPPTLVSVDIS
        MEKAKQLLELTPEESDAVEKLDGRPNIAGDSCFYTFFSFRGIRVNRVEPGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGSAVIYDEPPPTLVSVDIS
Subjt:  MEKAKQLLELTPEESDAVEKLDGRPNIAGDSCFYTFFSFRGIRVNRVEPGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGSAVIYDEPPPTLVSVDIS

Query:  IAYFSTADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRHSFFRIRSKM
        IAYFSTADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRHSFFRIRSKM
Subjt:  IAYFSTADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRHSFFRIRSKM

XP_023532314.1 acyl-coenzyme A thioesterase 13-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.7e-7796.79Show/hide
Query:  MEKAKQLLELTPEESDAVEKLDGRPNIAGDSCFYTFFSFRGIRVNRVEPGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGSAVIYDEPPPTLVSVDIS
        MEKAKQLLELTPEE+DAVEKLDGR NIAGDSCFYTFFSFRGIRVNRVEPGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGS VIYDEPPPTLVSVDIS
Subjt:  MEKAKQLLELTPEESDAVEKLDGRPNIAGDSCFYTFFSFRGIRVNRVEPGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGSAVIYDEPPPTLVSVDIS

Query:  IAYFSTADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRHSFFRIRSKM
        IAY STA+VDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRHSFFRIRSKM
Subjt:  IAYFSTADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRHSFFRIRSKM

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KH68 Acyl-CoA thioesterase2.9e-5877.78Show/hide
Query:  MEKAKQLLELTPEESDAVEKLDGRPNIAGDSCFYTFFSFRGIRVNRVEPGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGSAVIYDEPPPTLVSVDIS
        MEKAKQLLELT EE+DAV KL  RP   G SCFYTFF+ RGIRV+RVEPGL+VCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIG AVIYD+  P  VSVD+S
Subjt:  MEKAKQLLELTPEESDAVEKLDGRPNIAGDSCFYTFFSFRGIRVNRVEPGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGSAVIYDEPPPTLVSVDIS

Query:  IAYFSTADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRHSFFRIR
        I+Y S+ADVDDELEI S+LLGQK RY+G SV+IKNK  GEIVAEGRHS F +R
Subjt:  IAYFSTADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRHSFFRIR

A0A5A7V7K8 Putative acyl-CoA thioesterase3.7e-5877.78Show/hide
Query:  MEKAKQLLELTPEESDAVEKLDGRPNIAGDSCFYTFFSFRGIRVNRVEPGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGSAVIYDEPPPTLVSVDIS
        MEKAKQLLELT EE+DAV+KL  RP   G SCFYTFF+ RGI+V+RVEPGL+VCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIG AVIYDE  P  VSVD+S
Subjt:  MEKAKQLLELTPEESDAVEKLDGRPNIAGDSCFYTFFSFRGIRVNRVEPGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGSAVIYDEPPPTLVSVDIS

Query:  IAYFSTADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRHSFFRIR
        I+Y S+ADVDDELEI S+LLGQK RY+G  V+IKNK  GEIVAEGRHS F IR
Subjt:  IAYFSTADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRHSFFRIR

A0A6J1FSM4 uncharacterized protein LOC1114484248.9e-6079.08Show/hide
Query:  MEKAKQLLELTPEESDAVEKLDGRPNIAGDSCFYTFFSFRGIRVNRVEPGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGSAVIYDEPPPTLVSVDIS
        MEK KQLLEL+ EE++AVEKLD RP  AG+SCFYTFF+ RGIRV+R EPGL+VCTLKVPPRLTDRSGKL+SGAIANLVDE+G AVIYDE  P  VSVD+S
Subjt:  MEKAKQLLELTPEESDAVEKLDGRPNIAGDSCFYTFFSFRGIRVNRVEPGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGSAVIYDEPPPTLVSVDIS

Query:  IAYFSTADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRHSFFRIR
        I+Y STADVDDELEI SRLLGQK RY+G SV+IKNK TGEIVAEGRHS F IR
Subjt:  IAYFSTADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRHSFFRIR

A0A6J1G8H0 acyl-coenzyme A thioesterase 13-like2.0e-80100Show/hide
Query:  MEKAKQLLELTPEESDAVEKLDGRPNIAGDSCFYTFFSFRGIRVNRVEPGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGSAVIYDEPPPTLVSVDIS
        MEKAKQLLELTPEESDAVEKLDGRPNIAGDSCFYTFFSFRGIRVNRVEPGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGSAVIYDEPPPTLVSVDIS
Subjt:  MEKAKQLLELTPEESDAVEKLDGRPNIAGDSCFYTFFSFRGIRVNRVEPGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGSAVIYDEPPPTLVSVDIS

Query:  IAYFSTADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRHSFFRIRSKM
        IAYFSTADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRHSFFRIRSKM
Subjt:  IAYFSTADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRHSFFRIRSKM

A0A6J1JFG8 uncharacterized protein LOC1114845363.4e-5977.12Show/hide
Query:  MEKAKQLLELTPEESDAVEKLDGRPNIAGDSCFYTFFSFRGIRVNRVEPGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGSAVIYDEPPPTLVSVDIS
        MEK KQLLEL+ EE++AVEKLD RP  AG+SCFYTFF+ RGIRV+R EPGL+VCTLKVPPRLTDR+GKL+SGAIANLVDE+G A+IYDE  P  VS+D+S
Subjt:  MEKAKQLLELTPEESDAVEKLDGRPNIAGDSCFYTFFSFRGIRVNRVEPGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGSAVIYDEPPPTLVSVDIS

Query:  IAYFSTADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRHSFFRIR
        I+Y STADVDDELEI SRLLGQK RY+G SV+IKNK TGEIVAEGRHS F IR
Subjt:  IAYFSTADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRHSFFRIR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5R833 Acyl-coenzyme A thioesterase 135.6e-1137.62Show/hide
Query:  PGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGS-AVIYDEPPPTLVSVDISIAYFSTADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRH
        PG ++C +KV    T+  G L  G  A LVD I + A++  E     VSVD++I Y S A + +++ IT+ +L Q +     SV + NK TG+++A+GRH
Subjt:  PGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGS-AVIYDEPPPTLVSVDISIAYFSTADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRH

Query:  S
        +
Subjt:  S

Q9CQR4 Acyl-coenzyme A thioesterase 135.1e-1239.6Show/hide
Query:  PGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGS-AVIYDEPPPTLVSVDISIAYFSTADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRH
        P  ++C +KV  + T++ G L  G  A LVD I + A++  E     VSVD++I Y S A + +E+ IT+ +L Q +    ASV + NKTTG+++A+GRH
Subjt:  PGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGS-AVIYDEPPPTLVSVDISIAYFSTADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRH

Query:  S
        +
Subjt:  S

Q9NPJ3 Acyl-coenzyme A thioesterase 135.6e-1137.62Show/hide
Query:  PGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGS-AVIYDEPPPTLVSVDISIAYFSTADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRH
        PG ++C +KV    T+  G L  G  A LVD I + A++  E     VSVD++I Y S A + +++ IT+ +L Q +     SV + NK TG+++A+GRH
Subjt:  PGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGS-AVIYDEPPPTLVSVDISIAYFSTADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRH

Query:  S
        +
Subjt:  S

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G04290.1 Thioesterase superfamily protein5.2e-2039.13Show/hide
Query:  MEKAKQLLELTPEE---SDAVEKLDGRPNIAGDSCFYTFFSFRGIRVNRVEPGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGSAVIYDE-PPPTLVS
        +E  K+ LE   +E      V KL  R        F   F   G++V+ +EPG IVC++K+PP L +    L  GA A LVD IGSAVIY      + VS
Subjt:  MEKAKQLLELTPEE---SDAVEKLDGRPNIAGDSCFYTFFSFRGIRVNRVEPGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGSAVIYDE-PPPTLVS

Query:  VDISIAYFSTADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRHS-FFRIRSKM
        V+I+++Y   A +D+E+EI S+ L   +     SV ++ KTTG+I+A+GRH+ +F  RS +
Subjt:  VDISIAYFSTADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRHS-FFRIRSKM

AT1G52191.1 Thioesterase superfamily protein1.9e-0930.63Show/hide
Query:  FSFRGIRVNRVEPGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGSAVIYDEPPPTLVSVDISIAYFSTADVDDELEITSRLLGQK-ERYNGASVIIKN
        F   G++V  V  G++ C L V   + +  G L + AI  L++ +G+  IY     +  SVD++ + +STA + +E++I +R++G++ E  N A + I+ 
Subjt:  FSFRGIRVNRVEPGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGSAVIYDEPPPTLVSVDISIAYFSTADVDDELEITSRLLGQK-ERYNGASVIIKN

Query:  KTTGEIVAEGR
        +   E++A GR
Subjt:  KTTGEIVAEGR

AT2G29590.1 Thioesterase superfamily protein6.5e-3955.33Show/hide
Query:  MEKAKQLLELTPEESDAVEKLDGRPNIAGDSCFYTFFSFRGIRVNRVEPGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGSAVIYDEPPPTLVSVDIS
        MEK  + L+L+ E  D  E       +     FY  FS RGIRVNRVEPG I C+ KVP RLTDR   LA+GAIANLVDE+G A+++ E  P  VSVD+S
Subjt:  MEKAKQLLELTPEESDAVEKLDGRPNIAGDSCFYTFFSFRGIRVNRVEPGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGSAVIYDEPPPTLVSVDIS

Query:  IAYFSTADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRHSFF
        IA+ S A + +ELEITSRLLG++  Y G  V+++NK TGEI+AEGRHS F
Subjt:  IAYFSTADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRHSFF

AT3G16175.1 Thioesterase superfamily protein1.2e-1129.91Show/hide
Query:  RGIRVNRVEPGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGSAVIYDEPPPTLVSVDISIAYFSTADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTG
        +G+ +  V  G++ C L V   +    G   +G I  ++D IG++ +Y       +SVD++ +++STA + + +EI +R+ G       A + I+ +T+G
Subjt:  RGIRVNRVEPGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGSAVIYDEPPPTLVSVDISIAYFSTADVDDELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTG

Query:  EIVAEGR
        EI+A GR
Subjt:  EIVAEGR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGAAGGCGAAGCAGCTTTTGGAATTGACTCCGGAGGAATCGGACGCCGTCGAGAAACTCGACGGCCGGCCGAATATTGCCGGAGATTCTTGCTTCTACACGTTCTT
CTCTTTCAGAGGCATCCGAGTCAATCGCGTCGAACCAGGACTCATCGTTTGTACTCTCAAGGTCCCCCCGCGCCTCACAGATCGATCGGGGAAGCTGGCTTCAGGTGCGA
TCGCAAACCTAGTCGATGAAATTGGCAGCGCCGTAATCTACGATGAGCCCCCACCGACGCTGGTTTCTGTGGACATTTCGATCGCATACTTCTCGACCGCCGATGTCGAT
GATGAATTGGAAATAACGTCGAGGCTGTTAGGGCAGAAAGAGCGTTACAATGGAGCCAGTGTGATTATTAAGAACAAAACGACTGGAGAAATTGTTGCAGAAGGAAGGCA
CTCGTTCTTCAGAATACGATCGAAAATGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGAAGGCGAAGCAGCTTTTGGAATTGACTCCGGAGGAATCGGACGCCGTCGAGAAACTCGACGGCCGGCCGAATATTGCCGGAGATTCTTGCTTCTACACGTTCTT
CTCTTTCAGAGGCATCCGAGTCAATCGCGTCGAACCAGGACTCATCGTTTGTACTCTCAAGGTCCCCCCGCGCCTCACAGATCGATCGGGGAAGCTGGCTTCAGGTGCGA
TCGCAAACCTAGTCGATGAAATTGGCAGCGCCGTAATCTACGATGAGCCCCCACCGACGCTGGTTTCTGTGGACATTTCGATCGCATACTTCTCGACCGCCGATGTCGAT
GATGAATTGGAAATAACGTCGAGGCTGTTAGGGCAGAAAGAGCGTTACAATGGAGCCAGTGTGATTATTAAGAACAAAACGACTGGAGAAATTGTTGCAGAAGGAAGGCA
CTCGTTCTTCAGAATACGATCGAAAATGTGAGTGAAGGTAGAGAAATTCATTTGAACACTGATTTTCTGATCCACCATTCTTGGCAGACATATAATCATATTCAAAATTT
ATATTGAGCATAGCTCGTTCATCACTACCAGTGCTAAATAACAATGTAACATAATAATTTTCTTAACATTGCTCAAATTTTGGCTTAATCTTAACGAATGAAAGTTAATT
AAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MEKAKQLLELTPEESDAVEKLDGRPNIAGDSCFYTFFSFRGIRVNRVEPGLIVCTLKVPPRLTDRSGKLASGAIANLVDEIGSAVIYDEPPPTLVSVDISIAYFSTADVD
DELEITSRLLGQKERYNGASVIIKNKTTGEIVAEGRHSFFRIRSKM