; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh02G009100 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh02G009100
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionglycine-rich protein DOT1-like isoform X1
Genome locationCmo_Chr02:5611230..5613524
RNA-Seq ExpressionCmoCh02G009100
SyntenyCmoCh02G009100
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
AAQ96166.1 phloem RNA-binding protein 1 [Cucurbita maxima]1.2e-7169.2Show/hide
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        HG GPAGGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGP+GGHGHGP+ GHGHGPS        GGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGP+GGHGHGP+ GHGHGPSGGHG G
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        P+GGHGHGP+ GHGHGP+ GHGHGPSGGHGCGP                  AGGHGHGPAGG GHC PANPN+GHCQPANPNVGHCQPASPNVGH     
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AAQ96166.1 phloem RNA-binding protein 1 [Cucurbita maxima]6.7e-6275.94Show/hide
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        GHG GPSGGHG GP+GGHGHGP+ GHGHGPSGGHG GP+GGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGPAGGHGHGPA G GH     P+ GH C PA      P  
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        GH     P+ GH
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AAQ96166.1 phloem RNA-binding protein 1 [Cucurbita maxima]1.5e-6673.64Show/hide
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        WGHGHG         +GGHGHGPAWGHGHGPS        GGHGHGPA GHGHGPSGGHGCGPAGGH      GHGHGP+GGH  G AGGHGHGPA GHG
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        HGP+GGHG C PA      P  GH     P+ GH C PA
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KAG6605563.1 hypothetical protein SDJN03_02880, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.0e-6683.7Show/hide
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        +GGHGHGPSGGHGCGPAGGHGHGHGPAGGHDHGQ        AGGHGHGPAGGHGHCMPANPNIGHCQPANPNVGHCQPA+  V
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XP_022958513.1 glycine-rich cell wall structural protein 1-like [Cucurbita moschata]4.7e-28997.58Show/hide
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        GHGHGPSGGHGCGPAGGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGPAGGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGPAGGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGPAGGHGHGPAWGHGH
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        GPSGGHGCGPAGGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGPAGGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGPAGGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGPAGGHGHGPAWGHGHGPSG
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        GHGCGPAGGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGPAGGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGPAGGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGPAGGHGHGPAWGHGHGPSGGHGC
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        GPAGGHGHGPAWGHGHGPSGGHGHGPSGGHGCGPAGGHGHGHGPAGGHDHGQAGGHGHGPAGGHGHCMPANPNIGHCQPANPNVGHCQPASPNVGHCKAG
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        GSRKKGHHKNKEGGFLNKIKDAFSDHSDNSDSDDDCRR
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XP_022996064.1 glycine-rich protein DOT1-like isoform X1 [Cucurbita maxima]1.7e-18268.96Show/hide
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        GHGHGPSGGHGCGP+GGHGHGPAWGHGHGPSGGHG GP+GGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGP+GGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGP+GGHGHGPAWGHGH
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        GPSGGHGCGP+GGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGP+GGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGP+GGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGP+GGHGHGPAWGHGHGPSG
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        GHGCGP+GGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGP+GGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGP+GGHGHGPAWGHG           +GGHGHGPAWGHGHGPSGGHGC
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        GP                                                  AGGHGHGPAGG GHC PANPN+GHCQPANPNVGHCQPASPNVGH    
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                                 HSD+SDSD+DCRR
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XP_022996065.1 glycine-rich protein DOT1-like isoform X2 [Cucurbita maxima]2.6e-17566.73Show/hide
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                 HG GPAGGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGP+GGHGHGPAWGHGHGPSGGHG GP+GGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGP+GGHGHGPAWGHGH
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        GPSGGHGCGP+GGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGP+GGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGP+GGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGP+GGHGHGPAWGHGHGPSG
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        GHGCGP+GGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGP+GGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGP+GGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGP+GGHGHGPAWGHGHGPSGGHGC
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        GP                                                  AGGHGHGPAGG GHC PANPN+GHCQPANPNVGHCQPASPNVGH    
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A7DKT1 Phloem small RNA-binding protein 13.3e-6275.94Show/hide
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        GHG GPSGGHG GP+GGHGHGP+ GHGHGPSGGHG GP+GGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGPAGGHGHGPA G GH     P+ GH C PA      P  
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        GH     P+ GH
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A0A6J1H399 glycine-rich cell wall structural protein 1-like2.3e-28997.58Show/hide
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A0A6J1K5N7 glycine-rich protein DOT1-like isoform X21.3e-17566.73Show/hide
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                 HG GPAGGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGP+GGHGHGPAWGHGHGPSGGHG GP+GGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGP+GGHGHGPAWGHGH
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A0A6J1K7P1 glycine-rich protein DOT1-like isoform X18.3e-18368.96Show/hide
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        GHGCGP+GGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGP+GGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGP+GGHGHGPAWGHG           +GGHGHGPAWGHGHGPSGGHGC
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        GP                                                  AGGHGHGPAGG GHC PANPN+GHCQPANPNVGHCQPASPNVGH    
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                                 HSD+SDSD+DCRR
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Q6EI04 Phloem RNA-binding protein 15.9e-7269.2Show/hide
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        HG GPAGGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGP+GGHGHGP+ GHGHGPS        GGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGP+GGHGHGP+ GHGHGPSGGHG G
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        P+GGHGHGP+ GHGHGP+ GHGHGPSGGHGCGP                  AGGHGHGPAGG GHC PANPN+GHCQPANPNVGHCQPASPNVGH     
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                                HSD+SDSD+DCRR
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Q6EI04 Phloem RNA-binding protein 13.3e-6275.94Show/hide
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        MAS QCNKPAERSHHQRHDQCHQE    HQHH     HG GPAGGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGP+GGHGHGP+ GHGHGPSGGHG GPA GHGHGP+ 
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        GHG GPSGGHG GP+GGHGHGP+ GHGHGPSGGHG GP+GGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGPAGGHGHGPA G GH     P+ GH C PA      P  
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Query:  GHGH--GPSGGH
        GH     P+ GH
Subjt:  GHGH--GPSGGH

Q6EI04 Phloem RNA-binding protein 15.9e-7269.2Show/hide
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        HG GPAGGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGP+GGHGHGP+ GHGHGPS        GGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGP+GGHGHGP+ GHGHGPSGGHG G
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        P+GGHGHGP+ GHGHGP+ GHGHGPSGGHGCGP                  AGGHGHGPAGG GHC PANPN+GHCQPANPNVGHCQPASPNVGH     
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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GTGGGGTCACGGCCACGGTCCGTCGGGGGGTCACGGCTGCGGTCCGGCGGGGGGTCACGGCCACGGTCCGGCGTGGGGTCACGGCCACGGTCCGTCGGGGGGTCACGGCT
GCGGTCCGGCGGGGGGTCACGGCCACGGTCCGGCGTGGGGTCACGGCCACGGTCCGTCGGGGGGTCACGGCTGCGGTCCGGCGGGGGGTCACGGCCACGGTCCGGCGTGG
GGTCACGGCCACGGTCCGTCGGGGGGTCACGGCTGCGGTCCGGCGGGGGGTCACGGCCACGGTCCGGCGTGGGGTCACGGCCACGGTCCGTCGGGGGGTCACGGCTGCGG
TCCGGCGGGGGGTCACGGCCACGGTCCGGCGTGGGGTCACGGCCACGGTCCGTCGGGGGGTCACGGCTGCGGTCCGGCGGGGGGTCACGGCCACGGTCCGGCGTGGGGTC
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GCGGGGGGTCACGGCCACGGTCCGGCGTGGGGTCACGGCCACGGTCCGTCGGGGGGTCACGGCTGCGGTCCGGCGGGGGGTCACGGCCACGGTCCGGCGTGGGGTCACGG
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TTTTCCTTCTTCCAAATAA
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CACGGCTGCGGTCCGGCGGGGGGTCACGGCCACGGTCCGGCGTGGGGTCACGGCCACGGTCCGTCGGGGGGTCACGGCTGCGGTCCGGCGGGGGGTCACGGCCACGGTCC
GGCGTGGGGTCACGGCCACGGTCCGTCGGGGGGTCACGGCTGCGGTCCGGCGGGGGGTCACGGCCACGGTCCGGCGTGGGGTCACGGCCACGGTCCGTCGGGGGGTCACG
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GTCACGGCCACGGTCCGTCGGGGGGTCACGGCTGCGGTCCGGCGGGGGGTCACGGCCACGGTCCGGCGTGGGGTCACGGCCACGGTCCGTCGGGAGGTCACGGCCACGGT
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TGTCGCAGAGAATTGGAAGGAGGAAGTGGAAGGGTACTTACTAGATTGAAGGGAAAGGAATCAGAGAATGCATCTAAACTGCTACTGCTACTCCTACTACTAAGTATTCG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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GHGHGPSGGHGCGPAGGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGPAGGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGPAGGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGPAGGHGHGPAWGHGHGPSGGHGCGP
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GHGPAGGHDHGQAGGHGHGPAGGHGHCMPANPNIGHCQPANPNVGHCQPASPNVGHCKAGGSRKKGHHKNKEGGFLNKIKDAFSDHSDNSDSDDDCRRELEGGSGRVLTR
LKGKESENASKLLLLLLLLSIRVKLKINKTIYKTPYFFPSSK