; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh02G016120 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh02G016120
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionAcyl-CoA synthetase/AMP-acid ligaseII
Genome locationCmo_Chr02:9271684..9272308
RNA-Seq ExpressionCmoCh02G016120
SyntenyCmoCh02G016120
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0003824 - catalytic activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
GAV61316.1 hypothetical protein CFOL_v3_04843 [Cephalotus follicularis]2.5e-4165.75Show/hide
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        GV + VSSGV S+M ++S GQF +SSFA  F+  GSVIFGPA   V
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GER34767.1 acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligaseII [Striga asiatica]5.3e-3159.06Show/hide
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KAF4360772.1 hypothetical protein F8388_015095 [Cannabis sativa]2.2e-2973.27Show/hide
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KAF4395364.1 hypothetical protein G4B88_010828, partial [Cannabis sativa]2.2e-2973.27Show/hide
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RXH97173.1 hypothetical protein DVH24_035841 [Malus domestica]3.1e-3173.08Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1Q3AZY0 Uncharacterized protein1.2e-4165.75Show/hide
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A0A2P2K8D8 Zeaxanthin epoxidaseic-like6.7e-4866.87Show/hide
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         S RSTRGV + VSSG+VS+  +SS+ QF TSS A  F   GSVIFGPA        +RN N+
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A0A498JTC4 Fe2OG dioxygenase domain-containing protein1.5e-3173.08Show/hide
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A0A5A7PR50 Acyl-CoA synthetase/AMP-acid ligaseII2.6e-3159.06Show/hide
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A0A7J6EQS5 Uncharacterized protein1.1e-2973.27Show/hide
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Query:  R
        R
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACAACATTGTTTCTCACAGAACAAACAACTGGGTTGTCCCACTGCAGAGCCGATCCAACCACATTGGCTCGAACGGTGAGCGGGAACACTCGAGGCCATCTTTCGGT
TCCATACGACCTCAGAGCTTCTTCAACAGAAGGTGCTTCCGACTTGAGTGCAGTGGCCAGTTTTCTTGCTAGAACCACTGCATCTTCTAATGCACAGCATGCTCCTTGTC
CTAGATTTGGAGTCATCGGATGCCAGGCATCTCCAACCAGGACCACTCTTCCCGATGAAGCGGGCGGGCTGACTGCAGGCCAAAGCCATCGGTCTACGAGGGGTGTTCGG
ATTAACGTGTCCTCCGGGGTTGTGTCCATGATGTTTAGTAGCTCAGATGGCCAGTTTTTTACCAGTTCTTTCGCTTGCTGCTTTAGAACAGCTGGATCTGTGATTTTTGG
TCCTGCAATGAATCGAGTTCGAGGAATGGGAATGAGAAATGCAAACCTGGAGATGAGCTGTTGTAGCAGACAAACCAGTAAACTTTTGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGACAACATTGTTTCTCACAGAACAAACAACTGGGTTGTCCCACTGCAGAGCCGATCCAACCACATTGGCTCGAACGGTGAGCGGGAACACTCGAGGCCATCTTTCGGT
TCCATACGACCTCAGAGCTTCTTCAACAGAAGGTGCTTCCGACTTGAGTGCAGTGGCCAGTTTTCTTGCTAGAACCACTGCATCTTCTAATGCACAGCATGCTCCTTGTC
CTAGATTTGGAGTCATCGGATGCCAGGCATCTCCAACCAGGACCACTCTTCCCGATGAAGCGGGCGGGCTGACTGCAGGCCAAAGCCATCGGTCTACGAGGGGTGTTCGG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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