; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh02G016280 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh02G016280
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionras-related protein RABH1b
Genome locationCmo_Chr02:9394192..9398413
RNA-Seq ExpressionCmoCh02G016280
SyntenyCmoCh02G016280
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0006890 - retrograde vesicle-mediated transport, Golgi to endoplasmic reticulum (biological process)
GO:0006891 - intra-Golgi vesicle-mediated transport (biological process)
GO:0042147 - retrograde transport, endosome to Golgi (biological process)
GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0005829 - cytosol (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7036170.1 Ras-related protein RABH1b, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]7.0e-107100Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQSGGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

XP_022159735.1 ras-related protein RABH1b [Momordica charantia]7.8e-10698.56Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT
        MAP SALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTF+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVS+EEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQSGGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

XP_022958673.1 ras-related protein RABH1b [Cucurbita moschata]7.0e-107100Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQSGGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

XP_022996115.1 ras-related protein RABH1b [Cucurbita maxima]1.6e-10699.52Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKS+GSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQSGGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

XP_038889006.1 ras-related protein RABH1b [Benincasa hispida]4.6e-10698.56Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTF+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVS+EEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKS+GSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQSGGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LI95 Uncharacterized protein1.1e-10598.08Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTF+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVS+EEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKS+GSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQS GCAC
Subjt:  PQSGGCAC

A0A5A7TB19 Ras-related protein RABH1b-like isoform X11.1e-10598.08Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTF+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVS+EEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKS+GSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQS GCAC
Subjt:  PQSGGCAC

A0A6J1DZL5 ras-related protein RABH1b3.8e-10698.56Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT
        MAP SALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTF+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVS+EEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQSGGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

A0A6J1H3Q8 ras-related protein RABH1b3.4e-107100Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQSGGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

A0A6J1K5U1 ras-related protein RABH1b7.6e-10799.52Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT
        MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKS+GSGAAQSQ
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
        PQSGGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80501 Ras-related protein RABH1b7.1e-10291.83Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT
        MAP SALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQ+F+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        +KWI+EVRTERGSDVI+VLVGNKTDLV+KRQVS+EE EAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSS + A+ +Q
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
         QSGGC+C
Subjt:  PQSGGCAC

P20340 Ras-related protein Rab-6A4.0e-8174.88Show/hide
Query:  LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNTSKWIEE
        L K+KLVFLG+QSVGKTS+ITRFMYD FDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDS+VAV+VYD+ +  +F  T+KWI++
Subjt:  LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNTSKWIEE

Query:  VRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQPQS-GG
        VRTERGSDVII+LVGNKTDL +KRQVS+EEGE KA+ELNVMFIETSAKAG+N+K LFR++AAALPGME+     +EDM+D+ L+       Q QP S GG
Subjt:  VRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQPQS-GG

Query:  CAC
        C+C
Subjt:  CAC

Q9LFT9 Ras-related protein RABH1e1.7e-9587.98Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT
        MA  S LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVA+RQ+F+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIE+VRTERGSDVIIVLVGNKTDLV+KRQVS+EEG+ KAR+  V+FIETSAKAGFNIK LFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLK+S S +AQ +
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
         Q GGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

Q9SID8 Ras-related protein RABH1d3.6e-9083.17Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT
        MA  S LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAV+VYDVA+R +F+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVR ER  DVIIVLVGNKTDLVEKRQVS+EEG++K RE  VMFIETSAKAGFNIK LFRKIAAALPGME+ S+TK EDMVDVNLK + S ++Q  
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
         Q G C+C
Subjt:  PQSGGCAC

Q9SMR4 Ras-related protein RABH1c3.3e-8377.21Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT
        MA  S LAK+KLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQ TIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVA++VYDV++RQTF+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLS-STKQEDMVDVNLKSSGSGAAQ
        SKWIE+V  ERG S+VIIVLVGNKTDLVEKRQVS+ EGE K +E  VMFIETSAK  FNIKALFRKIAAALPG+++ S +TK +DMVDVNLK++ S ++Q
Subjt:  SKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLS-STKQEDMVDVNLKSSGSGAAQ

Query:  SQPQ-----SGGCAC
         + Q      GGC+C
Subjt:  SQPQ-----SGGCAC

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G22290.1 RAB GTPase homolog H1D2.6e-9183.17Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT
        MA  S LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAV+VYDVA+R +F+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIEEVR ER  DVIIVLVGNKTDLVEKRQVS+EEG++K RE  VMFIETSAKAGFNIK LFRKIAAALPGME+ S+TK EDMVDVNLK + S ++Q  
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
         Q G C+C
Subjt:  PQSGGCAC

AT2G44610.1 Ras-related small GTP-binding family protein5.0e-10391.83Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT
        MAP SALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQ+F+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        +KWI+EVRTERGSDVI+VLVGNKTDLV+KRQVS+EE EAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSS + A+ +Q
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
         QSGGC+C
Subjt:  PQSGGCAC

AT4G39890.1 RAB GTPase homolog H1C2.3e-8477.21Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT
        MA  S LAK+KLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQ TIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVA++VYDV++RQTF+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLS-STKQEDMVDVNLKSSGSGAAQ
        SKWIE+V  ERG S+VIIVLVGNKTDLVEKRQVS+ EGE K +E  VMFIETSAK  FNIKALFRKIAAALPG+++ S +TK +DMVDVNLK++ S ++Q
Subjt:  SKWIEEVRTERG-SDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLS-STKQEDMVDVNLKSSGSGAAQ

Query:  SQPQ-----SGGCAC
         + Q      GGC+C
Subjt:  SQPQ-----SGGCAC

AT5G10260.1 RAB GTPase homolog H1E1.2e-9687.98Show/hide
Query:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT
        MA  S LAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFD TYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVA+RQ+F+NT
Subjt:  MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNT

Query:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ
        SKWIE+VRTERGSDVIIVLVGNKTDLV+KRQVS+EEG+ KAR+  V+FIETSAKAGFNIK LFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLK+S S +AQ +
Subjt:  SKWIEEVRTERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQ

Query:  PQSGGCAC
         Q GGCAC
Subjt:  PQSGGCAC

AT5G64990.1 RAB GTPase homolog H1A1.6e-7775.38Show/hide
Query:  YKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNTSKWIEEVRT
        YKLVFLGDQ VGKTSIIT FMY KFD +YQATIGIDFLSKT   EDRT RLQLWDTAGQERF+SL+PSYIRDSSVAVIVYDVAS+Q+F+NTSKWIEEVR 
Subjt:  YKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNTSKWIEEVRT

Query:  ERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQPQSGGCAC
        ERGS VIIVLVGNKTDLV KRQVS+EEGE KARE   +F+ETSAKAGFNIK LF KI +AL G E +S TKQED+VDVNLK     +  +  Q   C+C
Subjt:  ERGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQPQSGGCAC


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCACCGACGTCAGCTCTGGCGAAGTACAAGCTGGTCTTTCTCGGAGACCAGTCTGTTGGAAAAACCAGTATCATTACACGCTTCATGTACGACAAATTCGATAATAC
GTATCAGGCTACAATTGGTATCGATTTTCTCTCAAAAACTATGTATCTTGAAGATCGCACTGTTCGACTGCAGTTGTGGGACACTGCTGGACAGGAAAGATTCAGAAGTT
TAATACCAAGCTATATCAGGGACTCATCTGTCGCGGTCATCGTTTATGATGTTGCAAGCCGGCAGACTTTCGTAAACACTTCGAAATGGATTGAGGAGGTGCGCACTGAG
AGGGGCAGTGATGTTATTATAGTGCTTGTTGGGAACAAAACGGACCTTGTGGAGAAGAGGCAAGTCTCCGTAGAGGAAGGAGAAGCCAAAGCCCGTGAACTAAATGTCAT
GTTTATCGAAACAAGTGCAAAAGCTGGATTCAATATCAAGGCACTATTCCGAAAAATTGCTGCAGCATTGCCCGGAATGGAAACTCTCTCTTCGACAAAGCAAGAAGACA
TGGTTGATGTCAACCTGAAGTCATCAGGCAGTGGTGCTGCACAATCCCAGCCGCAGTCCGGTGGATGCGCCTGCTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CTGAAAGCAGAATCAGATCAAAGGAAGAAAGACAAACTGAGCCAAAAGCCAGAGTTCCATTGCAACTGGCCTCGGCTTCATCGTCTCATTCAGAAATCTCCATCTTAATC
CGATAATTGTTCCTTTGTTGGAAACGAAAATCAGAGATCTCTGCGGATATGGCACCGACGTCAGCTCTGGCGAAGTACAAGCTGGTCTTTCTCGGAGACCAGTCTGTTGG
AAAAACCAGTATCATTACACGCTTCATGTACGACAAATTCGATAATACGTATCAGGCTACAATTGGTATCGATTTTCTCTCAAAAACTATGTATCTTGAAGATCGCACTG
TTCGACTGCAGTTGTGGGACACTGCTGGACAGGAAAGATTCAGAAGTTTAATACCAAGCTATATCAGGGACTCATCTGTCGCGGTCATCGTTTATGATGTTGCAAGCCGG
CAGACTTTCGTAAACACTTCGAAATGGATTGAGGAGGTGCGCACTGAGAGGGGCAGTGATGTTATTATAGTGCTTGTTGGGAACAAAACGGACCTTGTGGAGAAGAGGCA
AGTCTCCGTAGAGGAAGGAGAAGCCAAAGCCCGTGAACTAAATGTCATGTTTATCGAAACAAGTGCAAAAGCTGGATTCAATATCAAGGCACTATTCCGAAAAATTGCTG
CAGCATTGCCCGGAATGGAAACTCTCTCTTCGACAAAGCAAGAAGACATGGTTGATGTCAACCTGAAGTCATCAGGCAGTGGTGCTGCACAATCCCAGCCGCAGTCCGGT
GGATGCGCCTGCTAGTGAAGCTCGACATTGAGGAATCGCTCGCTCTTTCTTGCCTTTTGTTTTCAACACCTCAATCTTCTAGAACTGTGGCATTCAGGTACAAGGTGTGG
TTATATCCATCAATGCCTGCTTGAGCAATTCGTAAAATGTAATAGGTGGCAAGAGTAGACGGCTGTTATTTTATGGAGTAATTTGATGTATTGGTGGAGTCATTATTTGG
GTTTTGGGATTTGGGAGATGTGTAAAAATTAGAAAATTTATCTGTCGGACTCGATTACAGAATTTTGCTTGTCTTGTAAGTTGTAATTCATCTTTAGAAATTCTGCAAAT
TTCATTTGCTTTTACAATGATTTGTTGAGTTGGTTCATATTATGCTTTTGGT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAPTSALAKYKLVFLGDQSVGKTSIITRFMYDKFDNTYQATIGIDFLSKTMYLEDRTVRLQLWDTAGQERFRSLIPSYIRDSSVAVIVYDVASRQTFVNTSKWIEEVRTE
RGSDVIIVLVGNKTDLVEKRQVSVEEGEAKARELNVMFIETSAKAGFNIKALFRKIAAALPGMETLSSTKQEDMVDVNLKSSGSGAAQSQPQSGGCAC