; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh02G016500 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh02G016500
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptiontranscriptional regulator SUPERMAN-like
Genome locationCmo_Chr02:9518170..9518787
RNA-Seq ExpressionCmoCh02G016500
SyntenyCmoCh02G016500
Gene Ontology termsGO:0007155 - cell adhesion (biological process)
GO:0019062 - virion attachment to host cell (biological process)
InterPro domainsIPR013087 - Zinc finger C2H2-type
IPR036236 - Zinc finger C2H2 superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6606245.1 Zinc finger protein 10, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.7e-10697.58Show/hide
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KAG7036187.1 Zinc finger protein 10, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.2e-10697.6Show/hide
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XP_022931230.1 zinc finger protein 10-like [Cucurbita moschata]1.1e-109100Show/hide
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XP_022995519.1 transcriptional regulator SUPERMAN-like [Cucurbita maxima]1.9e-10496.17Show/hide
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XP_023533595.1 zinc finger protein 10-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.1e-10497.1Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CRJ1 transcriptional regulator SUPERMAN-like6.6e-6365.35Show/hide
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A0A5D3E693 Transcriptional regulator SUPERMAN-like6.6e-6365.35Show/hide
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        GG LC+LY FPNP S               I SPSSLFSM HHSFN +  STS ++AFP+   NHR   +S   +  +     S ++ +DLELRLG  P 
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A0A6J1E087 transcriptional regulator SUPERMAN-like3.0e-6367.31Show/hide
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        TL+ KG +
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A0A6J1EYW0 zinc finger protein 10-like5.5e-110100Show/hide
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        KRSSD
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A0A6J1K623 transcriptional regulator SUPERMAN-like9.1e-10596.17Show/hide
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        ACLRKRSSD
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80942 Zinc finger protein 101.3e-1844.72Show/hide
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        P   + + SWE  AFAED  D  G+ WPPRSYTC+FCRREF+SAQALGGHMNVHRRDRARL QA    + P SSSS    S  +S  I  H+ +   L V
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            PN Y     S +  +S  S   ++  +  +S  P + H    SS P S   E +  S
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Q38895 Transcriptional regulator SUPERMAN6.5e-1543.41Show/hide
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        +D   ++G +WPPRSYTC+FC+REFRSAQALGGHMNVHRRDRARL              S SSSST +                  P+PNP    S  + 
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            HHS     P+ SP S+     +RAG
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Q9LHS9 Probable transcriptional regulator RABBIT EARS1.6e-1358.57Show/hide
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        E RAF  AE+     G  WPPRSY+C+FC REF+SAQALGGHMNVHRRDRARL Q    ++ P S+  ++
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Q9SLB8 Zinc finger protein 117.6e-1662.86Show/hide
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        WPP++YTC+FCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA+L Q PS   +P            FSSSSSSS++T++
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Q9SR34 Transcriptional regulator TAC11.0e-0773.53Show/hide
Query:  RSYTCTFCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQ
        RSY C+FC R F +AQALGGHMN+HRRDRA+L Q
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G37740.1 zinc-finger protein 108.9e-2044.72Show/hide
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        P   + + SWE  AFAED  D  G+ WPPRSYTC+FCRREF+SAQALGGHMNVHRRDRARL QA    + P SSSS    S  +S  I  H+ +   L V
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Query:  LYPFPNPYSIRSPSSLFSMSHHSFNNFMPSTSPASAFPIRNHRAGASSFPQSLSDEQAMES
            PN Y     S +  +S  S   ++  +  +S  P + H    SS P S   E +  S
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AT2G42410.1 zinc finger protein 115.4e-1762.86Show/hide
Query:  WPPRSYTCTFCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAPSNAIKP------------FSSSSSSSSSTSN
        WPP++YTC+FCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA+L Q PS   +P            FSSSSSSS++T++
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AT3G23130.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein4.6e-1643.41Show/hide
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        +D   ++G +WPPRSYTC+FC+REFRSAQALGGHMNVHRRDRARL              S SSSST +                  P+PNP    S  + 
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Query:  FSMSHHSFNNFMPSTSPASAFPIRNHRAG
            HHS     P+ SP S+     +RAG
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AT4G17810.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein2.7e-2440.51Show/hide
Query:  DVVDDDDSWEVRAFAEDT-ADVMGTTWPPRSYTCTFCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA--RLHQAPSNAIKPFSS------SSSSSSSTSNSFIIPAHD
        ++ DDD+SWEV+AF +DT  ++ GTTWPPRSYTC FCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRA  R HQ  + A    S       +S +    + + II +  
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Query:  FNGGGLCVLYPFPNPYSIRSPSSLFSMSHHSFNNFMPSTSPASAFPIRNHRAGASSFPQSL-----------SDEQAMESSNQEVDLELRLGQAP
         N  GL       + Y +++PS +F  S    N +  ++ P S  P     +     P+ +           S ++A  +S  E+DLELRLG  P
Subjt:  FNGGGLCVLYPFPNPYSIRSPSSLFSMSHHSFNNFMPSTSPASAFPIRNHRAGASSFPQSL-----------SDEQAMESSNQEVDLELRLGQAP

AT5G06070.1 C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein1.1e-1458.57Show/hide
Query:  EVRAF--AEDTADVMGTTWPPRSYTCTFCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAPSNAIKPFSSSSSS
        E RAF  AE+     G  WPPRSY+C+FC REF+SAQALGGHMNVHRRDRARL Q    ++ P S+  ++
Subjt:  EVRAF--AEDTADVMGTTWPPRSYTCTFCRREFRSAQALGGHMNVHRRDRARLHQAPSNAIKPFSSSSSS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAAACGCCAGACGTTGTCGACGACGATGACTCGTGGGAAGTCAGGGCTTTCGCGGAGGACACGGCTGATGTCATGGGAACTACTTGGCCTCCTAGGTCATACACTTG
CACTTTTTGTAGAAGAGAGTTCAGGTCTGCTCAAGCCCTAGGTGGTCATATGAATGTTCACCGTCGCGATCGTGCTCGGCTCCATCAAGCCCCGTCGAACGCAATCAAAC
CCTTTTCTTCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTACTTCGAATTCTTTCATTATCCCAGCTCATGATTTTAATGGTGGAGGGTTGTGTGTTCTCTACCCATTCCCAAACCCT
TACAGCATTCGCTCACCCTCTTCTCTTTTCTCTATGTCCCATCATTCCTTCAACAACTTCATGCCCTCGACCTCGCCCGCCTCAGCCTTTCCGATTCGTAATCACCGTGC
CGGAGCGAGTAGTTTCCCTCAATCCTTGAGTGATGAACAAGCCATGGAAAGTAGCAACCAAGAGGTTGATCTAGAGCTCAGGCTTGGACAAGCTCCTTCAACTCAAACTC
TCATGGAAAAGGGACACAAAATCTCTAATTTTGAAGCTGCTTGTCTGAGGAAGAGATCATCAGATTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCAAACGCCAGACGTTGTCGACGACGATGACTCGTGGGAAGTCAGGGCTTTCGCGGAGGACACGGCTGATGTCATGGGAACTACTTGGCCTCCTAGGTCATACACTTG
CACTTTTTGTAGAAGAGAGTTCAGGTCTGCTCAAGCCCTAGGTGGTCATATGAATGTTCACCGTCGCGATCGTGCTCGGCTCCATCAAGCCCCGTCGAACGCAATCAAAC
CCTTTTCTTCCTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTACTTCGAATTCTTTCATTATCCCAGCTCATGATTTTAATGGTGGAGGGTTGTGTGTTCTCTACCCATTCCCAAACCCT
TACAGCATTCGCTCACCCTCTTCTCTTTTCTCTATGTCCCATCATTCCTTCAACAACTTCATGCCCTCGACCTCGCCCGCCTCAGCCTTTCCGATTCGTAATCACCGTGC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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YSIRSPSSLFSMSHHSFNNFMPSTSPASAFPIRNHRAGASSFPQSLSDEQAMESSNQEVDLELRLGQAPSTQTLMEKGHKISNFEAACLRKRSSD