; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh02G016640 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh02G016640
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionRING-H2 finger protein ATL29-like
Genome locationCmo_Chr02:9570003..9570908
RNA-Seq ExpressionCmoCh02G016640
SyntenyCmoCh02G016640
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6606259.1 RING-H2 finger protein ATL29, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.3e-16799Show/hide
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KAG7036200.1 RING-H2 finger protein ATL29, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.9e-16698.67Show/hide
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XP_022930986.1 RING-H2 finger protein ATL29-like [Cucurbita moschata]2.1e-168100Show/hide
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XP_022996104.1 RING-H2 finger protein ATL29-like, partial [Cucurbita maxima]1.3e-15793.36Show/hide
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XP_023533947.1 RING-H2 finger protein ATL29-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.8e-16598Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LI09 RING-H2 finger protein ATL293.8e-11570Show/hide
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        D D     CS KGKQ I   E EKE+ +     K+FSRSHSTGHSIVK++REGE +HKLILPEH+KIKI+RGHNWTGSCVTF+E  RN  NGGGFS+L E
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A0A6J1ESF8 RING-H2 finger protein ATL29-like1.0e-168100Show/hide
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A0A6J1HG37 RING-H2 finger protein ATL299.0e-11771.8Show/hide
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        D+     S SN+GKQ I+TEE E ++  KKFSR HSTGHSI+KA+RE + R+KL LPEHVKIKI+RGHNWTGSCVTF+E  RNP NGGGFS+L E  DR 
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A0A6J1HV34 LOW QUALITY PROTEIN: RING-H2 finger protein ATL29-like3.8e-11571.38Show/hide
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         DD+  S SN+GKQ I+ EE E ++  KKFSR HSTGHSI+KA+RE + R+KL LPEHVKIK++RGHNWTGSCVTF+E  RNP N GGFS+L E  DR +
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        LQKP
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A0A6J1K7T3 RING-H2 finger protein ATL29-like6.1e-15893.36Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O49691 RING-H2 finger protein ATL291.3e-5946.84Show/hide
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        P Q + +PP+T++LT+IL+ F F+GFF++Y C+C +D+ + +  +     + S N L      P  P GL+  +INSFPTFPYS +K+ R +  GLECAI
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Query:  CLLEFNDESFLRLLTVCYHVFHQECIDLWLESHKTCPVCRRNLDSDLRRNSADKTSDPPRTSHRESIEDAISIDIDEDADADADSDADDNEGSCSNKGKQ
        CLLEF+ +  LRLLT CYHVFHQECIDLW ESH+TCPVCRR+LD             PP  + + ++++ I   I E +D + D        +  +    
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Query:  RIETEEVEKEES-RKKFSRSHSTGHSIVKAKREGESRHKLILPEHVKIKILRGHNWTGSCVTFEELARN
          +T  ++KE++  +KFSRSHSTGHSIV+ K E E ++ L LPEHVKIK+ RGH+ T SCVTF EL RN
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Q6NKR1 RING-H2 finger protein ATL284.4e-3637.12Show/hide
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        +T +  IP    FPS    S PVT+VLT +L+  +F GFFS++  + +++    + N++R+  G+L+H +  +P   TGLDP +I SFP F YS   +  
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Query:  SDNVGLECAICLLEFNDESFLRLLTVCYHVFHQECIDLWLESHKTCPVCRRNLDSDLRRNSADKTSDPPRTSHRESIEDAISIDIDEDADADADSDADDN
          N G ECAICL EF+DE  +RL+TVC H FH  CIDLW E HKTCPVCR  LD  +             +   ES  + ++I I        D + D+ 
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Query:  EGSCSNKGKQRIETEEVEKEESRKKFSRSHSTGHSIVKAKREGESRHKLILPEHVKIKILRGHNWTGSCVTFEELARNPSNGGGFSKLCERGDRNNLQK
            +   K+ IE        S  +FSRSHSTGH +VK                  +K  R H  TGSCV+F+EL R    G G+  L   GD +++ +
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Q8W571 RING-H2 finger protein ATL324.5e-2532.66Show/hide
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        +P  T V  +++  F   G  S+Y   C       +R+   S++    + +ND  +   GLD  ++ SFP F YS +KE +  +  LECAICL E  D  
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Query:  FLRLLTVCYHVFHQECIDLWLESHKTCPVCRRNLDSDLRRNSADKTSDPPRTSHRESIEDAISIDIDEDADADADSDADDNEGSCSNKGKQRIETEEVEK
         +RLL +C H+FH +CID WL SH TCPVCR NL +      ++K  D        ++ D + +D                           IET EV K
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Query:  EESRK-------KFSRSHSTGHSIVKAKREGESRHKLILPEHVKIKIL
           R+       KF RS+STGHS+ +   +G  R  L LP+ VK++++
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Q9FIR0 RING-H2 finger protein ATL301.3e-5143.68Show/hide
Query:  TRIPFPSQDHASPPVTIVLTLILVAFLFVGFFSIYCCRCVVDSFLHSRN--VRRSTSGNLLHPSND--SPAAPTGLDPLLINSFPTFPYSKIKEFRSDNV
        T +P+P Q ++ PP+ I+LT+IL+   F+GFF+IY C+C   +   + N         N +    +   P    GL+P +I S+P FP+S +K+ R D  
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Query:  GLECAICLLEFNDES-FLRLLTVCYHVFHQECIDLWLESHKTCPVCRRNLDSDLRRNSADKTSDPPRTSHRESIEDAISIDIDEDADADADSDADDNEGS
        GLECAICLLEF +E   LRLLT CYHVFHQECID WLES+KTCPVCRRNLD +   N             +E I + I  +  E+ D +  S +++   S
Subjt:  GLECAICLLEFNDES-FLRLLTVCYHVFHQECIDLWLESHKTCPVCRRNLDSDLRRNSADKTSDPPRTSHRESIEDAISIDIDEDADADADSDADDNEGS

Query:  CSNKGKQRIETEEVEKEESRKKFSRSHSTGHSIVKAKREGESRHKLILPEHVKIKILRGH--NWTGSCVTFEELARN
          + G    + E +       KFSRS +TGHSIV+ K E E R+ L LP+HVKIK+ R H  N T SC++F EL RN
Subjt:  CSNKGKQRIETEEVEKEESRKKFSRSHSTGHSIVKAKREGESRHKLILPEHVKIKILRGH--NWTGSCVTFEELARN

Q9LQM2 RING-H2 finger protein ATL813.0e-2936.86Show/hide
Query:  PSQDHASPPVTIVLTLILVAFLFVGFFSIYCCRCVVDSFLHSRNVRRSTS--GNLLHPSNDSPAAPTGLDPLLINSFPTFPYSKIKEFRSDNVGLECAIC
        P     S PVTIVLT  L+  +F GFFS + C C+    +   N  R+ +   NL+ PSN  P    GLD  +I SFP +PYS +K+  +D    +C+IC
Subjt:  PSQDHASPPVTIVLTLILVAFLFVGFFSIYCCRCVVDSFLHSRNVRRSTS--GNLLHPSNDSPAAPTGLDPLLINSFPTFPYSKIKEFRSDNVGLECAIC

Query:  LLEFNDESFLRLLTVCYHVFHQECIDLWLESHKTCPVCRRNLDSDLRRNSADKTSDPPRTS------HRESI-EDAISIDIDEDADADADSDADDNEGSC
        L EF D+  +RL++ C H FH  CIDLW E HKTCPVCRR LD +  R S +K  + P         H E +  D ++I + E+  +      +  +   
Subjt:  LLEFNDESFLRLLTVCYHVFHQECIDLWLESHKTCPVCRRNLDSDLRRNSADKTSDPPRTS------HRESI-EDAISIDIDEDADADADSDADDNEGSC

Query:  SNKGKQRIETEEVEKEESRKKFSRSHSTGHSIVKAKREGESRHKLILPEHVKIKI
               IE+ E   + S  +F RSHSTGHSIV      +   +    + +KI+I
Subjt:  SNKGKQRIETEEVEKEESRKKFSRSHSTGHSIVKAKREGESRHKLILPEHVKIKI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G32361.1 RING/U-box superfamily protein2.2e-3036.86Show/hide
Query:  PSQDHASPPVTIVLTLILVAFLFVGFFSIYCCRCVVDSFLHSRNVRRSTS--GNLLHPSNDSPAAPTGLDPLLINSFPTFPYSKIKEFRSDNVGLECAIC
        P     S PVTIVLT  L+  +F GFFS + C C+    +   N  R+ +   NL+ PSN  P    GLD  +I SFP +PYS +K+  +D    +C+IC
Subjt:  PSQDHASPPVTIVLTLILVAFLFVGFFSIYCCRCVVDSFLHSRNVRRSTS--GNLLHPSNDSPAAPTGLDPLLINSFPTFPYSKIKEFRSDNVGLECAIC

Query:  LLEFNDESFLRLLTVCYHVFHQECIDLWLESHKTCPVCRRNLDSDLRRNSADKTSDPPRTS------HRESI-EDAISIDIDEDADADADSDADDNEGSC
        L EF D+  +RL++ C H FH  CIDLW E HKTCPVCRR LD +  R S +K  + P         H E +  D ++I + E+  +      +  +   
Subjt:  LLEFNDESFLRLLTVCYHVFHQECIDLWLESHKTCPVCRRNLDSDLRRNSADKTSDPPRTS------HRESI-EDAISIDIDEDADADADSDADDNEGSC

Query:  SNKGKQRIETEEVEKEESRKKFSRSHSTGHSIVKAKREGESRHKLILPEHVKIKI
               IE+ E   + S  +F RSHSTGHSIV      +   +    + +KI+I
Subjt:  SNKGKQRIETEEVEKEESRKKFSRSHSTGHSIVKAKREGESRHKLILPEHVKIKI

AT2G35420.1 RING/U-box superfamily protein3.1e-3737.12Show/hide
Query:  STDLTRIP----FPSQDHASPPVTIVLTLILVAFLFVGFFSIYCCRCVVDSFLHSRNVRRSTSGNLLHPSNDSPAAPTGLDPLLINSFPTFPYSKIKEFR
        +T +  IP    FPS    S PVT+VLT +L+  +F GFFS++  + +++    + N++R+  G+L+H +  +P   TGLDP +I SFP F YS   +  
Subjt:  STDLTRIP----FPSQDHASPPVTIVLTLILVAFLFVGFFSIYCCRCVVDSFLHSRNVRRSTSGNLLHPSNDSPAAPTGLDPLLINSFPTFPYSKIKEFR

Query:  SDNVGLECAICLLEFNDESFLRLLTVCYHVFHQECIDLWLESHKTCPVCRRNLDSDLRRNSADKTSDPPRTSHRESIEDAISIDIDEDADADADSDADDN
          N G ECAICL EF+DE  +RL+TVC H FH  CIDLW E HKTCPVCR  LD  +             +   ES  + ++I I        D + D+ 
Subjt:  SDNVGLECAICLLEFNDESFLRLLTVCYHVFHQECIDLWLESHKTCPVCRRNLDSDLRRNSADKTSDPPRTSHRESIEDAISIDIDEDADADADSDADDN

Query:  EGSCSNKGKQRIETEEVEKEESRKKFSRSHSTGHSIVKAKREGESRHKLILPEHVKIKILRGHNWTGSCVTFEELARNPSNGGGFSKLCERGDRNNLQK
            +   K+ IE        S  +FSRSHSTGH +VK                  +K  R H  TGSCV+F+EL R    G G+  L   GD +++ +
Subjt:  EGSCSNKGKQRIETEEVEKEESRKKFSRSHSTGHSIVKAKREGESRHKLILPEHVKIKILRGHNWTGSCVTFEELARNPSNGGGFSKLCERGDRNNLQK

AT4G17920.1 RING/U-box superfamily protein9.0e-6146.84Show/hide
Query:  PSQDHASPPVTIVLTLILVAFLFVGFFSIYCCRCVVDSFLHSRNVRR---STSGNLLHPSNDSPAAPTGLDPLLINSFPTFPYSKIKEFRSDNVGLECAI
        P Q + +PP+T++LT+IL+ F F+GFF++Y C+C +D+ + +  +     + S N L      P  P GL+  +INSFPTFPYS +K+ R +  GLECAI
Subjt:  PSQDHASPPVTIVLTLILVAFLFVGFFSIYCCRCVVDSFLHSRNVRR---STSGNLLHPSNDSPAAPTGLDPLLINSFPTFPYSKIKEFRSDNVGLECAI

Query:  CLLEFNDESFLRLLTVCYHVFHQECIDLWLESHKTCPVCRRNLDSDLRRNSADKTSDPPRTSHRESIEDAISIDIDEDADADADSDADDNEGSCSNKGKQ
        CLLEF+ +  LRLLT CYHVFHQECIDLW ESH+TCPVCRR+LD             PP  + + ++++ I   I E +D + D        +  +    
Subjt:  CLLEFNDESFLRLLTVCYHVFHQECIDLWLESHKTCPVCRRNLDSDLRRNSADKTSDPPRTSHRESIEDAISIDIDEDADADADSDADDNEGSCSNKGKQ

Query:  RIETEEVEKEES-RKKFSRSHSTGHSIVKAKREGESRHKLILPEHVKIKILRGHNWTGSCVTFEELARN
          +T  ++KE++  +KFSRSHSTGHSIV+ K E E ++ L LPEHVKIK+ RGH+ T SCVTF EL RN
Subjt:  RIETEEVEKEES-RKKFSRSHSTGHSIVKAKREGESRHKLILPEHVKIKILRGHNWTGSCVTFEELARN

AT4G40070.1 RING/U-box superfamily protein3.2e-2632.66Show/hide
Query:  SPPVTIVLTLILVAFLFVGFFSIYCCRCVVDSFLHSRNVRRSTSGNLLHPSNDSPAAPTGLDPLLINSFPTFPYSKIKEFRSDNVGLECAICLLEFNDES
        +P  T V  +++  F   G  S+Y   C       +R+   S++    + +ND  +   GLD  ++ SFP F YS +KE +  +  LECAICL E  D  
Subjt:  SPPVTIVLTLILVAFLFVGFFSIYCCRCVVDSFLHSRNVRRSTSGNLLHPSNDSPAAPTGLDPLLINSFPTFPYSKIKEFRSDNVGLECAICLLEFNDES

Query:  FLRLLTVCYHVFHQECIDLWLESHKTCPVCRRNLDSDLRRNSADKTSDPPRTSHRESIEDAISIDIDEDADADADSDADDNEGSCSNKGKQRIETEEVEK
         +RLL +C H+FH +CID WL SH TCPVCR NL +      ++K  D        ++ D + +D                           IET EV K
Subjt:  FLRLLTVCYHVFHQECIDLWLESHKTCPVCRRNLDSDLRRNSADKTSDPPRTSHRESIEDAISIDIDEDADADADSDADDNEGSCSNKGKQRIETEEVEK

Query:  EESRK-------KFSRSHSTGHSIVKAKREGESRHKLILPEHVKIKIL
           R+       KF RS+STGHS+ +   +G  R  L LP+ VK++++
Subjt:  EESRK-------KFSRSHSTGHSIVKAKREGESRHKLILPEHVKIKIL

AT5G46650.1 RING/U-box superfamily protein9.0e-5343.68Show/hide
Query:  TRIPFPSQDHASPPVTIVLTLILVAFLFVGFFSIYCCRCVVDSFLHSRN--VRRSTSGNLLHPSND--SPAAPTGLDPLLINSFPTFPYSKIKEFRSDNV
        T +P+P Q ++ PP+ I+LT+IL+   F+GFF+IY C+C   +   + N         N +    +   P    GL+P +I S+P FP+S +K+ R D  
Subjt:  TRIPFPSQDHASPPVTIVLTLILVAFLFVGFFSIYCCRCVVDSFLHSRN--VRRSTSGNLLHPSND--SPAAPTGLDPLLINSFPTFPYSKIKEFRSDNV

Query:  GLECAICLLEFNDES-FLRLLTVCYHVFHQECIDLWLESHKTCPVCRRNLDSDLRRNSADKTSDPPRTSHRESIEDAISIDIDEDADADADSDADDNEGS
        GLECAICLLEF +E   LRLLT CYHVFHQECID WLES+KTCPVCRRNLD +   N             +E I + I  +  E+ D +  S +++   S
Subjt:  GLECAICLLEFNDES-FLRLLTVCYHVFHQECIDLWLESHKTCPVCRRNLDSDLRRNSADKTSDPPRTSHRESIEDAISIDIDEDADADADSDADDNEGS

Query:  CSNKGKQRIETEEVEKEESRKKFSRSHSTGHSIVKAKREGESRHKLILPEHVKIKILRGH--NWTGSCVTFEELARN
          + G    + E +       KFSRS +TGHSIV+ K E E R+ L LP+HVKIK+ R H  N T SC++F EL RN
Subjt:  CSNKGKQRIETEEVEKEESRKKFSRSHSTGHSIVKAKREGESRHKLILPEHVKIKILRGH--NWTGSCVTFEELARN


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCCACCGATTTGACTCGCATTCCTTTCCCCTCACAAGACCACGCCAGTCCTCCTGTCACCATTGTCCTCACACTCATCCTCGTTGCCTTCCTCTTCGTCGGTTTCTT
CTCCATCTACTGCTGCCGCTGCGTTGTGGACTCCTTCCTCCATTCCCGCAACGTCCGCCGCTCCACCTCCGGCAACCTTCTCCACCCTTCCAACGATTCCCCTGCCGCCC
CTACTGGCCTCGACCCACTTCTCATCAACTCCTTTCCCACTTTCCCATATTCCAAAATCAAGGAATTTCGCAGTGACAATGTGGGATTAGAATGCGCCATTTGCCTTCTC
GAATTCAACGACGAGAGCTTCCTTCGCCTTCTCACTGTTTGCTACCATGTTTTCCATCAGGAGTGCATTGATCTCTGGCTCGAATCCCACAAGACCTGCCCTGTTTGCAG
GAGAAATCTCGACTCCGATTTGCGGAGGAATTCTGCTGATAAGACCTCTGATCCACCACGAACTTCCCACCGTGAGTCAATTGAAGATGCTATTAGTATTGATATTGATG
AGGACGCCGACGCCGATGCCGATTCCGATGCCGATGACAATGAGGGCTCTTGTTCGAACAAGGGAAAACAGAGGATTGAAACAGAGGAGGTGGAGAAGGAAGAGAGTAGG
AAGAAATTCTCGAGATCGCATTCGACAGGGCATTCGATTGTGAAGGCGAAAAGAGAAGGAGAAAGTCGGCATAAGTTGATATTACCGGAGCACGTGAAGATTAAGATTCT
AAGAGGACATAATTGGACGGGGAGTTGCGTGACATTTGAGGAGTTGGCGAGGAACCCTAGCAATGGCGGTGGGTTTTCAAAGCTCTGTGAAAGGGGTGATCGGAATAACT
TGCAGAAGCCGGCATGTTCAGTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCCACCGATTTGACTCGCATTCCTTTCCCCTCACAAGACCACGCCAGTCCTCCTGTCACCATTGTCCTCACACTCATCCTCGTTGCCTTCCTCTTCGTCGGTTTCTT
CTCCATCTACTGCTGCCGCTGCGTTGTGGACTCCTTCCTCCATTCCCGCAACGTCCGCCGCTCCACCTCCGGCAACCTTCTCCACCCTTCCAACGATTCCCCTGCCGCCC
CTACTGGCCTCGACCCACTTCTCATCAACTCCTTTCCCACTTTCCCATATTCCAAAATCAAGGAATTTCGCAGTGACAATGTGGGATTAGAATGCGCCATTTGCCTTCTC
GAATTCAACGACGAGAGCTTCCTTCGCCTTCTCACTGTTTGCTACCATGTTTTCCATCAGGAGTGCATTGATCTCTGGCTCGAATCCCACAAGACCTGCCCTGTTTGCAG
GAGAAATCTCGACTCCGATTTGCGGAGGAATTCTGCTGATAAGACCTCTGATCCACCACGAACTTCCCACCGTGAGTCAATTGAAGATGCTATTAGTATTGATATTGATG
AGGACGCCGACGCCGATGCCGATTCCGATGCCGATGACAATGAGGGCTCTTGTTCGAACAAGGGAAAACAGAGGATTGAAACAGAGGAGGTGGAGAAGGAAGAGAGTAGG
AAGAAATTCTCGAGATCGCATTCGACAGGGCATTCGATTGTGAAGGCGAAAAGAGAAGGAGAAAGTCGGCATAAGTTGATATTACCGGAGCACGTGAAGATTAAGATTCT
AAGAGGACATAATTGGACGGGGAGTTGCGTGACATTTGAGGAGTTGGCGAGGAACCCTAGCAATGGCGGTGGGTTTTCAAAGCTCTGTGAAAGGGGTGATCGGAATAACT
TGCAGAAGCCGGCATGTTCAGTTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSTDLTRIPFPSQDHASPPVTIVLTLILVAFLFVGFFSIYCCRCVVDSFLHSRNVRRSTSGNLLHPSNDSPAAPTGLDPLLINSFPTFPYSKIKEFRSDNVGLECAICLL
EFNDESFLRLLTVCYHVFHQECIDLWLESHKTCPVCRRNLDSDLRRNSADKTSDPPRTSHRESIEDAISIDIDEDADADADSDADDNEGSCSNKGKQRIETEEVEKEESR
KKFSRSHSTGHSIVKAKREGESRHKLILPEHVKIKILRGHNWTGSCVTFEELARNPSNGGGFSKLCERGDRNNLQKPACSV