; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh03G003700 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh03G003700
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationCmo_Chr03:4647971..4648831
RNA-Seq ExpressionCmoCh03G003700
SyntenyCmoCh03G003700
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022950112.1 uncharacterized protein LOC111453292 isoform X1 [Cucurbita moschata]1.8e-90100Show/hide
Query:  MSVSEVTEEEEEVSKFIDPEVQKERIRQILKYQKSVYSSSSSSSSSSSSSISTSASSSRSCSLLDLMKAGNTSLRRLFDMQHTSLATYFDKYSGSPTIKP
        MSVSEVTEEEEEVSKFIDPEVQKERIRQILKYQKSVYSSSSSSSSSSSSSISTSASSSRSCSLLDLMKAGNTSLRRLFDMQHTSLATYFDKYSGSPTIKP
Subjt:  MSVSEVTEEEEEVSKFIDPEVQKERIRQILKYQKSVYSSSSSSSSSSSSSISTSASSSRSCSLLDLMKAGNTSLRRLFDMQHTSLATYFDKYSGSPTIKP

Query:  IPLWGSDSDVEICDAWASIKIGLSHDSRSRGTNCTSNGVFMDRNTGLRNSTVRVNKHKLTRKKSFRKLPGFGLLWRSGRFRVRIR
        IPLWGSDSDVEICDAWASIKIGLSHDSRSRGTNCTSNGVFMDRNTGLRNSTVRVNKHKLTRKKSFRKLPGFGLLWRSGRFRVRIR
Subjt:  IPLWGSDSDVEICDAWASIKIGLSHDSRSRGTNCTSNGVFMDRNTGLRNSTVRVNKHKLTRKKSFRKLPGFGLLWRSGRFRVRIR

XP_022950113.1 uncharacterized protein LOC111453292 isoform X2 [Cucurbita moschata]2.8e-96100Show/hide
Query:  MSVSEVTEEEEEVSKFIDPEVQKERIRQILKYQKSVYSSSSSSSSSSSSSISTSASSSRSCSLLDLMKAGNTSLRRLFDMQHTSLATYFDKYSGSPTIKP
        MSVSEVTEEEEEVSKFIDPEVQKERIRQILKYQKSVYSSSSSSSSSSSSSISTSASSSRSCSLLDLMKAGNTSLRRLFDMQHTSLATYFDKYSGSPTIKP
Subjt:  MSVSEVTEEEEEVSKFIDPEVQKERIRQILKYQKSVYSSSSSSSSSSSSSISTSASSSRSCSLLDLMKAGNTSLRRLFDMQHTSLATYFDKYSGSPTIKP

Query:  IPLWGSDSDVEICDAWASIKIGLSHDSRSRGTNCTSNGVFMDRNTGLRNSTVRVNKHKLTRKKSFRKLPGFGLLWRSGRFRVRIRWRRLRIMIC
        IPLWGSDSDVEICDAWASIKIGLSHDSRSRGTNCTSNGVFMDRNTGLRNSTVRVNKHKLTRKKSFRKLPGFGLLWRSGRFRVRIRWRRLRIMIC
Subjt:  IPLWGSDSDVEICDAWASIKIGLSHDSRSRGTNCTSNGVFMDRNTGLRNSTVRVNKHKLTRKKSFRKLPGFGLLWRSGRFRVRIRWRRLRIMIC

XP_022978287.1 uncharacterized protein LOC111478319 isoform X2 [Cucurbita maxima]5.1e-9094.85Show/hide
Query:  MSVSEVTEEEEEVSKFIDPEVQKERIRQILKYQKSVYSSSSSSSSSSSSSISTSASSSRSCSLLDLMKAGNTSLRRLFDMQHTSLATYFDKYSGSPTIKP
        MSVSE+TEEEEEVSKFIDPEVQ+ERIRQILKYQKSVY    SSSSSSSSSISTSASSSRSCSLLDLMKAGN SLRRLFDMQHTSLATYFDKYSGSPTIKP
Subjt:  MSVSEVTEEEEEVSKFIDPEVQKERIRQILKYQKSVYSSSSSSSSSSSSSISTSASSSRSCSLLDLMKAGNTSLRRLFDMQHTSLATYFDKYSGSPTIKP

Query:  IPLWGSDSDVEICDAWASIKIGLSHDSRSRGTNCTSNGVFMDRNTGLRNSTVRVNKHKLTRKKSFRKLPGFGLLWRSGRFRVRIRWRRLRIMIC
        IPLWGSDSDVEICDAWASIKIG SHDSRS GTNCTSNGVFMDRNTGLRNSTVRVNKHKLTRKKSFRKLPGFGLLWRSGRFRVRIRWR LRIMIC
Subjt:  IPLWGSDSDVEICDAWASIKIGLSHDSRSRGTNCTSNGVFMDRNTGLRNSTVRVNKHKLTRKKSFRKLPGFGLLWRSGRFRVRIRWRRLRIMIC

XP_023543293.1 serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]9.0e-8795.24Show/hide
Query:  MSVSEVTEEEEEVSKFIDPEVQKERIRQILKYQKSVY----SSSSSSSSSSSSSISTSASSSRSCSLLDLMKAGNTSLRRLFDMQHTSLATYFDKYSGSP
        MSVSE+TE+EEEVSKFIDPEVQKERIRQILKYQKSVY    SSSSSSSSSSSSSISTSASSSRSCSLLDLMKAGNTSLRRLFDMQHTSLATYFDKYSGSP
Subjt:  MSVSEVTEEEEEVSKFIDPEVQKERIRQILKYQKSVY----SSSSSSSSSSSSSISTSASSSRSCSLLDLMKAGNTSLRRLFDMQHTSLATYFDKYSGSP

Query:  TIKPIPLWGSDSDVEICDAWASIKIGLSHDSRSRGTNCTSNGVFMDRNTGLRNSTVRVNKHKLTRKKSFRKLPGFGLLWRSGRFRVRIR
        TIKPIPLWGSDSDVE CDAWASIKIGLSHDSRSRGTNCTSNG+FMDRNTG RNSTVRVNKHKLTRKKSFRKLPGFGLLWRSGRFRVRIR
Subjt:  TIKPIPLWGSDSDVEICDAWASIKIGLSHDSRSRGTNCTSNGVFMDRNTGLRNSTVRVNKHKLTRKKSFRKLPGFGLLWRSGRFRVRIR

XP_023543295.1 serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 3-like isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.4e-9295.45Show/hide
Query:  MSVSEVTEEEEEVSKFIDPEVQKERIRQILKYQKSVY----SSSSSSSSSSSSSISTSASSSRSCSLLDLMKAGNTSLRRLFDMQHTSLATYFDKYSGSP
        MSVSE+TE+EEEVSKFIDPEVQKERIRQILKYQKSVY    SSSSSSSSSSSSSISTSASSSRSCSLLDLMKAGNTSLRRLFDMQHTSLATYFDKYSGSP
Subjt:  MSVSEVTEEEEEVSKFIDPEVQKERIRQILKYQKSVY----SSSSSSSSSSSSSISTSASSSRSCSLLDLMKAGNTSLRRLFDMQHTSLATYFDKYSGSP

Query:  TIKPIPLWGSDSDVEICDAWASIKIGLSHDSRSRGTNCTSNGVFMDRNTGLRNSTVRVNKHKLTRKKSFRKLPGFGLLWRSGRFRVRIRWRRLRIMIC
        TIKPIPLWGSDSDVE CDAWASIKIGLSHDSRSRGTNCTSNG+FMDRNTG RNSTVRVNKHKLTRKKSFRKLPGFGLLWRSGRFRVRIRWRRLRIMIC
Subjt:  TIKPIPLWGSDSDVEICDAWASIKIGLSHDSRSRGTNCTSNGVFMDRNTGLRNSTVRVNKHKLTRKKSFRKLPGFGLLWRSGRFRVRIRWRRLRIMIC

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L1A7 Uncharacterized protein2.9e-6777.84Show/hide
Query:  MSVSEVTEEEEEVSKFIDPEVQKERIRQILKYQKSVYSSSSSSSSSSSSSISTSASSSRSCSLLDLMKAGNTSLRRLFDMQHTSLATYFDKYSGSPTIKP
        M VSE++EEEE+V +FIDPEVQKERIRQILKYQKSVYSSSSSS SSSS       SS R  SLLDLMKAGNTSLRRLF+MQHTSLATYF KYSGSP IK 
Subjt:  MSVSEVTEEEEEVSKFIDPEVQKERIRQILKYQKSVYSSSSSSSSSSSSSISTSASSSRSCSLLDLMKAGNTSLRRLFDMQHTSLATYFDKYSGSPTIKP

Query:  IPLWGSDSDVEICDAWASIKIGLSHDSRSRGTNCTSNGVFMDRNTGLRNSTVRVNKHKLTRKKSFRKLPGFGLLWRSGRFRVRIRWRRLRIMIC
        IPLWGSDSDVEI DAWAS+KIGLSHDS S  TNCTS G  +DR TGL NST+ V+K KLTRKKSFRKLP F LLW S RFRVR R RRLRI+IC
Subjt:  IPLWGSDSDVEICDAWASIKIGLSHDSRSRGTNCTSNGVFMDRNTGLRNSTVRVNKHKLTRKKSFRKLPGFGLLWRSGRFRVRIRWRRLRIMIC

A0A6J1GDW9 uncharacterized protein LOC111453292 isoform X18.5e-91100Show/hide
Query:  MSVSEVTEEEEEVSKFIDPEVQKERIRQILKYQKSVYSSSSSSSSSSSSSISTSASSSRSCSLLDLMKAGNTSLRRLFDMQHTSLATYFDKYSGSPTIKP
        MSVSEVTEEEEEVSKFIDPEVQKERIRQILKYQKSVYSSSSSSSSSSSSSISTSASSSRSCSLLDLMKAGNTSLRRLFDMQHTSLATYFDKYSGSPTIKP
Subjt:  MSVSEVTEEEEEVSKFIDPEVQKERIRQILKYQKSVYSSSSSSSSSSSSSISTSASSSRSCSLLDLMKAGNTSLRRLFDMQHTSLATYFDKYSGSPTIKP

Query:  IPLWGSDSDVEICDAWASIKIGLSHDSRSRGTNCTSNGVFMDRNTGLRNSTVRVNKHKLTRKKSFRKLPGFGLLWRSGRFRVRIR
        IPLWGSDSDVEICDAWASIKIGLSHDSRSRGTNCTSNGVFMDRNTGLRNSTVRVNKHKLTRKKSFRKLPGFGLLWRSGRFRVRIR
Subjt:  IPLWGSDSDVEICDAWASIKIGLSHDSRSRGTNCTSNGVFMDRNTGLRNSTVRVNKHKLTRKKSFRKLPGFGLLWRSGRFRVRIR

A0A6J1GDZ9 uncharacterized protein LOC111453292 isoform X21.4e-96100Show/hide
Query:  MSVSEVTEEEEEVSKFIDPEVQKERIRQILKYQKSVYSSSSSSSSSSSSSISTSASSSRSCSLLDLMKAGNTSLRRLFDMQHTSLATYFDKYSGSPTIKP
        MSVSEVTEEEEEVSKFIDPEVQKERIRQILKYQKSVYSSSSSSSSSSSSSISTSASSSRSCSLLDLMKAGNTSLRRLFDMQHTSLATYFDKYSGSPTIKP
Subjt:  MSVSEVTEEEEEVSKFIDPEVQKERIRQILKYQKSVYSSSSSSSSSSSSSISTSASSSRSCSLLDLMKAGNTSLRRLFDMQHTSLATYFDKYSGSPTIKP

Query:  IPLWGSDSDVEICDAWASIKIGLSHDSRSRGTNCTSNGVFMDRNTGLRNSTVRVNKHKLTRKKSFRKLPGFGLLWRSGRFRVRIRWRRLRIMIC
        IPLWGSDSDVEICDAWASIKIGLSHDSRSRGTNCTSNGVFMDRNTGLRNSTVRVNKHKLTRKKSFRKLPGFGLLWRSGRFRVRIRWRRLRIMIC
Subjt:  IPLWGSDSDVEICDAWASIKIGLSHDSRSRGTNCTSNGVFMDRNTGLRNSTVRVNKHKLTRKKSFRKLPGFGLLWRSGRFRVRIRWRRLRIMIC

A0A6J1IM99 uncharacterized protein LOC111478319 isoform X13.1e-8595.14Show/hide
Query:  MSVSEVTEEEEEVSKFIDPEVQKERIRQILKYQKSVYSSSSSSSSSSSSSISTSASSSRSCSLLDLMKAGNTSLRRLFDMQHTSLATYFDKYSGSPTIKP
        MSVSE+TEEEEEVSKFIDPEVQ+ERIRQILKYQKSVY    SSSSSSSSSISTSASSSRSCSLLDLMKAGN SLRRLFDMQHTSLATYFDKYSGSPTIKP
Subjt:  MSVSEVTEEEEEVSKFIDPEVQKERIRQILKYQKSVYSSSSSSSSSSSSSISTSASSSRSCSLLDLMKAGNTSLRRLFDMQHTSLATYFDKYSGSPTIKP

Query:  IPLWGSDSDVEICDAWASIKIGLSHDSRSRGTNCTSNGVFMDRNTGLRNSTVRVNKHKLTRKKSFRKLPGFGLLWRSGRFRVRIR
        IPLWGSDSDVEICDAWASIKIG SHDSRS GTNCTSNGVFMDRNTGLRNSTVRVNKHKLTRKKSFRKLPGFGLLWRSGRFRVRIR
Subjt:  IPLWGSDSDVEICDAWASIKIGLSHDSRSRGTNCTSNGVFMDRNTGLRNSTVRVNKHKLTRKKSFRKLPGFGLLWRSGRFRVRIR

A0A6J1ISL5 uncharacterized protein LOC111478319 isoform X22.5e-9094.85Show/hide
Query:  MSVSEVTEEEEEVSKFIDPEVQKERIRQILKYQKSVYSSSSSSSSSSSSSISTSASSSRSCSLLDLMKAGNTSLRRLFDMQHTSLATYFDKYSGSPTIKP
        MSVSE+TEEEEEVSKFIDPEVQ+ERIRQILKYQKSVY    SSSSSSSSSISTSASSSRSCSLLDLMKAGN SLRRLFDMQHTSLATYFDKYSGSPTIKP
Subjt:  MSVSEVTEEEEEVSKFIDPEVQKERIRQILKYQKSVYSSSSSSSSSSSSSISTSASSSRSCSLLDLMKAGNTSLRRLFDMQHTSLATYFDKYSGSPTIKP

Query:  IPLWGSDSDVEICDAWASIKIGLSHDSRSRGTNCTSNGVFMDRNTGLRNSTVRVNKHKLTRKKSFRKLPGFGLLWRSGRFRVRIRWRRLRIMIC
        IPLWGSDSDVEICDAWASIKIG SHDSRS GTNCTSNGVFMDRNTGLRNSTVRVNKHKLTRKKSFRKLPGFGLLWRSGRFRVRIRWR LRIMIC
Subjt:  IPLWGSDSDVEICDAWASIKIGLSHDSRSRGTNCTSNGVFMDRNTGLRNSTVRVNKHKLTRKKSFRKLPGFGLLWRSGRFRVRIRWRRLRIMIC

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCAGTATCAGAGGTAACTGAGGAGGAAGAAGAGGTATCGAAGTTCATTGATCCTGAAGTCCAAAAGGAAAGAATCCGACAAATACTCAAGTACCAGAAATCT
GTGTATTCTTCATCTTCATCTTCATCTTCATCTTCATCTTCTTCTATCTCAACCTCGGCATCATCTTCCAGAAGCTGTAGTTTACTAGACTTGATGAAAGCAGGA
AACACTTCTCTCAGGAGATTATTTGACATGCAGCATACTAGTTTGGCCACCTATTTTGATAAGTACAGTGGATCACCCACGATAAAGCCTATACCGTTATGGGGC
AGTGATTCTGATGTAGAAATCTGTGATGCTTGGGCATCCATCAAGATCGGACTCTCACATGATTCTAGGTCTCGCGGAACTAATTGCACATCAAATGGTGTTTTC
ATGGACAGAAACACAGGGCTTCGGAATAGCACGGTAAGGGTTAACAAACACAAGTTAACTAGGAAAAAGTCATTTCGGAAGCTACCTGGATTTGGTCTGCTATGG
AGAAGCGGAAGATTTAGAGTCCGGATCAGGTGGAGACGACTTCGAATTATGATATGTGATGTCTTCAGTACAACACCCCTGTCGGCAAATCTCCATGCCCCAGCT
CCGGCTAGTGAATTCGACAGTGATGACTGGTCATTTCTGCCTATCAAGCTGCGATTTGACCCTAGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCAGTATCAGAGGTAACTGAGGAGGAAGAAGAGGTATCGAAGTTCATTGATCCTGAAGTCCAAAAGGAAAGAATCCGACAAATACTCAAGTACCAGAAATCT
GTGTATTCTTCATCTTCATCTTCATCTTCATCTTCATCTTCTTCTATCTCAACCTCGGCATCATCTTCCAGAAGCTGTAGTTTACTAGACTTGATGAAAGCAGGA
AACACTTCTCTCAGGAGATTATTTGACATGCAGCATACTAGTTTGGCCACCTATTTTGATAAGTACAGTGGATCACCCACGATAAAGCCTATACCGTTATGGGGC
AGTGATTCTGATGTAGAAATCTGTGATGCTTGGGCATCCATCAAGATCGGACTCTCACATGATTCTAGGTCTCGCGGAACTAATTGCACATCAAATGGTGTTTTC
ATGGACAGAAACACAGGGCTTCGGAATAGCACGGTAAGGGTTAACAAACACAAGTTAACTAGGAAAAAGTCATTTCGGAAGCTACCTGGATTTGGTCTGCTATGG
AGAAGCGGAAGATTTAGAGTCCGGATCAGGTGGAGACGACTTCGAATTATGATATGTGATGTCTTCAGTACAACACCCCTGTCGGCAAATCTCCATGCCCCAGCT
CCGGCTAGTGAATTCGACAGTGATGACTGGTCATTTCTGCCTATCAAGCTGCGATTTGACCCTAGCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSVSEVTEEEEEVSKFIDPEVQKERIRQILKYQKSVYSSSSSSSSSSSSSISTSASSSRSCSLLDLMKAGNTSLRRLFDMQHTSLATYFDKYSGSPTIKPIPLWG
SDSDVEICDAWASIKIGLSHDSRSRGTNCTSNGVFMDRNTGLRNSTVRVNKHKLTRKKSFRKLPGFGLLWRSGRFRVRIRWRRLRIMICDVFSTTPLSANLHAPA
PASEFDSDDWSFLPIKLRFDPS