| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAA0025634.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a [Cucumis melo var. makuwa] | 4.7e-40 | 93.14 | Show/hide |
Query: SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGERGSRYR-GGSFREDYGHRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPYGGGRSRRDHSRS-PPYSPYGGGSPDRRYPRG
SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRG+RGSRYR GGSFREDYG+RRSPRRSPYRGAREYSPRHS PPYGGGRSRRDHSRS PPYSP GGSPDRRYPRG
Subjt: SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGERGSRYR-GGSFREDYGHRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPYGGGRSRRDHSRS-PPYSPYGGGSPDRRYPRG
Query: SR
SR
Subjt: SR
|
|
| KAE8647621.1 hypothetical protein Csa_003197 [Cucumis sativus] | 3.7e-37 | 90.48 | Show/hide |
Query: SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYR-GERG-SRYR--GGSFREDYGHRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPYGGGRSRRDHSRS-PPYSPYGGGSPDRRY
SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYR G+RG SRYR GGSFREDYG+RRSPRRSPYRGAREYSPRHS PPYGGGRSRRDHSRS PPYSP GGSPDRRY
Subjt: SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYR-GERG-SRYR--GGSFREDYGHRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPYGGGRSRRDHSRS-PPYSPYGGGSPDRRY
Query: PRGSR
PRGSR
Subjt: PRGSR
|
|
| XP_016899368.1 PREDICTED: serine/arginine-rich splicing factor SR45a [Cucumis melo] | 4.7e-40 | 93.14 | Show/hide |
Query: SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGERGSRYR-GGSFREDYGHRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPYGGGRSRRDHSRS-PPYSPYGGGSPDRRYPRG
SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRG+RGSRYR GGSFREDYG+RRSPRRSPYRGAREYSPRHS PPYGGGRSRRDHSRS PPYSP GGSPDRRYPRG
Subjt: SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGERGSRYR-GGSFREDYGHRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPYGGGRSRRDHSRS-PPYSPYGGGSPDRRYPRG
Query: SR
SR
Subjt: SR
|
|
| XP_022950652.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a [Cucurbita moschata] | 3.6e-48 | 100 | Show/hide |
Query: SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGERGSRYRGGSFREDYGHRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPYGGGRSRRDHSRSPPYSPYGGGSPDRRYPRGSR
SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGERGSRYRGGSFREDYGHRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPYGGGRSRRDHSRSPPYSPYGGGSPDRRYPRGSR
Subjt: SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGERGSRYRGGSFREDYGHRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPYGGGRSRRDHSRSPPYSPYGGGSPDRRYPRGSR
|
|
| XP_031743118.1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a [Cucumis sativus] | 3.7e-37 | 90.48 | Show/hide |
Query: SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYR-GERG-SRYR--GGSFREDYGHRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPYGGGRSRRDHSRS-PPYSPYGGGSPDRRY
SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYR G+RG SRYR GGSFREDYG+RRSPRRSPYRGAREYSPRHS PPYGGGRSRRDHSRS PPYSP GGSPDRRY
Subjt: SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYR-GERG-SRYR--GGSFREDYGHRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPYGGGRSRRDHSRS-PPYSPYGGGSPDRRY
Query: PRGSR
PRGSR
Subjt: PRGSR
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0A0KMM4 RRM domain-containing protein | 1.8e-37 | 90.48 | Show/hide |
Query: SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYR-GERG-SRYR--GGSFREDYGHRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPYGGGRSRRDHSRS-PPYSPYGGGSPDRRY
SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYR G+RG SRYR GGSFREDYG+RRSPRRSPYRGAREYSPRHS PPYGGGRSRRDHSRS PPYSP GGSPDRRY
Subjt: SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYR-GERG-SRYR--GGSFREDYGHRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPYGGGRSRRDHSRS-PPYSPYGGGSPDRRY
Query: PRGSR
PRGSR
Subjt: PRGSR
|
|
| A0A1S4DTT1 serine/arginine-rich splicing factor SR45a | 2.3e-40 | 93.14 | Show/hide |
Query: SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGERGSRYR-GGSFREDYGHRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPYGGGRSRRDHSRS-PPYSPYGGGSPDRRYPRG
SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRG+RGSRYR GGSFREDYG+RRSPRRSPYRGAREYSPRHS PPYGGGRSRRDHSRS PPYSP GGSPDRRYPRG
Subjt: SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGERGSRYR-GGSFREDYGHRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPYGGGRSRRDHSRS-PPYSPYGGGSPDRRYPRG
Query: SR
SR
Subjt: SR
|
|
| A0A5A7SJ12 Serine/arginine-rich splicing factor SR45a | 2.3e-40 | 93.14 | Show/hide |
Query: SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGERGSRYR-GGSFREDYGHRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPYGGGRSRRDHSRS-PPYSPYGGGSPDRRYPRG
SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRG+RGSRYR GGSFREDYG+RRSPRRSPYRGAREYSPRHS PPYGGGRSRRDHSRS PPYSP GGSPDRRYPRG
Subjt: SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGERGSRYR-GGSFREDYGHRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPYGGGRSRRDHSRS-PPYSPYGGGSPDRRYPRG
Query: SR
SR
Subjt: SR
|
|
| A0A6J1GFF0 serine/arginine-rich splicing factor SR45a | 1.7e-48 | 100 | Show/hide |
Query: SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGERGSRYRGGSFREDYGHRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPYGGGRSRRDHSRSPPYSPYGGGSPDRRYPRGSR
SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGERGSRYRGGSFREDYGHRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPYGGGRSRRDHSRSPPYSPYGGGSPDRRYPRGSR
Subjt: SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGERGSRYRGGSFREDYGHRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPYGGGRSRRDHSRSPPYSPYGGGSPDRRYPRGSR
|
|
| A0A6J1INV2 serine/arginine-rich splicing factor SR45a | 1.7e-48 | 100 | Show/hide |
Query: SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGERGSRYRGGSFREDYGHRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPYGGGRSRRDHSRSPPYSPYGGGSPDRRYPRGSR
SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGERGSRYRGGSFREDYGHRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPYGGGRSRRDHSRSPPYSPYGGGSPDRRYPRGSR
Subjt: SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGERGSRYRGGSFREDYGHRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPYGGGRSRRDHSRSPPYSPYGGGSPDRRYPRGSR
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT1G07350.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 6.8e-05 | 43 | Show/hide |
Query: SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRD---------------SGYRGERGSRYRGGSFREDYGHR-RSPRRSP-YRGAREYSPRHSPPPYGGGRSRRDHSRSPPY
+RR+R RTPTPG YLGL++ R S R S RG S+ YG R RS SP YR R YSP SP P RRD S SP Y
Subjt: SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRD---------------SGYRGERGSRYRGGSFREDYGHR-RSPRRSP-YRGAREYSPRHSPPPYGGGRSRRDHSRSPPY
|
|
| AT4G35785.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.2e-11 | 56.57 | Show/hide |
Query: SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGERGSRYRGGSFREDYGHRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPYGGGRSRRDHSRSPPYSPYGGGSPDRRYPRGS
SRRKRPRTPTPGHYLGLKS+RDS G R SR R R+DY RRSPR R+YSPR RSRRD S YSP+ G SP+RR R S
Subjt: SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGERGSRYRGGSFREDYGHRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPYGGGRSRRDHSRSPPYSPYGGGSPDRRYPRGS
|
|
| AT4G35785.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein | 2.2e-11 | 56.57 | Show/hide |
Query: SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGERGSRYRGGSFREDYGHRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPYGGGRSRRDHSRSPPYSPYGGGSPDRRYPRGS
SRRKRPRTPTPGHYLGLKS+RDS G R SR R R+DY RRSPR R+YSPR RSRRD S YSP+ G SP+RR R S
Subjt: SRRKRPRTPTPGHYLGLKSTRDSGYRGERGSRYRGGSFREDYGHRRSPRRSPYRGAREYSPRHSPPPYGGGRSRRDHSRSPPYSPYGGGSPDRRYPRGS
|
|
