; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh03G008380 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh03G008380
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionVQ domain-containing protein
Genome locationCmo_Chr03:6671792..6673048
RNA-Seq ExpressionCmoCh03G008380
SyntenyCmoCh03G008380
Gene Ontology termsGO:0032259 - methylation (biological process)
GO:0008168 - methyltransferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039609 - VQ motif-containing protein 15/22


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6604026.1 hypothetical protein SDJN03_04635, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.5e-22096.67Show/hide
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KAG7034190.1 hypothetical protein SDJN02_03917, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.5e-22297.16Show/hide
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XP_022978502.1 kinesin-related protein 9-like [Cucurbita maxima]3.1e-21094.66Show/hide
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A0A1S3B292 uncharacterized protein LOC1034849791.5e-13068.55Show/hide
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A0A5A7SYC9 Rho GTPase-activating protein gacF-like7.5e-13068.33Show/hide
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A0A6J1GFX4 histone-lysine N-methyltransferase, H3 lysine-79 specific-like2.5e-22699.03Show/hide
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A0A6J1IL93 kinesin-related protein 9-like1.5e-21094.66Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9LIE6 VQ motif-containing protein 228.6e-0673.53Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G35830.1 VQ motif-containing protein1.4e-1935.89Show/hide
Query:  ASARNPRKRTRASRRAPTTVLTTDTSNFRAMVQEFTGIPAPPFTPASCFPRARVELFGGTSS--TSSPPYLLRPFPQKLPPFPFNSPDTTTTTTTATSSS
        +S+RNPRKRTRASRRAPTTVLTTDTSNFRAMVQEFTG+PA PF+        R ++F   S   T +P    RP PQK    P N    +T++       
Subjt:  ASARNPRKRTRASRRAPTTVLTTDTSNFRAMVQEFTGIPAPPFTPASCFPRARVELFGGTSS--TSSPPYLLRPFPQKLPPFPFNSPDTTTTTTTATSSS

Query:  TNTSLLSPSSHFLLPKQNHHLSSIFNLQPPPPLHQPNINLLASDLQVSLDTAQTTSEPRPNHHLHQTHLPE--EFLSGNILPPSWDIGGGGGGGGGASMN
        T TS+  P    L   Q H +S+  +L      HQP ++ L     ++L   Q    P  +   HQ  + +  EF      PP                 
Subjt:  TNTSLLSPSSHFLLPKQNHHLSSIFNLQPPPPLHQPNINLLASDLQVSLDTAQTTSEPRPNHHLHQTHLPE--EFLSGNILPPSWDIGGGGGGGGGASMN

Query:  TKYCGGTRVNNNYSASSSSLDFHGDKGSSENVTTRSEGMIESWICSSD
                ++NN S SSSS    G  G++   TT     ++ WIC +D
Subjt:  TKYCGGTRVNNNYSASSSSLDFHGDKGSSENVTTRSEGMIESWICSSD

AT3G22160.1 VQ motif-containing protein6.1e-0773.53Show/hide
Query:  RKRTRASRRAPTTVLTTDTSNFRAMVQEFTGIPA
        R+R+RASRR PTT+L TDTSNFRAMVQ++TG P+
Subjt:  RKRTRASRRAPTTVLTTDTSNFRAMVQEFTGIPA

AT4G15120.1 VQ motif-containing protein9.7e-0536.45Show/hide
Query:  ARNPRKRTRASRRAPTTVLTTDTSNFRAMVQEFTGIP---APPFTPASCFPRARVELFGGTSSTSSPPYLLR------PFPQKLPPFPFNSPDTTTTTTT
        A+  R+R+RASRR PTT+  TDT+NFRAMVQ+FTG P   A   +P+S F     +   G SS+      L+         Q+  P+ F+S +  +T + 
Subjt:  ARNPRKRTRASRRAPTTVLTTDTSNFRAMVQEFTGIP---APPFTPASCFPRARVELFGGTSSTSSPPYLLR------PFPQKLPPFPFNSPDTTTTTTT

Query:  ATSSSTN
          + +T+
Subjt:  ATSSSTN

AT4G39720.1 VQ motif-containing protein6.1e-1532.32Show/hide
Query:  MDSGSSASIQSSS----GGEEEYDSR-AEGGLSGFLNNPSRHVGPIATKPNPPPLSVHPPATHHPHSSSSLFDPFSNFAHHLPTRSPQNSLPNLDFLCSR
        M+SG+S+S+QSSS    GGEEEYDSR A+  +S F ++ + HV  I     P P   H    H  H++++   P + F ++                   
Subjt:  MDSGSSASIQSSS----GGEEEYDSR-AEGGLSGFLNNPSRHVGPIATKPNPPPLSVHPPATHHPHSSSSLFDPFSNFAHHLPTRSPQNSLPNLDFLCSR

Query:  NPRSDHDPIQLPASISMLPSSSQPQSFMTATNSQLQLQLPHQVTPTNVQAPRGLTFTADRTDVVHNHNNNNNNTGTGSNASARNPRKRTRASRRAPTTVL
                       + LP + QP        SQL L                      RT    +     NN G       +  +KR+RASRRAPTTVL
Subjt:  NPRSDHDPIQLPASISMLPSSSQPQSFMTATNSQLQLQLPHQVTPTNVQAPRGLTFTADRTDVVHNHNNNNNNTGTGSNASARNPRKRTRASRRAPTTVL

Query:  TTDTSNFRAMVQEFTGIPAPP-FTPASCFPRARVELFGGTSSTSSPPY-----LLRPFPQKL-PPFPFNSPDTTTTTTTATSSSTNTSLLS-PSSHFLLP
        TTDTSNFRAMVQEFTGIPAPP F   S     R+  F G SS+S   Y     LLRPF QKL P  P  S           +   + +L +   +H   P
Subjt:  TTDTSNFRAMVQEFTGIPAPP-FTPASCFPRARVELFGGTSSTSSPPY-----LLRPFPQKL-PPFPFNSPDTTTTTTTATSSSTNTSLLS-PSSHFLLP

Query:  KQNHHLSSIFNLQPPPPLHQPNINLLAS
        + N H      +   P  + P     A+
Subjt:  KQNHHLSSIFNLQPPPPLHQPNINLLAS

AT5G65170.1 VQ motif-containing protein5.7e-2131.4Show/hide
Query:  MDSGSSASIQSSSGG-----EEEYDSRAEGGLSGFLNNPSRHVGPIATKPN-PPPLSVHPPATHHPHSSSSLFDPFSNFAHHLPTRSPQNSLPNLDFLCS
        M+SG+S+S+QSSSGG     +EEYDSRA+  +S   N+ + +  P    PN   P  +     ++ ++S S  +P  +     PT               
Subjt:  MDSGSSASIQSSSGG-----EEEYDSRAEGGLSGFLNNPSRHVGPIATKPN-PPPLSVHPPATHHPHSSSSLFDPFSNFAHHLPTRSPQNSLPNLDFLCS

Query:  RNPRSDHDPIQLPASISMLPSSSQPQSFMTATNSQLQLQLPHQVTPTNVQAPRGLTFTADRTDVVHNHNNNNNNTGTGSNASARNPRKRTRASRRAPTTV
                      S  + P  S  Q F T   + LQ  L   V  TN  +P     T  +  +                A+ RNP+KR+R SRRAPTTV
Subjt:  RNPRSDHDPIQLPASISMLPSSSQPQSFMTATNSQLQLQLPHQVTPTNVQAPRGLTFTADRTDVVHNHNNNNNNTGTGSNASARNPRKRTRASRRAPTTV

Query:  LTTDTSNFRAMVQEFTGIPAPPFTP-ASCFPRARVELFGGTSSTSSPPYLLRPFPQKLPPFPFNSPDTTTTTTTATSSSTNTSLLSPSSHFLLPKQNHHL
        LTTDTSNFRAMVQEFTG P+ PFT  +S FPR+R +LFG +SS+SS P  ++PFP KL                 + S+ N   L PSS +     + H 
Subjt:  LTTDTSNFRAMVQEFTGIPAPPFTP-ASCFPRARVELFGGTSSTSSPPYLLRPFPQKLPPFPFNSPDTTTTTTTATSSSTNTSLLSPSSHFLLPKQNHHL

Query:  SSIFNLQPPPPLHQPNINLLASD--LQVSLDTAQTTSEPRPNHHLHQTHLPEEFLSGNILPPSWDIGGGGGGGGGASMNTKYCGGTRVNNNYSAS-SSSL
        + + N+   P +  P +N   +D     SL T+          +    H      S ++  P+ +   G      A  +         N+      S   
Subjt:  SSIFNLQPPPPLHQPNINLLASD--LQVSLDTAQTTSEPRPNHHLHQTHLPEEFLSGNILPPSWDIGGGGGGGGGASMNTKYCGGTRVNNNYSAS-SSSL

Query:  DFHGDKGSSENVT-TRSEGMIE-SWICSSD
           G  GS  N++  RSEGM+E SWI SSD
Subjt:  DFHGDKGSSENVT-TRSEGMIE-SWICSSD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATTCTGGGAGTAGTGCAAGTATACAAAGCTCGAGTGGCGGCGAAGAAGAGTACGATTCACGCGCGGAGGGGGGGCTCTCTGGTTTCTTAAACAATCCGTCA
CGGCATGTCGGCCCCATAGCTACTAAGCCCAATCCACCCCCACTATCCGTACATCCTCCAGCGACGCACCACCCTCATTCTTCCTCTTCCCTCTTCGACCCTTTC
TCCAACTTCGCCCATCATTTACCCACTCGATCACCTCAAAATTCCCTTCCCAATCTCGACTTCCTCTGTTCCAGAAACCCCAGGTCCGACCACGACCCGATCCAA
CTTCCCGCCTCCATTTCCATGCTCCCTTCTTCCTCTCAACCCCAATCGTTTATGACGGCCACCAATAGTCAATTGCAATTGCAACTCCCTCATCAAGTCACCCCA
ACTAATGTCCAAGCTCCACGGGGTTTAACTTTCACCGCGGATCGAACCGACGTCGTTCATAATCATAACAACAACAACAACAACACTGGTACTGGTAGCAACGCC
TCTGCTCGTAACCCGAGGAAGCGAACCCGAGCGTCGAGGAGAGCCCCAACCACCGTCCTCACCACAGATACTTCCAATTTCAGAGCCATGGTCCAGGAATTCACT
GGGATTCCAGCACCTCCCTTCACACCTGCATCCTGTTTCCCCAGAGCAAGAGTGGAGCTTTTTGGCGGCACCTCTTCCACCTCTTCCCCACCCTACCTACTCCGC
CCATTTCCCCAAAAGCTACCTCCTTTTCCTTTCAATTCCCCTGATACTACTACTACTACTACTACTGCTACTTCTTCTTCTACAAATACTTCCCTTCTCTCACCA
TCCTCCCATTTTCTTCTCCCCAAACAGAATCATCATCTGTCCTCTATTTTCAATCTCCAGCCCCCTCCCCCTCTCCACCAACCTAATATAAATCTCCTCGCCTCC
GACCTTCAAGTTTCCCTTGATACTGCCCAAACCACATCCGAGCCCCGTCCTAATCACCATCTTCATCAAACGCATCTCCCAGAAGAATTCCTTTCTGGGAATATT
CTTCCGCCAAGTTGGGACATTGGCGGCGGCGGCGGCGGAGGAGGAGGAGCGTCCATGAATACCAAATACTGTGGCGGTACTAGAGTTAACAACAACTATTCAGCC
TCTTCTTCTTCTTTGGATTTTCATGGTGATAAAGGGTCCTCCGAGAATGTGACGACTAGGAGTGAAGGTATGATAGAATCTTGGATTTGTTCGTCAGATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGATTCTGGGAGTAGTGCAAGTATACAAAGCTCGAGTGGCGGCGAAGAAGAGTACGATTCACGCGCGGAGGGGGGGCTCTCTGGTTTCTTAAACAATCCGTCA
CGGCATGTCGGCCCCATAGCTACTAAGCCCAATCCACCCCCACTATCCGTACATCCTCCAGCGACGCACCACCCTCATTCTTCCTCTTCCCTCTTCGACCCTTTC
TCCAACTTCGCCCATCATTTACCCACTCGATCACCTCAAAATTCCCTTCCCAATCTCGACTTCCTCTGTTCCAGAAACCCCAGGTCCGACCACGACCCGATCCAA
CTTCCCGCCTCCATTTCCATGCTCCCTTCTTCCTCTCAACCCCAATCGTTTATGACGGCCACCAATAGTCAATTGCAATTGCAACTCCCTCATCAAGTCACCCCA
ACTAATGTCCAAGCTCCACGGGGTTTAACTTTCACCGCGGATCGAACCGACGTCGTTCATAATCATAACAACAACAACAACAACACTGGTACTGGTAGCAACGCC
TCTGCTCGTAACCCGAGGAAGCGAACCCGAGCGTCGAGGAGAGCCCCAACCACCGTCCTCACCACAGATACTTCCAATTTCAGAGCCATGGTCCAGGAATTCACT
GGGATTCCAGCACCTCCCTTCACACCTGCATCCTGTTTCCCCAGAGCAAGAGTGGAGCTTTTTGGCGGCACCTCTTCCACCTCTTCCCCACCCTACCTACTCCGC
CCATTTCCCCAAAAGCTACCTCCTTTTCCTTTCAATTCCCCTGATACTACTACTACTACTACTACTGCTACTTCTTCTTCTACAAATACTTCCCTTCTCTCACCA
TCCTCCCATTTTCTTCTCCCCAAACAGAATCATCATCTGTCCTCTATTTTCAATCTCCAGCCCCCTCCCCCTCTCCACCAACCTAATATAAATCTCCTCGCCTCC
GACCTTCAAGTTTCCCTTGATACTGCCCAAACCACATCCGAGCCCCGTCCTAATCACCATCTTCATCAAACGCATCTCCCAGAAGAATTCCTTTCTGGGAATATT
CTTCCGCCAAGTTGGGACATTGGCGGCGGCGGCGGCGGAGGAGGAGGAGCGTCCATGAATACCAAATACTGTGGCGGTACTAGAGTTAACAACAACTATTCAGCC
TCTTCTTCTTCTTTGGATTTTCATGGTGATAAAGGGTCCTCCGAGAATGTGACGACTAGGAGTGAAGGTATGATAGAATCTTGGATTTGTTCGTCAGATTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDSGSSASIQSSSGGEEEYDSRAEGGLSGFLNNPSRHVGPIATKPNPPPLSVHPPATHHPHSSSSLFDPFSNFAHHLPTRSPQNSLPNLDFLCSRNPRSDHDPIQ
LPASISMLPSSSQPQSFMTATNSQLQLQLPHQVTPTNVQAPRGLTFTADRTDVVHNHNNNNNNTGTGSNASARNPRKRTRASRRAPTTVLTTDTSNFRAMVQEFT
GIPAPPFTPASCFPRARVELFGGTSSTSSPPYLLRPFPQKLPPFPFNSPDTTTTTTTATSSSTNTSLLSPSSHFLLPKQNHHLSSIFNLQPPPPLHQPNINLLAS
DLQVSLDTAQTTSEPRPNHHLHQTHLPEEFLSGNILPPSWDIGGGGGGGGGASMNTKYCGGTRVNNNYSASSSSLDFHGDKGSSENVTTRSEGMIESWICSSD