| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| KAG6600088.1 Serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia] | 4.2e-178 | 97.37 | Show/hide |
Query: MGSSYLLFPDKMPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGS
MGSSYLLFPDKMPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGS
Subjt: MGSSYLLFPDKMPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGS
Query: RESREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLE
RESREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLE
Subjt: RESREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLE
Query: RSEKRSRSPRGGRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRS---------RSRSRSPRGRSRSRSRSPRGRSRSPMDEAEDF
RSEKRSRSPRGGRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRS RSRSRSPRGRSRSRSRSPRGRSRSPMDEAEDF
Subjt: RSEKRSRSPRGGRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRS---------RSRSRSPRGRSRSRSRSPRGRSRSPMDEAEDF
Query: NGGGSRNYRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGG
NGGGSRNYRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGG
Subjt: NGGGSRNYRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGG
|
|
| XP_022942535.1 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X1 [Cucurbita moschata] | 4.4e-175 | 100 | Show/hide |
Query: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRGP
MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRGP
Subjt: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRGP
Query: PGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
PGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
Subjt: PGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
Query: GRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSPRGRSRSRSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRNYRKEENGYSRSPS
GRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSPRGRSRSRSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRNYRKEENGYSRSPS
Subjt: GRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSPRGRSRSRSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRNYRKEENGYSRSPS
Query: PLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
PLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
Subjt: PLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
|
|
| XP_022992885.1 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X1 [Cucurbita maxima] | 3.7e-166 | 91.98 | Show/hide |
Query: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRGP
MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRGP
Subjt: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRGP
Query: PGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
PGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
Subjt: PGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
Query: GRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRS----------------RSRSRSPRGRS-------RSRSRSPRGRSRSPMDEA
GRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRS SP NRDSPRGRS RSRSRSPRGRS RSRSRSPRGRSRSPMDEA
Subjt: GRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRS----------------RSRSRSPRGRS-------RSRSRSPRGRSRSPMDEA
Query: EDFNGGGSRNYRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
EDFNGGGSRNYRKEENGYSRSPSPLPREERSPVND++ANGSPRGGS SA
Subjt: EDFNGGGSRNYRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
|
|
| XP_022993050.1 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X2 [Cucurbita maxima] | 8.9e-168 | 95.82 | Show/hide |
Query: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRGP
MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRGP
Subjt: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRGP
Query: PGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
PGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
Subjt: PGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
Query: GRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRG--RSRSRSRSPRGRS-------RSRSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRNYRKE
GRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRS SP NRDSPRG RSRSRSRSPRGRS RSRSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRNYRKE
Subjt: GRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRG--RSRSRSRSPRGRS-------RSRSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRNYRKE
Query: ENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
ENGYSRSPSPLPREERSPVND++ANGSPRGGS SA
Subjt: ENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
|
|
| XP_023541883.1 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo] | 1.1e-170 | 95.87 | Show/hide |
Query: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRGP
MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRGP
Subjt: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRGP
Query: PGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
PGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
Subjt: PGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
Query: GRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRG------RSRSRSRSPRGRS-------RSRSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRN
GRLSPKRHSLSPPPSKA+KRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRG RSRSRSRSPRGRS RSRSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRN
Subjt: GRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRG------RSRSRSRSPRGRS-------RSRSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRN
Query: YRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
YRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
Subjt: YRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A6J1CET7 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X1 | 2.6e-157 | 93.11 | Show/hide |
Query: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRGP
MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGG SREYLGRGP
Subjt: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRGP
Query: PGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRR--GRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSP
PGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRR GRSRSRSYSRGRSYSRSRSP+KR+RSLERSEKRSRSP
Subjt: PGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRR--GRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSP
Query: RGGRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRS---RSRSPRGRSRS---RSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRNYRKEE
R GR SPKRHSLSPPP KAMKRSPTPD RSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRS RSRSPRGRSRS RSRSPRGRSRSPMDEAEDF+ GGSRNYR+EE
Subjt: RGGRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRS---RSRSPRGRSRS---RSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRNYRKEE
Query: NGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
NGYSRSPSPLPREERSP+NDED NG+PRGGSESA
Subjt: NGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
|
|
| A0A6J1FWH1 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X1 | 2.1e-175 | 100 | Show/hide |
Query: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRGP
MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRGP
Subjt: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRGP
Query: PGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
PGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
Subjt: PGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
Query: GRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSPRGRSRSRSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRNYRKEENGYSRSPS
GRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSPRGRSRSRSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRNYRKEENGYSRSPS
Subjt: GRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSPRGRSRSRSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRNYRKEENGYSRSPS
Query: PLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
PLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
Subjt: PLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
|
|
| A0A6J1JVG4 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X3 | 5.8e-165 | 95.4 | Show/hide |
Query: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRGP
MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRGP
Subjt: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRGP
Query: PGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
PGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
Subjt: PGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
Query: GRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSPRGRSRSRSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRNYRKEENGYSRSPS
GRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRS SP NRDSPRGRS R RSRSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRNYRKEENGYSRSPS
Subjt: GRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSPRGRSRSRSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRNYRKEENGYSRSPS
Query: PLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
PLPREERSPVND++ANGSPRGGS SA
Subjt: PLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
|
|
| A0A6J1JXF9 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X2 | 4.3e-168 | 95.82 | Show/hide |
Query: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRGP
MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRGP
Subjt: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRGP
Query: PGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
PGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
Subjt: PGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
Query: GRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRG--RSRSRSRSPRGRS-------RSRSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRNYRKE
GRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRS SP NRDSPRG RSRSRSRSPRGRS RSRSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRNYRKE
Subjt: GRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRG--RSRSRSRSPRGRS-------RSRSRSPRGRSRSPMDEAEDFNGGGSRNYRKE
Query: ENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
ENGYSRSPSPLPREERSPVND++ANGSPRGGS SA
Subjt: ENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
|
|
| A0A6J1JYX0 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X1 | 1.8e-166 | 91.98 | Show/hide |
Query: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRGP
MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRGP
Subjt: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRGP
Query: PGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
PGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
Subjt: PGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRG
Query: GRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRS----------------RSRSRSPRGRS-------RSRSRSPRGRSRSPMDEA
GRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRS SP NRDSPRGRS RSRSRSPRGRS RSRSRSPRGRSRSPMDEA
Subjt: GRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRS----------------RSRSRSPRGRS-------RSRSRSPRGRSRSPMDEA
Query: EDFNGGGSRNYRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
EDFNGGGSRNYRKEENGYSRSPSPLPREERSPVND++ANGSPRGGS SA
Subjt: EDFNGGGSRNYRKEENGYSRSPSPLPREERSPVNDEDANGSPRGGSESA
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| Q13243 Serine/arginine-rich splicing factor 5 | 1.1e-19 | 36.17 | Show/hide |
Query: GTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGG---------SRESREYLGRGP
G R+++GRL+ R +D++ F YGR+RD+D+KR + FVEF DPRDADDA Y L+G+++ R+ +E A+ RG G SR R P
Subjt: GTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGG---------SRESREYLGRGP
Query: PGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGE------------RGHIE----------------KNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRG
P R N I + + D K+ + GE G +E K KL GS S S R RSR+RS SR
Subjt: PGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGE------------RGHIE----------------KNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRG
Query: RSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRGGRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRS
RS SRSRS RS RS RSRS + S SP P K+ KR + RS SP + D R RSRSRSRS
Subjt: RSYSRSRSPVKRDRSLERSEKRSRSPRGGRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRS
|
|
| Q16629 Serine/arginine-rich splicing factor 7 | 2.9e-20 | 40.53 | Show/hide |
Query: MPRYDDRYGG-TRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRD---YAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYL
M RY RYGG T++YVG L + +L+ FS YG +R V + R+ +AFVEF DPRDA+DA L+G+ + GSR+ VE++ G+PR SR R
Subjt: MPRYDDRYGG-TRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRD---YAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYL
Query: GRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGR--SRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKR
PP + D ++CY CGE+GH +C ++ + S SRS S RGR SRSRS SRGR SRS SP +R RS+ R
Subjt: GRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGR--SRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKR
Query: S---RSPRGGRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSP
S R R G + R+ SP S++ RS + RS RSPSP SP G R RS SP
Subjt: S---RSPRGGRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSP
|
|
| Q3T106 Serine/arginine-rich splicing factor 7 | 2.4e-19 | 40.61 | Show/hide |
Query: MPRYDDRYGG-TRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRD---YAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYL
M RY RYGG T++YVG L + +L+ FS YG +R V + R+ +AFVEF DPRDA+DA L+G+ + GSR+ VE++ G+PR SR R
Subjt: MPRYDDRYGG-TRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRD---YAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYL
Query: GRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGR--SRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKR
PP + D ++CY CGE+GH +C ++ + S SRS S RGR SRSRS SRGR SRS SP +R RS+ R
Subjt: GRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGR--SRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERSEKR
Query: SRSPRGGRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSP
S S R R + S S S++ RS + RS RSPSP SP G R RS SP
Subjt: SRSPRGGRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSP
|
|
| Q8VYA5 Serine/arginine-rich splicing factor RS2Z33 | 7.7e-74 | 63.03 | Show/hide |
Query: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRG-
MPRYDDRYG TRLYVGRLSSRTR+RDL+ LFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEF DPRDADDAR+ L+GRD GSRI VE ++G PRG SR++ RG
Subjt: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRG-
Query: PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKR-GSYSRSP----SPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERS-EK
PPG GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHIE+NC+NSPKKL+R GSYSRSP SPRR RS SRS SR RSYSRSRSPV+R ERS E+
Subjt: PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKR-GSYSRSP----SPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERS-EK
Query: RSRSPR--GGRLSPKRHSLSP-----PPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSP----RGRSRSRSRSP
RSRSP+ LSP+ SP K + SP P SP+ + S + SP+ R+ SP G S RSP
Subjt: RSRSPR--GGRLSPKRHSLSP-----PPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSP----RGRSRSRSRSP
|
|
| Q9FYB7 Serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32 | 3.5e-74 | 61.64 | Show/hide |
Query: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRG-
MPRYDDRYG TRLYVGRLSSRTR+RDL+ LFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARY L+GRD GSRI VE ++G PRG SR+ RG
Subjt: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRG-
Query: PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSP---KKLKRGSYSRSP----SPRRGR--SRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLE-
PPG+GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHIE+NC+NSP K + GSYSRSP SPRR R SRSRSYSRGRSYSRSRSPV+R++S+E
Subjt: PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSP---KKLKRGSYSRSP----SPRRGR--SRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLE-
Query: -----RSEKRSRSPRG--GRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSPRGRSRSRSR-SPRGRSRSP
++ +RS SP+G LSP R + P + +P SP G +SP G + + RSP SR SP+G S SP
Subjt: -----RSEKRSRSPRG--GRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSPRGRSRSRSR-SPRGRSRSP
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT2G37340.1 arginine/serine-rich zinc knuckle-containing protein 33 | 5.5e-75 | 63.03 | Show/hide |
Query: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRG-
MPRYDDRYG TRLYVGRLSSRTR+RDL+ LFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEF DPRDADDAR+ L+GRD GSRI VE ++G PRG SR++ RG
Subjt: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRG-
Query: PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKR-GSYSRSP----SPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERS-EK
PPG GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHIE+NC+NSPKKL+R GSYSRSP SPRR RS SRS SR RSYSRSRSPV+R ERS E+
Subjt: PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKR-GSYSRSP----SPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERS-EK
Query: RSRSPR--GGRLSPKRHSLSP-----PPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSP----RGRSRSRSRSP
RSRSP+ LSP+ SP K + SP P SP+ + S + SP+ R+ SP G S RSP
Subjt: RSRSPR--GGRLSPKRHSLSP-----PPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSP----RGRSRSRSRSP
|
|
| AT2G37340.2 arginine/serine-rich zinc knuckle-containing protein 33 | 9.8e-48 | 57.02 | Show/hide |
Query: EFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL
EF DPRDADDAR+ L+GRD GSRI VE ++G PRG SR++ RG PPG GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHIE+NC+NSPKKL
Subjt: EFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKL
Query: KR-GSYSRSP----SPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERS-EKRSRSPR--GGRLSPKRHSLSP-----PPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRS
+R GSYSRSP SPRR RS SRS SR RSYSRSRSPV+R ERS E+RSRSP+ LSP+ SP K + SP P SP+ +
Subjt: KR-GSYSRSP----SPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERS-EKRSRSPR--GGRLSPKRHSLSP-----PPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRS
Query: PSPGNRDSPRGRSRSRSRSP----RGRSRSRSRSP
S + SP+ R+ SP G S RSP
Subjt: PSPGNRDSPRGRSRSRSRSP----RGRSRSRSRSP
|
|
| AT2G37340.3 arginine/serine-rich zinc knuckle-containing protein 33 | 1.3e-52 | 58.44 | Show/hide |
Query: MKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKN
MKRDYAFVEF DPRDADDAR+ L+GRD GSRI VE ++G PRG SR++ RG PPG GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHIE+N
Subjt: MKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKN
Query: CQNSPKKLKR-GSYSRSP----SPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERS-EKRSRSPR--GGRLSPKRHSLSP-----PPSKAMKRSPTPDVR
C+NSPKKL+R GSYSRSP SPRR RS SRS SR RSYSRSRSPV+R ERS E+RSRSP+ LSP+ SP K + SP P
Subjt: CQNSPKKLKR-GSYSRSP----SPRRGRSRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLERS-EKRSRSPR--GGRLSPKRHSLSP-----PPSKAMKRSPTPDVR
Query: SPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSP----RGRSRSRSRSP
SP+ + S + SP+ R+ SP G S RSP
Subjt: SPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSP----RGRSRSRSRSP
|
|
| AT3G53500.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein with retrovirus zinc finger-like domain | 5.9e-53 | 56.97 | Show/hide |
Query: MKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKN
MKRDYAFVEFSDPRDADDARY L+GRD GSRI VE ++G PRG SR+ RG PPG+GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHIE+N
Subjt: MKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKN
Query: CQNSP---KKLKRGSYSRSP----SPRRGR--SRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLE------RSEKRSRSPRG--GRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPT
C+NSP K + GSYSRSP SPRR R SRSRSYSRGRSYSRSRSPV+R++S+E ++ +RS SP+G LSP R + P + +
Subjt: CQNSP---KKLKRGSYSRSP----SPRRGR--SRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLE------RSEKRSRSPRG--GRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPT
Query: PDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSPRGRSRSRSR-SPRGRSRSP
P SP G +SP G + + RSP SR SP+G S SP
Subjt: PDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSPRGRSRSRSR-SPRGRSRSP
|
|
| AT3G53500.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein with retrovirus zinc finger-like domain | 2.5e-75 | 61.64 | Show/hide |
Query: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRG-
MPRYDDRYG TRLYVGRLSSRTR+RDL+ LFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARY L+GRD GSRI VE ++G PRG SR+ RG
Subjt: MPRYDDRYGGTRLYVGRLSSRTRSRDLDDLFSRYGRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVHGSRIIVEIAKGVPRGPGGSRESREYLGRG-
Query: PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSP---KKLKRGSYSRSP----SPRRGR--SRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLE-
PPG+GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHIE+NC+NSP K + GSYSRSP SPRR R SRSRSYSRGRSYSRSRSPV+R++S+E
Subjt: PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSP---KKLKRGSYSRSP----SPRRGR--SRSRSYSRGRSYSRSRSPVKRDRSLE-
Query: -----RSEKRSRSPRG--GRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSPRGRSRSRSR-SPRGRSRSP
++ +RS SP+G LSP R + P + +P SP G +SP G + + RSP SR SP+G S SP
Subjt: -----RSEKRSRSPRG--GRLSPKRHSLSPPPSKAMKRSPTPDVRSPEEARRSPSPGNRDSPRGRSRSRSRSPRGRSRSRSR-SPRGRSRSP
|
|
