; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh04G003860 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh04G003860
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionRas-related protein Rab-1A
Genome locationCmo_Chr04:1909547..1911786
RNA-Seq ExpressionCmoCh04G003860
SyntenyCmoCh04G003860
Gene Ontology termsGO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0044679.1 Ras-related protein RABD2c [Cucumis melo var. makuwa]1.1e-10498.47Show/hide
Query:  NDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLN
        NDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLN
Subjt:  NDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLN

Query:  EIDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS
        EIDRYASENVNKLLVGNKCDLPN+ VSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMAS PANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS
Subjt:  EIDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS

XP_004146899.1 ras-related protein RABD2a [Cucumis sativus]7.1e-10498.46Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDLPN+ VSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMAS PANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS

XP_022141232.1 ras-related protein RABD2c-like [Momordica charantia]1.1e-10499.49Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMAS PANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS

XP_022943181.1 ras-related protein RABD2c-like [Cucurbita moschata]2.2e-105100Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS

XP_038906428.1 ras-related protein RABD2c-like [Benincasa hispida]2.4e-10498.97Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDLPN+VVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMAS PANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KUE5 Uncharacterized protein3.4e-10498.46Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDLPN+ VSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMAS PANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS

A0A5D3CYB3 Ras-related protein RABD2c5.3e-10598.47Show/hide
Query:  NDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLN
        NDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLN
Subjt:  NDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLN

Query:  EIDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS
        EIDRYASENVNKLLVGNKCDLPN+ VSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMAS PANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS
Subjt:  EIDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS

A0A6J1CJB0 ras-related protein RABD2c-like5.3e-10599.49Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMAS PANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS

A0A6J1FR03 ras-related protein RABD2c-like1.1e-105100Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS

A0A6J1JJU9 ras-related protein RABD2c-like1.1e-105100Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P28188 Ras-related protein RABD2a1.5e-9387.31Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRF+DDSY++SYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTD+ESF NVKQWL+E
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDL-PNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPA-NNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS
        IDRYAS+NVNKLLVGNK DL  N+ + YE+AKAFADE+GIPFMETSAKDATNVEQAFMAM+A IK RMAS PA NNARPPTVQ++GQPV QK GCCS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDL-PNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPA-NNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS

P40392 Ras-related protein RIC11.7e-9286.29Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYL+SYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+VYDVTDQESF NVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDL-PNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNA-RPPTVQLQGQPVNQKGGCCS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDL  N+VVSYE+ KA ADE+GIPF+ETSAKDATNVE+AFM M  +IKNRMAS PA NA +P TVQ++GQPV Q+  CCS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDL-PNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNA-RPPTVQLQGQPVNQKGGCCS

Q05737 GTP-binding protein YPTM21.0e-9288.83Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESF NVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDL-PNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLP-ANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS
        IDRYAS+NVNKLLVGNK DL  NKVV+ E+AKAFADE+GIPFMETSAK+ATNV+QAFMAM A IK+RMAS P A NARP TVQ++GQPVNQK  CCS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDL-PNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLP-ANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS

Q9FPJ4 Ras-related protein RABD2b4.5e-9387.76Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+ YDVTD ESF NVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPN-KVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS
        IDRYASENVNKLLVGNK DL + KVVS E+AKAFADE+GIPF+ETSAK+ATNVE+AFMAMTA IK RMAS PA  A+PPTVQ++GQPVNQ+ GCCS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPN-KVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS

Q9SEH3 Ras-related protein RABD2c4.1e-9487.76Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+ YDVTD ESF NVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPN-KVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDL + KVVS E+AKAFADE+GIPF+ETSAK+ATNVE+AFMAMTA IK RMAS PA  ++PPTVQ++GQPVNQ+ GCCS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPN-KVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02130.1 RAS 51.1e-9487.31Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRF+DDSY++SYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTD+ESF NVKQWL+E
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDL-PNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPA-NNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS
        IDRYAS+NVNKLLVGNK DL  N+ + YE+AKAFADE+GIPFMETSAKDATNVEQAFMAM+A IK RMAS PA NNARPPTVQ++GQPV QK GCCS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDL-PNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPA-NNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS

AT3G09900.1 RAB GTPase homolog E1E3.6e-6157.07Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
        DYL KLLLIGDSGVGKSCLLLRF+DD++  S+I+TIG+DFKIRTVE DGK IKLQIWDTAGQERFRTIT++YYRGA GI++VYDVTD+ SF N++ W+  
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDL--PNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNARPPTVQLQGQ--------PVNQK
        I+++AS++VNK+LVGNK D+    + V     +A ADE GI F ETSAK   NVEQ F+++  DIK R+       A P  +++  Q          N+K
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDL--PNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNARPPTVQLQGQ--------PVNQK

Query:  GGCCS
          CCS
Subjt:  GGCCS

AT3G11730.1 Ras-related small GTP-binding family protein8.4e-7974.24Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDS VGKSCLLLRFADD+Y+DSYISTIGVDFKIRT+EQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYD T+ ESF NVKQWL+E
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDL-PNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANN--ARPPTVQLQGQPVNQ-KGGCC
        IDRYA+E+V KLL+GNK D+  +KVVS E+ +A ADE+GIPF+ETSAKD+ NVEQAF+ +  +IK +M S    N  + P TVQ++GQP+ Q  GGCC
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDL-PNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANN--ARPPTVQLQGQPVNQ-KGGCC

AT4G17530.1 RAB GTPase homolog 1C2.9e-9587.76Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+ YDVTD ESF NVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPN-KVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS
        IDRYASENVNKLLVGNKCDL + KVVS E+AKAFADE+GIPF+ETSAK+ATNVE+AFMAMTA IK RMAS PA  ++PPTVQ++GQPVNQ+ GCCS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPN-KVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS

AT5G47200.1 RAB GTPase homolog 1A3.2e-9487.76Show/hide
Query:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE
        DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGII+ YDVTD ESF NVKQWLNE
Subjt:  DYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNE

Query:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPN-KVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS
        IDRYASENVNKLLVGNK DL + KVVS E+AKAFADE+GIPF+ETSAK+ATNVE+AFMAMTA IK RMAS PA  A+PPTVQ++GQPVNQ+ GCCS
Subjt:  IDRYASENVNKLLVGNKCDLPN-KVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTCATGATTGTAACTTTTAATGACTACTTGTTCAAGCTCTTGCTTATTGGGGACTCTGGAGTTGGCAAATCATGTCTTCTTTTGAGATTTGCTGATGACTCATATCT
GGATAGTTATATTAGTACCATTGGAGTTGATTTTAAAATACGCACTGTGGAGCAGGATGGAAAGACAATTAAACTCCAAATTTGGGATACTGCAGGACAGGAGCGTTTTA
GGACCATCACTAGTAGCTACTACCGCGGGGCACATGGCATTATAATTGTTTATGATGTAACAGACCAGGAGAGTTTTGAAAATGTTAAGCAATGGTTAAACGAAATTGAC
CGTTATGCAAGTGAAAACGTAAACAAGCTTCTAGTTGGCAATAAGTGTGATCTTCCTAATAAAGTAGTGTCCTATGAATCAGCAAAGGCTTTTGCTGATGAGGTTGGGAT
CCCATTTATGGAGACAAGTGCAAAAGATGCTACCAATGTAGAACAGGCATTTATGGCCATGACTGCTGACATTAAAAATAGGATGGCTAGTCTGCCTGCGAACAATGCGA
GGCCACCGACGGTGCAGCTACAGGGGCAACCCGTCAACCAGAAGGGTGGATGTTGTTCTTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTTCATGATTGTAACTTTTAATGACTACTTGTTCAAGCTCTTGCTTATTGGGGACTCTGGAGTTGGCAAATCATGTCTTCTTTTGAGATTTGCTGATGACTCATATCT
GGATAGTTATATTAGTACCATTGGAGTTGATTTTAAAATACGCACTGTGGAGCAGGATGGAAAGACAATTAAACTCCAAATTTGGGATACTGCAGGACAGGAGCGTTTTA
GGACCATCACTAGTAGCTACTACCGCGGGGCACATGGCATTATAATTGTTTATGATGTAACAGACCAGGAGAGTTTTGAAAATGTTAAGCAATGGTTAAACGAAATTGAC
CGTTATGCAAGTGAAAACGTAAACAAGCTTCTAGTTGGCAATAAGTGTGATCTTCCTAATAAAGTAGTGTCCTATGAATCAGCAAAGGCTTTTGCTGATGAGGTTGGGAT
CCCATTTATGGAGACAAGTGCAAAAGATGCTACCAATGTAGAACAGGCATTTATGGCCATGACTGCTGACATTAAAAATAGGATGGCTAGTCTGCCTGCGAACAATGCGA
GGCCACCGACGGTGCAGCTACAGGGGCAACCCGTCAACCAGAAGGGTGGATGTTGTTCTTAGTTGAGTTGGTTGTTTCTGCCATTGCAAGTGTGCATTGTGCACGTAATA
TCAAGTGCATTCGAATCTCTCTCTATAAAGTATCTGAAATCCCATTCATTTCAAATAGACCTTGAATTGTCACTCTATACCTTTCTGTATTATCAAAGCAGTAGTATTTC
CTTTTTCTTCTTTCCAATACTTGTTTTAAGCTGCCGTGTAGGGAACTTTTAGAGGTACAGTTCAAGCCATCTCTCAGTTTATTTGCCTCATTAATATTTGTTTGGAGAAT
GCTTGGATGCTTTATGTTTCTGACTTTAGATAGCAAATGGTAGAGCTTAAGAATGCTCAAATTTGTCTTATTTTTTGTGTTGATGGGTCATTTCATAGTTTTCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MFMIVTFNDYLFKLLLIGDSGVGKSCLLLRFADDSYLDSYISTIGVDFKIRTVEQDGKTIKLQIWDTAGQERFRTITSSYYRGAHGIIIVYDVTDQESFENVKQWLNEID
RYASENVNKLLVGNKCDLPNKVVSYESAKAFADEVGIPFMETSAKDATNVEQAFMAMTADIKNRMASLPANNARPPTVQLQGQPVNQKGGCCS