; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh04G004380 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh04G004380
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionMADS-box transcription factor ANR1
Genome locationCmo_Chr04:2179770..2180417
RNA-Seq ExpressionCmoCh04G004380
SyntenyCmoCh04G004380
Gene Ontology termsGO:0045944 - positive regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0000978 - RNA polymerase II proximal promoter sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR002100 - Transcription factor, MADS-box
IPR033896 - MADS MEF2-like
IPR036879 - Transcription factor, MADS-box superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
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XP_022941775.1 MADS-box transcription factor 23-like isoform X2 [Cucurbita moschata]7.9e-24100Show/hide
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XP_022991134.1 MADS-box transcription factor 23-like isoform X1 [Cucurbita maxima]7.9e-24100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
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A0A6J1FUQ5 MADS-box transcription factor 23-like isoform X23.8e-24100Show/hide
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A0A6J1JL93 MADS-box transcription factor 23-like isoform X23.8e-24100Show/hide
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A0A6J1JUI3 MADS-box transcription factor ANR1-like isoform X33.8e-24100Show/hide
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A0A6J1JVH1 MADS-box transcription factor 23-like isoform X13.8e-24100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2RVQ5 Agamous-like MADS-box protein AGL162.0e-2281.97Show/hide
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Q6EP49 MADS-box transcription factor 271.4e-2385.25Show/hide
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Q6Z6W2 MADS-box transcription factor 573.7e-2488.52Show/hide
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Q9SI38 MADS-box transcription factor ANR13.7e-2483.33Show/hide
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Q9SZJ6 Agamous-like MADS-box protein AGL213.5e-2281.97Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
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AT3G57230.1 AGAMOUS-like 161.4e-2381.97Show/hide
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AT3G57230.2 AGAMOUS-like 161.4e-2381.97Show/hide
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AT4G37940.1 AGAMOUS-like 212.5e-2381.97Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CCTTTGTGATGCCGAAGTTGGATTGATCGTTTTCTCAAGCACAGGAAAGCTCTATGATTATTCCACCACCAGTTTTATGAACTGGGTTTGCTTTGTTTTTTTTTTATACG
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTTCTAGAGAGAGAAAAGAGGGATTTCTAGAGAGAGAAAAGAGGGATTTCTAGAGAGAGAAAAGAGGGGTTTCTAGAGAGAGAAAAGAGGGTTTTATTGAGAGAGAAATA
GAAGAACACTTCTATTCTCCAGGAAAAAACCACAAGAAGAAAGAAGCAAATCCGCAGACCATGGAGCGGTAAAAAAATCCCATCTTTTTTGCCTCTTTTTTTAAGCAAAT
TTTCAAGTGTTCATCATTTTTTTCCAACATTTTTGGATTTTGAAGAGGGTTGTTGGGTTTTTTTTGGAGATTTGAGTGAAATTATTGAATAAAAAGTTGAGAAAAATTAG
AAGAAAAAAAAGGAATGGGAAGAGGGAAGATTGTGATAAGAAGAATAGACAATTCAACGAGCAGACAAGTGACGTTCTCAAAGAGAAGAAATGGATTGCTGAAGAAAGCT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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