; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh04G007290 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh04G007290
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionLong chain acyl-CoA synthetase 4-like protein
Genome locationCmo_Chr04:3631228..3632949
RNA-Seq ExpressionCmoCh04G007290
SyntenyCmoCh04G007290
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6600514.1 Nucleoside diphosphate kinase IV, chloroplastic/mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.3e-68100Show/hide
Query:  SLPSGVSTIVFSSDELSYHQEMAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKR
        SLPSGVSTIVFSSDELSYHQEMAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKR
Subjt:  SLPSGVSTIVFSSDELSYHQEMAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKR

Query:  RSNFQGNQFALATEVARTAAVAPIRPRAFNRRVPNWKKTR
        RSNFQGNQFALATEVARTAAVAPIRPRAFNRRVPNWKKTR
Subjt:  RSNFQGNQFALATEVARTAAVAPIRPRAFNRRVPNWKKTR

KAG7031152.1 hypothetical protein SDJN02_05192, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.2e-56100Show/hide
Query:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVARTAAV
        MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVARTAAV
Subjt:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVARTAAV

Query:  APIRPRAFNRRVPNWKKTR
        APIRPRAFNRRVPNWKKTR
Subjt:  APIRPRAFNRRVPNWKKTR

XP_022941743.1 uncharacterized protein LOC111447019 isoform X1 [Cucurbita moschata]2.2e-56100Show/hide
Query:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVARTAAV
        MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVARTAAV
Subjt:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVARTAAV

Query:  APIRPRAFNRRVPNWKKTR
        APIRPRAFNRRVPNWKKTR
Subjt:  APIRPRAFNRRVPNWKKTR

XP_022941746.1 uncharacterized protein LOC111447019 isoform X2 [Cucurbita moschata]2.2e-56100Show/hide
Query:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVARTAAV
        MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVARTAAV
Subjt:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVARTAAV

Query:  APIRPRAFNRRVPNWKKTR
        APIRPRAFNRRVPNWKKTR
Subjt:  APIRPRAFNRRVPNWKKTR

XP_023528285.1 uncharacterized protein LOC111791234 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.3e-5699.16Show/hide
Query:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVARTAAV
        MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTG+KGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVARTAAV
Subjt:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVARTAAV

Query:  APIRPRAFNRRVPNWKKTR
        APIRPRAFNRRVPNWKKTR
Subjt:  APIRPRAFNRRVPNWKKTR

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A5A7TPS5 Pentatricopeptide repeat (PPR) superfamily protein isoform 23.5e-5293.28Show/hide
Query:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVARTAAV
        MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRR PNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMD+R+SLRQGALA RRSNFQGNQFALATEVAR AAV
Subjt:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVARTAAV

Query:  APIRPRAFNRRVPNWKKTR
        APIRPRAF RR PNW KTR
Subjt:  APIRPRAFNRRVPNWKKTR

A0A6J1FLY6 uncharacterized protein LOC111447019 isoform X21.1e-56100Show/hide
Query:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVARTAAV
        MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVARTAAV
Subjt:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVARTAAV

Query:  APIRPRAFNRRVPNWKKTR
        APIRPRAFNRRVPNWKKTR
Subjt:  APIRPRAFNRRVPNWKKTR

A0A6J1FPB6 uncharacterized protein LOC111447019 isoform X11.1e-56100Show/hide
Query:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVARTAAV
        MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVARTAAV
Subjt:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVARTAAV

Query:  APIRPRAFNRRVPNWKKTR
        APIRPRAFNRRVPNWKKTR
Subjt:  APIRPRAFNRRVPNWKKTR

A0A6J1IXQ4 uncharacterized protein LOC111481570 isoform X23.8e-5496.64Show/hide
Query:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVARTAAV
        MA KPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGA AKRRSNFQGNQFALATEVAR AAV
Subjt:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVARTAAV

Query:  APIRPRAFNRRVPNWKKTR
        APIRPRAFNR VPNWKKTR
Subjt:  APIRPRAFNRRVPNWKKTR

A0A6J1J5N5 uncharacterized protein LOC111481570 isoform X13.8e-5496.64Show/hide
Query:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVARTAAV
        MA KPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGA AKRRSNFQGNQFALATEVAR AAV
Subjt:  MAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSKNTGNKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVARTAAV

Query:  APIRPRAFNRRVPNWKKTR
        APIRPRAFNR VPNWKKTR
Subjt:  APIRPRAFNRRVPNWKKTR

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G10970.1 unknown protein1.2e-2355.83Show/hide
Query:  KPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSK-NTG-NKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVARTAAVA
        KP+TTE +A+TEKKMDM+LD+IIKM K NT  NKG+KQR   NK +KF + A ++   K QR+MD+R+ +RQGA AK+RSNFQGNQF + T VAR AA A
Subjt:  KPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSK-NTG-NKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVARTAAVA

Query:  PIRPRAFN-RRVPNWKKTRY
          R R +N  R+ N  ++R+
Subjt:  PIRPRAFN-RRVPNWKKTRY

AT4G10970.2 unknown protein1.2e-2355.83Show/hide
Query:  KPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSK-NTG-NKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVARTAAVA
        KP+TTE +A+TEKKMDM+LD+IIKM K NT  NKG+KQR   NK +KF + A ++   K QR+MD+R+ +RQGA AK+RSNFQGNQF + T VAR AA A
Subjt:  KPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSK-NTG-NKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVARTAAVA

Query:  PIRPRAFN-RRVPNWKKTRY
          R R +N  R+ N  ++R+
Subjt:  PIRPRAFN-RRVPNWKKTRY

AT4G10970.3 unknown protein1.2e-2355.83Show/hide
Query:  KPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSK-NTG-NKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVARTAAVA
        KP+TTE +A+TEKKMDM+LD+IIKM K NT  NKG+KQR   NK +KF + A ++   K QR+MD+R+ +RQGA AK+RSNFQGNQF + T VAR AA A
Subjt:  KPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSK-NTG-NKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVARTAAVA

Query:  PIRPRAFN-RRVPNWKKTRY
          R R +N  R+ N  ++R+
Subjt:  PIRPRAFN-RRVPNWKKTRY

AT4G10970.4 unknown protein1.2e-2355.83Show/hide
Query:  KPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSK-NTG-NKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVARTAAVA
        KP+TTE +A+TEKKMDM+LD+IIKM K NT  NKG+KQR   NK +KF + A ++   K QR+MD+R+ +RQGA AK+RSNFQGNQF + T VAR AA A
Subjt:  KPLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMSK-NTG-NKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVARTAAVA

Query:  PIRPRAFN-RRVPNWKKTRY
          R R +N  R+ N  ++R+
Subjt:  PIRPRAFN-RRVPNWKKTRY

AT4G23910.1 unknown protein6.2e-1750Show/hide
Query:  PLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMS--KNTGNKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVAR---TAA
        PL  E IA+TEKK+ MALDDIIK++  K   NKG+K RR  NK Q F N A ++    ++  M++ +++RQGA+ KRRS FQG QF + T +AR   TAA
Subjt:  PLTTEAIAITEKKMDMALDDIIKMS--KNTGNKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVAR---TAA

Query:  VAPIRPRAFN
            R RAFN
Subjt:  VAPIRPRAFN


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGACTCCAAATCCCAATCAAACCTCCTTAATATTATTTCACTGAAACGACGTCGCTGCTTTCCCTATATATGCCCCCTCCTTTGCGTTGTTTCCCTTCCAAGTCT
CCAATTCCTTCCGCGTTCAGTAATCGACTCTACCGCGAAGCTCAGGGATCTTTCATCTCTTTCGTCGAGGAACTTCGGAAGTTCTCTGCCCTCTGGTGTTTCTACGATCG
TTTTCTCGAGCGACGAATTATCTTATCATCAAGAGATGGCGGCTAAACCACTTACTACTGAAGCAATTGCCATAACTGAGAAGAAGATGGACATGGCTTTAGACGACATT
ATCAAGATGTCCAAAAATACTGGAAATAAAGGAAGGAAGCAAAGAAGGTTTCCGAACAAAATGCAGAAATTTCCAAATAACGCCACTCAGGATAGACCTAGGAAGTTGCA
GCGATTCATGGACGCTAGAACCTCTCTAAGACAGGGGGCTTTGGCCAAAAGGAGGTCAAATTTTCAAGGGAATCAGTTTGCATTGGCAACCGAGGTTGCAAGAACGGCTG
CAGTTGCTCCTATTCGGCCTAGAGCCTTTAACCGTAGGGTGCCCAATTGGAAGAAGACAAGGTATTGTCTGTGCTTATTGTTAGTAAATTGCGTTTATGAAAAATTGGTG
ACTTCTACAATGTCCATCAAGTTTTACTATATGAAGTTAGCGCAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCGGACTCCAAATCCCAATCAAACCTCCTTAATATTATTTCACTGAAACGACGTCGCTGCTTTCCCTATATATGCCCCCTCCTTTGCGTTGTTTCCCTTCCAAGTCT
CCAATTCCTTCCGCGTTCAGTAATCGACTCTACCGCGAAGCTCAGGGATCTTTCATCTCTTTCGTCGAGGAACTTCGGAAGTTCTCTGCCCTCTGGTGTTTCTACGATCG
TTTTCTCGAGCGACGAATTATCTTATCATCAAGAGATGGCGGCTAAACCACTTACTACTGAAGCAATTGCCATAACTGAGAAGAAGATGGACATGGCTTTAGACGACATT
ATCAAGATGTCCAAAAATACTGGAAATAAAGGAAGGAAGCAAAGAAGGTTTCCGAACAAAATGCAGAAATTTCCAAATAACGCCACTCAGGATAGACCTAGGAAGTTGCA
GCGATTCATGGACGCTAGAACCTCTCTAAGACAGGGGGCTTTGGCCAAAAGGAGGTCAAATTTTCAAGGGAATCAGTTTGCATTGGCAACCGAGGTTGCAAGAACGGCTG
CAGTTGCTCCTATTCGGCCTAGAGCCTTTAACCGTAGGGTGCCCAATTGGAAGAAGACAAGGTATTGTCTGTGCTTATTGTTAGTAAATTGCGTTTATGAAAAATTGGTG
ACTTCTACAATGTCCATCAAGTTTTACTATATGAAGTTAGCGCAGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MADSKSQSNLLNIISLKRRRCFPYICPLLCVVSLPSLQFLPRSVIDSTAKLRDLSSLSSRNFGSSLPSGVSTIVFSSDELSYHQEMAAKPLTTEAIAITEKKMDMALDDI
IKMSKNTGNKGRKQRRFPNKMQKFPNNATQDRPRKLQRFMDARTSLRQGALAKRRSNFQGNQFALATEVARTAAVAPIRPRAFNRRVPNWKKTRYCLCLLLVNCVYEKLV
TSTMSIKFYYMKLAQ