; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh04G008620 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh04G008620
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionSuccinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial
Genome locationCmo_Chr04:4306193..4307232
RNA-Seq ExpressionCmoCh04G008620
SyntenyCmoCh04G008620
Gene Ontology termsGO:0006099 - tricarboxylic acid cycle (biological process)
GO:0022904 - respiratory electron transport chain (biological process)
GO:0005743 - mitochondrial inner membrane (cellular component)
GO:0045273 - respiratory chain complex II (cellular component)
GO:0051539 - 4 iron, 4 sulfur cluster binding (molecular function)
GO:0051538 - 3 iron, 4 sulfur cluster binding (molecular function)
GO:0051537 - 2 iron, 2 sulfur cluster binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
GO:0009055 - electron transfer activity (molecular function)
GO:0008177 - succinate dehydrogenase (ubiquinone) activity (molecular function)
InterPro domainsIPR036010 - 2Fe-2S ferredoxin-like superfamily
IPR025192 - Succinate dehydogenase/fumarate reductase N-terminal
IPR017900 - 4Fe-4S ferredoxin, iron-sulphur binding, conserved site
IPR017896 - 4Fe-4S ferredoxin-type, iron-sulphur binding domain
IPR012675 - Beta-grasp domain superfamily
IPR009051 - Alpha-helical ferredoxin
IPR006058 - 2Fe-2S ferredoxin, iron-sulphur binding site
IPR004489 - Succinate dehydrogenase/fumarate reductase iron-sulphur protein
IPR001041 - 2Fe-2S ferredoxin-type iron-sulfur binding domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6600633.1 Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit 3, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.8e-16797.57Show/hide
Query:  MLRTWFRNAYSKAVPKPAANQKFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSY
        MLRTWFRNAY+KAVPKPAANQ+F VLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCG+MVLDALQKIKAEEDSSLSY
Subjt:  MLRTWFRNAYSKAVPKPAANQKFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSY

Query:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA
        RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA
Subjt:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA

Query:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAEDETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSRDNN
        CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEF+KERLQAIAED+TKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLS+DNN
Subjt:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAEDETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSRDNN

KAG7031269.1 Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit 3, mitochondrial, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.4e-16897.92Show/hide
Query:  MLRTWFRNAYSKAVPKPAANQKFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSY
        MLRTWFRNAY+KAVPKPAANQ+FGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCG+MVLDALQKIKAEEDSSLSY
Subjt:  MLRTWFRNAYSKAVPKPAANQKFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSY

Query:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA
        RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA
Subjt:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA

Query:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAEDETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSRDNN
        CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEF+KERLQAIAED+TKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLS+DNN
Subjt:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAEDETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSRDNN

XP_022942066.1 succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit 3, mitochondrial [Cucurbita moschata]2.1e-170100Show/hide
Query:  MLRTWFRNAYSKAVPKPAANQKFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSY
        MLRTWFRNAYSKAVPKPAANQKFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSY
Subjt:  MLRTWFRNAYSKAVPKPAANQKFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSY

Query:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA
        RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA
Subjt:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA

Query:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAEDETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSRDNN
        CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAEDETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSRDNN
Subjt:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAEDETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSRDNN

XP_022982204.1 succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit 3, mitochondrial [Cucurbita maxima]3.8e-16797.57Show/hide
Query:  MLRTWFRNAYSKAVPKPAANQKFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSY
        MLRTWFRNAY+KAVPKPA NQKFGVLDGHPAAQQHAQEA+EAHT FKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSY
Subjt:  MLRTWFRNAYSKAVPKPAANQKFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSY

Query:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA
        RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA
Subjt:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA

Query:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAEDETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSRDNN
        CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEF+KERLQAIAED+TKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLS+DNN
Subjt:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAEDETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSRDNN

XP_023528748.1 succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit 3, mitochondrial [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.7e-16797.57Show/hide
Query:  MLRTWFRNAYSKAVPKPAANQKFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSY
        MLRTWFRNAY+KA+PKP ANQKFG+LDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSY
Subjt:  MLRTWFRNAYSKAVPKPAANQKFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSY

Query:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA
        RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA
Subjt:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA

Query:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAEDETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSRDNN
        CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEF+KERLQAIAED+TKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLS+DNN
Subjt:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAEDETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSRDNN

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BY85 Iron-sulfur subunit of complex II4.2e-14081.51Show/hide
Query:  MLRTWFRNAYSKAVPKPAANQKFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKS-----NQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEED
        ML++WFR+AY+K      + Q+FGVL+ HP A+QHA+EAMEAH + KS     NQKEF++YRW+P++PNHKPFL SFF+DLSKCG MVLDALQ IKAE+D
Subjt:  MLRTWFRNAYSKAVPKPAANQKFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKS-----NQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEED

Query:  SSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYE
        SSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPID DTSKPTIITPLPHM+VIKDL VDLTNFYQQYKSIEPWLKT+R  + GREFRQ+PAER+KLDGLYE
Subjt:  SSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYE

Query:  CILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAEDETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSRDN
        CILCACCSASCPPYWWNPEEF+GPAALLHA RWISDSRDEFKKERLQAIAED+TKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPS AIH+MKAMHL+ R N
Subjt:  CILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAEDETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSRDN

A0A5A7TNF4 Iron-sulfur subunit of complex II4.2e-14081.51Show/hide
Query:  MLRTWFRNAYSKAVPKPAANQKFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKS-----NQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEED
        ML++WFR+AY+K      + Q+FGVL+ HP A+QHA+EAMEAH + KS     NQKEF++YRW+P++PNHKPFL SFF+DLSKCG MVLDALQ IKAE+D
Subjt:  MLRTWFRNAYSKAVPKPAANQKFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKS-----NQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEED

Query:  SSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYE
        SSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPID DTSKPTIITPLPHM+VIKDL VDLTNFYQQYKSIEPWLKT+R  + GREFRQ+PAER+KLDGLYE
Subjt:  SSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYE

Query:  CILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAEDETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSRDN
        CILCACCSASCPPYWWNPEEF+GPAALLHA RWISDSRDEFKKERLQAIAED+TKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPS AIH+MKAMHL+ R N
Subjt:  CILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAEDETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSRDN

A0A5A7TT90 Iron-sulfur subunit of complex II2.1e-13981.16Show/hide
Query:  MLRTWFRNAYSKAVPKPAANQKFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKS-----NQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEED
        ML+ WFR+AY+K      + ++FGVL+ HP A+QHA+EAMEAH + KS     NQKEF++YRW+P++PNHKPFL SFF+DLSKCG MVLDALQ IKAE+D
Subjt:  MLRTWFRNAYSKAVPKPAANQKFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKS-----NQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEED

Query:  SSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYE
        SSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPID DTSKPTIITPLPHM+VIKDL VDLTNFYQQYKSIEPWLKT+R  + GREFRQ+PAER+KLDGLYE
Subjt:  SSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYE

Query:  CILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAEDETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSRDN
        CILCACCS SCPPYWWNPEEFLGPAALLHA RWISDSRDEFK+ERLQAIAEDETKLYRCRTV+NCTA CPKSLDPS AIHHMKAMHL+SR N
Subjt:  CILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAEDETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSRDN

A0A6J1FMU7 Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial1.0e-170100Show/hide
Query:  MLRTWFRNAYSKAVPKPAANQKFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSY
        MLRTWFRNAYSKAVPKPAANQKFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSY
Subjt:  MLRTWFRNAYSKAVPKPAANQKFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSY

Query:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA
        RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA
Subjt:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA

Query:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAEDETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSRDNN
        CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAEDETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSRDNN
Subjt:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAEDETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSRDNN

A0A6J1J3X0 Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial1.8e-16797.57Show/hide
Query:  MLRTWFRNAYSKAVPKPAANQKFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSY
        MLRTWFRNAY+KAVPKPA NQKFGVLDGHPAAQQHAQEA+EAHT FKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSY
Subjt:  MLRTWFRNAYSKAVPKPAANQKFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSY

Query:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA
        RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA
Subjt:  RRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCA

Query:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAEDETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSRDNN
        CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEF+KERLQAIAED+TKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLS+DNN
Subjt:  CCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAEDETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSRDNN

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6H4G3 Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit 2, mitochondrial5.4e-10060.55Show/hide
Query:  ANQKFGVLDGHPAAQQHAQEAME---------------------AHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSS
        A+  F  L GHPAA+ +A++A E                     A +   S  KEFRVYRWSP+ P+ +P LQS+ +DL+ CG MVLD LQKIKAE D++
Subjt:  ANQKFGVLDGHPAAQQHAQEAME---------------------AHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSS

Query:  LSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPK-DGREFRQSPAERRKLDGLYEC
        L++RRSCREGICGSC+M IDG NTVACL+P+DTDTS  T +TPLPHM+V++DL VDLT+FYQQYKS+EPWLK K   K +  E  QSP ER++LDGLYEC
Subjt:  LSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPK-DGREFRQSPAERRKLDGLYEC

Query:  ILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAEDETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSR
        ILCACCSA+CP YWWN E FLGPAALLHA RW+SDSRDE+  ER+QA+AE   KLYRCR +++CTA CPKSLDP+ AI  MK +H L +
Subjt:  ILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAEDETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSR

Q8LB02 Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit 2, mitochondrial3.4e-8667.1Show/hide
Query:  KEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDL
        K F++YRW+P++P  KP LQ + IDL  CG MVLDAL KIK E D SL++RRSCREGICGSCAMNIDG N +ACL  I++  SK T ITPLPHMFVIKDL
Subjt:  KEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDL

Query:  AVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKR-LPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAEDET
         VD+TNFY QYKSIEPWLK K      G+E  QS  +R KLDG+YECILCACCS SCP YWWNPE +LGPAALLHA RWISDSRDE+ KERL+AI +DE 
Subjt:  AVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKR-LPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAEDET

Query:  KLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAM
        KLYRC T+ NC   CPK L+P   I H+K +
Subjt:  KLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAM

Q8LBZ7 Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit 1, mitochondrial7.5e-8666.24Show/hide
Query:  SNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVI
        SN K F++YRW+P++P  KP LQ++ IDL  CG MVLDAL KIK E D SL++RRSCREGICGSCAMNIDG N +ACL  I  + S+ T ITPLPHMFVI
Subjt:  SNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVI

Query:  KDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKR-LPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAE
        KDL VD+TNFY QYKSIEPWLK K       +E  QS  +R KLDG+YECILCACCS SCP YWWNPE +LGPAALLHA RWISDSRDE+ KERL+AI +
Subjt:  KDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKR-LPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAE

Query:  DETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAM
        DE KLYRC T+ NC   CPK L+P   I H+K +
Subjt:  DETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAM

Q9FJP9 Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit 3, mitochondrial2.0e-11572.12Show/hide
Query:  FGVLDGHPAAQQHAQEAMEAH--TKFKSNQ-----KEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSYRRSCREGICGSCAMN
        F +L+GH AAQ  +++ +++   TK K  Q     KEF++YRW+P+ PN KPFLQSFF+DLS CG MVLD LQKIKAE+D+SLSYRRSCREGICGSC+MN
Subjt:  FGVLDGHPAAQQHAQEAMEAH--TKFKSNQ-----KEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSYRRSCREGICGSCAMN

Query:  IDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEE
        IDG NTVACLKPI+ +TSKPTIITPLPHM+VIKDL VDLTNFYQQYKS+EPWLKT++ PKDGRE RQSP +R+KLDGLYECILCACC+ SCP YWWNPEE
Subjt:  IDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEE

Query:  FLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAEDETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLS
        F GPAALL A RWISDSRDE+++ERLQAI E ETK+YRCR ++NCTA CPK L+P+ AI  MK+ HLLS
Subjt:  FLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAEDETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLS

Q9S827 Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit 1, mitochondrial4.0e-8763.75Show/hide
Query:  TKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPH
        +K  +N K F +YRW P+ P+ KP L+ + +DLS CG MVLD L KIK E+D SL++RRSCREGICGSCAMNIDG N +ACL  I + +S  T I+PLPH
Subjt:  TKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPH

Query:  MFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRL-PKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQ
        MFVIKDL VD+TNFY QYKS+EPWLK K   P+ G+E  Q+ A+R KLDG+YECILCACCS SCP YWWNPEE+LGPAALLHA RWI DSRD+F KERL 
Subjt:  MFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRL-PKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQ

Query:  AIAEDETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHL
        +I  DE KLYRC T++NCT  CPK L+P+  I  +K + L
Subjt:  AIAEDETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G27380.1 succinate dehydrogenase 2-15.4e-8766.24Show/hide
Query:  SNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVI
        SN K F++YRW+P++P  KP LQ++ IDL  CG MVLDAL KIK E D SL++RRSCREGICGSCAMNIDG N +ACL  I  + S+ T ITPLPHMFVI
Subjt:  SNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVI

Query:  KDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKR-LPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAE
        KDL VD+TNFY QYKSIEPWLK K       +E  QS  +R KLDG+YECILCACCS SCP YWWNPE +LGPAALLHA RWISDSRDE+ KERL+AI +
Subjt:  KDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKR-LPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAE

Query:  DETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAM
        DE KLYRC T+ NC   CPK L+P   I H+K +
Subjt:  DETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAM

AT3G27380.2 succinate dehydrogenase 2-15.4e-8766.24Show/hide
Query:  SNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVI
        SN K F++YRW+P++P  KP LQ++ IDL  CG MVLDAL KIK E D SL++RRSCREGICGSCAMNIDG N +ACL  I  + S+ T ITPLPHMFVI
Subjt:  SNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVI

Query:  KDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKR-LPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAE
        KDL VD+TNFY QYKSIEPWLK K       +E  QS  +R KLDG+YECILCACCS SCP YWWNPE +LGPAALLHA RWISDSRDE+ KERL+AI +
Subjt:  KDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKR-LPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAE

Query:  DETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAM
        DE KLYRC T+ NC   CPK L+P   I H+K +
Subjt:  DETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAM

AT5G40650.1 succinate dehydrogenase 2-22.4e-8767.1Show/hide
Query:  KEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDL
        K F++YRW+P++P  KP LQ + IDL  CG MVLDAL KIK E D SL++RRSCREGICGSCAMNIDG N +ACL  I++  SK T ITPLPHMFVIKDL
Subjt:  KEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSYRRSCREGICGSCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDL

Query:  AVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKR-LPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAEDET
         VD+TNFY QYKSIEPWLK K      G+E  QS  +R KLDG+YECILCACCS SCP YWWNPE +LGPAALLHA RWISDSRDE+ KERL+AI +DE 
Subjt:  AVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKR-LPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAEDET

Query:  KLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAM
        KLYRC T+ NC   CPK L+P   I H+K +
Subjt:  KLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAM

AT5G65165.1 succinate dehydrogenase 2-31.4e-11672.12Show/hide
Query:  FGVLDGHPAAQQHAQEAMEAH--TKFKSNQ-----KEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSYRRSCREGICGSCAMN
        F +L+GH AAQ  +++ +++   TK K  Q     KEF++YRW+P+ PN KPFLQSFF+DLS CG MVLD LQKIKAE+D+SLSYRRSCREGICGSC+MN
Subjt:  FGVLDGHPAAQQHAQEAMEAH--TKFKSNQ-----KEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSYRRSCREGICGSCAMN

Query:  IDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEE
        IDG NTVACLKPI+ +TSKPTIITPLPHM+VIKDL VDLTNFYQQYKS+EPWLKT++ PKDGRE RQSP +R+KLDGLYECILCACC+ SCP YWWNPEE
Subjt:  IDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEE

Query:  FLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAEDETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLS
        F GPAALL A RWISDSRDE+++ERLQAI E ETK+YRCR ++NCTA CPK L+P+ AI  MK+ HLLS
Subjt:  FLGPAALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAEDETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTACGAACCTGGTTCCGCAATGCCTACAGCAAGGCCGTCCCTAAGCCGGCGGCAAACCAGAAGTTTGGAGTACTGGACGGCCATCCTGCGGCTCAGCAACATGCACA
AGAAGCCATGGAAGCCCATACCAAATTTAAATCCAATCAAAAGGAGTTCAGAGTGTATCGGTGGAGTCCTGAGCACCCCAACCACAAGCCTTTCCTTCAGTCTTTCTTCA
TTGATCTCTCTAAATGTGGCTCAATGGTATTGGATGCGTTACAGAAGATAAAAGCAGAGGAAGACTCAAGCTTGAGCTACAGAAGGTCTTGTAGGGAAGGTATATGCGGA
TCATGTGCTATGAACATCGATGGAGCCAACACTGTGGCTTGCCTCAAACCTATTGATACTGACACTTCCAAACCCACCATTATAACGCCCCTTCCCCATATGTTTGTCAT
CAAGGATCTTGCTGTTGATCTCACCAATTTCTATCAGCAATACAAGTCGATCGAGCCATGGTTGAAGACCAAAAGGTTGCCGAAGGATGGGCGAGAGTTCAGGCAATCAC
CAGCGGAAAGGAGGAAGCTGGATGGGTTGTATGAGTGTATTCTGTGCGCTTGTTGCAGTGCTTCATGCCCTCCATATTGGTGGAATCCAGAGGAGTTTCTTGGCCCTGCT
GCCTTGCTCCATGCCTGTCGATGGATCTCTGATAGTCGAGATGAGTTCAAGAAGGAACGACTGCAAGCAATAGCTGAAGACGAGACGAAGCTGTATAGATGTAGAACTGT
ACAGAATTGCACAGCCAACTGCCCCAAAAGCCTCGATCCTTCCGGTGCCATTCACCACATGAAGGCTATGCATTTGCTCTCAAGGGACAACAATTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ACCAAATTCACAAAGGAGAGAGTATGTTACGAACCTGGTTCCGCAATGCCTACAGCAAGGCCGTCCCTAAGCCGGCGGCAAACCAGAAGTTTGGAGTACTGGACGGCCAT
CCTGCGGCTCAGCAACATGCACAAGAAGCCATGGAAGCCCATACCAAATTTAAATCCAATCAAAAGGAGTTCAGAGTGTATCGGTGGAGTCCTGAGCACCCCAACCACAA
GCCTTTCCTTCAGTCTTTCTTCATTGATCTCTCTAAATGTGGCTCAATGGTATTGGATGCGTTACAGAAGATAAAAGCAGAGGAAGACTCAAGCTTGAGCTACAGAAGGT
CTTGTAGGGAAGGTATATGCGGATCATGTGCTATGAACATCGATGGAGCCAACACTGTGGCTTGCCTCAAACCTATTGATACTGACACTTCCAAACCCACCATTATAACG
CCCCTTCCCCATATGTTTGTCATCAAGGATCTTGCTGTTGATCTCACCAATTTCTATCAGCAATACAAGTCGATCGAGCCATGGTTGAAGACCAAAAGGTTGCCGAAGGA
TGGGCGAGAGTTCAGGCAATCACCAGCGGAAAGGAGGAAGCTGGATGGGTTGTATGAGTGTATTCTGTGCGCTTGTTGCAGTGCTTCATGCCCTCCATATTGGTGGAATC
CAGAGGAGTTTCTTGGCCCTGCTGCCTTGCTCCATGCCTGTCGATGGATCTCTGATAGTCGAGATGAGTTCAAGAAGGAACGACTGCAAGCAATAGCTGAAGACGAGACG
AAGCTGTATAGATGTAGAACTGTACAGAATTGCACAGCCAACTGCCCCAAAAGCCTCGATCCTTCCGGTGCCATTCACCACATGAAGGCTATGCATTTGCTCTCAAGGGA
CAACAATTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLRTWFRNAYSKAVPKPAANQKFGVLDGHPAAQQHAQEAMEAHTKFKSNQKEFRVYRWSPEHPNHKPFLQSFFIDLSKCGSMVLDALQKIKAEEDSSLSYRRSCREGICG
SCAMNIDGANTVACLKPIDTDTSKPTIITPLPHMFVIKDLAVDLTNFYQQYKSIEPWLKTKRLPKDGREFRQSPAERRKLDGLYECILCACCSASCPPYWWNPEEFLGPA
ALLHACRWISDSRDEFKKERLQAIAEDETKLYRCRTVQNCTANCPKSLDPSGAIHHMKAMHLLSRDNN