; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh04G009190 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh04G009190
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionZinc finger, Dof-type
Genome locationCmo_Chr04:4620710..4621672
RNA-Seq ExpressionCmoCh04G009190
SyntenyCmoCh04G009190
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR003851 - Zinc finger, Dof-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6600685.1 Dof zinc finger protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.3e-18098.44Show/hide
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XP_022136484.1 dof zinc finger protein DOF5.7 [Momordica charantia]7.8e-6553.33Show/hide
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XP_022942698.1 dof zinc finger protein DOF5.7 [Cucurbita moschata]1.2e-182100Show/hide
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XP_022991832.1 dof zinc finger protein DOF5.7 [Cucurbita maxima]1.9e-17296.56Show/hide
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XP_023545577.1 dof zinc finger protein DOF5.7-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.6e-17188.45Show/hide
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         TTEWFFGNNSYDDR N HHQVSATNSAG NGWNHTNNNNGVQAWEDLHHFTALP
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1C4F1 dof zinc finger protein DOF5.73.8e-6553.33Show/hide
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        +  +    + D   F F A +S S DFQL                P TP  ++ +MGLNY        ++  N    +Q H NT  +LASSI+SLSSLNQ
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        DLH KLQQ RL MIFG  D  Q + Q  KLLQPILF NLE PK Q+   N+    T        STTG++ ATTEWFFG+     R+N         S  
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        G+GW   NN++G+QA   WED LHH+TALP
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A0A6J1EN47 dof zinc finger protein DOF5.7-like7.2e-6450.46Show/hide
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                    F  GISPSIDF   G        S   LFP    +   T  P        N+  +  +N N N            LASSI+SLS LNQ
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        DLH KLQQ RL MIFGDH      DQN K LQPI F NLEPPKQ++ FN + PR  S  A+ TG    T TEW FGNN   D ++HHHQ+S T+      
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          +AGG+G+NH   NNGV+A W+DL HFT
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A0A6J1FVF9 dof zinc finger protein DOF5.75.9e-183100Show/hide
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A0A6J1JBH6 dof zinc finger protein DOF5.7-like1.1e-6450.91Show/hide
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        M+   Q+ I+QN   +             + Q PLKCPRC+STNTKFCYYNNY LTQPRHFCKTCRRYWTKGGALRN+PIGGGCRK KKLKSSSS+S+  
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                      F  GISPSIDF   G  G     S   L  T  T       +   TN+  +  +N N N            LASSI+SLS LNQDL
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        H +LQQ RL MIFGDH      DQN K+LQPI F NLE PKQ++ F+ + PR   T +AAA+ T     TTEW FGNN   D ++HHHQ+S T+++    
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        GGN      NNNGV+A WEDL HFTALP
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A0A6J1JMZ5 dof zinc finger protein DOF5.79.4e-17396.56Show/hide
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        NSK LPSGDTPAFRFFAGISPSIDFQLNG LGVGLSSSSPQLFPTTPTTNHPYMGLNYDTNFPLIHHHNT+SNLNLQPHYNTNTTLASSIQSLSSLNQDL
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        HSKLQQHRLAMIFGDHDHVQNKDQNHKLLQPILFHNLEPPKQDSCFNIHDPRTQSA ASTTGEDA  TEWFFGNNSYDDRHN HHQVSATNSAGGNGWNH
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6Z345 Dof zinc finger protein 43.6e-2853.85Show/hide
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        + +KCPRC+STNTKFCYYNNY L+QPRHFCK+CRRYWTKGG LRNVP+GGGCRKTK+  SSS++SS+ ++    + +    R  +  SP      +GG G
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Query:  VGLSSSSPQLFPTTPTT
            +++    PTTP T
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Q8L9V6 Dof zinc finger protein DOF1.12.6e-2644.57Show/hide
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        PLKCPRCDS+NTKFCYYNNY LTQPRHFCK CRRYWT+GGALRNVP+GGGCR+  K      LKSSSSS   SSS N++   SG       F       +
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            GG+G+ L++++           H        ++   +H  NT++ +    H N N       L +S+ SLS
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Q94AR6 Dof zinc finger protein DOF3.11.3e-2566.67Show/hide
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        +T  +   +QQQ Q  +Q+ LKCPRCDS NTKFCYYNNY L+QPRHFCK+CRRYWTKGGALRNVP+GGG RK    +S+SSSSS+++
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Q9FM03 Dof zinc finger protein DOF5.66.7e-2736.05Show/hide
Query:  PLKCPRCDSTNTKFCYYNNYCLTQPRHFCKTCRRYWTKGGALRNVPIGGGCRKTKKLKSSSSSSSSNNSKLLPSGDTPA---------------------
        P KCPRC+ST+TKFCYYNNY L+QPR+FCKTCRRYWTKGG LRN+P+GGGCRK KK  SS+SSSS+++ K  PS    A                     
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Query:  FRFFAGISPSIDFQLNGGLGV------GLSSSSPQ-------LFPTTPTTNHPYMGLNYDTNFPLIHHHNTNSNLNLQPHYNTNTTLASSIQSLSSLNQD
        F  F G+  S     +G +G       GL S SP+        F      N   + +N+ +N    HHHN +  LN     N N         +S+    
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Query:  LHSKLQQ----HRLAMIFGDHDHVQNKDQNHKLLQPILFHNLEPP------KQDSCFN
            L       RL +   DH H  N  ++H+ +  I+     P       +QD C++
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Q9LSL6 Dof zinc finger protein DOF5.72.3e-4341.18Show/hide
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        SGT++TK   ++     Q QQ LKCPRC+S NTKFCYYNNY L+QPRHFCK+CRRYWT+GGALRNVPIGGGCRKTKK +K +SS     SSS++ +   S
Subjt:  SGTTRTKSSSNTKQQQTQQQQPLKCPRCDSTNTKFCYYNNYCLTQPRHFCKTCRRYWTKGGALRNVPIGGGCRKTKK-LKSSSS----SSSSNNSKLLPS

Query:  GDTPAFRFFAGISPSIDFQLNGGLGVGLSSSSPQLFPTTPTTNHPYMG-------LNYDTNFPLI---HHHNTNSNLNLQPHYNTNTTLASSIQSLSSLN
            + +FF     ++DFQL  GL +   +    L         P M        ++  +   L+     +N +S         ++  LASSI++LS LN
Subjt:  GDTPAFRFFAGISPSIDFQLNGGLGVGLSSSSPQLFPTTPTTNHPYMG-------LNYDTNFPLI---HHHNTNSNLNLQPHYNTNTTLASSIQSLSSLN

Query:  QDLHSKLQQHRLAMIFGDHDHVQNKDQNHKLLQPILFHNLEPPKQDSCFNIHDPRTQSAAASTTGEDAATTEWFFGNNSYDDRHNHHHQVSATNSAGGNG
        QDLH +LQQ R+AM+FG+    + +    +  QPIL+ NLE                S+ +S T +    TEW+FGNNS ++    +   +A    GG+ 
Subjt:  QDLHSKLQQHRLAMIFGDHDHVQNKDQNHKLLQPILFHNLEPPKQDSCFNIHDPRTQSAAASTTGEDAATTEWFFGNNSYDDRHNHHHQVSATNSAGGNG

Query:  WNHTNNNNGVQAWEDLHHFTALP
        W     NNG+QAW DL+H+ ALP
Subjt:  WNHTNNNNGVQAWEDLHHFTALP

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G07640.1 Dof-type zinc finger DNA-binding family protein1.8e-2744.57Show/hide
Query:  PLKCPRCDSTNTKFCYYNNYCLTQPRHFCKTCRRYWTKGGALRNVPIGGGCRKTKK------LKSSSSS---SSSNNSKLLPSGDTPAFRFFAGISPSID
        PLKCPRCDS+NTKFCYYNNY LTQPRHFCK CRRYWT+GGALRNVP+GGGCR+  K      LKSSSSS   SSS N++   SG       F       +
Subjt:  PLKCPRCDSTNTKFCYYNNYCLTQPRHFCKTCRRYWTKGGALRNVPIGGGCRKTKK------LKSSSSS---SSSNNSKLLPSGDTPAFRFFAGISPSID

Query:  FQLNGGLGVGLSSSSPQLFPTTPTTNHPYMGLNYDTNFPLIHHHNTNSNLNLQPHYNTN-----TTLASSIQSLS
            GG+G+ L++++           H        ++   +H  NT++ +    H N N       L +S+ SLS
Subjt:  FQLNGGLGVGLSSSSPQLFPTTPTTNHPYMGLNYDTNFPLIHHHNTNSNLNLQPHYNTN-----TTLASSIQSLS

AT1G07640.2 Dof-type zinc finger DNA-binding family protein1.8e-2744.57Show/hide
Query:  PLKCPRCDSTNTKFCYYNNYCLTQPRHFCKTCRRYWTKGGALRNVPIGGGCRKTKK------LKSSSSS---SSSNNSKLLPSGDTPAFRFFAGISPSID
        PLKCPRCDS+NTKFCYYNNY LTQPRHFCK CRRYWT+GGALRNVP+GGGCR+  K      LKSSSSS   SSS N++   SG       F       +
Subjt:  PLKCPRCDSTNTKFCYYNNYCLTQPRHFCKTCRRYWTKGGALRNVPIGGGCRKTKK------LKSSSSS---SSSNNSKLLPSGDTPAFRFFAGISPSID

Query:  FQLNGGLGVGLSSSSPQLFPTTPTTNHPYMGLNYDTNFPLIHHHNTNSNLNLQPHYNTN-----TTLASSIQSLS
            GG+G+ L++++           H        ++   +H  NT++ +    H N N       L +S+ SLS
Subjt:  FQLNGGLGVGLSSSSPQLFPTTPTTNHPYMGLNYDTNFPLIHHHNTNSNLNLQPHYNTN-----TTLASSIQSLS

AT1G07640.3 Dof-type zinc finger DNA-binding family protein1.8e-2744.57Show/hide
Query:  PLKCPRCDSTNTKFCYYNNYCLTQPRHFCKTCRRYWTKGGALRNVPIGGGCRKTKK------LKSSSSS---SSSNNSKLLPSGDTPAFRFFAGISPSID
        PLKCPRCDS+NTKFCYYNNY LTQPRHFCK CRRYWT+GGALRNVP+GGGCR+  K      LKSSSSS   SSS N++   SG       F       +
Subjt:  PLKCPRCDSTNTKFCYYNNYCLTQPRHFCKTCRRYWTKGGALRNVPIGGGCRKTKK------LKSSSSS---SSSNNSKLLPSGDTPAFRFFAGISPSID

Query:  FQLNGGLGVGLSSSSPQLFPTTPTTNHPYMGLNYDTNFPLIHHHNTNSNLNLQPHYNTN-----TTLASSIQSLS
            GG+G+ L++++           H        ++   +H  NT++ +    H N N       L +S+ SLS
Subjt:  FQLNGGLGVGLSSSSPQLFPTTPTTNHPYMGLNYDTNFPLIHHHNTNSNLNLQPHYNTN-----TTLASSIQSLS

AT5G62940.1 Dof-type zinc finger DNA-binding family protein4.8e-2836.05Show/hide
Query:  PLKCPRCDSTNTKFCYYNNYCLTQPRHFCKTCRRYWTKGGALRNVPIGGGCRKTKKLKSSSSSSSSNNSKLLPSGDTPA---------------------
        P KCPRC+ST+TKFCYYNNY L+QPR+FCKTCRRYWTKGG LRN+P+GGGCRK KK  SS+SSSS+++ K  PS    A                     
Subjt:  PLKCPRCDSTNTKFCYYNNYCLTQPRHFCKTCRRYWTKGGALRNVPIGGGCRKTKKLKSSSSSSSSNNSKLLPSGDTPA---------------------

Query:  FRFFAGISPSIDFQLNGGLGV------GLSSSSPQ-------LFPTTPTTNHPYMGLNYDTNFPLIHHHNTNSNLNLQPHYNTNTTLASSIQSLSSLNQD
        F  F G+  S     +G +G       GL S SP+        F      N   + +N+ +N    HHHN +  LN     N N         +S+    
Subjt:  FRFFAGISPSIDFQLNGGLGV------GLSSSSPQ-------LFPTTPTTNHPYMGLNYDTNFPLIHHHNTNSNLNLQPHYNTNTTLASSIQSLSSLNQD

Query:  LHSKLQQ----HRLAMIFGDHDHVQNKDQNHKLLQPILFHNLEPP------KQDSCFN
            L       RL +   DH H  N  ++H+ +  I+     P       +QD C++
Subjt:  LHSKLQQ----HRLAMIFGDHDHVQNKDQNHKLLQPILFHNLEPP------KQDSCFN

AT5G65590.1 Dof-type zinc finger DNA-binding family protein1.6e-4441.18Show/hide
Query:  SGTTRTKSSSNTKQQQTQQQQPLKCPRCDSTNTKFCYYNNYCLTQPRHFCKTCRRYWTKGGALRNVPIGGGCRKTKK-LKSSSS----SSSSNNSKLLPS
        SGT++TK   ++     Q QQ LKCPRC+S NTKFCYYNNY L+QPRHFCK+CRRYWT+GGALRNVPIGGGCRKTKK +K +SS     SSS++ +   S
Subjt:  SGTTRTKSSSNTKQQQTQQQQPLKCPRCDSTNTKFCYYNNYCLTQPRHFCKTCRRYWTKGGALRNVPIGGGCRKTKK-LKSSSS----SSSSNNSKLLPS

Query:  GDTPAFRFFAGISPSIDFQLNGGLGVGLSSSSPQLFPTTPTTNHPYMG-------LNYDTNFPLI---HHHNTNSNLNLQPHYNTNTTLASSIQSLSSLN
            + +FF     ++DFQL  GL +   +    L         P M        ++  +   L+     +N +S         ++  LASSI++LS LN
Subjt:  GDTPAFRFFAGISPSIDFQLNGGLGVGLSSSSPQLFPTTPTTNHPYMG-------LNYDTNFPLI---HHHNTNSNLNLQPHYNTNTTLASSIQSLSSLN

Query:  QDLHSKLQQHRLAMIFGDHDHVQNKDQNHKLLQPILFHNLEPPKQDSCFNIHDPRTQSAAASTTGEDAATTEWFFGNNSYDDRHNHHHQVSATNSAGGNG
        QDLH +LQQ R+AM+FG+    + +    +  QPIL+ NLE                S+ +S T +    TEW+FGNNS ++    +   +A    GG+ 
Subjt:  QDLHSKLQQHRLAMIFGDHDHVQNKDQNHKLLQPILFHNLEPPKQDSCFNIHDPRTQSAAASTTGEDAATTEWFFGNNSYDDRHNHHHQVSATNSAGGNG

Query:  WNHTNNNNGVQAWEDLHHFTALP
        W     NNG+QAW DL+H+ ALP
Subjt:  WNHTNNNNGVQAWEDLHHFTALP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGGCCCTCATCGCAAGAAGAAATCAGCCAAAACTCAGGCACAACAAGAACCAAATCATCGTCAAATACGAAACAACAGCAAACCCAACAACAACAACCTCTGAAATG
TCCTCGATGTGATTCCACCAACACCAAGTTTTGCTACTACAACAACTACTGCCTCACTCAACCTCGTCACTTTTGCAAGACCTGTCGTAGATATTGGACCAAAGGTGGCG
CCTTGAGAAATGTCCCCATCGGTGGCGGCTGCCGGAAAACCAAAAAGCTCAAATCTTCTTCCTCTTCTTCTTCTTCCAATAATTCCAAACTCCTCCCCTCCGGCGACACC
CCTGCCTTCAGATTCTTTGCTGGAATCTCACCCTCCATTGATTTCCAATTGAATGGTGGTCTTGGAGTTGGACTCTCATCATCTTCACCACAATTATTCCCAACAACTCC
CACCACAAATCATCCATACATGGGCCTCAACTACGACACCAATTTCCCTCTAATTCACCACCACAATACCAACTCAAATTTAAACCTCCAACCTCACTATAATACCAACA
CCACCCTTGCATCTTCAATTCAATCTTTGAGCTCTCTAAACCAAGACCTCCATTCTAAATTACAGCAACACCGGTTGGCTATGATATTTGGAGACCACGATCATGTGCAA
AACAAGGATCAAAATCACAAATTGTTGCAACCCATTTTGTTTCACAATCTAGAGCCTCCAAAACAGGATAGTTGTTTCAATATCCATGATCCTAGAACACAATCTGCAGC
AGCTTCAACAACCGGGGAGGATGCCGCTACAACTGAATGGTTCTTCGGAAATAATTCTTATGATGATCGTCATAATCATCATCATCAAGTGAGTGCCACAAACAGTGCTG
GTGGGAATGGGTGGAATCATACTAATAATAATAATGGAGTTCAAGCTTGGGAGGATTTGCACCATTTCACTGCCTTGCCCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAGGCCCTCATCGCAAGAAGAAATCAGCCAAAACTCAGGCACAACAAGAACCAAATCATCGTCAAATACGAAACAACAGCAAACCCAACAACAACAACCTCTGAAATG
TCCTCGATGTGATTCCACCAACACCAAGTTTTGCTACTACAACAACTACTGCCTCACTCAACCTCGTCACTTTTGCAAGACCTGTCGTAGATATTGGACCAAAGGTGGCG
CCTTGAGAAATGTCCCCATCGGTGGCGGCTGCCGGAAAACCAAAAAGCTCAAATCTTCTTCCTCTTCTTCTTCTTCCAATAATTCCAAACTCCTCCCCTCCGGCGACACC
CCTGCCTTCAGATTCTTTGCTGGAATCTCACCCTCCATTGATTTCCAATTGAATGGTGGTCTTGGAGTTGGACTCTCATCATCTTCACCACAATTATTCCCAACAACTCC
CACCACAAATCATCCATACATGGGCCTCAACTACGACACCAATTTCCCTCTAATTCACCACCACAATACCAACTCAAATTTAAACCTCCAACCTCACTATAATACCAACA
CCACCCTTGCATCTTCAATTCAATCTTTGAGCTCTCTAAACCAAGACCTCCATTCTAAATTACAGCAACACCGGTTGGCTATGATATTTGGAGACCACGATCATGTGCAA
AACAAGGATCAAAATCACAAATTGTTGCAACCCATTTTGTTTCACAATCTAGAGCCTCCAAAACAGGATAGTTGTTTCAATATCCATGATCCTAGAACACAATCTGCAGC
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GTGGGAATGGGTGGAATCATACTAATAATAATAATGGAGTTCAAGCTTGGGAGGATTTGCACCATTTCACTGCCTTGCCCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRPSSQEEISQNSGTTRTKSSSNTKQQQTQQQQPLKCPRCDSTNTKFCYYNNYCLTQPRHFCKTCRRYWTKGGALRNVPIGGGCRKTKKLKSSSSSSSSNNSKLLPSGDT
PAFRFFAGISPSIDFQLNGGLGVGLSSSSPQLFPTTPTTNHPYMGLNYDTNFPLIHHHNTNSNLNLQPHYNTNTTLASSIQSLSSLNQDLHSKLQQHRLAMIFGDHDHVQ
NKDQNHKLLQPILFHNLEPPKQDSCFNIHDPRTQSAAASTTGEDAATTEWFFGNNSYDDRHNHHHQVSATNSAGGNGWNHTNNNNGVQAWEDLHHFTALP