; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh04G009600 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh04G009600
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionRAB GTPase 11C
Genome locationCmo_Chr04:4888085..4890260
RNA-Seq ExpressionCmoCh04G009600
SyntenyCmoCh04G009600
Gene Ontology termsGO:0005768 - endosome (cellular component)
GO:0005794 - Golgi apparatus (cellular component)
GO:0003924 - GTPase activity (molecular function)
GO:0005525 - GTP binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001806 - Small GTPase
IPR005225 - Small GTP-binding protein domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6600719.1 Ras-related protein RABA2a, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.0e-11399.53Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV
        DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV

Query:  GESEDNSKKACCSSS
        GESE NSKKACCSSS
Subjt:  GESEDNSKKACCSSS

XP_022943001.1 ras-related protein RABA2a-like [Cucurbita moschata]6.1e-114100Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV
        DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV

Query:  GESEDNSKKACCSSS
        GESEDNSKKACCSSS
Subjt:  GESEDNSKKACCSSS

XP_022989944.1 ras-related protein RABA2a-like [Cucurbita maxima]9.8e-11298.14Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV
        DNVNRWLKELRDHAD+NIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSY+EKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPA ANIKEGKTIVV
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV

Query:  GESEDNSKKACCSSS
        GESE NSKKACCSSS
Subjt:  GESEDNSKKACCSSS

XP_023517501.1 ras-related protein RABA2a-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.0e-11097.69Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEP-ATANIKEGKTIV
        DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLS IETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEP A ANIKEGK+IV
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEP-ATANIKEGKTIV

Query:  VGESEDNSKKACCSSS
        VGESE NSKKACCSSS
Subjt:  VGESEDNSKKACCSSS

XP_038905598.1 ras-related protein RABA2a [Benincasa hispida]6.3e-11197.21Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRT+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV
        DNV+RWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNS+EPA ANIKEGKTIVV
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV

Query:  GESEDNSKKACCSSS
        GESE N+KKACCSSS
Subjt:  GESEDNSKKACCSSS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L6P8 Uncharacterized protein5.8e-11097.22Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATA-NIKEGKTIV
        DNV+RWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNS+EPA A NIKEGKTIV
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATA-NIKEGKTIV

Query:  VGESEDNSKKACCSSS
        VGESE N+KKACCSSS
Subjt:  VGESEDNSKKACCSSS

A0A1S3BTD1 ras-related protein RABA2a1.3e-10996.76Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATA-NIKEGKTIV
        DNV+RWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNS+EP+ A NIKEGKTIV
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATA-NIKEGKTIV

Query:  VGESEDNSKKACCSSS
        VGESE N+KKACCSSS
Subjt:  VGESEDNSKKACCSSS

A0A6J1EU78 ras-related protein RABA2a1.3e-10996.77Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEP--ATANIKEGKTI
        DNV+RWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNS+EP  A ANIKEGKTI
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEP--ATANIKEGKTI

Query:  VVGESEDNSKKACCSSS
        VVGESE NSKK CCSSS
Subjt:  VVGESEDNSKKACCSSS

A0A6J1FQI3 ras-related protein RABA2a-like3.0e-114100Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV
        DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV

Query:  GESEDNSKKACCSSS
        GESEDNSKKACCSSS
Subjt:  GESEDNSKKACCSSS

A0A6J1JQR7 ras-related protein RABA2a-like4.7e-11298.14Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV
        DNVNRWLKELRDHAD+NIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSY+EKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPA ANIKEGKTIVV
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV

Query:  GESEDNSKKACCSSS
        GESE NSKKACCSSS
Subjt:  GESEDNSKKACCSSS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O04486 Ras-related protein RABA2a6.0e-10490.32Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPD++YDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKP TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDE-PATANIKEGKTI-
        +NV+RWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEA NVEKAFQTILSE+YRIISKKS++SD+  A ANIKEG+TI 
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDE-PATANIKEGKTI-

Query:  VVGESEDNSKKACCSSS
        V   SE N+KK CCSSS
Subjt:  VVGESEDNSKKACCSSS

Q39434 Ras-related protein Rab2BV8.4e-9076.64Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MA R D +YDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEG+TVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD+TK  TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV
        DNV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK+DLKHLRAV+ ED Q+ AEKEGLSF+ETSALEA N+EKAFQTIL+EIY IISKK+L + E ++    +G TI V
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV

Query:  GESEDNSKKACCSS
         ++  N +++CCS+
Subjt:  GESEDNSKKACCSS

Q40193 Ras-related protein Rab11C2.1e-8876.04Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MA R D +YDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEG+TVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD+TK  TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIK---EGKT
        DNV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK+DL HLRAV+ +D  + +EKEGLSF+ETSALEATN+EKAFQTIL+EIY I+SKK+L + E ATA      +G T
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIK---EGKT

Query:  IVVGESEDNSKKACCSS
        I V ++  N+KK CCS+
Subjt:  IVVGESEDNSKKACCSS

Q96283 Ras-related protein RABA2c8.4e-9077.42Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        M  R D +YDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRT QVEG+T+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD+TK  TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIK---EGKT
        DNV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK+DL HLR+VA ED QS AEKEGLSF+ETSALEATNVEKAFQTIL EIY IISKK+L + E A AN     +G T
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIK---EGKT

Query:  IVVGESEDNSKKACCSS
        I V ++   +K+ACCSS
Subjt:  IVVGESEDNSKKACCSS

Q9LNW1 Ras-related protein RABA2b2.1e-8876.64Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MA R D +YDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEG+TVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD+TK  TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV
        +NV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK+DL HLR+VA ED +S AEKEGLSF+ETSALEATN+EKAFQTILSEIY IISKK+L + E A     +G  I +
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV

Query:  GESEDNSKKACCSS
         +S   ++K CCS+
Subjt:  GESEDNSKKACCSS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G07410.1 RAB GTPase homolog A2B1.5e-8976.64Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MA R D +YDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEG+TVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD+TK  TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV
        +NV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK+DL HLR+VA ED +S AEKEGLSF+ETSALEATN+EKAFQTILSEIY IISKK+L + E A     +G  I +
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVV

Query:  GESEDNSKKACCSS
         +S   ++K CCS+
Subjt:  GESEDNSKKACCSS

AT1G09630.1 RAB GTPase 11C4.2e-10590.32Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MARRPD++YDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKP TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDE-PATANIKEGKTI-
        +NV+RWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEA NVEKAFQTILSE+YRIISKKS++SD+  A ANIKEG+TI 
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDE-PATANIKEGKTI-

Query:  VVGESEDNSKKACCSSS
        V   SE N+KK CCSSS
Subjt:  VVGESEDNSKKACCSSS

AT3G46830.1 RAB GTPase homolog A2C6.0e-9177.42Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        M  R D +YDYLFK+VLIGDSGVGKSN+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRT QVEG+T+KAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD+TK  TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIK---EGKT
        DNV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK+DL HLR+VA ED QS AEKEGLSF+ETSALEATNVEKAFQTIL EIY IISKK+L + E A AN     +G T
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIK---EGKT

Query:  IVVGESEDNSKKACCSS
        I V ++   +K+ACCSS
Subjt:  IVVGESEDNSKKACCSS

AT5G59150.1 RAB GTPase homolog A2D2.5e-8976.04Show/hide
Query:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF
        MA R + DYDYLFK+VLIGDSGVGK+N+LSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEG+TVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYD+TK  TF
Subjt:  MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTF

Query:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIK---EGKT
        DNV RWL+ELRDHADSNIVIM+ GNK DL HLR+VA ED Q+ AE EGLSF+ETSALEATNVEKAFQT+L+EIY IISKK+L + E A AN     +G T
Subjt:  DNVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIK---EGKT

Query:  IVVGESEDNSKKACCSS
        I V ++    K+ CCS+
Subjt:  IVVGESEDNSKKACCSS

AT5G60860.1 RAB GTPase homolog A1F1.9e-8170.05Show/hide
Query:  ARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFD
        A R DD+YDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEF LESKSTIGVEFATR++ V+ + VKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGA+GALLVYDVT+ +TF+
Subjt:  ARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFD

Query:  NVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLN-SDEPATANIKEGKTIVV
        NV RWLKELRDH D+NIVIM +GNK DL+HLRAV+TEDA+++AE+E   F+ETSALE+ NVE AF  +LS+IYR++S+K+L+  D+PA   + +G+TI V
Subjt:  NVNRWLKELRDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLN-SDEPATANIKEGKTIVV

Query:  GESEDNS---KKACCSS
        G  +D S   K  CCS+
Subjt:  GESEDNS---KKACCSS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCCCGGAGACCCGACGATGACTACGATTACCTCTTCAAAGTTGTGCTAATCGGCGATTCCGGCGTTGGAAAATCCAACCTTCTTTCCCGGTTCACTCGGAATGAGTT
TTGTTTGGAGTCCAAGTCCACCATTGGCGTCGAATTCGCCACTCGTACTCTTCAGGTTGAGGGAAGAACCGTGAAAGCTCAGATATGGGACACGGCCGGTCAAGAGCGTT
ACAGAGCAATAACCAGTGCTTACTATAGGGGTGCCCTCGGAGCCCTTCTAGTATACGATGTAACGAAACCGATGACTTTCGACAATGTAAACCGTTGGTTGAAGGAACTT
AGGGACCATGCAGATTCCAACATAGTCATCATGTTAATCGGTAACAAGACCGATCTGAAACACCTCCGAGCAGTGGCAACAGAAGACGCACAGAGCTACGCCGAGAAAGA
AGGGCTGTCATTCATTGAAACTTCGGCTCTTGAAGCAACAAACGTGGAGAAGGCTTTCCAAACCATTCTCTCAGAGATATATAGGATAATCAGTAAGAAGTCCCTCAATT
CGGATGAGCCTGCTACTGCTAACATCAAGGAAGGAAAAACCATTGTGGTTGGTGAATCAGAGGACAATTCGAAGAAGGCTTGTTGCTCCTCTTCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAGGGTAGTTTTGGGCATAGAAGTTGGTGACAGTCGCAGTATTTGAAGTCGGCTGTCTCTCCGTATTGTCTACATTTTCGAAGTGGGGCACCCGATTTGGGAGGGACAAT
TTCTTCAATTTTGCTTTCCGAGATTTCGGAAAGCTAAATCTTCAGAACCAGGAACCAGAGAGAGAGAGAGACCAGCGAGATAATATGGCCCGGAGACCCGACGATGACTA
CGATTACCTCTTCAAAGTTGTGCTAATCGGCGATTCCGGCGTTGGAAAATCCAACCTTCTTTCCCGGTTCACTCGGAATGAGTTTTGTTTGGAGTCCAAGTCCACCATTG
GCGTCGAATTCGCCACTCGTACTCTTCAGGTTGAGGGAAGAACCGTGAAAGCTCAGATATGGGACACGGCCGGTCAAGAGCGTTACAGAGCAATAACCAGTGCTTACTAT
AGGGGTGCCCTCGGAGCCCTTCTAGTATACGATGTAACGAAACCGATGACTTTCGACAATGTAAACCGTTGGTTGAAGGAACTTAGGGACCATGCAGATTCCAACATAGT
CATCATGTTAATCGGTAACAAGACCGATCTGAAACACCTCCGAGCAGTGGCAACAGAAGACGCACAGAGCTACGCCGAGAAAGAAGGGCTGTCATTCATTGAAACTTCGG
CTCTTGAAGCAACAAACGTGGAGAAGGCTTTCCAAACCATTCTCTCAGAGATATATAGGATAATCAGTAAGAAGTCCCTCAATTCGGATGAGCCTGCTACTGCTAACATC
AAGGAAGGAAAAACCATTGTGGTTGGTGAATCAGAGGACAATTCGAAGAAGGCTTGTTGCTCCTCTTCTTAAGTTCAGAAAAATATCCCCACAATTTTTTGTAACTCTCC
TCTCTCTCTCTCTCTCCCTCTTTTCTTGGTCATCTGCTTACGCATATCTTTCTAGTTACCAACTCTATTCTGTTATTCTTGTTTGCTTGGATTTTGTTGGTGTATAATTT
TCATATAATTTATATTTTACTTAGATTTTTTTTTTTCAAGAGATCATTGAGATCTCATGTCAGAAACACTATTGAGCGGTTCATTTCAGAGTTTGTCTGTTTTTATGGAA
TCTCTATGTTGGAGAATCAAATGTGAATGTCTTATTTTAATATCCGTGAGGCTTATGTGTATGCAACTAGTTTTTGGTCTTAGGAACTGTTGATTTTAAAGTGGCTATGG
ACCATATTCTTTCTAACATACTTGAGTA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MARRPDDDYDYLFKVVLIGDSGVGKSNLLSRFTRNEFCLESKSTIGVEFATRTLQVEGRTVKAQIWDTAGQERYRAITSAYYRGALGALLVYDVTKPMTFDNVNRWLKEL
RDHADSNIVIMLIGNKTDLKHLRAVATEDAQSYAEKEGLSFIETSALEATNVEKAFQTILSEIYRIISKKSLNSDEPATANIKEGKTIVVGESEDNSKKACCSSS