; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh04G012590 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh04G012590
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionCASP-like protein
Genome locationCmo_Chr04:6396867..6398272
RNA-Seq ExpressionCmoCh04G012590
SyntenyCmoCh04G012590
Gene Ontology termsGO:0005886 - plasma membrane (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0051539 - 4 iron, 4 sulfur cluster binding (molecular function)
InterPro domainsIPR006702 - Casparian strip membrane protein domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022957591.1 CASP-like protein 4C1 isoform X1 [Cucurbita moschata]3.0e-139100Show/hide
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XP_023524861.1 CASP-like protein 4C1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.3e-9677.13Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KNW2 CASP-like protein1.5e-9173.95Show/hide
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A0A6J1GZJ4 CASP-like protein1.4e-139100Show/hide
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A0A6J1H0N7 CASP-like protein4.0e-9777.52Show/hide
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A0A6J1JLP0 CASP-like protein3.1e-13496.9Show/hide
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A0A6J1JST8 CASP-like protein5.4e-9476.36Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A9STU1 CASP-like protein 4C12.3e-2535.44Show/hide
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        TP  H +   +  K +R N+++ VFRL TF FSLA+ + M TN +   S +P+     W+DFD F                                   
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         C    A+C Q+ +SIA+GF  FLFL LSS L+G RV
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B9HMF8 CASP-like protein 4C13.0e-6255.43Show/hide
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        MR PQ  RNGG T            HFHST+S+QKLKRFNSLILVFR S FCFSLASAVFM+TNSR  GSDS  WY+FDAF                   
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                                               RYVFAANAIVAVYSLFEM A+VWEISR  TLFPE+ QVWFDFGHDQ FAYLLLSA S GT 
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        +  T++  D C     FCVQS I+IALGF GFLFLG+SSL SGFRVVCF+INGSRF++
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B9HTK2 CASP-like protein 4C25.6e-6457.36Show/hide
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        MRSPQ  R+GG T            HF STVSVQKLKRFNSLILVFR + FCFSLASAVFM+TNSR  GSDS  WY+FDAF                   
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                                               RYVFAANAIVA+YSLFEM ASVWEISR  TLFPEI QVWFDFGHDQ FAYLLLSA +AGT 
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        L  TL+  DTC    AFCVQS I+I LGFAGFLFLG+SSL SGFRVVCF+INGSRF++
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B9SR15 CASP-like protein 4C13.7e-6861Show/hide
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        MRSPQSLRN G TPSP  R P  P  HFHSTVS+QKLKRFN LILVFRLSTFCFSLAS+VFM+TN        P WY FDAF                  
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                                                RYVFAANAIVA+YSLFEM ASVWEISR  TLFPEILQVWFDFGHDQ FAYLLLSA SA T
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        AL  TL+  DTC A++AFCVQS I+IALGFAGFLFLGLSSLLSGFRVVCF+INGSRF++
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Q9M2U0 CASP-like protein 4C12.0e-5852.71Show/hide
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        MRSP + RNG    SP  R    H HFHSTV+ QKL+RFNSLIL+ RL++F FSLASAVFM+TNSRGS   SP WYDFDAF                   
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                                               R+VF ANAIVA+YS+FEM   VWE SRE TL+PE  QVWFDFGHDQ F+YLLLSAGSA  A
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        L  T+R  DTC A  AFC+QS ++I LGFA FLFL  SS  SGFRV CF+I GSRFHL
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G79780.1 Uncharacterised protein family (UPF0497)1.5e-0834.55Show/hide
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        +YV  A A   +YSL ++   V+ +     + P   Q W  F  DQ F YL++SAGSAG+ +       +R T   D C+  S+FC    +S+ L F  F
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Query:  LFLGLSSLLS
        +FL  SS  +
Subjt:  LFLGLSSLLS

AT2G36330.1 Uncharacterised protein family (UPF0497)1.7e-0430.91Show/hide
Query:  RYVFAANAIVAVYSLFEMIASVWEISREVTLFPEILQVWFDFGHDQAFAYLLLSAGSAGTALLITLRRTDTCRAT---SAFCVQSTISIALGFAGFLFLG
        R+  + N +  VYS F+     + + +E  L    L+  F+F  DQ  AYLL+SA +A       + R D   +      F   ++ SIA+ F  FL   
Subjt:  RYVFAANAIVAVYSLFEMIASVWEISREVTLFPEILQVWFDFGHDQAFAYLLLSAGSAGTALLITLRRTDTCRAT---SAFCVQSTISIALGFAGFLFLG

Query:  LSSLLSGFRV
         SSL+SG+ +
Subjt:  LSSLLSGFRV

AT3G16300.1 Uncharacterised protein family (UPF0497)1.3e-0430.28Show/hide
Query:  YVFAANAIVAVYSLFEMIASVWEISREVTLFPEILQVWFDFGHDQAFAYLLLSAGSAGTALLITLRRT--------DTCRATSAFCVQSTISIALGFAGF
        Y+   ++   +YSL ++I S   + R+  + P   Q WF F  DQ   Y ++S GSA    +  + RT        + C++   FC     SI      F
Subjt:  YVFAANAIVAVYSLFEMIASVWEISREVTLFPEILQVWFDFGHDQAFAYLLLSAGSAGTALLITLRRT--------DTCRATSAFCVQSTISIALGFAGF

Query:  LFLGLSSLL
        L L  SSLL
Subjt:  LFLGLSSLL

AT3G55390.1 Uncharacterised protein family (UPF0497)1.5e-5952.71Show/hide
Query:  MRSPQSLRNGGGTPSPHARIPTPHHHFHSTVSVQKLKRFNSLILVFRLSTFCFSLASAVFMITNSRGSGSDSPRWYDFDAFRYAVCPLFRFFAFEVFLLK
        MRSP + RNG    SP  R    H HFHSTV+ QKL+RFNSLIL+ RL++F FSLASAVFM+TNSRGS   SP WYDFDAF                   
Subjt:  MRSPQSLRNGGGTPSPHARIPTPHHHFHSTVSVQKLKRFNSLILVFRLSTFCFSLASAVFMITNSRGSGSDSPRWYDFDAFRYAVCPLFRFFAFEVFLLK

Query:  IKYNRRDFRIGTTTNSAHTETHISILKNALYYRTNAFLTRYVFAANAIVAVYSLFEMIASVWEISREVTLFPEILQVWFDFGHDQAFAYLLLSAGSAGTA
                                               R+VF ANAIVA+YS+FEM   VWE SRE TL+PE  QVWFDFGHDQ F+YLLLSAGSA  A
Subjt:  IKYNRRDFRIGTTTNSAHTETHISILKNALYYRTNAFLTRYVFAANAIVAVYSLFEMIASVWEISREVTLFPEILQVWFDFGHDQAFAYLLLSAGSAGTA

Query:  LLITLRRTDTCRATSAFCVQSTISIALGFAGFLFLGLSSLLSGFRVVCFVINGSRFHL
        L  T+R  DTC A  AFC+QS ++I LGFA FLFL  SS  SGFRV CF+I GSRFHL
Subjt:  LLITLRRTDTCRATSAFCVQSTISIALGFAGFLFLGLSSLLSGFRVVCFVINGSRFHL

AT4G11655.1 Uncharacterised protein family (UPF0497)8.7e-0430.19Show/hide
Query:  YVFAANAIVAVYSLFEMIASVWEISREVTLFPEILQVWFDFGHDQAFAYLLLSAGSAGTALLITLRRTDTCRATSAFCVQSTISIALGFAGFLFLGLSSL
        Y F    I  VY+  +    V +I+    L  E L  +  F  DQ   YLL+S+ S   A +  +       A       S +S+++ F+ FL L LS L
Subjt:  YVFAANAIVAVYSLFEMIASVWEISREVTLFPEILQVWFDFGHDQAFAYLLLSAGSAGTALLITLRRTDTCRATSAFCVQSTISIALGFAGFLFLGLSSL

Query:  LSGFRV
        LSG+++
Subjt:  LSGFRV


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCGATCCCCTCAGTCACTCCGTAACGGCGGCGGCACACCATCGCCTCACGCTCGAATCCCTACTCCTCACCATCACTTTCACTCGACCGTCTCTGTTCAGAAACTGAA
GCGCTTCAACTCTCTAATCCTCGTCTTCCGTTTGTCTACCTTCTGCTTCTCCCTTGCCTCTGCTGTTTTCATGATTACTAACTCTCGCGGCTCTGGATCCGATTCCCCTC
GCTGGTACGATTTCGACGCCTTCAGGTACGCCGTTTGCCCTCTTTTCCGATTCTTCGCATTCGAGGTATTTCTCCTGAAAATCAAATACAACAGACGAGATTTTCGAATT
GGAACCACAACTAATTCCGCACATACGGAAACGCACATTTCCATACTAAAAAACGCACTCTATTACCGAACTAACGCTTTCCTGACCAGGTACGTCTTCGCGGCAAACGC
CATAGTCGCAGTGTACTCACTGTTCGAAATGATTGCCTCCGTGTGGGAAATCTCGAGAGAAGTGACGCTCTTCCCTGAGATTTTACAAGTCTGGTTCGACTTCGGCCATG
ACCAGGCGTTCGCGTACCTTCTTCTCTCTGCGGGCTCCGCAGGGACGGCTCTCTTGATAACTCTGAGGAGAACCGACACGTGTAGGGCTACCAGCGCCTTTTGTGTTCAA
TCCACGATCTCGATTGCATTGGGATTCGCCGGTTTCCTGTTTCTCGGGTTATCCTCGCTGCTTTCGGGTTTTCGGGTCGTCTGTTTCGTAATCAACGGCTCTCGTTTTCA
TTTATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCAGTTCTCTCTGCTAGCCGCTTTGAATAATTTCCCACTCATTTTTTCACACAACCCTCTCTTCTA
ATGGAACCCTTGCCCTCGCCCGTGACTCCACCGCCATCTCCCATCTCAACTTCATCTCTCTAATCCAAAATCCTAATCCTCTGTTTTTCTCTCTCTTTTACAGCTCAAAA
GGGAAAACAGGAAATCCAAACCTTACCTTATATTCCTCCTCTGTCTGCAACAATCAATTTCACCCCCATTTCATGTATGACCTACTACTCTACCTGTAGCAAACTGCGAC
GGCGACCATGCGATCCCCTCAGTCACTCCGTAACGGCGGCGGCACACCATCGCCTCACGCTCGAATCCCTACTCCTCACCATCACTTTCACTCGACCGTCTCTGTTCAGA
AACTGAAGCGCTTCAACTCTCTAATCCTCGTCTTCCGTTTGTCTACCTTCTGCTTCTCCCTTGCCTCTGCTGTTTTCATGATTACTAACTCTCGCGGCTCTGGATCCGAT
TCCCCTCGCTGGTACGATTTCGACGCCTTCAGGTACGCCGTTTGCCCTCTTTTCCGATTCTTCGCATTCGAGGTATTTCTCCTGAAAATCAAATACAACAGACGAGATTT
TCGAATTGGAACCACAACTAATTCCGCACATACGGAAACGCACATTTCCATACTAAAAAACGCACTCTATTACCGAACTAACGCTTTCCTGACCAGGTACGTCTTCGCGG
CAAACGCCATAGTCGCAGTGTACTCACTGTTCGAAATGATTGCCTCCGTGTGGGAAATCTCGAGAGAAGTGACGCTCTTCCCTGAGATTTTACAAGTCTGGTTCGACTTC
GGCCATGACCAGGCGTTCGCGTACCTTCTTCTCTCTGCGGGCTCCGCAGGGACGGCTCTCTTGATAACTCTGAGGAGAACCGACACGTGTAGGGCTACCAGCGCCTTTTG
TGTTCAATCCACGATCTCGATTGCATTGGGATTCGCCGGTTTCCTGTTTCTCGGGTTATCCTCGCTGCTTTCGGGTTTTCGGGTCGTCTGTTTCGTAATCAACGGCTCTC
GTTTTCATTTATAACCTTACTTCCTTCAAGAGGACTTCCACCGCTGAATTTTTTGGTGCGTCATGTCGTTTGATTTGCCTAATTATATCTAATGGTCCTTCATCTTTTTC
TTTTTCTCCATTTGGTCCTTAATTTATCTTAAAATTAACAACTCTCAATTATATCTAATTAGTTTAAACATTAAATTAAATTTTAAATAATATATAATAACTACTACA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MRSPQSLRNGGGTPSPHARIPTPHHHFHSTVSVQKLKRFNSLILVFRLSTFCFSLASAVFMITNSRGSGSDSPRWYDFDAFRYAVCPLFRFFAFEVFLLKIKYNRRDFRI
GTTTNSAHTETHISILKNALYYRTNAFLTRYVFAANAIVAVYSLFEMIASVWEISREVTLFPEILQVWFDFGHDQAFAYLLLSAGSAGTALLITLRRTDTCRATSAFCVQ
STISIALGFAGFLFLGLSSLLSGFRVVCFVINGSRFHL