; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh04G012800 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh04G012800
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Description50S ribosomal protein L23, chloroplastic
Genome locationCmo_Chr04:6487541..6494078
RNA-Seq ExpressionCmoCh04G012800
SyntenyCmoCh04G012800
Gene Ontology termsGO:0000027 - ribosomal large subunit assembly (biological process)
GO:0006412 - translation (biological process)
GO:0022625 - cytosolic large ribosomal subunit (cellular component)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function)
GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR005633 - Ribosomal protein L23/L25, N-terminal
IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily
IPR012678 - Ribosomal protein L23/L15e core domain superfamily
IPR013025 - Ribosomal protein L25/L23


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6600068.1 60S ribosomal protein L23a, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.1e-7496.25Show/hide
Query:  VDYSGPGSSAMAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDN
        V YSGPGSSAMAPKADS KKADPKAQALK AKAVK+GPTFK KAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDN
Subjt:  VDYSGPGSSAMAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDN

Query:  NTLVFIVDIRADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
        NTLVFIVDIRA+KKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
Subjt:  NTLVFIVDIRADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI

KAG6601015.1 60S ribosomal protein L23a, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.3e-14071.9Show/hide
Query:  MPMSTISCVTLLNTFKVKELDGLEEELVTLNVD--EADGQIRDKLLKPQVVSFCSSTMLLPCTTDPPPLPTVYFCSHPSFFSNSRCRSIYSHDPNEDCPS
        +P+ T +C  L     V  L+ L + + TL+    +ADG+IRD LLKPQVVSFCSSTMLLPCTTDPPPLPTVYFCSHPSFFSN RCRSIYSHDPNE CPS
Subjt:  MPMSTISCVTLLNTFKVKELDGLEEELVTLNVD--EADGQIRDKLLKPQVVSFCSSTMLLPCTTDPPPLPTVYFCSHPSFFSNSRCRSIYSHDPNEDCPS

Query:  CGYEMSRQLEYLEPLTENTTNTSSKKEEGYVKGV------------------------------------------------------------------
        CG EMSRQLEYLEPLTENTTNTSSKKEEGYVKGV                                                                  
Subjt:  CGYEMSRQLEYLEPLTENTTNTSSKKEEGYVKGV------------------------------------------------------------------

Query:  -----------VDYSGPGSSAMAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLT
                   VDYSGPGSSAMAPKAD+IKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLT
Subjt:  -----------VDYSGPGSSAMAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLT

Query:  TESAMKKIEDNNTLVFIVDIRADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIDSGSFPSVVGHPLSSLASSLNEAV
        TESAMKKIEDNNTLVFIVDIRADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIDSGSFPSVVGHPLSSLASSLNEA+
Subjt:  TESAMKKIEDNNTLVFIVDIRADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIDSGSFPSVVGHPLSSLASSLNEAV

KAG7031627.1 60S ribosomal protein L23a, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.1e-78100Show/hide
Query:  VDYSGPGSSAMAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDN
        VDYSGPGSSAMAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDN
Subjt:  VDYSGPGSSAMAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDN

Query:  NTLVFIVDIRADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
        NTLVFIVDIRADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
Subjt:  NTLVFIVDIRADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI

PQQ12121.1 60S ribosomal protein L23a [Prunus yedoensis var. nudiflora]1.0e-7275.24Show/hide
Query:  CRSIYSHDPNEDCPSCGYEMSRQLEYLEPLTENTTNTSSKKEEGYVKGVVDYSGPGSSAMAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTS
        CRS +  +P   CP C Y +S ++ Y+        ++    EE      V        AMAP KADS KK+DPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTS
Subjt:  CRSIYSHDPNEDCPSCGYEMSRQLEYLEPLTENTTNTSSKKEEGYVKGVVDYSGPGSSAMAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTS

Query:  VTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPD
        VTFHRP+TLKK+RNPKYPRISA PRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPD
Subjt:  VTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPD

Query:  YDALDVANKI
        YDALDVANKI
Subjt:  YDALDVANKI

XP_022957518.1 60S ribosomal protein L23a-like [Cucurbita moschata]1.0e-72100Show/hide
Query:  MAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
        MAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
Subjt:  MAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR

Query:  ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
        ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
Subjt:  ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0KS61 50S ribosomal protein L23, chloroplastic1.5e-7492.73Show/hide
Query:  YVKGVVDYSGPGSSAMAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMK
        ++   V +SG GSSAMAPKADS KKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRIS TPRNKLDQYQILKYPLTTESAMK
Subjt:  YVKGVVDYSGPGSSAMAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMK

Query:  KIEDNNTLVFIVDIRADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
        KIEDNNTLVFIVDIRA+KK IKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
Subjt:  KIEDNNTLVFIVDIRADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI

A0A314Z5J4 50S ribosomal protein L23, chloroplastic4.9e-7375.24Show/hide
Query:  CRSIYSHDPNEDCPSCGYEMSRQLEYLEPLTENTTNTSSKKEEGYVKGVVDYSGPGSSAMAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTS
        CRS +  +P   CP C Y +S ++ Y+        ++    EE      V        AMAP KADS KK+DPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTS
Subjt:  CRSIYSHDPNEDCPSCGYEMSRQLEYLEPLTENTTNTSSKKEEGYVKGVVDYSGPGSSAMAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTS

Query:  VTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPD
        VTFHRP+TLKK+RNPKYPRISA PRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPD
Subjt:  VTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPD

Query:  YDALDVANKI
        YDALDVANKI
Subjt:  YDALDVANKI

A0A6J1DJ76 50S ribosomal protein L23, chloroplastic4.1e-7298.67Show/hide
Query:  MAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
        MAPKAD+ KKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
Subjt:  MAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR

Query:  ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
        ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
Subjt:  ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI

A0A6J1H0G0 50S ribosomal protein L23, chloroplastic4.9e-73100Show/hide
Query:  MAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
        MAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
Subjt:  MAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR

Query:  ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
        ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
Subjt:  ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI

A0A6J1K8U2 50S ribosomal protein L23, chloroplastic2.4e-7299.33Show/hide
Query:  MAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
        MAPKADS KKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR
Subjt:  MAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDIR

Query:  ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
        ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
Subjt:  ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22644 60S ribosomal protein L23A8.0e-6590.07Show/hide
Query:  MAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSG-PTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        MAP A   KK D KAQALK AKAVKSG  T +KKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISA PRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSG-PTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
        RADKKKIK AVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALD+ANKI
Subjt:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI

Q07761 60S ribosomal protein L23a1.2e-6590.07Show/hide
Query:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        MAP KAD  KK+DPKAQA K AKAVKSG T KKK++KIRT VTFHRPKTLKKDRNPKYPRISA  RNKLDQY ILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
        +ADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
Subjt:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI

Q8LD46 60S ribosomal protein L23a-11.4e-6488.74Show/hide
Query:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D+ KKADPKA+ALK AKAVKSG  FKKK KKIRT VTFHRPKTL K R  KYP+ISATPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
        RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
Subjt:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI

Q9AT35 60S ribosomal protein L23a7.2e-6690.73Show/hide
Query:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D  KK+D KAQALKTAKAVKSG T  KK KKIRTSVTFHRP+TL KDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
        RA+KKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
Subjt:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI

Q9M3C3 60S ribosomal protein L23a-21.5e-6388.08Show/hide
Query:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D  KKADPKA+ALK AKAVKSG   KK AKKIRT VTFHRPKTL   R PKYP+ISATPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
        RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
Subjt:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G39460.1 ribosomal protein L23AA9.7e-6688.74Show/hide
Query:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D+ KKADPKA+ALK AKAVKSG  FKKK KKIRT VTFHRPKTL K R  KYP+ISATPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
        RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
Subjt:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI

AT2G39460.2 ribosomal protein L23AA9.7e-6688.74Show/hide
Query:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D+ KKADPKA+ALK AKAVKSG  FKKK KKIRT VTFHRPKTL K R  KYP+ISATPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
        RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
Subjt:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI

AT3G55280.1 ribosomal protein L23AB1.1e-6488.08Show/hide
Query:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D  KKADPKA+ALK AKAVKSG   KK AKKIRT VTFHRPKTL   R PKYP+ISATPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
        RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
Subjt:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI

AT3G55280.2 ribosomal protein L23AB1.1e-6488.08Show/hide
Query:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D  KKADPKA+ALK AKAVKSG   KK AKKIRT VTFHRPKTL   R PKYP+ISATPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
        RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
Subjt:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI

AT3G55280.3 ribosomal protein L23AB2.5e-6185.43Show/hide
Query:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
        M+P K D  KKADPKA+ALK AKAVKSG        KIRT VTFHRPKTL   R PKYP+ISATPRNKLD YQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI
Subjt:  MAP-KADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPLTTESAMKKIEDNNTLVFIVDI

Query:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
        RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI
Subjt:  RADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCCTATGTCTACCATCTCTTGCGTTACTCTGTTGAACACGTTTAAGGTCAAAGAATTGGATGGTTTGGAGGAGGAACTTGTCACTTTGAATGTGGATGAGGCAGATGG
GCAGATTAGAGACAAGCTTTTGAAGCCCCAAGTTGTGTCATTTTGTAGCTCTACTATGCTGTTGCCTTGCACTACTGATCCACCACCTTTGCCAACAGTTTATTTTTGTA
GTCATCCGAGTTTCTTTAGTAATAGCCGATGCCGCTCTATCTACTCCCATGATCCTAACGAAGACTGTCCATCTTGTGGTTATGAAATGAGCAGACAGCTTGAGTATTTG
GAGCCACTAACTGAAAACACGACCAACACAAGTAGTAAGAAAGAGGAAGGTTATGTTAAGGGTGTGGTTGATTATTCTGGTCCAGGATCTTCAGCAATGGCTCCTAAAGC
TGACAGTATCAAAAAGGCTGATCCCAAGGCTCAAGCCTTGAAGACTGCCAAGGCAGTGAAGTCTGGTCCAACATTCAAGAAGAAGGCTAAGAAGATTAGAACTTCAGTCA
CATTCCATAGGCCAAAGACATTGAAGAAGGATAGGAATCCCAAGTATCCCAGGATCAGTGCTACTCCAAGGAACAAGTTGGACCAGTATCAAATTCTCAAATATCCACTG
ACCACAGAATCTGCAATGAAGAAAATTGAGGATAATAACACCCTTGTTTTTATTGTTGACATTCGTGCCGACAAGAAGAAGATTAAGGATGCCGTGAAGAAGATGTATGA
CATTCAGACCAAGAAAGTGAACACTTTAATCAGGCCAGACGGAACGAAGAAGGCGTATGTTAGGTTAACTCCAGATTATGATGCTCTGGATGTGGCGAACAAGATTGATA
GTGGGTCCTTCCCAAGTGTAGTAGGTCACCCCTTGAGTTCGTTGGCTTCTTCCTTGAATGAAGCAGTAATCTCGGCGAGAAACCCTCAAGAGCTATTAGGAACCGCTACT
CGCCATGGACCTAGATTGTCCAAGCGAGAGAAACGAAGAGAATCGGTAATTTTCACAGCGTCGGATGGGAATAAGGATCAGAAGAAGGAAGAGGATAATGAGAAGGCCAA
GAAGTTGAAGAAAAAGAAGAAGAAGAGTAATAAGAAGACAAAAAGTGGTGAGGAGGAGAAGGAGAAGCAGGGAGATGTAGCTGGGAATGAAGTGAAACGGCAGCTTGAAG
AAACTCAGAATAATATAGGCAGGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCCTATGTCTACCATCTCTTGCGTTACTCTGTTGAACACGTTTAAGGTCAAAGAATTGGATGGTTTGGAGGAGGAACTTGTCACTTTGAATGTGGATGAGGCAGATGG
GCAGATTAGAGACAAGCTTTTGAAGCCCCAAGTTGTGTCATTTTGTAGCTCTACTATGCTGTTGCCTTGCACTACTGATCCACCACCTTTGCCAACAGTTTATTTTTGTA
GTCATCCGAGTTTCTTTAGTAATAGCCGATGCCGCTCTATCTACTCCCATGATCCTAACGAAGACTGTCCATCTTGTGGTTATGAAATGAGCAGACAGCTTGAGTATTTG
GAGCCACTAACTGAAAACACGACCAACACAAGTAGTAAGAAAGAGGAAGGTTATGTTAAGGGTGTGGTTGATTATTCTGGTCCAGGATCTTCAGCAATGGCTCCTAAAGC
TGACAGTATCAAAAAGGCTGATCCCAAGGCTCAAGCCTTGAAGACTGCCAAGGCAGTGAAGTCTGGTCCAACATTCAAGAAGAAGGCTAAGAAGATTAGAACTTCAGTCA
CATTCCATAGGCCAAAGACATTGAAGAAGGATAGGAATCCCAAGTATCCCAGGATCAGTGCTACTCCAAGGAACAAGTTGGACCAGTATCAAATTCTCAAATATCCACTG
ACCACAGAATCTGCAATGAAGAAAATTGAGGATAATAACACCCTTGTTTTTATTGTTGACATTCGTGCCGACAAGAAGAAGATTAAGGATGCCGTGAAGAAGATGTATGA
CATTCAGACCAAGAAAGTGAACACTTTAATCAGGCCAGACGGAACGAAGAAGGCGTATGTTAGGTTAACTCCAGATTATGATGCTCTGGATGTGGCGAACAAGATTGATA
GTGGGTCCTTCCCAAGTGTAGTAGGTCACCCCTTGAGTTCGTTGGCTTCTTCCTTGAATGAAGCAGTAATCTCGGCGAGAAACCCTCAAGAGCTATTAGGAACCGCTACT
CGCCATGGACCTAGATTGTCCAAGCGAGAGAAACGAAGAGAATCGGTAATTTTCACAGCGTCGGATGGGAATAAGGATCAGAAGAAGGAAGAGGATAATGAGAAGGCCAA
GAAGTTGAAGAAAAAGAAGAAGAAGAGTAATAAGAAGACAAAAAGTGGTGAGGAGGAGAAGGAGAAGCAGGGAGATGTAGCTGGGAATGAAGTGAAACGGCAGCTTGAAG
AAACTCAGAATAATATAGGCAGGTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MPMSTISCVTLLNTFKVKELDGLEEELVTLNVDEADGQIRDKLLKPQVVSFCSSTMLLPCTTDPPPLPTVYFCSHPSFFSNSRCRSIYSHDPNEDCPSCGYEMSRQLEYL
EPLTENTTNTSSKKEEGYVKGVVDYSGPGSSAMAPKADSIKKADPKAQALKTAKAVKSGPTFKKKAKKIRTSVTFHRPKTLKKDRNPKYPRISATPRNKLDQYQILKYPL
TTESAMKKIEDNNTLVFIVDIRADKKKIKDAVKKMYDIQTKKVNTLIRPDGTKKAYVRLTPDYDALDVANKIDSGSFPSVVGHPLSSLASSLNEAVISARNPQELLGTAT
RHGPRLSKREKRRESVIFTASDGNKDQKKEEDNEKAKKLKKKKKKSNKKTKSGEEEKEKQGDVAGNEVKRQLEETQNNIGR