; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh04G012980 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh04G012980
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionserine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X2
Genome locationCmo_Chr04:6593153..6594937
RNA-Seq ExpressionCmoCh04G012980
SyntenyCmoCh04G012980
Gene Ontology termsGO:0003723 - RNA binding (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000504 - RNA recognition motif domain
IPR001878 - Zinc finger, CCHC-type
IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily
IPR035979 - RNA-binding domain superfamily
IPR036875 - Zinc finger, CCHC-type superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022956469.1 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X1 [Cucurbita moschata]1.4e-17586Show/hide
Query:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQPSYNFSYYVLFSW
        RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKG                                                      
Subjt:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQPSYNFSYYVLFSW

Query:  LALVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGHSYSRSRSP
           VPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGHSYSRSRSP
Subjt:  LALVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGHSYSRSRSP

Query:  VKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRG
        VKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRG
Subjt:  VKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRG

Query:  RSRSPRGRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDRSRSPMDRSRSPMDEGEDFNGGGSKNYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSP
        RSRSPRGRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDRSRSPMDRSRSPMDEGEDFNGGGSKNYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSP
Subjt:  RSRSPRGRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDRSRSPMDRSRSPMDEGEDFNGGGSKNYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSP

Query:  RGDSESA
        RGDSESA
Subjt:  RGDSESA

XP_022956472.1 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X2 [Cucurbita moschata]1.6e-18286.4Show/hide
Query:  MMALPVSGTNLRRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQP
        MMALPVSGTNLRRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKG                                          
Subjt:  MMALPVSGTNLRRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQP

Query:  SYNFSYYVLFSWLALVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSY
                       VPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSY
Subjt:  SYNFSYYVLFSWLALVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSY

Query:  SRGHSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRS
        SRGHSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRS
Subjt:  SRGHSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRS

Query:  PRGRSRSRSPRGRSRSPRGRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDRSRSPMDRSRSPMDEGEDFNGGGSKNYRREENGYSRSPSPLPREEA
        PRGRSRSRSPRGRSRSPRGRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDRSRSPMDRSRSPMDEGEDFNGGGSKNYRREENGYSRSPSPLPREEA
Subjt:  PRGRSRSRSPRGRSRSPRGRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDRSRSPMDRSRSPMDEGEDFNGGGSKNYRREENGYSRSPSPLPREEA

Query:  SPVNDEDNNGSPRGDSESA
        SPVNDEDNNGSPRGDSESA
Subjt:  SPVNDEDNNGSPRGDSESA

XP_022956473.1 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X3 [Cucurbita moschata]1.1e-15177.4Show/hide
Query:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQPSYNFSYYVLFSW
        RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKG                                                      
Subjt:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQPSYNFSYYVLFSW

Query:  LALVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGHSYSRSRSP
           VPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGHSYSRSRSP
Subjt:  LALVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGHSYSRSRSP

Query:  VKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRG
        VKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRG
Subjt:  VKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRG

Query:  RSRSPRGRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDRSRSPMDRSRSPMDEGEDFNGGGSKNYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSP
        RSRSPRGRSRSPI                                   DRSRSPMDEGEDFNGGGSKNYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSP
Subjt:  RSRSPRGRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDRSRSPMDRSRSPMDEGEDFNGGGSKNYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSP

Query:  RGDSESA
        RGDSESA
Subjt:  RGDSESA

XP_023539977.1 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.5e-15380.49Show/hide
Query:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQPSYNFSYYVLFSW
        RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKG                                                      
Subjt:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQPSYNFSYYVLFSW

Query:  LALVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGHSYSRSRSP
           VPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRG SYSRSRSP
Subjt:  LALVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGHSYSRSRSP

Query:  VKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRG
        VKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRS TPDERSPEEARHSLSPG RDSPRGGR SRSPRGRS SRSPRGRS SRSPRG  RS SPRG
Subjt:  VKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRG

Query:  RSR-SPRGR-SRSPIDR-SRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDRSRSPMDRSRSPMDEGEDFNGGGSKNYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNN
        RS  SPRGR SRSP  R SRSP  RS SP  RSRSP+DRSRSPMDRSRSPMDRSRSPMDEGEDFNGGGS+NYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNN
Subjt:  RSR-SPRGR-SRSPIDR-SRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDRSRSPMDRSRSPMDEGEDFNGGGSKNYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNN

Query:  GSPRGDSESA
        GSPRG SESA
Subjt:  GSPRGDSESA

XP_023540002.1 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X3 [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.0e-16081.04Show/hide
Query:  MMALPVSGTNLRRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQP
        MMALPVSGTNLRRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKG                                          
Subjt:  MMALPVSGTNLRRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQP

Query:  SYNFSYYVLFSWLALVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSY
                       VPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSY
Subjt:  SYNFSYYVLFSWLALVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSY

Query:  SRGHSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRS
        SRG SYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRS TPDERSPEEARHSLSPG RDSPRGGR SRSPRGRS SRSPRGRS SRS
Subjt:  SRGHSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRS

Query:  PRGRSRSRSPRGRSR-SPRGR-SRSPIDR-SRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDRSRSPMDRSRSPMDEGEDFNGGGSKNYRREENGYSRSPSPLPR
        PRG  RS SPRGRS  SPRGR SRSP  R SRSP  RS SP  RSRSP+DRSRSPMDRSRSPMDRSRSPMDEGEDFNGGGS+NYRREENGYSRSPSPLPR
Subjt:  PRGRSRSRSPRGRSR-SPRGR-SRSPIDR-SRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDRSRSPMDRSRSPMDEGEDFNGGGSKNYRREENGYSRSPSPLPR

Query:  EEASPVNDEDNNGSPRGDSESA
        EEASPVNDEDNNGSPRG SESA
Subjt:  EEASPVNDEDNNGSPRGDSESA

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1GWF1 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X27.7e-18386.4Show/hide
Query:  MMALPVSGTNLRRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQP
        MMALPVSGTNLRRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKG                                          
Subjt:  MMALPVSGTNLRRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQP

Query:  SYNFSYYVLFSWLALVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSY
                       VPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSY
Subjt:  SYNFSYYVLFSWLALVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSY

Query:  SRGHSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRS
        SRGHSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRS
Subjt:  SRGHSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRS

Query:  PRGRSRSRSPRGRSRSPRGRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDRSRSPMDRSRSPMDEGEDFNGGGSKNYRREENGYSRSPSPLPREEA
        PRGRSRSRSPRGRSRSPRGRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDRSRSPMDRSRSPMDEGEDFNGGGSKNYRREENGYSRSPSPLPREEA
Subjt:  PRGRSRSRSPRGRSRSPRGRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDRSRSPMDRSRSPMDEGEDFNGGGSKNYRREENGYSRSPSPLPREEA

Query:  SPVNDEDNNGSPRGDSESA
        SPVNDEDNNGSPRGDSESA
Subjt:  SPVNDEDNNGSPRGDSESA

A0A6J1GWY2 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X35.4e-15277.4Show/hide
Query:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQPSYNFSYYVLFSW
        RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKG                                                      
Subjt:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQPSYNFSYYVLFSW

Query:  LALVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGHSYSRSRSP
           VPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGHSYSRSRSP
Subjt:  LALVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGHSYSRSRSP

Query:  VKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRG
        VKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRG
Subjt:  VKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRG

Query:  RSRSPRGRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDRSRSPMDRSRSPMDEGEDFNGGGSKNYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSP
        RSRSPRGRSRSPI                                   DRSRSPMDEGEDFNGGGSKNYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSP
Subjt:  RSRSPRGRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDRSRSPMDRSRSPMDEGEDFNGGGSKNYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSP

Query:  RGDSESA
        RGDSESA
Subjt:  RGDSESA

A0A6J1GZ46 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X16.9e-17686Show/hide
Query:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQPSYNFSYYVLFSW
        RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKG                                                      
Subjt:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQPSYNFSYYVLFSW

Query:  LALVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGHSYSRSRSP
           VPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGHSYSRSRSP
Subjt:  LALVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGHSYSRSRSP

Query:  VKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRG
        VKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRG
Subjt:  VKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRG

Query:  RSRSPRGRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDRSRSPMDRSRSPMDEGEDFNGGGSKNYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSP
        RSRSPRGRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDRSRSPMDRSRSPMDEGEDFNGGGSKNYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSP
Subjt:  RSRSPRGRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDRSRSPMDRSRSPMDEGEDFNGGGSKNYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSP

Query:  RGDSESA
        RGDSESA
Subjt:  RGDSESA

A0A6J1J216 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X11.0e-14275.49Show/hide
Query:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQPSYNFSYYVLFSW
        RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKG                                                      
Subjt:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQPSYNFSYYVLFSW

Query:  LALVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGHSYSRSRSP
           VPRGPGGSRE LGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPR GRSRSRSYSRGHSYSRSRSP
Subjt:  LALVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGHSYSRSRSP

Query:  VKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRG
        VKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRS TPDERSPEEA+HSLSPGNR SPRGGRSSRSPRGRS SRSP GRSRS SPRGRS S SPRG
Subjt:  VKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRG

Query:  RSRSPRGRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDRSRSPMDRSRSPMDEG-EDFNGGGSKNYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGS
        RSRSPRGRSRSP  RSRSPI                            DRSRSPMDEG EDFNGGGS+NYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGS
Subjt:  RSRSPRGRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDRSRSPMDRSRSPMDEG-EDFNGGGSKNYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGS

Query:  PRGDSESA
        PRG SESA
Subjt:  PRGDSESA

A0A6J1JAE7 serine/arginine-rich splicing factor RS2Z32-like isoform X31.1e-14976.19Show/hide
Query:  MMALPVSGTNLRRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQP
        MMALPVSGTNLRRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKG                                          
Subjt:  MMALPVSGTNLRRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQP

Query:  SYNFSYYVLFSWLALVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSY
                       VPRGPGGSRE LGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPR GRSRSRSY
Subjt:  SYNFSYYVLFSWLALVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSY

Query:  SRGHSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRS
        SRGHSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRS TPDERSPEEA+HSLSPGNR SPRGGRSSRSPRGRS SRSP GRSRS S
Subjt:  SRGHSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRS

Query:  PRGRSRSRSPRGRSRSPRGRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDRSRSPMDRSRSPMDEG-EDFNGGGSKNYRREENGYSRSPSPLPREE
        PRGRS S SPRGRSRSPRGRSRSP  RSRSPI                            DRSRSPMDEG EDFNGGGS+NYRREENGYSRSPSPLPREE
Subjt:  PRGRSRSRSPRGRSRSPRGRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDRSRSPMDRSRSPMDEG-EDFNGGGSKNYRREENGYSRSPSPLPREE

Query:  ASPVNDEDNNGSPRGDSESA
        ASPVNDEDNNGSPRG SESA
Subjt:  ASPVNDEDNNGSPRGDSESA

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q08170 Serine/arginine-rich splicing factor 44.6e-0732.74Show/hide
Query:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQ---PSYNFSYYVL
        ++ +VD+K  Y FVEF D RDADDA Y LNG+D+ G R+IVE A+G       D ++    +G               + Y   GR    P     Y ++
Subjt:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQ---PSYNFSYYVL

Query:  F-------SWLALVPRGPGGSREYLGRGPPGT------GRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSR
                SW  L        ++Y+ +    T      GR     I+     D K      K       G   +  ++ P   +R SYSRS S  R RSR
Subjt:  F-------SWLALVPRGPGGSREYLGRGPPGT------GRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSR

Query:  SR----------SYSRGHSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDE---RSPEEARHSL-------SPGNRDSPRG
        SR          S    HS SRSRS   R  S  RS  RSRS     S K  S SP   K+  RS +  +   +S ++A   +        P +R SP  
Subjt:  SR----------SYSRGHSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDE---RSPEEARHSL-------SPGNRDSPRG

Query:  GRSSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRS---PRGRSRSPRG-RSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDRSRSPMDRSRSPMDEGED
         +S    R RS+ R      R    RGRS+ +S    R RSRS  G RSRS   RSRS     R    RSR    RSRS   RSRS  +RSR       D
Subjt:  GRSSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRS---PRGRSRSPRG-RSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDRSRSPMDRSRSPMDEGED

Query:  FNGGGSKNYRRE--ENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSPRGDSESA
           G SK  ++E  +   SRSPS    +E      E +    RG+SE+A
Subjt:  FNGGGSKNYRRE--ENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSPRGDSESA

Q8BTI8 Serine/arginine repetitive matrix protein 22.7e-0742.91Show/hide
Query:  SYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGHSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGR--SSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSS
        S+S +PS R GRSRS +  RG   SRSR+P KR  S      RSRSP+ R   S +R   S  P +  +       RSP+    S S   R++ R GRS 
Subjt:  SYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGHSYSRSRSPVKRERSLERSDKRSRSPRGR--SSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSS

Query:  RSPRGRSRSRSP--RGRSRSRSP--RGRSRSRSP---RGRSRSP---RGRSRSPIDRSRSPIDRSRSPI---DRSRSPI-DRSRSPMDRSRSPMDRSRSP
         + RGRS SRSP  RGRSRSR+P  RGRSRSR+P   R RSR+P   R RSR+P  R RS   RSR+P     R+RSP+  RSRS     RS   RSR+P
Subjt:  RSPRGRSRSRSP--RGRSRSRSP--RGRSRSRSP---RGRSRSP---RGRSRSPIDRSRSPIDRSRSPI---DRSRSPI-DRSRSPMDRSRSPMDRSRSP

Query:  MDEGEDFNGGGSKNYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSPR
                 G S++      G SRS +P  R   S        G  R
Subjt:  MDEGEDFNGGGSKNYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSPR

Q8VYA5 Serine/arginine-rich splicing factor RS2Z339.1e-4848.43Show/hide
Query:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQPSYNFSYYVLFSW
        RVRDVDMKRDYAFVEF DPRDADDAR+ L+GRD  GSRI VE ++G                                                      
Subjt:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQPSYNFSYYVLFSW

Query:  LALVPRGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKR-GSYSRSP----SPRRGRSRSRSYSRGHSY
               P GSR++  RG PPG GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHIE+NC+NSPKKL+R GSYSRSP    SPRR RS SRS SR  SY
Subjt:  LALVPRGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKR-GSYSRSP----SPRRGRSRSRSYSRGHSY

Query:  SRSRSPV-KRERSLE---RSDKR---SRSPRGR---------SSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDE--RSPEE-ARHS-LSP---GNRDSPRGGRSSRSP
        SRSRSPV +RERS+E   RS KR   S SPR R          SPK    SPPPS  +++    D    SP++  R+S +SP      DS +  RS    
Subjt:  SRSRSPV-KRERSLE---RSDKR---SRSPRGR---------SSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDE--RSPEE-ARHS-LSP---GNRDSPRGGRSSRSP

Query:  RGRSRSRSPRGRSRSRSP
               SPRG   S SP
Subjt:  RGRSRSRSPRGRSRSRSP

Q9FYB7 Serine/arginine-rich splicing factor RS2Z326.9e-4848.23Show/hide
Query:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQPSYNFSYYVLFSW
        RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARY L+GRD  GSRI VE ++G                                                      
Subjt:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQPSYNFSYYVLFSW

Query:  LALVPRGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSP---KKLKRGSYSRSP----SPRRGR--SRSRSYSR
               P GSR+   RG PPG+GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHIE+NC+NSP   K  + GSYSRSP    SPRR R  SRSRSYSR
Subjt:  LALVPRGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSP---KKLKRGSYSRSP----SPRRGR--SRSRSYSR

Query:  GHSYSRSRSPVKRERSLE---RSDK---RSRSPRGRS---SPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSP--GNRDSPRG-GRSSRSPRGRSRSR
        G SYSRSRSPV+RE+S+E   RS K   RS SP+GR    SP R  +   P +      +P E      R+S SP  G  +SP G     RSP       
Subjt:  GHSYSRSRSPVKRERSLE---RSDK---RSRSPRGRS---SPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSP--GNRDSPRG-GRSSRSPRGRSRSR

Query:  SPRGRSRSRSP
        S      S SP
Subjt:  SPRGRSRSRSP

Q9UQ35 Serine/arginine repetitive matrix protein 26.6e-0636.98Show/hide
Query:  RGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGHSYSRSRSPVKRER
        R P  ++    R    T R  +      W R   A  W         R    +    SP   +R  +SRS + +R R RSRS  RG S+  SRSP  R R
Subjt:  RGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGHSYSRSRSPVKRER

Query:  SLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSP-RGRSRSRSP---RGRSRSRSP--RGRSRSRSP-
        S  R+  R    R R+  +R S S  P++   RS TP  R    +R   +P  R S      +RSP R RSRSRSP    GRSRSR+P  RGRSRSR+P 
Subjt:  SLERSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSP-RGRSRSRSP---RGRSRSRSP--RGRSRSRSP-

Query:  -RGRSRSPRGRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDRSRSPMDRSRSPMDEGEDFNGGGSKNYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNN
         RGRSRS     RS   RSR+P  R RS     R    RSRS + R RS    SR+P   G   +    KN  R     SRS S  P  + S ++   + 
Subjt:  -RGRSRSPRGRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDRSRSPMDRSRSPMDEGEDFNGGGSKNYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNN

Query:  --GSPRGDSES
           SPR  ++S
Subjt:  --GSPRGDSES

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G37340.1 arginine/serine-rich zinc knuckle-containing protein 336.4e-4948.43Show/hide
Query:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQPSYNFSYYVLFSW
        RVRDVDMKRDYAFVEF DPRDADDAR+ L+GRD  GSRI VE ++G                                                      
Subjt:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQPSYNFSYYVLFSW

Query:  LALVPRGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKR-GSYSRSP----SPRRGRSRSRSYSRGHSY
               P GSR++  RG PPG GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHIE+NC+NSPKKL+R GSYSRSP    SPRR RS SRS SR  SY
Subjt:  LALVPRGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKR-GSYSRSP----SPRRGRSRSRSYSRGHSY

Query:  SRSRSPV-KRERSLE---RSDKR---SRSPRGR---------SSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDE--RSPEE-ARHS-LSP---GNRDSPRGGRSSRSP
        SRSRSPV +RERS+E   RS KR   S SPR R          SPK    SPPPS  +++    D    SP++  R+S +SP      DS +  RS    
Subjt:  SRSRSPV-KRERSLE---RSDKR---SRSPRGR---------SSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDE--RSPEE-ARHS-LSP---GNRDSPRGGRSSRSP

Query:  RGRSRSRSPRGRSRSRSP
               SPRG   S SP
Subjt:  RGRSRSRSPRGRSRSRSP

AT2G37340.2 arginine/serine-rich zinc knuckle-containing protein 331.4e-4046.05Show/hide
Query:  EFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQPSYNFSYYVLFSWLALVPRGPGGSREY
        EF DPRDADDAR+ L+GRD  GSRI VE ++G                                                             P GSR++
Subjt:  EFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQPSYNFSYYVLFSWLALVPRGPGGSREY

Query:  LGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKR-GSYSRSP----SPRRGRSRSRSYSRGHSYSRSRSPV-KRERSL
          RG PPG GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHIE+NC+NSPKKL+R GSYSRSP    SPRR RS SRS SR  SYSRSRSPV +RERS+
Subjt:  LGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKR-GSYSRSP----SPRRGRSRSRSYSRGHSYSRSRSPV-KRERSL

Query:  E---RSDKR---SRSPRGR---------SSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDE--RSPEE-ARHS-LSP---GNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSR
        E   RS KR   S SPR R          SPK    SPPPS  +++    D    SP++  R+S +SP      DS +  RS           SPRG   
Subjt:  E---RSDKR---SRSPRGR---------SSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDE--RSPEE-ARHS-LSP---GNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSR

Query:  SRSP
        S SP
Subjt:  SRSP

AT2G37340.3 arginine/serine-rich zinc knuckle-containing protein 331.5e-4547.44Show/hide
Query:  MKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQPSYNFSYYVLFSWLALVPR
        MKRDYAFVEF DPRDADDAR+ L+GRD  GSRI VE ++G                                                            
Subjt:  MKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQPSYNFSYYVLFSWLALVPR

Query:  GPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKR-GSYSRSP----SPRRGRSRSRSYSRGHSYSRSRSP
         P GSR++  RG PPG GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHIE+NC+NSPKKL+R GSYSRSP    SPRR RS SRS SR  SYSRSRSP
Subjt:  GPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKR-GSYSRSP----SPRRGRSRSRSYSRGHSYSRSRSP

Query:  V-KRERSLE---RSDKR---SRSPRGR---------SSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDE--RSPEE-ARHS-LSP---GNRDSPRGGRSSRSPRGRSRS
        V +RERS+E   RS KR   S SPR R          SPK    SPPPS  +++    D    SP++  R+S +SP      DS +  RS          
Subjt:  V-KRERSLE---RSDKR---SRSPRGR---------SSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDE--RSPEE-ARHS-LSP---GNRDSPRGGRSSRSPRGRSRS

Query:  RSPRGRSRSRSP
         SPRG   S SP
Subjt:  RSPRGRSRSRSP

AT3G53500.1 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein with retrovirus zinc finger-like domain1.5e-4547.21Show/hide
Query:  MKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQPSYNFSYYVLFSWLALVPR
        MKRDYAFVEFSDPRDADDARY L+GRD  GSRI VE ++G                                                            
Subjt:  MKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQPSYNFSYYVLFSWLALVPR

Query:  GPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSP---KKLKRGSYSRSP----SPRRGR--SRSRSYSRGHSYSR
         P GSR+   RG PPG+GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHIE+NC+NSP   K  + GSYSRSP    SPRR R  SRSRSYSRG SYSR
Subjt:  GPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSP---KKLKRGSYSRSP----SPRRGR--SRSRSYSRGHSYSR

Query:  SRSPVKRERSLE---RSDK---RSRSPRGRS---SPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSP--GNRDSPRG-GRSSRSPRGRSRSRSPRGRS
        SRSPV+RE+S+E   RS K   RS SP+GR    SP R  +   P +      +P E      R+S SP  G  +SP G     RSP       S     
Subjt:  SRSPVKRERSLE---RSDK---RSRSPRGRS---SPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSP--GNRDSPRG-GRSSRSPRGRSRSRSPRGRS

Query:  RSRSP
         S SP
Subjt:  RSRSP

AT3G53500.2 RNA-binding (RRM/RBD/RNP motifs) family protein with retrovirus zinc finger-like domain4.9e-4948.23Show/hide
Query:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQPSYNFSYYVLFSW
        RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARY L+GRD  GSRI VE ++G                                                      
Subjt:  RVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQPSYNFSYYVLFSW

Query:  LALVPRGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSP---KKLKRGSYSRSP----SPRRGR--SRSRSYSR
               P GSR+   RG PPG+GRCFNCG+DGHWARDC AGDWKNKCYRCGERGHIE+NC+NSP   K  + GSYSRSP    SPRR R  SRSRSYSR
Subjt:  LALVPRGPGGSREYLGRG-PPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSP---KKLKRGSYSRSP----SPRRGR--SRSRSYSR

Query:  GHSYSRSRSPVKRERSLE---RSDK---RSRSPRGRS---SPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSP--GNRDSPRG-GRSSRSPRGRSRSR
        G SYSRSRSPV+RE+S+E   RS K   RS SP+GR    SP R  +   P +      +P E      R+S SP  G  +SP G     RSP       
Subjt:  GHSYSRSRSPVKRERSLE---RSDK---RSRSPRGRS---SPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSP--GNRDSPRG-GRSSRSPRGRSRSR

Query:  SPRGRSRSRSP
        S      S SP
Subjt:  SPRGRSRSRSP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATGGCCTTACCTGTTTCTGGAACCAATTTGCGCAGAGTACGCGATGTGGATATGAAGCGAGACTATGCATTTGTTGAGTTTAGTGATCCCCGAGATGCTGACGATGC
AAGATATAGTTTAAATGGGAGGGATGTTCAAGGAAGTAGAATCATTGTGGAAATAGCTAAAGGGGTATGTACCATAATATTTCCAGACAAAACCTTTCATAAACTGTGTA
ACGGTTGTCTTTTGGTGGTTTCTGTTCTTGTATGTGCTAATATAATATTATTTTGGTACGTGGAACTTGGAAGACAACCTTCATACAATTTCAGCTATTATGTGTTGTTT
TCCTGGCTTGCTCTGGTACCCCGTGGTCCTGGTGGATCCCGTGAATATCTTGGTAGAGGCCCTCCTGGAACTGGGCGATGTTTTAACTGTGGGATTGATGGCCACTGGGC
TAGAGATTGCAAGGCTGGAGACTGGAAAAATAAGTGCTATCGCTGTGGTGAACGGGGTCACATAGAGAAGAATTGCCAGAACAGTCCTAAGAAATTGAAACGTGGAAGTT
ACTCACGTTCACCCAGTCCTCGCCGTGGTAGAAGCCGCAGTCGAAGTTACAGCAGAGGTCATAGCTACAGTCGTTCTAGATCACCCGTAAAAAGAGAGAGAAGCCTTGAA
CGATCAGATAAAAGATCAAGGAGTCCGAGAGGCAGGTCAAGCCCAAAGAGGCACAGTTTGTCACCTCCTCCTTCGAAAGCTATGAAACGTAGCGCCACACCTGATGAGAG
GAGTCCAGAAGAAGCAAGACACAGTCTGTCCCCTGGGAATCGCGACAGTCCAAGAGGAGGTAGGAGCAGCAGGAGTCCGAGAGGTAGGAGCAGGAGCAGAAGTCCAAGAG
GTAGGAGCAGGAGCAGAAGTCCAAGAGGTAGGAGCAGGAGCAGAAGTCCAAGAGGTAGAAGCAGGAGTCCAAGAGGTAGAAGCAGGAGTCCAATAGATAGGAGCAGGAGT
CCAATAGATAGGAGCAGGAGTCCAATAGATAGGAGCAGGAGTCCAATAGATAGGAGCAGGAGTCCAATGGATAGGAGCAGGAGTCCAATGGATAGGAGCAGGAGTCCAAT
GGATGAAGGCGAGGACTTCAATGGTGGTGGAAGTAAGAATTATCGGAGGGAAGAAAATGGCTACAGTCGCAGCCCCAGTCCATTGCCCAGAGAAGAAGCGAGTCCTGTAA
ACGATGAAGATAATAATGGTTCTCCAAGGGGGGACAGCGAGTCTGCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATGGCCTTACCTGTTTCTGGAACCAATTTGCGCAGAGTACGCGATGTGGATATGAAGCGAGACTATGCATTTGTTGAGTTTAGTGATCCCCGAGATGCTGACGATGC
AAGATATAGTTTAAATGGGAGGGATGTTCAAGGAAGTAGAATCATTGTGGAAATAGCTAAAGGGGTATGTACCATAATATTTCCAGACAAAACCTTTCATAAACTGTGTA
ACGGTTGTCTTTTGGTGGTTTCTGTTCTTGTATGTGCTAATATAATATTATTTTGGTACGTGGAACTTGGAAGACAACCTTCATACAATTTCAGCTATTATGTGTTGTTT
TCCTGGCTTGCTCTGGTACCCCGTGGTCCTGGTGGATCCCGTGAATATCTTGGTAGAGGCCCTCCTGGAACTGGGCGATGTTTTAACTGTGGGATTGATGGCCACTGGGC
TAGAGATTGCAAGGCTGGAGACTGGAAAAATAAGTGCTATCGCTGTGGTGAACGGGGTCACATAGAGAAGAATTGCCAGAACAGTCCTAAGAAATTGAAACGTGGAAGTT
ACTCACGTTCACCCAGTCCTCGCCGTGGTAGAAGCCGCAGTCGAAGTTACAGCAGAGGTCATAGCTACAGTCGTTCTAGATCACCCGTAAAAAGAGAGAGAAGCCTTGAA
CGATCAGATAAAAGATCAAGGAGTCCGAGAGGCAGGTCAAGCCCAAAGAGGCACAGTTTGTCACCTCCTCCTTCGAAAGCTATGAAACGTAGCGCCACACCTGATGAGAG
GAGTCCAGAAGAAGCAAGACACAGTCTGTCCCCTGGGAATCGCGACAGTCCAAGAGGAGGTAGGAGCAGCAGGAGTCCGAGAGGTAGGAGCAGGAGCAGAAGTCCAAGAG
GTAGGAGCAGGAGCAGAAGTCCAAGAGGTAGGAGCAGGAGCAGAAGTCCAAGAGGTAGAAGCAGGAGTCCAAGAGGTAGAAGCAGGAGTCCAATAGATAGGAGCAGGAGT
CCAATAGATAGGAGCAGGAGTCCAATAGATAGGAGCAGGAGTCCAATAGATAGGAGCAGGAGTCCAATGGATAGGAGCAGGAGTCCAATGGATAGGAGCAGGAGTCCAAT
GGATGAAGGCGAGGACTTCAATGGTGGTGGAAGTAAGAATTATCGGAGGGAAGAAAATGGCTACAGTCGCAGCCCCAGTCCATTGCCCAGAGAAGAAGCGAGTCCTGTAA
ACGATGAAGATAATAATGGTTCTCCAAGGGGGGACAGCGAGTCTGCCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MMALPVSGTNLRRVRDVDMKRDYAFVEFSDPRDADDARYSLNGRDVQGSRIIVEIAKGVCTIIFPDKTFHKLCNGCLLVVSVLVCANIILFWYVELGRQPSYNFSYYVLF
SWLALVPRGPGGSREYLGRGPPGTGRCFNCGIDGHWARDCKAGDWKNKCYRCGERGHIEKNCQNSPKKLKRGSYSRSPSPRRGRSRSRSYSRGHSYSRSRSPVKRERSLE
RSDKRSRSPRGRSSPKRHSLSPPPSKAMKRSATPDERSPEEARHSLSPGNRDSPRGGRSSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSRSPRGRSRSPRGRSRSPIDRSRS
PIDRSRSPIDRSRSPIDRSRSPMDRSRSPMDRSRSPMDEGEDFNGGGSKNYRREENGYSRSPSPLPREEASPVNDEDNNGSPRGDSESA