CuGenDBv2

Gene ID	CmoCh04G014820
Organism	Cucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Description	Mitochondrial arginine transporter BAC2-like
Genome location	Cmo_Chr04:7593513..7595443
RNA-Seq Expression	CmoCh04G014820
Synteny	CmoCh04G014820
Gene Ontology terms	GO:1901962 - S-adenosyl-L-methionine transmembrane transport (biological process) GO:0005743 - mitochondrial inner membrane (cellular component) GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component) GO:0000095 - S-adenosyl-L-methionine transmembrane transporter activity (molecular function)
InterPro domains	IPR018108 - Mitochondrial substrate/solute carrier IPR023395 - Mitochondrial carrier domain superfamily

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

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Alignment

KAG6601202.1 Mitochondrial substrate carrier family protein S, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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KAG7031998.1 hypothetical protein SDJN02_06040 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

2.8e-159

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XP_022957565.1 mitochondrial arginine transporter BAC2 isoform X1 [Cucurbita moschata]

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XP_022957567.1 uncharacterized protein LOC111458924 isoform X2 [Cucurbita moschata]

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XP_023522755.1 uncharacterized protein LOC111786659 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

2.7e-157

99.29

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TrEMBL top hits

e value

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Alignment

A0A6J1CAV8 uncharacterized protein LOC111009990 isoform X1

2.4e-140

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A0A6J1GZG9 uncharacterized protein LOC111458924 isoform X2

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A0A6J1H0X1 mitochondrial arginine transporter BAC2 isoform X1

5.2e-159

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A0A6J1JSG1 uncharacterized protein LOC111489353 isoform X1

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A0A6J1JZV6 uncharacterized protein LOC111489353 isoform X2

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SwissProt top hits

e value

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Alignment

Q8C0K5 Graves disease carrier protein homolog

9.3e-04

30.15

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        G+  F+RGL   I   + ++GV F T+  L    L +    +  P   N  V  L      L  GV+GA+A  +S+ FD    R  L  VLP       +
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Query:  FLKWHRPGNRFERTTGIHPADRSLLFRGIGLRMARC
        F K        +   G H   R  L+RG+ L   RC
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Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT4G15010.1 Mitochondrial substrate carrier family protein

2.5e-97

59.79

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        YPWMMTG+G PP+  +V RP D+ SLEG++A WR LRSG+ RD I+ GVFFSTWQFLH +M+ WK++ M+P P S +EVGPLSP ++SLAAG+SGAVAAA
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         SH FDTA +R+ C +LPKY A ERKFLKW++PG R ER TGIHP DR+LLFRGIG+RMAR  + S  +VG YYL +D L+
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AT4G15010.2 Mitochondrial substrate carrier family protein

2.5e-97

59.79

Show/hide

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        DGR D+YV V EA LAGL+ GAAE+++ SPFEL+K+R QVT+A R P+  S V +   ++P +++ L  YTLD+K+L  +V LLS L  KH N+  ALQE
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        YPWMMTG+G PP+  +V RP D+ SLEG++A WR LRSG+ RD I+ GVFFSTWQFLH +M+ WK++ M+P P S +EVGPLSP ++SLAAG+SGAVAAA
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         SH FDTA +R+ C +LPKY A ERKFLKW++PG R ER TGIHP DR+LLFRGIG+RMAR  + S  +VG YYL +D L+
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AT4G15010.3 Mitochondrial substrate carrier family protein

2.5e-97

59.79

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        DGR D+YV V EA LAGL+ GAAE+++ SPFEL+K+R QVT+A R P+  S V +   ++P +++ L  YTLD+K+L  +V LLS L  KH N+  ALQE
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCAGATGGTCGTGAGGATGATTACGTGCATGTGTCCGAGGCTCTTCTGGCTGGACTTATGGCTGGTGCAGCAGAATCATTGATATGCTCGCCATTTGAGCTTGTTAA
ACTTCGTGCTCAGGTGACCTCTGCTATTCGATTACCAAGCCGAGTTTCTCTCGTTGGACAAGAAAGAGCTCTTGCACCTTCTATGTCAAGGTTTCTTCATGGCTATACAC
TGGATCTGAAAGCCTTAAACCATTCAGTTGGTCTTTTATCCACCCTAACAACTAAGCACCAAAATATAAAAGGTGCCTTACAAGAGTATCCATGGATGATGACGGGGTCC
GGGAGGCCACCTGCAGTTAGCAATGTGCATAGGCCATCAGATATCATATCACTGGAAGGATGGCAGGCATTTTGGAGAGGTCTACGATCTGGGATCGCGAGGGATTCCAT
CTTCAGCGGCGTATTTTTCTCGACCTGGCAATTTCTGCACCGATCTATGCTAATTTGGAAGAGCATCGAGATGGATCCACCACCCAGGTCAAATGATGAAGTAGGCCCAC
TGTCTCCGTTTTCGGTTAGTCTTGCAGCTGGAGTTTCCGGTGCAGTTGCTGCAGCTGTCTCTCATGGTTTCGATACTGCCAATAGTCGGTCACTATGCACCGTGCTGCCC
AAGTATGTCGCCATGGAGAGAAAGTTTCTCAAATGGCATCGACCGGGGAATAGATTTGAGAGAACCACGGGGATTCATCCTGCAGATCGGAGTCTCCTGTTTCGTGGCAT
AGGATTGCGAATGGCTCGTTGTGGTTTAGGGTCATTTTTTATGGTTGGAGGTTACTATTTGATTCTTGATCATTTGTTGAAATGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

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GRPPAVSNVHRPSDIISLEGWQAFWRGLRSGIARDSIFSGVFFSTWQFLHRSMLIWKSIEMDPPPRSNDEVGPLSPFSVSLAAGVSGAVAAAVSHGFDTANSRSLCTVLP
KYVAMERKFLKWHRPGNRFERTTGIHPADRSLLFRGIGLRMARCGLGSFFMVGGYYLILDHLLK

CmoCh04G014820 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome