; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh04G017460 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh04G017460
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptiontranscription factor MYB117
Genome locationCmo_Chr04:8817867..8819112
RNA-Seq ExpressionCmoCh04G017460
SyntenyCmoCh04G017460
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
InterPro domainsIPR001005 - SANT/Myb domain
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017930 - Myb domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6601441.1 Transcription factor MYB105, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.0e-18499.39Show/hide
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KAG7032223.1 Transcription factor MYB-like protein [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.0e-18499.39Show/hide
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XP_022957222.1 transcription factor MYB117 [Cucurbita moschata]2.4e-186100Show/hide
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XP_022991707.1 transcription factor MYB117-like [Cucurbita maxima]1.2e-16694.69Show/hide
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XP_023512105.1 transcription factor MYB117-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.0e-18499.39Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1G0L6 transcription factor CSA-like isoform X21.7e-11665.94Show/hide
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        MARKYRE SR YRRRKL+QSVY KM++DLSFL     + +  P  ++  GAVDY FLTQM  AG E+M      + PFF+SC+ LS LNVL DPKSRFW+
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        GTG+G + P S  +Y   NT A A+NDGVGGSQVAT     GGSSS        +P FIDFLGVGAT
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A0A6J1GYK1 transcription factor MYB1171.2e-186100Show/hide
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        GSQVATGGSSSSPRFIDFLGVGATGS
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A0A6J1HTU7 transcription factor CSA-like isoform X22.6e-11766.49Show/hide
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        MGML D     DD+G+ VE S+ LDLN A++S S              +FPFSCES M+RSSETDFSDGFVEN N   N AS             GAQSR
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        MARKYRE SR YRRRKL QSVY KM++DLSFL     + +  P  ++  GAVDY FLTQM   G E+M      + PFF+SC+ LS LNVLPDPKSRFW+
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        GTG+G + P S  +Y   NTAA A+NDGVGGSQ AT     GGSSS        +P FIDFLGVGAT
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A0A6J1HW56 transcription factor CSA-like isoform X12.4e-11565.42Show/hide
Query:  MGMLVD-----DDYGMKVEGSMDLDLNSALMSIS--------------DFPFSCESMMSRSSETDFSDGFVENHN--ANPASCSNANNNNTTTPTGAQSR
        MGML D     DD+G+ VE S+ LDLN A++S S              +FPFSCES M+RSSETDFSDGFVEN N   N AS             GAQSR
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        LCARGHWRPAEDTKLRELVA+YGPQNWNLIAEKLEGRSGKSCRLRWFNQLDPRINRR FSEEEEERLMQAHRIYGNKWAMIARLFPGRTDNAVKNHWHVI
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Query:  MARKYREHSRCYRRRKLTQSVYTKMDQDLSFL-----KHHNMPNFQASIGAVDYAFLTQMPIAGAEAM----PCDTPFFTSCAHLSNLNVLP------DP
        MARKYRE SR YRRRKL QSVY KM++DLSFL     + +  P  ++  GAVDY FLTQM   G E+M      + PFF+SC+ LS LNVLP      DP
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Query:  KSRFWDGTGNGILVPGSQSEYGACNTAAAAANDGVGGSQVAT-----GGSSS--------SPRFIDFLGVGAT
        KSRFW+GTG+G + P S  +Y   NTAA A+NDGVGGSQ AT     GGSSS        +P FIDFLGVGAT
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A0A6J1JML3 transcription factor MYB117-like6.0e-16794.69Show/hide
Query:  MDLDLNSALMSISDFPFSCESMMSRSSETDFSDGFVENHNANPASCSNANNNNTTTPTGAQSRLCARGHWRPAEDTKLRELVAIYGPQNWNLIAEKLEGR
        MDLDLNSALMSISDFPFSCESMMSRSSETDFSDGFVENHNANPASCSNANNNN TTPTGAQSRLCARGHWRPAEDTKLRELVAIYGPQNWNLIAEKLEGR
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Query:  SGKSCRLRWFNQLDPRINRRAFSEEEEERLMQAHRIYGNKWAMIARLFPGRTDNAVKNHWHVIMARKYREHSRCYRRRKLTQSVYTKMDQDLSFLKHHNM
        SGKSCRLRWFNQLDPRINRRAFSEEEEERLMQAHRIYGNKWAMIARLFPGRTDNAVKNHWHVIMARKYREHSRCYRRRKLTQSVYTKMDQDLSFLKHHN+
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Query:  PNFQASIGAVDYAFLTQMPIAGAEAMPCDTPFFTSCAHLSNLNVLPDPKSRFWDGTGNGILVPGSQSEYGACNT-AAAAANDGVGGSQVATGGSSS----
        PNFQASIGAVDYAFLTQMPIAGAEAMP DTPFFTSCAHLS LNVLPDPKSRFWDGTGNGILVPGS SEY ACNT AAAAANDGVGGSQVA GGSSS    
Subjt:  PNFQASIGAVDYAFLTQMPIAGAEAMPCDTPFFTSCAHLSNLNVLPDPKSRFWDGTGNGILVPGSQSEYGACNT-AAAAANDGVGGSQVATGGSSS----

Query:  -----SPRFIDFLGVGATGS
             SPRFIDFLGVGATGS
Subjt:  -----SPRFIDFLGVGATGS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q5NBM8 Transcription factor CSA7.5e-5847.83Show/hide
Query:  GAQSRLCARGHWRPAEDTKLRELVAIYGPQNWNLIAEKLEGRSGKSCRLRWFNQLDPRINRRAFSEEEEERLMQAHRIYGNKWAMIARLFPGRTDNAVKN
        G Q +LCARGHWRPAED KL++LVA YGPQNWNLIAEKL+GRSGKSCRLRWFNQLDPRINRRAF+EEEEERLM AHR YGNKWA+IARLFPGRTDNAVKN
Subjt:  GAQSRLCARGHWRPAEDTKLRELVAIYGPQNWNLIAEKLEGRSGKSCRLRWFNQLDPRINRRAFSEEEEERLMQAHRIYGNKWAMIARLFPGRTDNAVKN

Query:  HWHVIMARKYREHSRCYRRRKLTQSVYTKM--------DQDLSFLKHHNMPNFQ--------------ASIGAVDYAFLTQMPIAGAEA-----MPCDTP
        HWHV+MAR++RE S  +RRRK + S  +           Q +  L HH+    Q              AS    D +  +    A A A     +PC   
Subjt:  HWHVIMARKYREHSRCYRRRKLTQSVYTKM--------DQDLSFLKHHNMPNFQ--------------ASIGAVDYAFLTQMPIAGAEA-----MPCDTP

Query:  FFTSCAHLSNLNVLPDPK-------SRFWDGTGNGI------LVPGSQSEYGACNTAAAAANDGVG---------GSQVATGGSSSSPRFIDFLGVGAT
          T  A  S+      P+         F+ G G         + P + S +     +A +A  G G         G   AT  S + P F DFLGVGAT
Subjt:  FFTSCAHLSNLNVLPDPK-------SRFWDGTGNGI------LVPGSQSEYGACNTAAAAANDGVG---------GSQVATGGSSSSPRFIDFLGVGAT

Q6R053 Transcription factor MYB561.3e-4975.86Show/hide
Query:  TGAQSRLCARGHWRPAEDTKLRELVAIYGPQNWNLIAEKLEGRSGKSCRLRWFNQLDPRINRRAFSEEEEERLMQAHRIYGNKWAMIARLFPGRTDNAVK
        +G  +++C+RGHWRP ED KL+ELVA +GPQNWNLI+  L GRSGKSCRLRWFNQLDPRIN+RAF+EEEE RL+ AHR YGNKWA+I+RLFPGRTDNAVK
Subjt:  TGAQSRLCARGHWRPAEDTKLRELVAIYGPQNWNLIAEKLEGRSGKSCRLRWFNQLDPRINRRAFSEEEEERLMQAHRIYGNKWAMIARLFPGRTDNAVK

Query:  NHWHVIMARKYREHSR
        NHWHVIMAR+ RE  R
Subjt:  NHWHVIMARKYREHSR

Q6R0C4 Transcription factor MYB522.4e-4877.27Show/hide
Query:  LCARGHWRPAEDTKLRELVAIYGPQNWNLIAEKLEGRSGKSCRLRWFNQLDPRINRRAFSEEEEERLMQAHRIYGNKWAMIARLFPGRTDNAVKNHWHVI
        +C+RGHWRPAED KLRELV  +GP NWN IA+KL GRSGKSCRLRWFNQLDPRINR  F+EEEEERL+ +HRI+GN+W++IAR FPGRTDNAVKNHWHVI
Subjt:  LCARGHWRPAEDTKLRELVAIYGPQNWNLIAEKLEGRSGKSCRLRWFNQLDPRINRRAFSEEEEERLMQAHRIYGNKWAMIARLFPGRTDNAVKNHWHVI

Query:  MARKYREHSR
        MAR+ RE S+
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Q9LQX5 Transcription factor MYB1174.7e-6064.13Show/hide
Query:  ENHNANPASCSNANNNNTTTPTG-------AQSRLCARGHWRPAEDTKLRELVAIYGPQNWNLIAEKLEGRSGKSCRLRWFNQLDPRINRRAFSEEEEER
        E++N NP   ++ +    TT +G       ++  +  RGHWRPAED KL+ELV+IYGPQNWNLIAEKL+GRSGKSCRLRWFNQLDPRINRRAF+EEEEER
Subjt:  ENHNANPASCSNANNNNTTTPTG-------AQSRLCARGHWRPAEDTKLRELVAIYGPQNWNLIAEKLEGRSGKSCRLRWFNQLDPRINRRAFSEEEEER

Query:  LMQAHRIYGNKWAMIARLFPGRTDNAVKNHWHVIMARKYREHSRCYRRRKLTQSVYTKMDQDLSFLKHHN-MPNFQASIGAVDY
        LMQAHR+YGNKWAMIARLFPGRTDN+VKNHWHV+MARKYREHS  YRRRKL  +    +   L+   H N  PN+ + I    Y
Subjt:  LMQAHRIYGNKWAMIARLFPGRTDNAVKNHWHVIMARKYREHSRCYRRRKLTQSVYTKMDQDLSFLKHHN-MPNFQASIGAVDY

Q9SEZ4 Transcription factor MYB1054.0e-5975.5Show/hide
Query:  ENHNANPASCSNANNNNTTT--PTGAQSRL-CARGHWRPAEDTKLRELVAIYGPQNWNLIAEKLEGRSGKSCRLRWFNQLDPRINRRAFSEEEEERLMQA
        E+ N N +  SN N  +TT     G  S+   +RGHWRPAEDTKL+ELVA+YGPQNWNLIAEKL+GRSGKSCRLRWFNQLDPRINRRAF+EEEEERLMQA
Subjt:  ENHNANPASCSNANNNNTTT--PTGAQSRL-CARGHWRPAEDTKLRELVAIYGPQNWNLIAEKLEGRSGKSCRLRWFNQLDPRINRRAFSEEEEERLMQA

Query:  HRIYGNKWAMIARLFPGRTDNAVKNHWHVIMARKYREHSRCYRRRKLTQSV
        HR+YGNKWAMIARLFPGRTDN+VKNHWHVIMARK+RE S  YRRRK   S+
Subjt:  HRIYGNKWAMIARLFPGRTDNAVKNHWHVIMARKYREHSRCYRRRKLTQSV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G26780.1 myb domain protein 1173.3e-6164.13Show/hide
Query:  ENHNANPASCSNANNNNTTTPTG-------AQSRLCARGHWRPAEDTKLRELVAIYGPQNWNLIAEKLEGRSGKSCRLRWFNQLDPRINRRAFSEEEEER
        E++N NP   ++ +    TT +G       ++  +  RGHWRPAED KL+ELV+IYGPQNWNLIAEKL+GRSGKSCRLRWFNQLDPRINRRAF+EEEEER
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Query:  LMQAHRIYGNKWAMIARLFPGRTDNAVKNHWHVIMARKYREHSRCYRRRKLTQSVYTKMDQDLSFLKHHN-MPNFQASIGAVDY
        LMQAHR+YGNKWAMIARLFPGRTDN+VKNHWHV+MARKYREHS  YRRRKL  +    +   L+   H N  PN+ + I    Y
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AT1G26780.2 myb domain protein 1173.3e-6164.13Show/hide
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        E++N NP   ++ +    TT +G       ++  +  RGHWRPAED KL+ELV+IYGPQNWNLIAEKL+GRSGKSCRLRWFNQLDPRINRRAF+EEEEER
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        LMQAHR+YGNKWAMIARLFPGRTDN+VKNHWHV+MARKYREHS  YRRRKL  +    +   L+   H N  PN+ + I    Y
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AT1G69560.1 myb domain protein 1052.8e-6075.5Show/hide
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        E+ N N +  SN N  +TT     G  S+   +RGHWRPAEDTKL+ELVA+YGPQNWNLIAEKL+GRSGKSCRLRWFNQLDPRINRRAF+EEEEERLMQA
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Query:  HRIYGNKWAMIARLFPGRTDNAVKNHWHVIMARKYREHSRCYRRRKLTQSV
        HR+YGNKWAMIARLFPGRTDN+VKNHWHVIMARK+RE S  YRRRK   S+
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AT3G29020.1 myb domain protein 1101.6e-5074.36Show/hide
Query:  SRLCARGHWRPAEDTKLRELVAIYGPQNWNLIAEKLEGRSGKSCRLRWFNQLDPRINRRAFSEEEEERLMQAHRIYGNKWAMIARLFPGRTDNAVKNHWH
        SR+C+RGHWR +EDT+L ELV++YGPQNWN IAE ++GR+GKSCRLRWFNQLDPRIN+RAFS+EEEERL+ AHR +GNKWAMIA+LF GRTDNA+KNHWH
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Query:  VIMARKYREHSRCYRRR
        V+MARK R+ S  Y +R
Subjt:  VIMARKYREHSRCYRRR

AT5G17800.1 myb domain protein 569.1e-5175.86Show/hide
Query:  TGAQSRLCARGHWRPAEDTKLRELVAIYGPQNWNLIAEKLEGRSGKSCRLRWFNQLDPRINRRAFSEEEEERLMQAHRIYGNKWAMIARLFPGRTDNAVK
        +G  +++C+RGHWRP ED KL+ELVA +GPQNWNLI+  L GRSGKSCRLRWFNQLDPRIN+RAF+EEEE RL+ AHR YGNKWA+I+RLFPGRTDNAVK
Subjt:  TGAQSRLCARGHWRPAEDTKLRELVAIYGPQNWNLIAEKLEGRSGKSCRLRWFNQLDPRINRRAFSEEEEERLMQAHRIYGNKWAMIARLFPGRTDNAVK

Query:  NHWHVIMARKYREHSR
        NHWHVIMAR+ RE  R
Subjt:  NHWHVIMARKYREHSR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGTATGTTGGTTGATGATGATTATGGTATGAAAGTGGAGGGAAGCATGGATCTTGATCTCAACTCTGCACTCATGTCCATCTCTGATTTTCCATTTTCATGTGAGTC
TATGATGAGTAGAAGCTCAGAGACTGATTTCAGCGATGGATTTGTTGAAAATCACAACGCTAATCCAGCTTCTTGTTCCAATGCTAATAATAATAATACTACTACACCCA
CTGGGGCTCAGTCTAGGCTCTGTGCCAGAGGCCATTGGAGGCCTGCAGAGGACACCAAATTGAGAGAGCTCGTAGCCATTTATGGCCCCCAAAATTGGAACCTCATTGCA
GAGAAGCTAGAGGGAAGATCCGGTAAGAGCTGCAGATTGAGATGGTTTAACCAACTGGACCCAAGGATTAACAGAAGGGCATTCAGTGAAGAAGAGGAAGAGAGGCTAAT
GCAAGCTCATAGGATATATGGAAACAAATGGGCGATGATTGCAAGGCTTTTTCCTGGGAGGACTGATAATGCAGTGAAGAATCATTGGCATGTCATAATGGCAAGGAAGT
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GCTTCTATTGGTGCTGTTGATTATGCGTTTTTAACCCAAATGCCCATTGCTGGAGCAGAGGCAATGCCCTGTGACACCCCGTTCTTCACCTCATGTGCTCATCTTTCAAA
TCTCAATGTCCTTCCAGATCCCAAGAGCAGATTTTGGGATGGAACAGGCAATGGGATTCTGGTACCAGGAAGCCAGAGTGAGTATGGGGCGTGTAACACGGCGGCGGCGG
CGGCAAACGACGGCGTCGGGGGATCACAAGTGGCAACAGGTGGATCTTCTTCATCACCAAGATTTATTGACTTTCTTGGAGTTGGAGCCACAGGAAGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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EKLEGRSGKSCRLRWFNQLDPRINRRAFSEEEEERLMQAHRIYGNKWAMIARLFPGRTDNAVKNHWHVIMARKYREHSRCYRRRKLTQSVYTKMDQDLSFLKHHNMPNFQ
ASIGAVDYAFLTQMPIAGAEAMPCDTPFFTSCAHLSNLNVLPDPKSRFWDGTGNGILVPGSQSEYGACNTAAAAANDGVGGSQVATGGSSSSPRFIDFLGVGATGS