; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh04G017880 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh04G017880
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionlisH domain-containing protein C1711.05 isoform X4
Genome locationCmo_Chr04:8988809..8992379
RNA-Seq ExpressionCmoCh04G017880
SyntenyCmoCh04G017880
Gene Ontology termsGO:0016020 - membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6601476.1 hypothetical protein SDJN03_06709, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.8e-15784.08Show/hide
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                                           ++A     VVIFVLTVIFVLDAVFSTLAIFVVVKWTMSQKRQ
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KAG7032255.1 hypothetical protein SDJN02_06299, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.2e-16799.37Show/hide
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        AFPILADEVAQDGS L
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XP_022956763.1 uncharacterized protein LOC111458373 [Cucurbita moschata]1.9e-15599.66Show/hide
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XP_022978412.1 uncharacterized protein LOC111478406 [Cucurbita maxima]2.3e-14090.33Show/hide
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        MAATGRCE ++         GLGSTHSEDTAGEGFSLSPT QLAYGSSSCINL+ELSDLVQV ENVNRPE GTI LGNPDHDVYQLQFKDDESDVSS+CS
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XP_023530940.1 uncharacterized protein LOC111793332 [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.4e-14387.04Show/hide
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        MAATGRCE ++         GLGSTHSEDTAGEGFSLSPTEQLAYGSSSCINLLELSDLVQV ENVNRPEAGTIFLGNPDHDVYQLQFKDDESDVSSICS
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        G                        KSDELLVFNSPP VITSRETEMKSVEYEEEPKVAD+TEYNIEDKEGLVAEDLSGRNVLPPALSSNSSSRSRHSER
Subjt:  G------------------------KSDELLVFNSPPEVITSRETEMKSVEYEEEPKVADSTEYNIEDKEGLVAEDLSGRNVLPPALSSNSSSRSRHSER

Query:  SQCSSNSFAFPILADEVAQDGSSL
        SQCSSNSFAFPILADEVAQD S L
Subjt:  SQCSSNSFAFPILADEVAQDGSSL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S4DW25 uncharacterized protein LOC103489558 isoform X25.0e-9365.06Show/hide
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        MAA G   R   T G+    GLGS +S  T G+G SL PT+QL +GS+S I+LLE+SDL QVG NVNRPEA TI L NP   +YQLQFKDD+S+VSS CS
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        +KSEKSSGS  PTS SQV  +THESGGN +SPTQSP LQTMDR+GGY ESYDP RIPSAVFQRS S TP+EWSIASNESLFSI  G++SFS D++SMLS+
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Query:  PILADEVAQDGS
        PILADE AQ  S
Subjt:  PILADEVAQDGS

A0A1S4DW26 uncharacterized protein LOC103489558 isoform X11.2e-8964.9Show/hide
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        MAA G   R   T G+    GLGS +S  T G+G SL PT+QL +GS+S I+LLE+SDL QVG NVNRPEA TI L NP   +YQLQFKDD+S+VSS CS
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         GKS            DE  VF+ PP VITSRE EMKS EYEE PK+AD+ EYNI+DK G +  +DLS RN+ PPA+S NSS++SRHS++SQ SS+SFAF
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Query:  PI
        PI
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A0A5A7STD6 Uncharacterized protein1.2e-8964.9Show/hide
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        MAA G   R   T G+    GLGS +S  T G+G SL PT+QL +GS+S I+LLE+SDL QVG NVNRPEA TI L NP   +YQLQFKDD+S+VSS CS
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Query:  AKSEKSSGSQGPTSASQVYDITHESGGNAMSPTQSPPLQTMDRVGGY-ESYDPSRIPSAVFQRSRSTTPLEWSIASNESLFSIHGGDDSFSGDNLSMLSD
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Query:  LGKS------------DELLVFNSPPEVITSRETEMKSVEYEEEPKVADSTEYNIEDKEGLVA-EDLSGRNVLPPALSSNSSSRSRHSERSQCSSNSFAF
         GKS            DE  VF+ PP VITSRE EMKS EYEE PK+AD+ EYNI+DK G +  +DLS RN+ PPA+S NSS++SRHS++SQ SS+SFAF
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Query:  PI
        PI
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A0A6J1GYP0 uncharacterized protein LOC1114583739.3e-15699.66Show/hide
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        VFNSPPEVITSRETEMKSVEYEEEPKVADSTEYNIEDKEGLVAEDLSGRNVLPPALSSNSSSRSRHSERSQCSSNSFAFPILADEVAQDGS L
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A0A6J1IL15 uncharacterized protein LOC1114784061.1e-14090.33Show/hide
Query:  MAATGRCEDTAGE-------GLGSTHSEDTAGEGFSLSPTEQLAYGSSSCINLLELSDLVQVGENVNRPEAGTIFLGNPDHDVYQLQFKDDESDVSSICS
        MAATGRCE ++         GLGSTHSEDTAGEGFSLSPT QLAYGSSSCINL+ELSDLVQV ENVNRPE GTI LGNPDHDVYQLQFKDDESDVSS+CS
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Query:  AKSEKSSGSQGPTSASQVYDITHESGGNAMSPTQSPPLQTMDRVGGYESYDPSRIPSAVFQRSRSTTPLEWSIASNESLFSIHGGDDSFSGDNLSMLSDL
        AKSEKSSGSQGPTSASQV DITHESGGN MSPTQSPPLQTMDRVGGYE YDP RIPSAVFQRSRSTTPLEWSIASNESLFSIHGGDDSFSGDNLSMLSDL
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        GKSDELLVFNS P VITSRETEMKSVEYEEEPKVAD+TEYNIED+EGLVAEDLSGRNVLPPALSS+SSSRSRHSERSQCSSNSFAFPILADE AQDGS L
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G74220.1 unknown protein1.1e-0732.19Show/hide
Query:  SEKSSGSQGPTSASQVYDITHESGGNAMSPTQSPPLQTMDR--------VGGYESYDPSRIPSAVFQRSRSTTPLEWSIASNESLFSIHGGDDSFSGDNL
        S  SS S     A    D  H    N  +  QSPP Q M+R             +  P RIPS VF R+ ST P EWS  SNESLFSIH G++SF+G   
Subjt:  SEKSSGSQGPTSASQVYDITHESGGNAMSPTQSPPLQTMDR--------VGGYESYDPSRIPSAVFQRSRSTTPLEWSIASNESLFSIHGGDDSFSGDNL

Query:  SMLSDLGKSDELLVFNSPPEVITS--------------------RETEMKSVEYEEEPKVADSTEYNIEDKEGLVAEDLSGRNVLPPALSSNSSSRSRHS
            D  KS E L F  PP  ITS                       E+K+   +   K A++ +     KE       S R V+    ++N+++++   
Subjt:  SMLSDLGKSDELLVFNSPPEVITS--------------------RETEMKSVEYEEEPKVADSTEYNIEDKEGLVAEDLSGRNVLPPALSSNSSSRSRHS

Query:  ERS------QCSSNSFAFPIL--ADEVAQDGSS
        +RS        S  SFAFP++  AD+    GS+
Subjt:  ERS------QCSSNSFAFPIL--ADEVAQDGSS

AT2G03630.1 unknown protein5.8e-1735.09Show/hide
Query:  GNPDHDVYQLQFKDDESDVSSICSAKSEKSSGSQGPTSASQVY-----DITHESGGNAMSPTQ--SPPLQTMDRVGGYESYDPSRIPSAVFQRSRSTTPL
        G+ +H    LQ    E++   I S    + S S   +S+S  Y     D+  E    +++  +  SPP+Q MDR      YDP+RIPS+VF+RS+S  P 
Subjt:  GNPDHDVYQLQFKDDESDVSSICSAKSEKSSGSQGPTSASQVY-----DITHESGGNAMSPTQ--SPPLQTMDRVGGYESYDPSRIPSAVFQRSRSTTPL

Query:  EWSIASNESLFSIHGGDDSFS--GDNLSMLSDLGKSDELLVFNS--PPEVITSRE-----TEMKSVEYEEEPKVADSTEYNIEDKEGLVAEDLSGRNVLP
        EWS  SNESLFSIH G++SF+  G +L    +L KS ELL ++   P   +   E      E K VE ++E KV    E +    +    +  S      
Subjt:  EWSIASNESLFSIHGGDDSFS--GDNLSMLSDLGKSDELLVFNS--PPEVITSRE-----TEMKSVEYEEEPKVADSTEYNIEDKEGLVAEDLSGRNVLP

Query:  PALSSNSSSRSRHSERSQCSSNSFAFPI
        PA+S  + + S  S RS  S++SF+FP+
Subjt:  PALSSNSSSRSRHSERSQCSSNSFAFPI

AT2G03630.2 unknown protein7.1e-1538.82Show/hide
Query:  GNPDHDVYQLQFKDDESDVSSICSAKSEKSSGSQGPTSASQVY-----DITHESGGNAMSPTQ--SPPLQTMDRVGGYESYDPSRIPSAVFQRSRSTTPL
        G+ +H    LQ    E++   I S    + S S   +S+S  Y     D+  E    +++  +  SPP+Q MDR      YDP+RIPS+VF+RS+S  P 
Subjt:  GNPDHDVYQLQFKDDESDVSSICSAKSEKSSGSQGPTSASQVY-----DITHESGGNAMSPTQ--SPPLQTMDRVGGYESYDPSRIPSAVFQRSRSTTPL

Query:  EWSIASNESLFSIHGGDDSFS--GDNLSMLSDLGKSDELLVFNSPPEVITSRETEMKSVEYEEEPKVADS
        EWS  SNESLFSIH G++SF+  G +L    +L KS ELL ++    +     +E K V   EEPKV +S
Subjt:  EWSIASNESLFSIHGGDDSFS--GDNLSMLSDLGKSDELLVFNSPPEVITSRETEMKSVEYEEEPKVADS

AT3G02125.1 unknown protein3.8e-0833.52Show/hide
Query:  YDPSRIPSAVFQRSRSTTPLEWSIASNESLFSIHGGDDSFSGDNLSMLSDLGKSDE----LLVFNS---PPEVITSRETEMKSVEYEEEPKVADSTEYNI
        YDP+RIPS+VF  S+     EWS+ASNESLFSIH  D +FS      L+++ + +E    +   NS   PP V    E E +++  E+EP   +++  +I
Subjt:  YDPSRIPSAVFQRSRSTTPLEWSIASNESLFSIHGGDDSFSGDNLSMLSDLGKSDE----LLVFNS---PPEVITSRETEMKSVEYEEEPKVADSTEYNI

Query:  EDKEG--------------------LVAEDLSGRNVLPP----------ALSSNSSSRSRHSERSQCSSNSFAFPILADEVA
        ED E                     + AE L  + V+            ++ S+S S S  S+ S  S  SFAFP+L  E A
Subjt:  EDKEG--------------------LVAEDLSGRNVLPP----------ALSSNSSSRSRHSERSQCSSNSFAFPILADEVA

AT5G39200.1 unknown protein4.2e-0737.82Show/hide
Query:  YDPSRIPSAVFQRSRSTTPLEWSIASNESLFSIHGGDDSFSGDNLSMLSDLGKSDELLVFNSPPEVITSRETEMKSVEYEEEPKVADSTEYNIEDKE-GL
        Y+P RIP +VF  S  T   EWSI SNESLFSIH GD SF        S + KS EL  F        S      +++ +  P  A + E NI   E G 
Subjt:  YDPSRIPSAVFQRSRSTTPLEWSIASNESLFSIHGGDDSFSGDNLSMLSDLGKSDELLVFNSPPEVITSRETEMKSVEYEEEPKVADSTEYNIEDKE-GL

Query:  VAEDLSG-RNVLPPALSSN---SSSRSRHSERSQCSSNSFAFPILADEVAQDGSSL
           +  G  NV  P        S ++S HSE S  S+ SFAFP L +   +  +SL
Subjt:  VAEDLSG-RNVLPPALSSN---SSSRSRHSERSQCSSNSFAFPILADEVAQDGSSL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATAGCTTCTGGTGGCTGCTCTGTGTTGTCATTCCATTCTATGGAGGTCAGCTTCTCGCATGTCAGCATGTTGCTTATGTTCACAGTGGCTGTTGCGGTCCTCATGGC
TTCATCAGGACATAGACATTGGAAAATCATTAGGGAAAGCTTGTTAAATCTCCATGGCTTTCGAGGATTTTTGTCGTCGGTGTCGCTTCCGGCGAGATTTAGCGGCAGTG
AACAGCATATTGCAAGCCATATAGTCTCTAATTATATAGCTATTGAATTGTCTAAAGGAGCAAAAGCTGCATTCATGGATCTATTGGTGGAAGTGGGAGAAAGCTTGAAA
CTATTGAAGAAGGCGAGAACAATAGAATATATGGCAGCGACGGGTAGATGTGAAGATACCGCTGGGGAAGGATTAGGCAGTACACATTCTGAAGATACTGCTGGGGAAGG
ATTTTCACTTTCCCCAACAGAGCAGCTGGCGTATGGGTCTTCATCATGTATAAACTTGTTGGAATTATCAGATCTCGTTCAAGTTGGCGAAAATGTTAACCGACCCGAAG
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GGTTCTCAAGGTCCCACATCTGCATCTCAAGTTTATGATATTACCCATGAGTCTGGTGGAAATGCTATGTCTCCAACCCAATCCCCTCCTCTTCAGACAATGGATCGTGT
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