; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh04G020000 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh04G020000
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionsurvival of motor neuron-related-splicing factor 30
Genome locationCmo_Chr04:10590917..10596454
RNA-Seq ExpressionCmoCh04G020000
SyntenyCmoCh04G020000
Gene Ontology termsGO:0006397 - mRNA processing (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005737 - cytoplasm (cellular component)
GO:0003723 - RNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002999 - Tudor domain
IPR010304 - Survival motor neuron


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7032438.1 Survival of motor neuron-related-splicing factor 30 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.7e-13499.6Show/hide
Query:  MQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPA
        MQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESM DYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPA
Subjt:  MQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPA

Query:  NVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKK
        NVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKK
Subjt:  NVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKK

Query:  IGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
        IGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
Subjt:  IGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD

XP_004142809.1 survival of motor neuron-related-splicing factor 30 isoform X2 [Cucumis sativus]1.4e-12894.86Show/hide
Query:  MQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPA
        MQVIALTEELLSTAKQNE+SGSNVETGDDSASI FQQ+K N+MEA SMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPA
Subjt:  MQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPA

Query:  NVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKK
        NVRTIQLEVN LLEAER+AEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPS+LRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQ+AKGKSKK
Subjt:  NVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKK

Query:  IGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
        IGFFSGRK+ESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGA+VEMD+
Subjt:  IGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD

XP_008460591.1 PREDICTED: survival of motor neuron-related-splicing factor 30 isoform X1 [Cucumis melo]9.4e-13096.05Show/hide
Query:  MQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPA
        MQVIALTEELLSTAKQNE+SGSNVETGDDSASI FQQ K N+MEA SMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPA
Subjt:  MQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPA

Query:  NVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKK
        NVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPS+LRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKK
Subjt:  NVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKK

Query:  IGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
        IGFFSGRK+ESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGA+VEMD+
Subjt:  IGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD

XP_008460593.1 PREDICTED: survival of motor neuron-related-splicing factor 30 isoform X2 [Cucumis melo]6.1e-12995.63Show/hide
Query:  QVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPAN
        +VIALTEELLSTAKQNE+SGSNVETGDDSASI FQQ K N+MEA SMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPAN
Subjt:  QVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPAN

Query:  VRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKI
        VRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPS+LRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKI
Subjt:  VRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKI

Query:  GFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
        GFFSGRK+ESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGA+VEMD+
Subjt:  GFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD

XP_022933076.1 survival of motor neuron-related-splicing factor 30 [Cucurbita moschata]6.3e-13499.6Show/hide
Query:  QVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPAN
        +VIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPAN
Subjt:  QVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPAN

Query:  VRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKI
        VRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKI
Subjt:  VRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKI

Query:  GFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
        GFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
Subjt:  GFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CD96 survival of motor neuron-related-splicing factor 30 isoform X14.5e-13096.05Show/hide
Query:  MQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPA
        MQVIALTEELLSTAKQNE+SGSNVETGDDSASI FQQ K N+MEA SMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPA
Subjt:  MQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPA

Query:  NVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKK
        NVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPS+LRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKK
Subjt:  NVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKK

Query:  IGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
        IGFFSGRK+ESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGA+VEMD+
Subjt:  IGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD

A0A1S3CE07 survival of motor neuron-related-splicing factor 30 isoform X22.9e-12995.63Show/hide
Query:  QVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPAN
        +VIALTEELLSTAKQNE+SGSNVETGDDSASI FQQ K N+MEA SMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPAN
Subjt:  QVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPAN

Query:  VRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKI
        VRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPS+LRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKI
Subjt:  VRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKI

Query:  GFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
        GFFSGRK+ESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGA+VEMD+
Subjt:  GFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD

A0A6J1DPE2 survival of motor neuron-related-splicing factor 305.7e-12592.86Show/hide
Query:  QVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPAN
        +VI+LTEELL+TAKQNEISGSNVETGD+SASISF Q+K  KMEAES+SD+HEKFPIG+KVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYD WGNKEEVDPAN
Subjt:  QVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPAN

Query:  VRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKI
        VR IQ EVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLP +LRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKI
Subjt:  VRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKI

Query:  GFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
        GFFSGRK+ESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGA+VEMDD
Subjt:  GFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD

A0A6J1EY48 survival of motor neuron-related-splicing factor 303.0e-13499.6Show/hide
Query:  QVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPAN
        +VIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPAN
Subjt:  QVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPAN

Query:  VRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKI
        VRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKI
Subjt:  VRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKI

Query:  GFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
        GFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
Subjt:  GFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD

A0A6J1K7R2 survival of motor neuron-related-splicing factor 303.0e-13499.6Show/hide
Query:  QVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPAN
        +VIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPAN
Subjt:  QVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPAN

Query:  VRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKI
        VRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKI
Subjt:  VRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKI

Query:  GFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
        GFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
Subjt:  GFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O75940 Survival of motor neuron-related-splicing factor 302.5e-0828.05Show/hide
Query:  QVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATI-EAHTVNG-FYVSYDGWGNKEEVDP
        +VI LT++LLST     ++ S+          SF  T+               + +G K  AVWSEDG+ Y+A I E    NG   +++ G+GN E    
Subjt:  QVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATI-EAHTVNG-FYVSYDGWGNKEEVDP

Query:  ANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKS
         N++ ++    A  ++     + K+ I ++                            +  K+KK  A K   RI++LE  +  ++  WQQF + A  K+
Subjt:  ANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKS

Query:  KKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLTEFQKREKH
        KK     G+ K SIF SP+   GKVGV   G   K +T++Q   K+
Subjt:  KKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLTEFQKREKH

Q3T045 Survival of motor neuron-related-splicing factor 307.2e-0827.24Show/hide
Query:  QVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATI-EAHTVNG-FYVSYDGWGNKEEVDP
        +VI LT++LLST     ++ S+          +F  T+               + +G K  A+WSEDG+ Y+A I E    NG   +++ G+GN E    
Subjt:  QVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATI-EAHTVNG-FYVSYDGWGNKEEVDP

Query:  ANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKS
         N++ ++    A  ++     + K+ I ++                            +  K+KK  A K   RI++LE  +  ++  WQQF + A  K+
Subjt:  ANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKS

Query:  KKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLTEFQKREKH
        KK     G+ K SIF SP+   GKVGV   G   K +T++Q   K+
Subjt:  KKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLTEFQKREKH

Q5R591 Survival of motor neuron-related-splicing factor 303.2e-0827.64Show/hide
Query:  QVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATI-EAHTVNG-FYVSYDGWGNKEEVDP
        +VI LT++LLST     ++ S+          SF  T+               + +G K  A+WSEDG+ Y+A I E    NG   +++ G+GN E    
Subjt:  QVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATI-EAHTVNG-FYVSYDGWGNKEEVDP

Query:  ANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKS
         N++ ++    A  ++     + K+ I ++                            +  K+KK  A K   RI++LE  +  ++  WQQF + A  K+
Subjt:  ANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKS

Query:  KKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLTEFQKREKH
        KK     G+ K SIF SP+   GKVGV   G   K +T++Q   K+
Subjt:  KKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLTEFQKREKH

Q6DEY1 Survival of motor neuron-related-splicing factor 303.5e-1029.55Show/hide
Query:  QVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATI-EAHTVNG-FYVSYDGWGNKEEVDP
        +VI LT++LLS+           ET DD+               +  +   + + +G K  AVWS+DG+WY+A I E    NG   +++ G+GN E    
Subjt:  QVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATI-EAHTVNG-FYVSYDGWGNKEEVDP

Query:  ANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKR-KKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGK
         N+R ++       E  +  E                   S NLP   +      E + A +  KK  A K   RI++LE  +  ++  WQQF + A  K
Subjt:  ANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKR-KKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGK

Query:  SKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLTEFQKREKH
        +KK     G+ K SIF SP+   GKVGV   G   K +T++Q   K+
Subjt:  SKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLTEFQKREKH

Q8BGT7 Survival of motor neuron-related-splicing factor 302.7e-0727.64Show/hide
Query:  QVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATI-EAHTVNG-FYVSYDGWGNKEEVDP
        +VI LT++LLST     ++ S+          SF  T+               + +G K  AVWSEDG+ Y+A I E    NG   +++  +GN E    
Subjt:  QVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATI-EAHTVNG-FYVSYDGWGNKEEVDP

Query:  ANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKS
         N++ ++    A  ++     + K+ I ++                            +  K+KK  A K   RI++LE  +  ++  WQQF + A  K+
Subjt:  ANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS-AKGKS

Query:  KKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLTEFQKREKH
        KK     G+ K SIF SP+   GKVGV   G   K +T++Q   K+
Subjt:  KKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSG---KGLTEFQKREKH

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G02570.1 nucleic acid binding;RNA binding1.6e-8765Show/hide
Query:  QVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGN--------KMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGN
        +VIALTEE+L+TAKQNEIS S+       A +S + T G+        K    +   +  KFP+GTKVQAV+S+DGEWYDATIEAHT NG++V+YD WGN
Subjt:  QVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGN--------KMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGN

Query:  KEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS
        KEEVDP NVR I  E NA++EAER+A+ATK A+KRKI +AAS D+Q++ LP++L+I+P+DPEDVK  KRKKIHAFKSK R EQLEV QNK+QN WQQFQ+
Subjt:  KEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS

Query:  AKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
         K K+KK+GFF+GRKKESIFKSP+DP GKVGVTGSGKGLT+FQKREKHLHLK  + E  D
Subjt:  AKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD

AT2G02570.2 nucleic acid binding;RNA binding1.6e-8765Show/hide
Query:  QVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGN--------KMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGN
        +VIALTEE+L+TAKQNEIS S+       A +S + T G+        K    +   +  KFP+GTKVQAV+S+DGEWYDATIEAHT NG++V+YD WGN
Subjt:  QVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGN--------KMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGN

Query:  KEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS
        KEEVDP NVR I  E NA++EAER+A+ATK A+KRKI +AAS D+Q++ LP++L+I+P+DPEDVK  KRKKIHAFKSK R EQLEV QNK+QN WQQFQ+
Subjt:  KEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS

Query:  AKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
         K K+KK+GFF+GRKKESIFKSP+DP GKVGVTGSGKGLT+FQKREKHLHLK  + E  D
Subjt:  AKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD

AT2G02570.3 nucleic acid binding;RNA binding1.2e-7961.15Show/hide
Query:  QVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGN--------KMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGN
        +VIALTEE+L+TAKQNEIS S+       A +S + T G+        K    +   +  KFP+GTKVQAV+S+DGEWYDATIEAHT NG++V+YD WGN
Subjt:  QVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGN--------KMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGN

Query:  KEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS
        KEEVDP NVR I  E NA++EAER+A+ATK A+KRKI +AAS D+Q++ LP++L+I+P+DPEDVK  KRKKIH            V QNK+QN WQQFQ+
Subjt:  KEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS

Query:  AKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
         K K+KK+GFF+GRKKESIFKSP+DP GKVGVTGSGKGLT+FQKREKHLHLK  + E  D
Subjt:  AKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD

AT2G02570.4 nucleic acid binding;RNA binding1.6e-8765Show/hide
Query:  QVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGN--------KMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGN
        +VIALTEE+L+TAKQNEIS S+       A +S + T G+        K    +   +  KFP+GTKVQAV+S+DGEWYDATIEAHT NG++V+YD WGN
Subjt:  QVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGN--------KMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGN

Query:  KEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS
        KEEVDP NVR I  E NA++EAER+A+ATK A+KRKI +AAS D+Q++ LP++L+I+P+DPEDVK  KRKKIHAFKSK R EQLEV QNK+QN WQQFQ+
Subjt:  KEEVDPANVRTIQLEVNALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQS

Query:  AKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD
         K K+KK+GFF+GRKKESIFKSP+DP GKVGVTGSGKGLT+FQKREKHLHLK  + E  D
Subjt:  AKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPNGKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCAGGTTATCGCCTTGACGGAAGAGCTTCTTTCAACAGCAAAGCAAAATGAGATTTCTGGATCAAATGTAGAAACTGGTGATGACAGTGCATCAATTAGTTTCCAGCA
GACTAAAGGAAATAAGATGGAAGCTGAAAGCATGTCTGACTATCACGAAAAATTTCCTATTGGAACAAAAGTTCAAGCTGTTTGGAGCGAGGATGGGGAGTGGTACGATG
CTACAATTGAAGCCCATACTGTAAATGGTTTCTATGTTAGTTATGATGGTTGGGGAAACAAAGAAGAGGTGGACCCTGCTAATGTAAGAACAATCCAACTGGAAGTTAAT
GCTTTGCTTGAAGCAGAAAGAATGGCTGAAGCTACAAAACAGGCTATCAAGCGCAAGATTGCTCAAGCTGCTTCTGTTGACTTCCAATCACGAAATTTACCATCAAGGCT
TCGAATTGAACCTGATGATCCTGAGGATGTAAAAGCCACCAAACGCAAGAAAATACATGCTTTCAAGTCAAAGATGCGCATAGAACAGCTTGAAGTTACCCAGAATAAAC
GGCAGAATGCTTGGCAGCAGTTTCAGTCAGCAAAAGGCAAGTCGAAGAAGATTGGCTTCTTCTCTGGGCGCAAGAAGGAGAGCATTTTCAAGTCTCCTGATGATCCAAAT
GGCAAGGTTGGTGTGACTGGAAGTGGCAAGGGTTTGACTGAGTTTCAGAAGAGGGAAAAACACTTGCATCTCAAGGGTGCATCGGTGGAGATGGATGATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGCAGGTTATCGCCTTGACGGAAGAGCTTCTTTCAACAGCAAAGCAAAATGAGATTTCTGGATCAAATGTAGAAACTGGTGATGACAGTGCATCAATTAGTTTCCAGCA
GACTAAAGGAAATAAGATGGAAGCTGAAAGCATGTCTGACTATCACGAAAAATTTCCTATTGGAACAAAAGTTCAAGCTGTTTGGAGCGAGGATGGGGAGTGGTACGATG
CTACAATTGAAGCCCATACTGTAAATGGTTTCTATGTTAGTTATGATGGTTGGGGAAACAAAGAAGAGGTGGACCCTGCTAATGTAAGAACAATCCAACTGGAAGTTAAT
GCTTTGCTTGAAGCAGAAAGAATGGCTGAAGCTACAAAACAGGCTATCAAGCGCAAGATTGCTCAAGCTGCTTCTGTTGACTTCCAATCACGAAATTTACCATCAAGGCT
TCGAATTGAACCTGATGATCCTGAGGATGTAAAAGCCACCAAACGCAAGAAAATACATGCTTTCAAGTCAAAGATGCGCATAGAACAGCTTGAAGTTACCCAGAATAAAC
GGCAGAATGCTTGGCAGCAGTTTCAGTCAGCAAAAGGCAAGTCGAAGAAGATTGGCTTCTTCTCTGGGCGCAAGAAGGAGAGCATTTTCAAGTCTCCTGATGATCCAAAT
GGCAAGGTTGGTGTGACTGGAAGTGGCAAGGGTTTGACTGAGTTTCAGAAGAGGGAAAAACACTTGCATCTCAAGGGTGCATCGGTGGAGATGGATGATTAAGGGCAGGT
CAGATTTTGTAGGTTGCTGCTTTCTTTGTATGTATCTTCATTTAGTATCCATTTGGGGCCATCTGTCTGGTTAGATTCATATAAATGGTTATACCTGTACTAAAAGCTTA
GGTTGGGGGATGATTCCCTCTGGGTAACATAGTTTTCTTATAAGAATGGTTACGAAGCCTAGCCATGACAGGATCTCTTTTCTTCGACGTTTTATTTTACGTTCTGTTTC
CTTATTATGTGAAAACCCCAGCAATTGTGTTCAAATTTCCTCTCCCGCTAATCACCCCTTCATTAGCAATGAAGAGTGAGTTCTATCCTAAGATGTTTAAGGGAGCTTAA
TTTATAACATACCATTTGCTTATGTGGAGGGAAGAATTTCAATATTCAATCATTTTAGTTCCATCCATTTGAAATGCAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MQVIALTEELLSTAKQNEISGSNVETGDDSASISFQQTKGNKMEAESMSDYHEKFPIGTKVQAVWSEDGEWYDATIEAHTVNGFYVSYDGWGNKEEVDPANVRTIQLEVN
ALLEAERMAEATKQAIKRKIAQAASVDFQSRNLPSRLRIEPDDPEDVKATKRKKIHAFKSKMRIEQLEVTQNKRQNAWQQFQSAKGKSKKIGFFSGRKKESIFKSPDDPN
GKVGVTGSGKGLTEFQKREKHLHLKGASVEMDD