; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh04G022020 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh04G022020
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionRING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein
Genome locationCmo_Chr04:16391261..16394170
RNA-Seq ExpressionCmoCh04G022020
SyntenyCmoCh04G022020
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR011016 - Zinc finger, RING-CH-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type
IPR022143 - Protein of unknown function DUF3675
IPR033275 - E3 ubiquitin-protein ligase MARCH-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6601855.1 putative E3 ubiquitin ligase SUD1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.4e-14499.63Show/hide
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KAG7032554.1 hypothetical protein SDJN02_06603, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]3.6e-12786.2Show/hide
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XP_022922015.1 E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8-like [Cucurbita moschata]2.5e-144100Show/hide
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XP_022990541.1 E3 ubiquitin-protein ligase MARCH11 [Cucurbita maxima]1.7e-14097.79Show/hide
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XP_023521591.1 E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.3e-14097.42Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CST5 uncharacterized protein LOC103504564 isoform X29.5e-11079.34Show/hide
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A0A1S3CST7 uncharacterized protein LOC103504564 isoform X19.5e-11079.34Show/hide
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A0A5A7TTY1 DUF3675 domain-containing protein/RINGv domain-containing protein9.5e-11079.34Show/hide
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A0A6J1E7E6 E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8-like1.2e-144100Show/hide
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A0A6J1JN85 E3 ubiquitin-protein ligase MARCH118.0e-14197.79Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q28IK8 E3 ubiquitin-protein ligase MARCHF81.9e-0633.02Show/hide
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Q5XH39 E3 ubiquitin-protein ligase MARCHF86.6e-0731.73Show/hide
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Query:  QQQF
        + +F
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Q6NZQ8 E3 ubiquitin-protein ligase MARCHF14.3e-0633.7Show/hide
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Q8TCQ1 E3 ubiquitin-protein ligase MARCHF14.3e-0633.7Show/hide
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Q9DBD2 E3 ubiquitin-protein ligase MARCHF82.5e-0631.78Show/hide
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        D+   E TLG ++     + +A SS  S+T  +   +++++    +DI        CRIC  E D++S + TPC C GSL + H+ C+Q+W        C
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Query:  EICQQQF
        E+C+ +F
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G14260.1 RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein5.3e-3635.79Show/hide
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        GNT+CEIC Q ++ GYT+PP   +     ++  G W +S  D D P  + +  + R + +S+YD+  AS  S      S A+  M LL+LRH L +    
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         S+   P  +L L  LR     L  Y+M   ++ +HRRR        +   ++  A   +S+ P+P  N++
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AT1G14260.2 RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein5.3e-3635.79Show/hide
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         S+   P  +L L  LR     L  Y+M   ++ +HRRR        +   ++  A   +S+ P+P  N++
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AT2G01275.1 RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein4.7e-6149.82Show/hide
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        G+T CEIC Q+FKP YTAPP L E+  +P++FRGNW +S+R+     +IT+V ++    D  Y     S+ +S +CC S+ + FM LL+LRH LPL+   
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        ++ + FP+  L+ LRI GI L IYV+ K V    R    L T   SP   SS   + + + PQ Q   I V
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AT2G01275.2 RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein4.7e-6149.82Show/hide
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        MGDHFVLLVDRL+TEST+ AAI+SR Q+++A        +  +K TLEM     LS   M ECRIC DED DSNMETPCSC GS+KYAHRRC+Q+WCNEK
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Query:  GNTVCEICQQQFKPGYTAPPSLFEMRRIPMNFRGNWEMSRRDSDSPTYITMVSSNRNVADSDYDEIAASAASSVLCCHSIAITFMVLLVLRHILPLMFNE
        G+T CEIC Q+FKP YTAPP L E+  +P++FRGNW +S+R+     +IT+V ++    D  Y     S+ +S +CC S+ + FM LL+LRH LPL+   
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        ++ + FP+  L+ LRI GI L IYV+ K V    R    L T   SP   SS   + + + PQ Q   I V
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AT5G38070.1 RING/FYVE/PHD zinc finger superfamily protein5.4e-4942.62Show/hide
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        MGDH VL+VDRL ++S LG    +  +         ++ +       E +F         V+CRIC DEDED+NM+TPCSC G+LK+AH  C+Q+WCNEK
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        G+TVCEIC+QQ+KPGYTAP  LF    I MNF  +W +   D  +P ++T        AD D+D  +  + +S++CC  IA+ F++LL LRH LP++   
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Query:  TSDYSFPMLLLICLRIFGICLLIYVMFKVVTAVHRRR
          D+S  +L+L  +R  GI L+ YV FK    + R R
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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AGATGATTTGAAGAGGAATAAGTCAACCTTAGAAATGGAGTTCGAAGATATACTTTCTTCAAAGAAAATGGTGGAATGTAGAATATGTCAGGATGAGGATGAAGACTCGA
ACATGGAAACGCCTTGCTCGTGCCGTGGTAGCCTTAAGTACGCGCATCGAAGATGCATACAGAAGTGGTGTAATGAGAAGGGTAACACAGTTTGTGAAATATGCCAACAG
CAATTCAAGCCAGGCTACACGGCTCCTCCTTCGTTATTTGAAATGAGACGTATCCCAATGAACTTCAGAGGGAACTGGGAGATGTCTAGAAGGGACTCGGATAGTCCTAC
CTATATAACAATGGTATCATCAAACCGTAATGTGGCTGATTCCGATTATGATGAGATAGCAGCTTCTGCTGCAAGCAGTGTCCTATGCTGTCATTCAATTGCTATCACCT
TCATGGTTCTTCTGGTGTTGAGGCACATTCTTCCCCTCATGTTTAATGAAACCAGTGATTACTCTTTTCCTATGCTTCTGTTGATATGCCTGCGAATTTTCGGGATCTGC
CTACTGATATACGTTATGTTCAAAGTCGTCACTGCGGTGCATCGTCGTCGACTTCTCCTGCCTACGTCTTCTAGCTCACCCATTAGTTCATCCAGCATAGCTCGGAGTTC
GACGTCCCAATCGCCCCAACCTCAGCCTAACTTTATCCGTGTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TCTTATATTCTTCTTTCCTGTTTTTGATTCTTTCGTCTTTCTTCCTTCCTTTTCTCTTCTGCCTGTTTCTTCTCCTTTTCCTCTGTTTTCCTCTGTTTTCCTCCTCCTCC
TTATAAACCTTTGCCCTCTACTTTTTCCTGTATATCTTTCCTAATGTTGTCGGTGGGGTTTTAAAGAGGATCCTGTAGTCTTTTTTTGTTGGGGTTTTTCTCATTTATCC
TGTTTTGTCATTGCCTACATACATGTTGTTTAATCTCTAGCATAACCCATTAATTGGAAAGAATTAAAGGCTTGGTTTCTCATATCTCTATGCTGTTGGTCAGTTTAAAT
ATTGTGAAATCAATTGTCCTGATATTGCGAGTTTCTTAGTATGGGGGATCACTTTGTTTTGCTGGTTGATCGGTTGTTGACGGAGTCGACATTAGGAGCAGCAATCGAGA
GTCGAAGGCAGTTGATGGAAGCGACATCGTCTTCTTCCACAGATGATTTGAAGAGGAATAAGTCAACCTTAGAAATGGAGTTCGAAGATATACTTTCTTCAAAGAAAATG
GTGGAATGTAGAATATGTCAGGATGAGGATGAAGACTCGAACATGGAAACGCCTTGCTCGTGCCGTGGTAGCCTTAAGTACGCGCATCGAAGATGCATACAGAAGTGGTG
TAATGAGAAGGGTAACACAGTTTGTGAAATATGCCAACAGCAATTCAAGCCAGGCTACACGGCTCCTCCTTCGTTATTTGAAATGAGACGTATCCCAATGAACTTCAGAG
GGAACTGGGAGATGTCTAGAAGGGACTCGGATAGTCCTACCTATATAACAATGGTATCATCAAACCGTAATGTGGCTGATTCCGATTATGATGAGATAGCAGCTTCTGCT
GCAAGCAGTGTCCTATGCTGTCATTCAATTGCTATCACCTTCATGGTTCTTCTGGTGTTGAGGCACATTCTTCCCCTCATGTTTAATGAAACCAGTGATTACTCTTTTCC
TATGCTTCTGTTGATATGCCTGCGAATTTTCGGGATCTGCCTACTGATATACGTTATGTTCAAAGTCGTCACTGCGGTGCATCGTCGTCGACTTCTCCTGCCTACGTCTT
CTAGCTCACCCATTAGTTCATCCAGCATAGCTCGGAGTTCGACGTCCCAATCGCCCCAACCTCAGCCTAACTTTATCCGTGTTTGATGAGTTTTGTACGAGCTTGGAGAA
ACTCGATTTCAAGGCTGAAAAACGGTGTAGCTGTGGTTATCCAATGCAAAAGGTTTCATGGCTGTGGCGTTTCTCAGCTTCAAGTGGAAAATCACATTGTAAAGGATAGA
AGAGAGAATATTTATCAAGAAAAAAAATGCTCTTAGATGTTTGAAATTGTTATGCAGTTAATTAAATCATTACTCTTTTAGAATTTCTCTGTACAGATAGAGAGAGAAAA
TACAAAATGAAAGATATCTATATATCTATATATATCTATTCTCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGDHFVLLVDRLLTESTLGAAIESRRQLMEATSSSSTDDLKRNKSTLEMEFEDILSSKKMVECRICQDEDEDSNMETPCSCRGSLKYAHRRCIQKWCNEKGNTVCEICQQ
QFKPGYTAPPSLFEMRRIPMNFRGNWEMSRRDSDSPTYITMVSSNRNVADSDYDEIAASAASSVLCCHSIAITFMVLLVLRHILPLMFNETSDYSFPMLLLICLRIFGIC
LLIYVMFKVVTAVHRRRLLLPTSSSSPISSSSIARSSTSQSPQPQPNFIRV