; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh04G022610 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh04G022610
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptiondefensin J1-2-like
Genome locationCmo_Chr04:16903691..16904739
RNA-Seq ExpressionCmoCh04G022610
SyntenyCmoCh04G022610
Gene Ontology termsGO:0031640 - killing of cells of other organism (biological process)
GO:0050832 - defense response to fungus (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR003614 - Knottin, scorpion toxin-like
IPR008176 - Defensin, plant
IPR036574 - Knottin, scorpion toxin-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6601912.1 hypothetical protein SDJN03_07145, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.8e-3697.33Show/hide
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XP_022922106.1 defensin J1-2-like [Cucurbita moschata]5.2e-3696Show/hide
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XP_022953671.1 defensin J1-2-like [Cucurbita moschata]9.5e-38100Show/hide
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XP_022990903.1 defensin J1-2-like [Cucurbita maxima]2.2e-3496Show/hide
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XP_023517597.1 defensin J1-2-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.8e-3597.33Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1E380 defensin J1-2-like2.5e-3696Show/hide
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A0A6J1GNQ3 defensin J1-2-like4.6e-38100Show/hide
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A0A6J1JK66 defensin J1-2-like1.4e-3496Show/hide
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A0A6J1JUM8 defensin J1-2-like1.1e-3496Show/hide
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V5LEQ8 Defensin-like protein 13.8e-3290.67Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O65740 Defensin J1-26.9e-2369.57Show/hide
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        A I L+++L+  TGM     EARTCES SH F+GLCFSK+NCG VC TEGF+GGHCRGFRRRCFCT+HC
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P82659 Defensin SD27.9e-1956.76Show/hide
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        MK F+A +L+++ LL      P+  EARTCES SH F+G C S  NC +VC +E F GG CRGFRRRCFCT HC
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Q39182 Defensin-like protein 21.4e-2059.42Show/hide
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        +A+L++ ++   TGM P+  EARTCES SH F+G C S +NC +VC  EGF GG+CRGFRRRCFCT+HC
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Q41914 Defensin-like protein 41.1e-1756.52Show/hide
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        +A+L L+++   TGM P+  EARTC S S  F+G C S  NC +VC  EGF GG CRGFRRRCFCT++C
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Q9ZUL7 Defensin-like protein 11.4e-2059.46Show/hide
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        ++F SAA+LL ++ +  TGM P+  EARTCES SH F+G C S +NC +VC  EGF GG CRGFRRRC+CT+HC
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G61070.1 low-molecular-weight cysteine-rich 665.4e-1554.55Show/hide
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        LLLL ++  T M  +  EARTCE+ S+ F G C S +NC +VC  EGF  G CRGFRRRC CT+ C
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AT2G02100.1 low-molecular-weight cysteine-rich 691.0e-2159.42Show/hide
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        +A+L++ ++   TGM P+  EARTCES SH F+G C S +NC +VC  EGF GG+CRGFRRRCFCT+HC
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AT2G02120.1 Scorpion toxin-like knottin superfamily protein8.1e-1956.52Show/hide
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        +A+L L+++   TGM P+  EARTC S S  F+G C S  NC +VC  EGF GG CRGFRRRCFCT++C
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AT2G02130.1 low-molecular-weight cysteine-rich 681.0e-2159.46Show/hide
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        ++F SAA+LL ++ +  TGM P+  EARTCES SH F+G C S +NC +VC  EGF GG CRGFRRRC+CT+HC
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AT5G63660.1 Scorpion toxin-like knottin superfamily protein9.9e-1752.05Show/hide
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        KFF+A  LLL+L    +    +G E RTC+S SHHF+ +C S +NC  VC+ EGF GG C GF RRC+CT+ C
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAAGTTCTTTTCAGCTGCAATTCTGCTGCTCCTGCTGCTTCTCGGCGGCACTGGGATGGCGCCAATGGGTACAGAGGCAAGGACATGCGAGTCTCCGAGCCACCACTT
CAGGGGGTTGTGCTTCAGTAAGAACAACTGCGGCCATGTGTGCAAGACAGAGGGCTTCCATGGTGGGCACTGCAGAGGCTTCCGCCGCCGCTGCTTCTGCACAAAGCACT
GCGTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AAGAGTGTAGATGAGAATGTGGTAGGGACAAAGGGAATTGAAAGACAGCTCAAAAAACCCAAACCATATGGATCATGAAGGAACGGAGATCTAAAGCTTCCACAACACTT
AGTGCTCTATGACTCACTCAATCTTCACTTTTAATCTTCTTTTCTGGATCATTCTTATGCTAATTTAACCCTCAAAGTGGTCTCCCAATCTTTATATAAACCGCTTTCCA
TTTTCACTCCCTCAACACAAAATCCTCTGTTTCTCTCTGTGAATATGAAGTTCTTTTCAGCTGCAATTCTGCTGCTCCTGCTGCTTCTCGGCGGCACTGGGATGGCGCCA
ATGGGTACAGAGGCAAGGACATGCGAGTCTCCGAGCCACCACTTCAGGGGGTTGTGCTTCAGTAAGAACAACTGCGGCCATGTGTGCAAGACAGAGGGCTTCCATGGTGG
GCACTGCAGAGGCTTCCGCCGCCGCTGCTTCTGCACAAAGCACTGCGTTTGAGGGATCTTTGTTGTTTCAAATCAGTTGTCTATCAGTGGAAGTAGACACTGATGAGAGC
TTTATGGGCGTGGTAATGTAGAATAAAAGTGGCCATCTTTTGGGTATTGTTGTGTTGTATAAGCGCTTTGTTTCATTTGCTTTGGTGTATTTGATACTTCGTTTCTGTAA
GGCTTTTAACAAAGAGGTTCACTAAAGCATTCGGCCCATGGGGTTTAAGCATCCAACTCCTTCCACTCCTTATTATTAACTCCCTCCATCTACGTTTTAACCAAAGATAT
CTCGTCCTCGTCCTCCAGGGACATGTCCTGAATGAAGAGGAGATTCCACGGAAAATTGAAAAGAGAGTGGGAACCATTTTTCAGATGGGGTTAAAGATGAGATTATATTT
TCGAACTCCACCCTGTCCACCTGCTTAATATAAATCTTAGGTAGGCTATGTTCTTCAGACTTACATTTTACAGAAACTGCC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MKFFSAAILLLLLLLGGTGMAPMGTEARTCESPSHHFRGLCFSKNNCGHVCKTEGFHGGHCRGFRRRCFCTKHCV