CuGenDBv2

Gene ID	CmoCh04G024590
Organism	Cucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Description	Histone-lysine N-methyltransferase
Genome location	Cmo_Chr04:18187348..18188422
RNA-Seq Expression	CmoCh04G024590
Synteny	CmoCh04G024590
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6602083.1 DIS3-like exonuclease 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

5.7e-72

98.67

Show/hide

Query:  MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEAGEGKGSNETPKSVISSTSSSASVSTLPLVSETPDLPKLFQENYDQLNKSFDDNDHSWTALTLKMCSALDTASKLVES
        MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEAGEGKGSNETPKSVISSTSSSASVSTLPLVSETPDLPKLFQENYDQLNKSFDDNDHSWTALTLKMCSALDTASKLVES
Subjt:  MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEAGEGKGSNETPKSVISSTSSSASVSTLPLVSETPDLPKLFQENYDQLNKSFDDNDHSWTALTLKMCSALDTASKLVES

Query:  TNSNSRFLLEKIVELEQVLEKGDSTREAAMAIQTSFSSQVAQDSISSQSQ
        TNSNSRFLLEKIVELEQVLEKGDSTREAAMAIQTSFSSQVAQDSISS++Q
Subjt:  TNSNSRFLLEKIVELEQVLEKGDSTREAAMAIQTSFSSQVAQDSISSQSQ

KAG7032788.1 hypothetical protein SDJN02_06838 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

5.7e-72

98.67

Show/hide

Query:  MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEAGEGKGSNETPKSVISSTSSSASVSTLPLVSETPDLPKLFQENYDQLNKSFDDNDHSWTALTLKMCSALDTASKLVES
        MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEAGEGKGSNETPKSVISSTSSSASVSTLPLVSETPDLPKLFQENYDQLNKSFDDNDHSWTALTLKMCSALDTASKLVES
Subjt:  MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEAGEGKGSNETPKSVISSTSSSASVSTLPLVSETPDLPKLFQENYDQLNKSFDDNDHSWTALTLKMCSALDTASKLVES

Query:  TNSNSRFLLEKIVELEQVLEKGDSTREAAMAIQTSFSSQVAQDSISSQSQ
        TNSNSRFLLEKIVELEQVLEKGDSTREAAMAIQTSFSSQVAQDSISS++Q
Subjt:  TNSNSRFLLEKIVELEQVLEKGDSTREAAMAIQTSFSSQVAQDSISSQSQ

XP_022964546.1 uncharacterized protein LOC111464539 [Cucurbita moschata]

8.8e-73

100

Show/hide

Query:  MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEAGEGKGSNETPKSVISSTSSSASVSTLPLVSETPDLPKLFQENYDQLNKSFDDNDHSWTALTLKMCSALDTASKLVES
        MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEAGEGKGSNETPKSVISSTSSSASVSTLPLVSETPDLPKLFQENYDQLNKSFDDNDHSWTALTLKMCSALDTASKLVES
Subjt:  MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEAGEGKGSNETPKSVISSTSSSASVSTLPLVSETPDLPKLFQENYDQLNKSFDDNDHSWTALTLKMCSALDTASKLVES

Query:  TNSNSRFLLEKIVELEQVLEKGDSTREAAMAIQTSFSSQVAQDSISSQSQ
        TNSNSRFLLEKIVELEQVLEKGDSTREAAMAIQTSFSSQVAQDSISSQSQ
Subjt:  TNSNSRFLLEKIVELEQVLEKGDSTREAAMAIQTSFSSQVAQDSISSQSQ

XP_022989818.1 uncharacterized protein LOC111486891 [Cucurbita maxima]

4.8e-71

96.67

Show/hide

Query:  MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEAGEGKGSNETPKSVISSTSSSASVSTLPLVSETPDLPKLFQENYDQLNKSFDDNDHSWTALTLKMCSALDTASKLVES
        MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEAGEGKGSNETPKSVISSTSSSASVSTLP+VSETPDLPKLFQENYDQLNKSFDDNDHSWTALTLKMCSALDTASKLVES
Subjt:  MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEAGEGKGSNETPKSVISSTSSSASVSTLPLVSETPDLPKLFQENYDQLNKSFDDNDHSWTALTLKMCSALDTASKLVES

Query:  TNSNSRFLLEKIVELEQVLEKGDSTREAAMAIQTSFSSQVAQDSISSQSQ
        TNSNSRFLLEKIVELEQ+LEKGDSTREAAMAIQTSFSSQV QDSISS++Q
Subjt:  TNSNSRFLLEKIVELEQVLEKGDSTREAAMAIQTSFSSQVAQDSISSQSQ

XP_023516408.1 uncharacterized protein LOC111780279 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

2.8e-71

Show/hide

Query:  MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEAGEGKGSNETPKSVISSTSSSASVSTLPLVSETPDLPKLFQENYDQLNKSFDDNDHSWTALTLKMCSALDTASKLVES
        MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEAGEGKGSNETPKSVISSTSSSASVSTLPL SE PDLPKLFQENYDQLNKSFDDNDHSWTALTLKMCSALDTASKLVES
Subjt:  MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEAGEGKGSNETPKSVISSTSSSASVSTLPLVSETPDLPKLFQENYDQLNKSFDDNDHSWTALTLKMCSALDTASKLVES

Query:  TNSNSRFLLEKIVELEQVLEKGDSTREAAMAIQTSFSSQVAQDSISSQSQ
        TNSNSRFLLEKIVELEQVLEKGDSTREAAMAIQTSFSSQVAQDSISSQ+Q
Subjt:  TNSNSRFLLEKIVELEQVLEKGDSTREAAMAIQTSFSSQVAQDSISSQSQ

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1S3BCT2 uncharacterized protein LOC103488633 isoform X5

5.4e-60

84.87

Show/hide

Query:  MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEAGEGKGSNETPKSVISSTSSSASVS-TLPLVSETPDLPKLFQENYDQLNKSFDDNDHSWTALTLKMCSALDTASKLVE
        MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEA EGKG NETPKS+ S +SSS+SVS TL  +S+ PDLP+LFQENYDQLNK FDDNDHSWTALTLKMCSALDTA+KLVE
Subjt:  MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEAGEGKGSNETPKSVISSTSSSASVS-TLPLVSETPDLPKLFQENYDQLNKSFDDNDHSWTALTLKMCSALDTASKLVE

Query:  STNSNSRFLLEKIVELEQVLEKGDSTREAAMAIQTSFSSQVAQDSISSQSQV
        STNSNSRFLLEKIVELE VLEKGD+TREAAMAIQTS+SSQ+AQDSISS ++V
Subjt:  STNSNSRFLLEKIVELEQVLEKGDSTREAAMAIQTSFSSQVAQDSISSQSQV

A0A1S3BDA2 uncharacterized protein LOC103488633 isoform X2

5.4e-60

84.87

Show/hide

Query:  MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEAGEGKGSNETPKSVISSTSSSASVS-TLPLVSETPDLPKLFQENYDQLNKSFDDNDHSWTALTLKMCSALDTASKLVE
        MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEA EGKG NETPKS+ S +SSS+SVS TL  +S+ PDLP+LFQENYDQLNK FDDNDHSWTALTLKMCSALDTA+KLVE
Subjt:  MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEAGEGKGSNETPKSVISSTSSSASVS-TLPLVSETPDLPKLFQENYDQLNKSFDDNDHSWTALTLKMCSALDTASKLVE

Query:  STNSNSRFLLEKIVELEQVLEKGDSTREAAMAIQTSFSSQVAQDSISSQSQV
        STNSNSRFLLEKIVELE VLEKGD+TREAAMAIQTS+SSQ+AQDSISS ++V
Subjt:  STNSNSRFLLEKIVELEQVLEKGDSTREAAMAIQTSFSSQVAQDSISSQSQV

A0A1S4DVZ1 uncharacterized protein LOC103488633 isoform X3

5.4e-60

84.87

Show/hide

Query:  MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEAGEGKGSNETPKSVISSTSSSASVS-TLPLVSETPDLPKLFQENYDQLNKSFDDNDHSWTALTLKMCSALDTASKLVE
        MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEA EGKG NETPKS+ S +SSS+SVS TL  +S+ PDLP+LFQENYDQLNK FDDNDHSWTALTLKMCSALDTA+KLVE
Subjt:  MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEAGEGKGSNETPKSVISSTSSSASVS-TLPLVSETPDLPKLFQENYDQLNKSFDDNDHSWTALTLKMCSALDTASKLVE

Query:  STNSNSRFLLEKIVELEQVLEKGDSTREAAMAIQTSFSSQVAQDSISSQSQV
        STNSNSRFLLEKIVELE VLEKGD+TREAAMAIQTS+SSQ+AQDSISS ++V
Subjt:  STNSNSRFLLEKIVELEQVLEKGDSTREAAMAIQTSFSSQVAQDSISSQSQV

A0A6J1HJ70 uncharacterized protein LOC111464539

4.2e-73

100

Show/hide

Query:  MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEAGEGKGSNETPKSVISSTSSSASVSTLPLVSETPDLPKLFQENYDQLNKSFDDNDHSWTALTLKMCSALDTASKLVES
        MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEAGEGKGSNETPKSVISSTSSSASVSTLPLVSETPDLPKLFQENYDQLNKSFDDNDHSWTALTLKMCSALDTASKLVES
Subjt:  MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEAGEGKGSNETPKSVISSTSSSASVSTLPLVSETPDLPKLFQENYDQLNKSFDDNDHSWTALTLKMCSALDTASKLVES

Query:  TNSNSRFLLEKIVELEQVLEKGDSTREAAMAIQTSFSSQVAQDSISSQSQ
        TNSNSRFLLEKIVELEQVLEKGDSTREAAMAIQTSFSSQVAQDSISSQSQ
Subjt:  TNSNSRFLLEKIVELEQVLEKGDSTREAAMAIQTSFSSQVAQDSISSQSQ

A0A6J1JRF3 uncharacterized protein LOC111486891

2.3e-71

96.67

Show/hide

Query:  MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEAGEGKGSNETPKSVISSTSSSASVSTLPLVSETPDLPKLFQENYDQLNKSFDDNDHSWTALTLKMCSALDTASKLVES
        MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEAGEGKGSNETPKSVISSTSSSASVSTLP+VSETPDLPKLFQENYDQLNKSFDDNDHSWTALTLKMCSALDTASKLVES
Subjt:  MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEAGEGKGSNETPKSVISSTSSSASVSTLPLVSETPDLPKLFQENYDQLNKSFDDNDHSWTALTLKMCSALDTASKLVES

Query:  TNSNSRFLLEKIVELEQVLEKGDSTREAAMAIQTSFSSQVAQDSISSQSQ
        TNSNSRFLLEKIVELEQ+LEKGDSTREAAMAIQTSFSSQV QDSISS++Q
Subjt:  TNSNSRFLLEKIVELEQVLEKGDSTREAAMAIQTSFSSQVAQDSISSQSQ

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT4G08240.1 unknown protein

2.7e-27

46.76

Show/hide

Query:  MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEAGEGKGSNETPKSVISSTSSSASVSTLPLVSETPDLPKLFQENYDQLNKSFDDNDHSWTALTLKMCSALDTASKLVES
        MRG GGPLL IGDLL D+G+E    G      P   +SS S S    + PL     DL +LFQENYD+LN +F  +DHSWT+LTL++C++L+TA+KLV +
Subjt:  MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEAGEGKGSNETPKSVISSTSSSASVSTLPLVSETPDLPKLFQENYDQLNKSFDDNDHSWTALTLKMCSALDTASKLVES

Query:  TNSNSRFLLEKIVELEQVLEKGDSTREAAMAIQTSFSSQ
        T +N+R L EK+ ELE+++++GDS   AA  +  + + +
Subjt:  TNSNSRFLLEKIVELEQVLEKGDSTREAAMAIQTSFSSQ

AT4G08240.2 unknown protein

2.7e-27

46.76

Show/hide

Query:  MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEAGEGKGSNETPKSVISSTSSSASVSTLPLVSETPDLPKLFQENYDQLNKSFDDNDHSWTALTLKMCSALDTASKLVES
        MRG GGPLL IGDLL D+G+E    G      P   +SS S S    + PL     DL +LFQENYD+LN +F  +DHSWT+LTL++C++L+TA+KLV +
Subjt:  MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEAGEGKGSNETPKSVISSTSSSASVSTLPLVSETPDLPKLFQENYDQLNKSFDDNDHSWTALTLKMCSALDTASKLVES

Query:  TNSNSRFLLEKIVELEQVLEKGDSTREAAMAIQTSFSSQ
        T +N+R L EK+ ELE+++++GDS   AA  +  + + +
Subjt:  TNSNSRFLLEKIVELEQVLEKGDSTREAAMAIQTSFSSQ

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGCGAGGAACTGGTGGACCTCTTCTCTGCATAGGCGATCTTCTGTGCGATGTCGGAGAAGAAGAAGCAGGAGAAGGAAAGGGATCTAATGAAACCCCTAAATCAGTAAT
ATCATCAACTTCTTCCTCTGCTTCTGTTTCCACTCTTCCGCTCGTATCAGAAACCCCCGATCTCCCCAAACTCTTTCAGGAAAATTACGACCAATTGAACAAATCATTCG
ATGATAATGACCACTCTTGGACAGCTTTGACGTTGAAGATGTGCAGTGCTCTTGATACTGCTAGTAAACTGGTTGAATCAACCAACTCAAATTCGAGATTTTTGTTGGAG
AAGATTGTGGAGCTTGAACAGGTTTTGGAAAAGGGGGATTCTACAAGAGAGGCGGCCATGGCCATCCAAACCAGTTTTAGCTCTCAAGTTGCTCAGGACTCCATTTCTTC
TCAGAGTCAAGTTGCCATATTCATTGCTTTGATTCATGCAGTTTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

CCAGGCTCGGTCGGTGCAGTGGCCGAGCTCCAACCGAAGAGGGTTCAGTCGGAGGATTACGGTGTTTCTCCGCGATCAGATTTGCGTAAACAGATAGAGAGATGCGAGGA
ACTGGTGGACCTCTTCTCTGCATAGGCGATCTTCTGTGCGATGTCGGAGAAGAAGAAGCAGGAGAAGGAAAGGGATCTAATGAAACCCCTAAATCAGTAATATCATCAAC
TTCTTCCTCTGCTTCTGTTTCCACTCTTCCGCTCGTATCAGAAACCCCCGATCTCCCCAAACTCTTTCAGGAAAATTACGACCAATTGAACAAATCATTCGATGATAATG
ACCACTCTTGGACAGCTTTGACGTTGAAGATGTGCAGTGCTCTTGATACTGCTAGTAAACTGGTTGAATCAACCAACTCAAATTCGAGATTTTTGTTGGAGAAGATTGTG
GAGCTTGAACAGGTTTTGGAAAAGGGGGATTCTACAAGAGAGGCGGCCATGGCCATCCAAACCAGTTTTAGCTCTCAAGTTGCTCAGGACTCCATTTCTTCTCAGAGTCA
AGTTGCCATATTCATTGCTTTGATTCATGCAGTTTGA

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MRGTGGPLLCIGDLLCDVGEEEAGEGKGSNETPKSVISSTSSSASVSTLPLVSETPDLPKLFQENYDQLNKSFDDNDHSWTALTLKMCSALDTASKLVESTNSNSRFLLE
KIVELEQVLEKGDSTREAAMAIQTSFSSQVAQDSISSQSQVAIFIALIHAV

CmoCh04G024590 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome