; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh04G026210 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh04G026210
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionnuclear pore complex protein NUP1-like
Genome locationCmo_Chr04:19097328..19106337
RNA-Seq ExpressionCmoCh04G026210
SyntenyCmoCh04G026210
Gene Ontology termsGO:0016973 - poly(A)+ mRNA export from nucleus (biological process)
GO:0071763 - nuclear membrane organization (biological process)
GO:0005635 - nuclear envelope (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6602242.1 Nuclear pore complex protein NUP1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]0.0e+0090.47Show/hide
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KAG7032922.1 Nuclear pore complex protein NUP1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]0.0e+0090.3Show/hide
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XP_022956154.1 nuclear pore complex protein NUP1-like [Cucurbita moschata]0.0e+0091.99Show/hide
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XP_022990208.1 nuclear pore complex protein NUP1-like [Cucurbita maxima]0.0e+0089.12Show/hide
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        PQTKCAFQMSAHEDFVDIDEEGCSNGPVTDISFDRREKMD SLVAMSKP+DTEAITVDKPQASAEVKPST SELNKINGQ KSDVPVTAEKSPI SFATA
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        SPPSIT NAKDPES LRPEKNIS EAPK ANAPIFGFGDKLPSQKESFSSAPTFAFGNKFAPSTNEQNAVPVATSESNVAPGKATFPIPANAATENGNKN
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Query:  TGSPFKFASPLVNEKESAKVGSSSVFKAESNSSSILSFGVPKESMSDKAGDKSLSAGLSVGTSENLFSSSVSTSTSAPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVST
        TG+PFKFASPLVNEKES KVGSSSVFKAESNS SILSFG P+ESMSDKAGDK  SAGLSVGTSENLFSSSVSTSTSAPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVST
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        PSIFSSPATTFSNNITNQNPSIKPSLTTAPSNSEPATTTSLSMPSPVPSFSAAPIFKFGSPSVPSSSAPALSAAETKTKQETTFGNLSGIPPSDTSAAKV
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Query:  SSTGGSVFQFGAAATTDSNKRPENSTSAPGNVPTFGAPVFPANSGVASSTQSTPVLPFSSSSTSFGLAANTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGTTFGLTG
        SS GGSVFQFGAAATTDSNK+PEN TSAPGNVPTFGAPVFPANSGVASSTQSTPVLPFSSSSTSFGLAANTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGTTFGLTG
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Query:  TSSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQTSSTPSFSTGFSSTPTGGFPFGLSSSSAASNSSPMLFGSSTTSASTTSMFSFTSAASSQPAFSNSNHGFTFGSTPPA
        TSSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQTSSTPSFSTGFSSTPTGGF FGLSSSSAASNSSPMLFGSSTTSASTTSMFSFTS ASSQPAF NSNHGFTFGSTP A
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Query:  NNDQANMEDSMAEDTVQAVTLPTPTFG---QQPLTPPPSSGFMFGSAAPPPVAASPFQFGSQQNAPTPQNPSPFHASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKA
        NNDQANMEDSMAEDTVQAVTLPTPTFG   QQPLTPPPSSGFMFGSAAPPPVAASPFQFGSQQNAPTPQNPSPFHASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKA
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        NRKYVKVKSKSRKK
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XP_023527371.1 nuclear pore complex protein NUP1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]0.0e+0090.09Show/hide
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        MATEREEIRYEGGRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPTALRNSAGNGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRIPPPPPSLPVSR               
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                                +ANDEMGNENHEEVAADLPGTQEGTNRDFGPSIKTDNTHGVTDLEQILKEKTFTR                     
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                                                    VLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPK+TPLSMASHSHKFGDSFASENLSKSSALTLVPR
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        SPGNFDVIENGFVTPRSRGRSALYNMARMPYSGVSATHSIKNSVATTDAYRATGSSSSQLAWERGRVLGSKQGALKRRSSVLDDEMGHVGPIRRLRHKSN
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        LLYPTGLSLPSSSTSIPVSGIGSENAQQFQSTKVHPFSSSSGK LYSRSLSKRSAESENDVKPSSSFSQIPLRSSEMASKILEQLEKLTPPKD+SSKLKL
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        LSVTNNSPTKLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYLENVEDIQSNDARELTSQKNNKVEESSSLKYKLPI+K ISAGDGLGS VPTKDTVLSSRPQV+FVGAS
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        PQTKCAFQMSAHEDFVDIDEEGCSNGPVTDISFDRREKMD SL AMSKP+DTEAITVDKPQASAEVKPST SELNK+NGQRKSDVPV AEKSPIFSFATA
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        SPPSI  NAKDPESTLRPEKNISPEAPKPANAPIFGFGDKLPSQKESFSSAPTFAFGNKFAPSTNEQNAVPVA SESNVAPGKATFPIPANAATENGNKN
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Query:  TGSPFKFASPLVNEKESAKVGSSSVFKAESNSSSILSFGVPKESMSDKAGDKSLSAGLSVGTSENLFSSSVSTSTSAPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVST
        TGSPFKFASPLVNEKE AKVGSSSVFKAESNSSSILSFGVPKESMSDKAGDKS SAGLSVGTSENLFSSSVSTSTS+PSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVST
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Query:  PSIFSSPATTFSNNITNQNPSIKPSLTTAPSNSEPA-TTTSLSMPSPVPSFSAAPIFKFGSPSVPSSSAPALSAAETKTKQETTFGNLSGIPPSDTSAAK
        PSIFSSPATTFSNNITNQNPSIKPSLTTAPSNSEPA TTTSLSMPSPVPSFSAAPIFKFGSPSVPSSSAPALSAAETKTKQETTFGNLSGIPPSDTSAAK
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Query:  VSSTGGSVFQFGAAATTDSNKRPENSTSAPGNVPTFGAPVFPANSGVASSTQSTPVLPFSSSSTSFGLAANTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGTTFGLT
        VSSTGGSVFQFGAAATTDSNKRPENSTSAPGNVPTFGAPVFPANSGVASSTQSTPVLPFSSSSTSFGLAANTGLSSGS LFGSSAPASNLFS GTTFGLT
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Query:  GTSSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQTSSTPSFSTGFSSTPTGGFPFGLSSSSAASNSSPMLFGSSTTSASTTSMFSFTSAASSQPAFSNSNHGFTFGSTPP
         TSSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQTSSTPSFSTGFSSTPTGGFPFGLSSSSAASNSSPMLFGSSTTSASTTSMFSFTSA SSQPAF NSNHGFTFGSTPP
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Query:  ANNDQANMEDSMAEDTVQAVTLPTPTFGQQPLTPPPSSGFMFGSAAPPPVAASPFQFGSQQNAPTPQNPSPFHASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKANR
        ANNDQANMEDSMAEDTVQAVTLPTPTFGQQPLTPPPSSGFMFGSAAPPPVAASPFQFGSQQNAPTPQNPSPFHASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKANR
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Query:  KYVKVKSKSRKK
        KYVKVKSKSRKK
Subjt:  KYVKVKSKSRKK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1FF52 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X10.0e+0071.63Show/hide
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        MATERE + YEGGRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPP ALRNS G GWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKR+PPPPPSLP+SR               
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Query:  VFNWNALLTIVRMVYGFCFSHSGTQANDEMGNENHEEVAADLPGTQEGTNRDFGPSIKTDNTHGVTDLEQILKEKTFTR---------------------
                                +ANDEM  +N EEVAAD PGTQEGTN DF PSI ++N HGV+DLE+ILKEKTFTR                     
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Query:  -------------------------------------------QVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKSTPLSMASHSHKFGDSFASENLSKSSALTLVPR
                                                    V DEDVASPAEIAKA+MGSRPPK+TPLSM +HS KFGD+FA  N SKSS L+LVPR
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Query:  SPGNFDVIENGFVTPRSRGRSALYNMARMPYSGVSATHSIKNSVATTDAYRATGSSSSQLAWERGRVLGSKQGALKRRSSVLDDEMGHVGPIRRLRHKSN
        SPGNFDV EN FVTPRSRGRSALY+MARMPYS V AT SIKNSVATTD+YRAT +SSSQ AWE+GR+L S QGALKRRSSVLDDE+G VGPIRR+RHKSN
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Query:  LLYPTGLSLPSSSTSIPVSGIGSENAQQFQSTKVHPFSSSSGKGLYS----RSLSKRSAESENDVKPSSSFSQIPLRSSEMASKILEQLEKLTPPKDKSS
        LL+P GLSLPSSSTSIPVSGIGSE +Q  QSTKVHPFSS +GK  YS    R+LSK SAESEND  PSSSF QIPLRSSEMA KILEQL+KLTPPK+KSS
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Query:  KLKLLSVTNNSPTKLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYLENVEDIQSNDARELTSQKNNKVEESSSLKYKLPINKEISAGDGLGSPVPTKDTVLSSRPQVSF
        +LKL SV NNSP KLSPSMLHGPALRSLEDVDS+KYLENVEDI+SND R+LTS+K +K E+SS LK K+P +K IS G G+GS VP+KDTV SS  QVSF
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Query:  VGASPQTKCAFQMSAHEDFVDIDEEGCSNGPVTDISFDRREKMDASLVAMSKPSDTEAITVDKPQASAEVKPSTVSELNKINGQRKSDVPVTAEKSPIFS
        VG S  TKCAFQMS  EDFVD+D+E  SNGPV+  SF+RREK+D SLVA+ KPSDTEAITVDKPQAS + KPS VSE+ KIN Q KSDVPVT EKS IFS
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Query:  FATASPPSITTNAKDPESTLRPEKNISPEAPKPANAPIFGFGDKLPSQKESFSSAPTFAFGNKFAPSTNEQNAVPVATSESNVAP-------------GK
        F TASP S T N  +PEST RPEK  S E PK A APIFGFG+KLPSQK+   S+PTF FGNK   STNEQNAVP  TSE NVAP              K
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Query:  ATFPIPANAATENGNKNTGSPFKFASPLVNEKESAKVGSSSVFKAESNSSSI----LSFGVPKESMSDKAGD-KSLSAGLSVGTSENLFSSSVSTSTSAP
        ATFPIPA+ ATENGN   GSPFKFAS LVNEKE AK GS+SVFK+ES+SSS     LSFGVPKESMS+KAGD KS SAGLSVGTS NL  SSVS ST  P
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Query:  SLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTPSIFSSPATTFSNNITNQNPSIKPSLTTAPSNSEPATTTSLSMPSPVPSFSAAPIFKFGSPSVPSSSAPA-LSAAETK
        SLFSFSSP+TNSNL NGSL STPS F SP+ TF +NITNQN SIKPSL  A SNSEP TTTSLS  SP+PSFSAAPIFKFGS SVPSSSAP+ + + ETK
Subjt:  SLFSFSSPSTNSNLNNGSLVSTPSIFSSPATTFSNNITNQNPSIKPSLTTAPSNSEPATTTSLSMPSPVPSFSAAPIFKFGSPSVPSSSAPA-LSAAETK

Query:  TKQETT-FGNLSGIPPSDTSAAKVSSTGGSVFQFGAAATT-DSNKRPENSTSAPGNVPTFGAPVFPANSGVASSTQSTPVLPFSSSSTSFGLAANTGLSS
        TKQETT FGN+SGI PSDTSAAKV STG SVFQFGAA+TT DSNK+PE ST AP +VP+FGAPV PA+SGVASSTQSTPV PFSSSSTSFGL  NTGL+S
Subjt:  TKQETT-FGNLSGIPPSDTSAAKVSSTGGSVFQFGAAATT-DSNKRPENSTSAPGNVPTFGAPVFPANSGVASSTQSTPVLPFSSSSTSFGLAANTGLSS

Query:  GSSLFGSSAPASNLFSSGTTFGLTGTSSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQTSSTPSFSTGFSSTPTGGFPFGLSSSSAASNSSPMLFGSSTT-SASTTSMFS
        G+SL GSSAPASNLF+SG TFG  G+SSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQ SS PSFS+GF STPTGGF FGL+SSSAAS+SSPMLFGSSTT +ASTTSMFS
Subjt:  GSSLFGSSAPASNLFSSGTTFGLTGTSSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQTSSTPSFSTGFSSTPTGGFPFGLSSSSAASNSSPMLFGSSTT-SASTTSMFS

Query:  FTSAAS---SQPAFSNSNHGFTFGSTPPANNDQANMEDSMAEDTVQAVTLPT--PTFGQQPLTPPPSSGFMFGSAAPPPVAASPFQF-GSQQNAPTPQNP
        FTSAA+   SQPAF  SNHGFTFGSTPPANND ANMEDSMAEDTVQ V  PT  P+FGQQPLTPPPSSGF+FGS AP P+ A+PFQF GSQQN PTPQNP
Subjt:  FTSAAS---SQPAFSNSNHGFTFGSTPPANNDQANMEDSMAEDTVQAVTLPT--PTFGQQPLTPPPSSGFMFGSAAPPPVAASPFQF-GSQQNAPTPQNP

Query:  SPFHASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKANRKYVKVKSKSRKK
        +PF ASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDK+NRK+VKVKSKSRKK
Subjt:  SPFHASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKANRKYVKVKSKSRKK

A0A6J1FKS9 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X20.0e+0071.84Show/hide
Query:  MATEREEIRYEGGRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPTALRNSAGNGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRIPPPPPSLPVSRGFLLLLFLFVSWCFL
        MATERE + YEGGRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPP ALRNS G GWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKR+PPPPPSLP+SR               
Subjt:  MATEREEIRYEGGRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPTALRNSAGNGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRIPPPPPSLPVSRGFLLLLFLFVSWCFL

Query:  VFNWNALLTIVRMVYGFCFSHSGTQANDEMGNENHEEVAADLPGTQEGTNRDFGPSIKTDNTHGVTDLEQILKEKTFTR---------------------
                                +ANDEM  +N EEVAAD PGTQEGTN DF PSI ++N HGV+DLE+ILKEKTFTR                     
Subjt:  VFNWNALLTIVRMVYGFCFSHSGTQANDEMGNENHEEVAADLPGTQEGTNRDFGPSIKTDNTHGVTDLEQILKEKTFTR---------------------

Query:  -------------------------------------------QVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKSTPLSMASHSHKFGDSFASENLSKSSALTLVPR
                                                    V DEDVASPAEIAKA+MGSRPPK+TPLSM +HS KFGD+FA  N SKSS L+LVPR
Subjt:  -------------------------------------------QVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKSTPLSMASHSHKFGDSFASENLSKSSALTLVPR

Query:  SPGNFDVIENGFVTPRSRGRSALYNMARMPYSGVSATHSIKNSVATTDAYRATGSSSSQLAWERGRVLGSKQGALKRRSSVLDDEMGHVGPIRRLRHKSN
        SPGNFDV EN FVTPRSRGRSALY+MARMPYS V AT SIKNSVATTD+YRAT +SSSQ AWE+GR+L S QGALKRRSSVLDDE+G VGPIRR+RHKSN
Subjt:  SPGNFDVIENGFVTPRSRGRSALYNMARMPYSGVSATHSIKNSVATTDAYRATGSSSSQLAWERGRVLGSKQGALKRRSSVLDDEMGHVGPIRRLRHKSN

Query:  LLYPTGLSLPSSSTSIPVSGIGSENAQQFQSTKVHPFSSSSGKGLYS----RSLSKRSAESENDVKPSSSFSQIPLRSSEMASKILEQLEKLTPPKDKSS
        LL+P GLSLPSSSTSIPVSGIGSE +Q  QSTKVHPFSS +GK  YS    R+LSK SAESEND  PSSSF QIPLRSSEMA KILEQL+KLTPPK+KSS
Subjt:  LLYPTGLSLPSSSTSIPVSGIGSENAQQFQSTKVHPFSSSSGKGLYS----RSLSKRSAESENDVKPSSSFSQIPLRSSEMASKILEQLEKLTPPKDKSS

Query:  KLKLLSVTNNSPTKLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYLENVEDIQSNDARELTSQKNNKVEESSSLKYKLPINKEISAGDGLGSPVPTKDTVLSSRPQVSF
        +LKL SV NNSP KLSPSMLHGPALRSLEDVDS+KYLENVEDI+SND R+LTS+K +K E+SS LK K+P +K IS G G+GS VP+KDTV SS  QVSF
Subjt:  KLKLLSVTNNSPTKLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYLENVEDIQSNDARELTSQKNNKVEESSSLKYKLPINKEISAGDGLGSPVPTKDTVLSSRPQVSF

Query:  VGASPQTKCAFQMSAHEDFVDIDEEGCSNGPVTDISFDRREKMDASLVAMSKPSDTEAITVDKPQASAEVKPSTVSELNKINGQRKSDVPVTAEKSPIFS
        VG S  TKCAFQMS  EDFVD+D+E  SNGPV+  SF+RREK+D SLVA+ KPSDTEAITVDKPQAS + KPS VSE+ KIN Q KSDVPVT EKS IFS
Subjt:  VGASPQTKCAFQMSAHEDFVDIDEEGCSNGPVTDISFDRREKMDASLVAMSKPSDTEAITVDKPQASAEVKPSTVSELNKINGQRKSDVPVTAEKSPIFS

Query:  FATASPPSITTNAKDPESTLRPEKNISPEAPKPANAPIFGFGDKLPSQKESFSSAPTFAFGNKFAPSTNEQNAVPVATSESNVAP-------------GK
        F TASP S T N  +PEST RPEK  S E PK A APIFGFG+KLPSQK+   S+PTF FGNK   STNEQNAVP  TSE NVAP              K
Subjt:  FATASPPSITTNAKDPESTLRPEKNISPEAPKPANAPIFGFGDKLPSQKESFSSAPTFAFGNKFAPSTNEQNAVPVATSESNVAP-------------GK

Query:  ATFPIPANAATENGNKNTGSPFKFASPLVNEKESAKVGSSSVFKAESNSSSILSFGVPKESMSDKAGD-KSLSAGLSVGTSENLFSSSVSTSTSAPSLFS
        ATFPIPA+ ATENGN   GSPFKFAS LVNEKE AK GS+SVFK+ES+SSS LSFGVPKESMS+KAGD KS SAGLSVGTS NL  SSVS ST  PSLFS
Subjt:  ATFPIPANAATENGNKNTGSPFKFASPLVNEKESAKVGSSSVFKAESNSSSILSFGVPKESMSDKAGD-KSLSAGLSVGTSENLFSSSVSTSTSAPSLFS

Query:  FSSPSTNSNLNNGSLVSTPSIFSSPATTFSNNITNQNPSIKPSLTTAPSNSEPATTTSLSMPSPVPSFSAAPIFKFGSPSVPSSSAPA-LSAAETKTKQE
        FSSP+TNSNL NGSL STPS F SP+ TF +NITNQN SIKPSL  A SNSEP TTTSLS  SP+PSFSAAPIFKFGS SVPSSSAP+ + + ETKTKQE
Subjt:  FSSPSTNSNLNNGSLVSTPSIFSSPATTFSNNITNQNPSIKPSLTTAPSNSEPATTTSLSMPSPVPSFSAAPIFKFGSPSVPSSSAPA-LSAAETKTKQE

Query:  TT-FGNLSGIPPSDTSAAKVSSTGGSVFQFGAAATT-DSNKRPENSTSAPGNVPTFGAPVFPANSGVASSTQSTPVLPFSSSSTSFGLAANTGLSSGSSL
        TT FGN+SGI PSDTSAAKV STG SVFQFGAA+TT DSNK+PE ST AP +VP+FGAPV PA+SGVASSTQSTPV PFSSSSTSFGL  NTGL+SG+SL
Subjt:  TT-FGNLSGIPPSDTSAAKVSSTGGSVFQFGAAATT-DSNKRPENSTSAPGNVPTFGAPVFPANSGVASSTQSTPVLPFSSSSTSFGLAANTGLSSGSSL

Query:  FGSSAPASNLFSSGTTFGLTGTSSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQTSSTPSFSTGFSSTPTGGFPFGLSSSSAASNSSPMLFGSSTT-SASTTSMFSFTSA
         GSSAPASNLF+SG TFG  G+SSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQ SS PSFS+GF STPTGGF FGL+SSSAAS+SSPMLFGSSTT +ASTTSMFSFTSA
Subjt:  FGSSAPASNLFSSGTTFGLTGTSSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQTSSTPSFSTGFSSTPTGGFPFGLSSSSAASNSSPMLFGSSTT-SASTTSMFSFTSA

Query:  AS---SQPAFSNSNHGFTFGSTPPANNDQANMEDSMAEDTVQAVTLPT--PTFGQQPLTPPPSSGFMFGSAAPPPVAASPFQF-GSQQNAPTPQNPSPFH
        A+   SQPAF  SNHGFTFGSTPPANND ANMEDSMAEDTVQ V  PT  P+FGQQPLTPPPSSGF+FGS AP P+ A+PFQF GSQQN PTPQNP+PF 
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Query:  ASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKANRKYVKVKSKSRKK
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A0A6J1GY88 nuclear pore complex protein NUP1-like0.0e+0091.99Show/hide
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        MATEREEIRYEGGRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPTALRNSAGNGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRIPPPPPSLPVSR               
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        SSTGGSVFQFGAAATTDSNKRPENSTSAPGNVPTFGAPVFPANSGVASSTQSTPVLPFSSSSTSFGLAANTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGTTFGLTG
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        TSSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQTSSTPSFSTGFSSTPTGGFPFGLSSSSAASNSSPMLFGSSTTSASTTSMFSFTSAASSQPAFSNSNHGFTFGSTPPA
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        NNDQANMEDSMAEDTVQAVTLPTPTFGQQPLTPPPSSGFMFGSAAPPPVAASPFQFGSQQNAPTPQNPSPFHASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKANRK
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        YVKVKSKSRKK
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A0A6J1JSL2 nuclear pore complex protein NUP1-like0.0e+0089.12Show/hide
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        MATEREEIRYEGGRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPTALRNSAGNGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRIPPPPPSLPVSR               
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                                +ANDEMGNENHEEVAADL GTQEG N DFGPSIKTDNTHGVTDLEQILKEKTFTR                     
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                                                    VLDEDVASPAEIAKA+MGSRPPK+TPLSMASHSHKF D+FASENLSKSSALTLVPR
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        SPGNFDVIENGFVTPRSRGRSALYNMARMPYSGVSATHSIKNSVATTDAYRATGSSSSQLA ERGRVLGSKQGALKRRSSVLDDEMGHVGPIRRLRHKSN
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        LLYPTGLSLPSSSTSIPVSGIGSENAQQFQSTKVHPF SSSGKGLYSRSLSKRSAESENDVKPSSSFSQIPLRSSEMASKILEQLEKLTPPKDKS KLKL
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        LSVTNNSPTKLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYLENVEDIQSNDARELTSQK NKVEESSSLKYKLPINK ISAGDGLGSPVPTKDTVLSSRPQVSFVGAS
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        PQTKCAFQMSAHEDFVDIDEEGCSNGPVTDISFDRREKMD SLVAMSKP+DTEAITVDKPQASAEVKPST SELNKINGQ KSDVPVTAEKSPI SFATA
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        SPPSIT NAKDPES LRPEKNIS EAPK ANAPIFGFGDKLPSQKESFSSAPTFAFGNKFAPSTNEQNAVPVATSESNVAPGKATFPIPANAATENGNKN
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        TG+PFKFASPLVNEKES KVGSSSVFKAESNS SILSFG P+ESMSDKAGDK  SAGLSVGTSENLFSSSVSTSTSAPSLFSFSSPSTNSNLNNGSLVST
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        PSIFSSPATTFSNNITNQNPSIKPSLTTAPSNSEPATTTSLSMPSPVPSFSAAPIFKFGSPSVPSSSAPALSAAETKTKQETTFGNLSGIPPSDTSAAKV
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Query:  SSTGGSVFQFGAAATTDSNKRPENSTSAPGNVPTFGAPVFPANSGVASSTQSTPVLPFSSSSTSFGLAANTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGTTFGLTG
        SS GGSVFQFGAAATTDSNK+PEN TSAPGNVPTFGAPVFPANSGVASSTQSTPVLPFSSSSTSFGLAANTGLSSGSSLFGSSAPASNLFSSGTTFGLTG
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Query:  TSSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQTSSTPSFSTGFSSTPTGGFPFGLSSSSAASNSSPMLFGSSTTSASTTSMFSFTSAASSQPAFSNSNHGFTFGSTPPA
        TSSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQTSSTPSFSTGFSSTPTGGF FGLSSSSAASNSSPMLFGSSTTSASTTSMFSFTS ASSQPAF NSNHGFTFGSTP A
Subjt:  TSSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQTSSTPSFSTGFSSTPTGGFPFGLSSSSAASNSSPMLFGSSTTSASTTSMFSFTSAASSQPAFSNSNHGFTFGSTPPA

Query:  NNDQANMEDSMAEDTVQAVTLPTPTFG---QQPLTPPPSSGFMFGSAAPPPVAASPFQFGSQQNAPTPQNPSPFHASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKA
        NNDQANMEDSMAEDTVQAVTLPTPTFG   QQPLTPPPSSGFMFGSAAPPPVAASPFQFGSQQNAPTPQNPSPFHASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKA
Subjt:  NNDQANMEDSMAEDTVQAVTLPTPTFG---QQPLTPPPSSGFMFGSAAPPPVAASPFQFGSQQNAPTPQNPSPFHASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKA

Query:  NRKYVKVKSKSRKK
        NRKYVKVKSKSRKK
Subjt:  NRKYVKVKSKSRKK

A0A6J1K059 nuclear pore complex protein NUP1-like isoform X20.0e+0071.4Show/hide
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        MATEREE+RYEGGRGGKFQKRPLRR+HTTPYDRPP ALRNSAG GWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKR+PPPPPSLP+ R               
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Query:  VFNWNALLTIVRMVYGFCFSHSGTQANDEMGNENHEEVAADLPGTQEGTNRDFGPSIKTDNTHGVTDLEQILKEKTFTR---------------------
                                +ANDEM  +N EEVAAD PGTQEGTN DF PSI ++N HGV+DLE+ILKEKTFTR                     
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Query:  -------------------------------------------QVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKSTPLSMASHSHKFGDSFASENLSKSSALTLVPR
                                                    V DEDVASPAEIAKA+MGSRPPK+TPLSM +HS KFGD+FA  N SKSS L+LVPR
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Query:  SPGNFDVIENGFVTPRSRGRSALYNMARMPYSGVSATHSIKNSVATTDAYRATGSSSSQLAWERGRVLGSKQGALKRRSSVLDDEMGHVGPIRRLRHKSN
        SPGNFDV EN FVTPRSRGRSALY+MARMPYS V AT SIKNSVATTD+YRA+ +SSSQ AWE+GR+L S QGALKRRSSVLDDE+G VGPIRR+RHKSN
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Query:  LLYPTGLSLPSSSTSIPVSGIGSENAQQFQSTKVHPFSSSSGKGLYS----RSLSKRSAESENDVKPSSSFSQIPLRSSEMASKILEQLEKLTPPKDKSS
        LL+P GLSLPSSSTSIPVSGIGSE  Q  QSTKVHPFSS++GK  YS    R+LSK SAESEND  PSSSF QIPLRSSEMA KILEQL+KLTPPK+KSS
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Query:  KLKLLSVTNNSPTKLSPSMLHGPALRSLEDVDSSKYLENVEDIQSNDARELTSQKNNKVEESSSLKYKLPINKEISAGDGLGSPVPTKDTVLSSRPQVSF
        +LKL SV NNSP KLSPSMLHGPALRSLEDVDS+KYLENVEDI+SND R+LTS+KN+K E+SS LK ++P +K IS G G+GS VP+KDTV SS  QVSF
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Query:  VGASPQTKCAFQMSAHEDFVDIDEEGCSNGPVTDISFDRREKMDASLVAMSKPSDTEAITVDKPQASAEVKPSTVSELNKINGQRKSDVPVTAEKSPIFS
        VG S  TKCAFQMS  EDFVD+D+E  SNGPV   SF+RREK+D SLVA+ KPSD EAI VDKPQAS + KPSTVSE+ KIN Q KSD+PVT EKS IFS
Subjt:  VGASPQTKCAFQMSAHEDFVDIDEEGCSNGPVTDISFDRREKMDASLVAMSKPSDTEAITVDKPQASAEVKPSTVSELNKINGQRKSDVPVTAEKSPIFS

Query:  FATASPPSITTNAKDPESTLRPEKNISPEAPKPANAPIFGFGDKLPSQKESFSSAPTFAFGNKFAPSTNEQNAVPVATSESNVAP-------------GK
        F TASP S T    +PEST RPEK    E PK A APIFGFG+K PSQK+   S+PTF FGNK   STNEQNAVP  TSE NVAP              K
Subjt:  FATASPPSITTNAKDPESTLRPEKNISPEAPKPANAPIFGFGDKLPSQKESFSSAPTFAFGNKFAPSTNEQNAVPVATSESNVAP-------------GK

Query:  ATFPIPANAATENGNKNTGSPFKFASPLVNEKESAKVGSSSVFKAESNSSSILSFGVPKESMSDKAGD-KSLSAGLSVGTSENLFSSSVSTSTSAPSLFS
        ATFPIPA+  TENGN   GSPFKFAS LVNEKE AK GS+SVFK+ES+SSSILSFGVPKE MS+KAGD KS SAGLSVGTS NL  SSVS ST  PSLFS
Subjt:  ATFPIPANAATENGNKNTGSPFKFASPLVNEKESAKVGSSSVFKAESNSSSILSFGVPKESMSDKAGD-KSLSAGLSVGTSENLFSSSVSTSTSAPSLFS

Query:  FSSPSTNSNLNNGSLVSTPSIFSSPATTFSNNITNQNPSIKPSLTTAPSNSEPATTTSLSMPSPVPSFSAAPIFKFGSPSVPSSSAP-ALSAAETKTKQE
        FSSP+TNSNL NGSL STPS F SP+ TF +NITNQN SIKPSL  A SNSEP TTTSLS  SP+PSFSAAPIFKFGS SVPS+SAP    + ETKTKQE
Subjt:  FSSPSTNSNLNNGSLVSTPSIFSSPATTFSNNITNQNPSIKPSLTTAPSNSEPATTTSLSMPSPVPSFSAAPIFKFGSPSVPSSSAP-ALSAAETKTKQE

Query:  TT-FGNLSGIPPSDTSAAKVSSTGGSVFQFGAAATT-DSNKRPENSTSAPGNVPTFGAPVFPANSGVASSTQSTPVLPFSSSSTSFGLAANTGLSSGSSL
        TT FGN+SGI PSDTSAAKV STG SVFQFGAA+TT DSNK PE ST AP +VP+FGAPV PA+SGVASSTQSTPV PFSSSSTSFGL  NTGL+SG+SL
Subjt:  TT-FGNLSGIPPSDTSAAKVSSTGGSVFQFGAAATT-DSNKRPENSTSAPGNVPTFGAPVFPANSGVASSTQSTPVLPFSSSSTSFGLAANTGLSSGSSL

Query:  FGSSAPASNLFSSGTTFGLTGTSSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQTSSTPSFSTGFSSTPTGGFPFGLSSSSAASNSSPMLFGSSTT-SASTTSMFSFTS-
         GSSAPASNLF+SG TFG  G+SSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQ SS PSFS+GF STPTGGF FGL+SSSAAS+S+PMLFGSS+T +ASTTSMFSFTS 
Subjt:  FGSSAPASNLFSSGTTFGLTGTSSSANNSVSSGAGTSSSFFNWQTSSTPSFSTGFSSTPTGGFPFGLSSSSAASNSSPMLFGSSTT-SASTTSMFSFTS-

Query:  --AASSQPAFSNSNHGFTFGSTPPANNDQANMEDSMAEDTVQAVTLPT--PTFGQQPLTPPPSSGFMFGSAAPPPVAASPFQF-GSQQNAPTPQNPSPFH
          AASSQPAF NSNHGFTFGSTPPANND ANMEDSMAEDTVQ V LPT  P+FGQQPLTPPPSSGFMFGS AP P+ A+PFQF GSQQN  TPQNP+PF 
Subjt:  --AASSQPAFSNSNHGFTFGSTPPANNDQANMEDSMAEDTVQAVTLPT--PTFGQQPLTPPPSSGFMFGSAAPPPVAASPFQF-GSQQNAPTPQNPSPFH

Query:  ASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKANRKYVKVKSKSRKK
        ASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDK+NRK+VKVKSKSRKK
Subjt:  ASGSLDFNASAGGSFSLGAGGGDKANRKYVKVKSKSRKK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q9CAF4 Nuclear pore complex protein NUP12.8e-8933.07Show/hide
Query:  GRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPTALRNSA-------GNGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRI---------PPPPPSLP---------VSRGF
        G GGKF+K   RRS  TPYDRP T++RN+        G GWLSKLVDPAQ+LIT SA RLF S+ RKR+         P     LP         V    
Subjt:  GRGGKFQKRPLRRSHTTPYDRPPTALRNSA-------GNGWLSKLVDPAQKLITSSAHRLFSSVFRKRI---------PPPPPSLP---------VSRGF

Query:  LLLLFLFVSWCFLVFNWNA--------LLTIVRMVYGFCFSHSGTQANDEMGNENHEEVAADLPGTQEGTNRDFG------PSIKTDNTHGVT-DLEQIL
         +      +    + + NA           + +++ G  F+ S       +        AAD     E    + G      PS + D TH     +  ++
Subjt:  LLLLFLFVSWCFLVFNWNA--------LLTIVRMVYGFCFSHSGTQANDEMGNENHEEVAADLPGTQEGTNRDFG------PSIKTDNTHGVT-DLEQIL

Query:  KEKTFTRQVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKSTP--LSMASHSHKFGDSFASEN--LSKSSALTLVPRSPGNFDVIENGFVTPRSRGRSALYNMARMPYS
             + + LDE +ASPA++AKAYMGSRP + TP  L +   + +    F +      KS  ++LV + P     +ENGFVTPRSRGRSA+Y+MAR PYS
Subjt:  KEKTFTRQVLDEDVASPAEIAKAYMGSRPPKSTP--LSMASHSHKFGDSFASEN--LSKSSALTLVPRSPGNFDVIENGFVTPRSRGRSALYNMARMPYS

Query:  GVSATHSIKNSVATTDAYRATGSSSSQLAWERGRVLGSKQG---ALKRRSSVLDDEMGHVGPIRRLRHKSNLLYPTGLSLPSSSTSIPVSGIGSENAQQF
                ++SV     ++A+ S      WE     GS+QG    LKRRSSVLD+++G VGP+RR+R KSN        L S S ++PVS          
Subjt:  GVSATHSIKNSVATTDAYRATGSSSSQLAWERGRVLGSKQG---ALKRRSSVLDDEMGHVGPIRRLRHKSNLLYPTGLSLPSSSTSIPVSGIGSENAQQF

Query:  QSTKVHPFSSSSGKGLYSRSLSKRSAESENDVKPSSSFSQIPLRSSEMASKILEQLEKLTPPKDKSSKLKLLSVTNNSPTKLSPSMLHGPALRSLEDVDS
              P S  +  G  +   SK SAE   D+ P SSF+ +P +SSEMASKIL+QL+KL   ++K            SP+KLSPSML GPAL+SL++V++
Subjt:  QSTKVHPFSSSSGKGLYSRSLSKRSAESENDVKPSSSFSQIPLRSSEMASKILEQLEKLTPPKDKSSKLKLLSVTNNSPTKLSPSMLHGPALRSLEDVDS

Query:  SKYLENVEDIQSNDARELTSQKNNKVEESSSLKYKLPINKEISAGDGLGSPVPTKDTVLSSR----PQVSFVGASPQTKCAFQMSAHEDFVDIDEE-GCS
         K+L N+ + ++N + + + QK     ES S +      K   A DG      +KD  +  +    P  + +   P  K +F+MSAHEDF+++D++ G +
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Query:  NGPVTDISFDRREKMDASLVAMSKPSDTEAITVDKPQASAEVKPSTVSELNKINGQRKSDVPVTAEKSPIFSFA--------TASPPS---ITTNAKDPE
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G10650.1 BEST Arabidopsis thaliana protein match is: nucleoporin-related (TAIR:AT5G20200.1)2.0e-9033.07Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
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TAATGATCAAGCAAATATGGAGGATAGCATGGCTGAGGATACCGTCCAGGCAGTCACGCTGCCTACGCCTACTTTTGGGCAACAGCCCCTTACACCACCTCCATCATCAG
GGTTTATGTTTGGTTCAGCGGCCCCTCCTCCGGTAGCAGCAAGTCCTTTCCAGTTCGGCAGCCAGCAAAATGCACCTACCCCACAAAATCCCTCTCCATTTCATGCTTCT
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GTAG
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TTCCCCCTCCGCCGCCGTCATTGCCCGTTTCTCGAGGTTTTTTGCTTCTTCTTTTTTTGTTTGTTTCCTGGTGTTTTTTGGTTTTTAATTGGAATGCTCTCTTAACGATT
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AGGATGTTGCTTCACCTGCAGAGATTGCAAAAGCATACATGGGCAGCAGGCCTCCAAAATCAACTCCGTTGAGTATGGCGTCCCATAGTCACAAGTTTGGGGATAGTTTT
GCTTCAGAAAATCTCTCGAAATCCTCTGCTTTAACTCTTGTGCCGAGATCTCCTGGAAATTTTGATGTTATTGAAAATGGTTTTGTCACCCCAAGATCTCGAGGCAGATC
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AATAACTCACCCACAAAGTTGTCGCCATCAATGTTGCATGGGCCAGCTCTTAGAAGCCTGGAAGATGTGGATTCATCTAAGTATTTGGAAAATGTTGAAGACATTCAGTC
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ATAAGAATACAGGGTCACCGTTTAAATTTGCATCGCCTTTAGTCAATGAAAAAGAAAGTGCTAAAGTGGGCAGCTCTTCGGTTTTTAAAGCCGAGAGTAATAGCAGCAGC
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TCTCCTGTGCCATCTTTTTCAGCTGCACCTATTTTCAAATTTGGGAGCCCTAGTGTTCCTTCATCTTCCGCTCCAGCTCTATCAGCAGCGGAAACCAAGACCAAGCAAGA
GACAACCTTTGGTAATTTAAGTGGCATTCCTCCAAGCGACACGTCTGCTGCTAAAGTATCTAGTACTGGAGGCAGCGTTTTTCAATTCGGAGCTGCAGCTACTACAGATT
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CATCATTTTCCACTGGATTCAGCTCAACTCCAACTGGAGGGTTCCCTTTTGGTCTTTCATCTTCTTCCGCTGCTTCTAATAGTTCACCTATGCTCTTTGGGTCATCAACA
ACTAGTGCATCGACAACGTCAATGTTCTCATTTACTTCCGCTGCGTCGTCACAGCCTGCTTTCAGTAATTCTAATCATGGCTTCACTTTTGGTTCAACACCCCCTGCCAA
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TSASTTSMFSFTSAASSQPAFSNSNHGFTFGSTPPANNDQANMEDSMAEDTVQAVTLPTPTFGQQPLTPPPSSGFMFGSAAPPPVAASPFQFGSQQNAPTPQNPSPFHAS
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